КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ
Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.
ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ
Номер проекта 19-74-10013
НазваниеИзучение основных закономерностей эволюции геномов паразитических организмов на примере представителей Orthonectida и Turbellaria
Руководитель Бондаренко Наталья Ивановна, Кандидат биологических наук
Организация финансирования, регион федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский государственный университет" , г Санкт-Петербург
Конкурс №41 - Конкурс 2019 года «Проведение исследований научными группами под руководством молодых ученых» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными
Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни; 04-101 - Зоология
Ключевые слова паразитизм, редуктивная эволюция, изменение размеров генома, гены
Код ГРНТИ34.33.15
ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ
Аннотация
Совершенствование молекулярно-биологических и генно-инженерных методов, а также наличие мощных вычислительных алгоритмов, позволяющих обрабатывать большие объемы данных, определяет интенсивное развитие одного из современных направлений биологии, а именно геномики. Она включает в себя идентификацию, локализацию и характиризацию отдельных генов или участков генов, а также изучение сходства и различий геномов разных организмов. Эволюционный подход постепенно становится основным приемом для разрешения общебиологических проблем, таких как пути и последствия редуктивной эволюции генома и, в более широком смысле, вопросов о том, каковы возможные масштабы редуктивной эволюции и компактизации всех структур организма – как на морфологическом уровне, так и на уровне генома. С этой точки зрения особый интерес представляют геномы паразитических червей, вариабельность которых определяется сложными молекулярно-генетическими адаптациями, возникающими в процессе коэволюции в системе паразит-хозяин и обладающих филогенетически близкородственными свободноживущими формами. Настоящий проект направлен на широкомасштабное изучение геномных изменений, сопровождающих процессы перехода к паразитическому образу жизни многоклеточных организмов с целью выявления общих закономерностей данных эволюционных преобразований среди разных таксономических групп животных. Паразитические турбеллярии и ортонектиды оказываются оригинальной и удобной моделью для решения таких задач. В пределах одного, четко очерченного таксона турбеллярий есть как свободно живущие, коменсальные, так и настоящие паразитические виды. Что касается ортонектид, то, как недавно было показано, они являются близкими родственниками свободноживущих аннелид. Это позволяет максимально корректно провести сравнительный анализ геномов паразитических и свободноживущих видов и выявить закономерности в перестройке генома у паразитов. Проект предполагает расшифровку полных геномов 4 видов ортонектид и 3 видов турбеллярий, проведение сравнительного геномного анализа со свободноживущими формами с целью оценки изменений геномов паразитов и выявления основных закономерностей эволюции геномов. Научная новизна проекта определяется оригинальной постановкой задач и уникальностью объектов исследования. В проекте будет применен комплексный подход, основанный как на современных, так и на классических методах молекулярной биологии, цитологии, клеточной биологии и биоинформатики
ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ
Публикации
1.
Слюсарев Ю.С., Старунов В.В., Бондаренко А.С., Зорина Н.А., Бонадренко Н.И.
Extreme Genome and Nervous System Streamlining in the Invertebrate Parasite Intoshia variabili
Current Biology, Volume 30, Issue 7, Pages 1292-1298 (год публикации - 2020)
10.1016/j.cub.2020.01.061
2. Радченко Д.Д., Скалон Е., Бондаренко А.С., Слюсарев Ю.С., Бондаренко Н.И. Mitochondrial genome supports hypothesis of divergence of Rhopalura ophiocomae (Orthonectida, Annellida) into two closely related species. Mitochondrial DNA (год публикации - 2021)
3. Слюсарев Ю., Бондаренко Н., Скалон Е., Раппопорт А., Старунов В. The structure of the muscular and nervous systems of the orthonectid Rhopalura litoralis (Orthonectida), or what parasitism can do to an annelid. Organisms Diversity & Evolution (год публикации - 2021)
4. Бондаренко Н., Шафранская Д., Яковлева Ю., Зорина Н., Старунов В., Бондаренко А., Скалон Е., Слюсарев Ю. First multigene analysis of Orthonectida robustly reveals its phylogeny and relationships with Annelida MGAG (год публикации - 2021)
5.
Слюсарев Ю. Бондаренко Н., Скалон Е., Раппопорт А., Радченко Д., Старунов В.
The structure of the muscular and nervous systems of the orthonectid Rhopalura litoralis (Orthonectida) or what parasitism can do to an annelid
Organisms Diversity and Evolution, 10.1007/s13127-021-00519-7 (год публикации - 2021)
10.1007/s13127-021-00519-7
Публикации
1.
Слюсарев Ю.С., Старунов В.В., Бондаренко А.С., Зорина Н.А., Бонадренко Н.И.
Extreme Genome and Nervous System Streamlining in the Invertebrate Parasite Intoshia variabili
Current Biology, Volume 30, Issue 7, Pages 1292-1298 (год публикации - 2020)
10.1016/j.cub.2020.01.061
2. Радченко Д.Д., Скалон Е., Бондаренко А.С., Слюсарев Ю.С., Бондаренко Н.И. Mitochondrial genome supports hypothesis of divergence of Rhopalura ophiocomae (Orthonectida, Annellida) into two closely related species. Mitochondrial DNA (год публикации - 2021)
3. Слюсарев Ю., Бондаренко Н., Скалон Е., Раппопорт А., Старунов В. The structure of the muscular and nervous systems of the orthonectid Rhopalura litoralis (Orthonectida), or what parasitism can do to an annelid. Organisms Diversity & Evolution (год публикации - 2021)
4. Бондаренко Н., Шафранская Д., Яковлева Ю., Зорина Н., Старунов В., Бондаренко А., Скалон Е., Слюсарев Ю. First multigene analysis of Orthonectida robustly reveals its phylogeny and relationships with Annelida MGAG (год публикации - 2021)
5.
Слюсарев Ю. Бондаренко Н., Скалон Е., Раппопорт А., Радченко Д., Старунов В.
The structure of the muscular and nervous systems of the orthonectid Rhopalura litoralis (Orthonectida) or what parasitism can do to an annelid
Organisms Diversity and Evolution, 10.1007/s13127-021-00519-7 (год публикации - 2021)
10.1007/s13127-021-00519-7
Публикации
1.
Слюсарев Ю.С., Старунов В.В., Бондаренко А.С., Зорина Н.А., Бонадренко Н.И.
Extreme Genome and Nervous System Streamlining in the Invertebrate Parasite Intoshia variabili
Current Biology, Volume 30, Issue 7, Pages 1292-1298 (год публикации - 2020)
10.1016/j.cub.2020.01.061
2. Радченко Д.Д., Скалон Е., Бондаренко А.С., Слюсарев Ю.С., Бондаренко Н.И. Mitochondrial genome supports hypothesis of divergence of Rhopalura ophiocomae (Orthonectida, Annellida) into two closely related species. Mitochondrial DNA (год публикации - 2021)
3. Слюсарев Ю., Бондаренко Н., Скалон Е., Раппопорт А., Старунов В. The structure of the muscular and nervous systems of the orthonectid Rhopalura litoralis (Orthonectida), or what parasitism can do to an annelid. Organisms Diversity & Evolution (год публикации - 2021)
4. Бондаренко Н., Шафранская Д., Яковлева Ю., Зорина Н., Старунов В., Бондаренко А., Скалон Е., Слюсарев Ю. First multigene analysis of Orthonectida robustly reveals its phylogeny and relationships with Annelida MGAG (год публикации - 2021)
5.
Слюсарев Ю. Бондаренко Н., Скалон Е., Раппопорт А., Радченко Д., Старунов В.
The structure of the muscular and nervous systems of the orthonectid Rhopalura litoralis (Orthonectida) or what parasitism can do to an annelid
Organisms Diversity and Evolution, 10.1007/s13127-021-00519-7 (год публикации - 2021)
10.1007/s13127-021-00519-7