КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ
Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.
ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ
Номер проекта 25-14-00162
НазваниеРазработка подходов к преодолению резистентности к антибиотикам «последней надежды», обладающим мембраноассоциированным механизмом действия
Руководитель Остроумова Ольга Сергеевна, Доктор биологических наук
Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт цитологии Российской академии наук , г Санкт-Петербург
Конкурс №104 - Конкурс 2025 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами»
Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни; 04-208 - Молекулярная биология
Ключевые слова антибиотики, мембраны, полимиксины, даптомицин, амфотерицин В, антимикробные пептиды, цекропины, ион-проницаемые поры, малые молекулы, липидные везикулы
Код ГРНТИ34.11.27
ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ
Аннотация
Согласно ВОЗ, устойчивость к противомикробным препаратам является одной из главных угроз для современного здравоохранения. Повышенные уровни резистентности приводят к более частому использованию препаратов последнего резерва, устойчивость к которым уже наблюдается во многих регионах. Поскольку эффективность резервных препаратов снижается, увеличиваются риски возникновения и диссеминированного распространения инфекций, которые невозможно вылечить. По официальным оценкам к 2035 г. ожидается двукратный рост резистентности к антибиотикам «последней надежды» по сравнению с 2005 г., что подчеркивает необходимость ужесточения контроля за их использованием и поиска других способов сохранения их эффективности.
Целый ряд противомикробных препаратов последнего резерва, в частности, полимиксины, даптомицин, и амфотерицин В, нацелены на мембраны патогенов и оказывают свое цитотоксическое действие посредством увеличения их проницаемости. Это подчеркивает связь подобного механизма действия с низким риском возникновения резистентности, а появление устойчивых микроорганизмов указывает на необходимость детального изучения особенностей взаимодействия антибиотиков с их мембранами с целью идентификации возможных мишеней, воздействие на которые позволит восстановить мембранную, а, следовательно, антимикробную активность препаратов.
Используемые в настоящее время подходы к решению этой задачи включают комбинирование антибиотиков с малыми молекулами, потенцирующими их активность. Однако, большинство таких молекул обнаруживается случайным образом, а механизмы синергетического действия остаются неидентифицированными. Рациональный подход к поиску потенцирующих соединений требует глубокого понимания как липидных детерминант, опосредующих резистентность, так и молекулярной природы модификации малой молекулой свойств таргетной мембраны и антибиотик-липидных взаимодействий. Реализация описанного подхода не отменяет необходимости поиска новых противомикробных препаратов и мишеней. При этом, необходимо сосредоточить усилия на препаратах с принципиально новым механизмом действия и (или) потенциально низким риском развития резистентности. В этом ключе, соединения, способные напрямую нарушать барьерную функцию мембран патогенов, привлекают все большее внимание. Препаратов с таким механизмом действия явно не хватает в арсенале противотуберкулезных средств. В этой связи также следует упомянуть и порообразующие антимикробные пептиды, как альтернативу антибиотикам при лечении инфекций грамположительной этиологии.
Необходимость исследования тонких механизмов взаимодействия противомикробных препаратов с таргетными мембранами определяет целесообразность использования искусственных моделей мембран чувствительных и устойчивых микроорганизмов и комплексного методологического подхода, включающего электрофизиологические, флуориметрические, калориметрические и биоинформатические методы. В ходе выполнения Проекта предполагается определить подходы к усилению порообразующей способности полимиксинов, даптомицина и амфотерицина В в липидных бислоях, имитирующих мембраны резистентных микроорганизмов; установить липидные детерминанты порообразующей активности антимикробных пептидов насекомых; оценить потенциал совместного применения тестируемых противомикробных препаратов и низкомолекулярных модуляторов мембран в фармацевтических целях; идентифицировать нацеленные на мембраны фармакологические агенты с потенциальной активностью против микобактерий и лейшманий; а также сформировать представления о возможностях развития к ним резистентности. Ожидаемые результаты должны способствовать разработке новых антибактериальных, противотуберкулезных, противогрибковых и антипаразитарных препаратов, определяя возможность решения одной из приоритетных социально-значимых задач, направленных на снижение смертности от инфекционных заболеваний, вызванных устойчивыми штаммами патогенных микроорганизмов.
Ожидаемые результаты
1) Будут разработаны модели мембран различных бактериальных (включая возбудителя туберкулеза) и грибковых патогенов человека, имеющих критический и высокий приоритет.
2) Будут выявлены свойства липидного матрикса, модуляция которых сопряжена с потенциацией порообразования полимиксинами, даптомицином, амфотерицином В и антимикробными пептидами насекомых в таргетных мембранах, в том числе резистентных к ним микроорганизмов.
3) Будут идентифицированы малые молекулы, способные оказывать синергетическое действие с тестируемыми противомикробными препаратами в отношении чувствительных и устойчивых микроорганизмов, и оценены перспективы создания комбинированных антибактериальных средств.
3) Будут обнаружены соединения и (или) комбинации фармакологических агентов с потенциальной противотуберкулезной активностью, обусловленной прямым воздействием на клеточную стенку патогена, и сформированы представления о возможных механизмах развития резистентности к обнаруженным препаратам у микобактерий.
4) Будут идентифицированы липидные детерминанты порообразующей способности антимикробных пептидов насекомых и сформированы представления о возможных механизмах развития устойчивости к действию пептидов путем модификации состава бактериальных мембран.
5) Будут идентифицированы новые возможности для расширения терапевтического окна амфотерицина В.
6) Будут оценены перспективы разработки новых комбинированных лекарственных средств с противогрибковой и антипаразитарной активностью, действие которых сосредоточено на мембране патогенов.
ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ
Аннотация результатов, полученных в 2025 году
Распространение устойчивости к карбапенемам среди грамотрицательных бактерий привело к росту потребления резервных антибиотиков, полимиксинов, что вызвало появление мультирезистентных штаммов, устойчивых также к полимиксинам. Это существенно увеличивает риск смертельного исхода и диссеминированного распространения опасных для жизни бактериальных инфекций. Действие полимиксинов связано с порообразованием во внешних мембранах грамотрицательных бактерий при взаимодействии с липополисахаридами, а устойчивость обусловлена модификацией их липидного «якоря» – липида А, приводящей к изменению электрического заряда липополисахарида и ослаблению электростатического взаимодействия с полимиксинами. Специалисты прогнозируют дальнейшее распространение резистентности к полимиксинам в микробных популяциях даже в случае значительного сокращения их использования, поэтому наиболее перспективной стратегией сохранения эффективности этих критически важных антибиотиков видится комбинирование с малыми молекулами, увеличивающими их порообразующую активность в мембранах, содержащих модифицированные, характерные для устойчивых штаммов, липополисахариды.
С использованием полученных фундаментальных знаний о детерминантах порообразования полимиксином Б, в отчетном периоде обнаружено, что ряд природных полифенолов (флоретин, бутеин, 4’-гидроксихалкон, кардамонин, мирицетин, кверцетин, ресвератрол и пицеатаннол), снижающих скачок электрического потенциала на границе раздела «мембрана-окружающий раствор» и/или плотность упаковки мембранных липидов, значительно потенцируют формирование пор антибиотиком, в том числе в мембранах, включающих модифицированные липополисахариды. Полученные данные подтверждены с использованием клеточных тест-систем, включающих полимиксин-чувствительные штаммы Escherichia coli и природно резистентные к нему Serratia proteamaculans. Оценка токсичности выбранных комбинаций указывает на перспективы использования бутеина, 4’-гидроксихалкона, кверцетина, ресвератрола и пицеатаннола для разработки комбинированных противомикробных препаратов на основе полимиксина Б.
При обновлении списка ВОЗ приоритетных бактериальных патогенов в 2024 году рифампицин-устойчивые Mycobacterium tuberculosis были «повышены» в рейтинге до «критического уровня». Длительный период лечения, нежелательные побочные эффекты терапии и высокая скорость появления и распространения лекарственно-устойчивых штаммов делают необходимой разработку новых противотуберкулезных препаратов. Обнаружение фармакофоров, способных обеспечить прямое воздействие на мембраны микобактерий, потенциально может не только снизить риск развития резистентности к лекарственным препаратам, но и значительно упростить и удешевить лечение туберкулеза. В ходе выполнения проекта показано потенцирование порообразующей способности антмикробных пептидов, сирингопептина 22А и цекропина А, при включении в состав липидных бислоев миколовых кислот, характерных для клеточной стенки микобактерий. Это создает предпосылки для разработки высокоселективных противотуберкулезных средств, которые могут характеризоваться низким риском развития лекарственной устойчивости за счет мембранолитического механизма действия.
Задача по выявлению путей повышения избирательности действия мембранотропных антибиотиков не может быть решена без разработки и усовершенствования молекулярного инструментария для направленной модификации физико-химических свойств липидного матрикса. С этой целью в отчетный период дополнительно проанализировано действие природных протобербериновых алкалоидов (ротундина, берберина и нитидина) и производных коричной кислоты (этил-4-метоксициннамата и остола) на граничный потенциал липидных бислоев и термотропное поведение мембранных липидов. Установлено, что этил-4-метоксициннамат и остол могут рассматриваться в качестве эффективных модуляторов плотности упаковки липидов в бислое и характеризуются выраженной селективностью в отношении отрицательно заряженных мембран, что может быть использовано для разработки комбинированных антибактериальных препаратов.
По результатам работы в отчетном году опубликовано 2 статьи в зарубежных высокорейтинговых журналах «Pharmaceutics» (Q1 по WoS/SJR, IF 5.5) и «International Journal of Molecular Sciences» (Q1 по WoS/SJR, IF 4.9).
Публикации
1.
Захарова А.А., Ефимова С.С., Остроумова О.С.
State of the Art of Cyclic Lipopeptide–Membrane Interactions: Pore Formation and Bilayer Permeability
Pharmaceutics, 17(9), 1142 (год публикации - 2025)
10.3390/pharmaceutics17091142
2.
Ефимова, С.С.; Злодеева, П.Д.; Фам, К.М.; Чинь, Х.Т.Т.; Ле, Х.М.; Нгуен, В.Т.Х.; Фам, Л.К.; Остроумова, О.С.
The effects of several natural protoberberine alkaloids and cinnamic acid derivatives used for traditional medicine on the membrane boundary potential and lipid packing stress
International Journal of Molecular Sciences , 26, 11237 (год публикации - 2025)
10.3390/ijms262211237