КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ
Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.
ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ
Номер проекта 25-16-20127
НазваниеРазработки тест-систем для диагностики основных бактериальных возбудителей аквакультурных рыб
Руководитель Рубель Мария Сергеевна
Организация финансирования, регион федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский государственный университет" , г Санкт-Петербург
Конкурс №101 - Конкурс 2025 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами» (региональный конкурс)
Область знания, основной код классификатора 06 - Сельскохозяйственные науки; 06-201 - Рыбный промысел
Ключевые слова диагностическая тест-система, патогены аквакультуры, патогены лососевых, Aeromonas salmonicida, Aeromonas hydrophila, Pseudomonas fluorescens, амплификация, изотермическая амплификация, ДНК-наносенсоры, аптамеры, вспыхивающие аптамеры
Код ГРНТИ69.25.17
ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ
Ожидаемые результаты
Главным результатом представленного проекта будет создание первой тест-системы в России на основе изотермической амплификации и системы для специфической детекции продуктов изотермической амплификации. Тест-система будет направлена на диагностику инфекционных бактерий, являющихся возбудителями болезней аквакультурных рыб, а именно: Aeromonas salmonicida, Aeromonas hydrophila, Pseudomonas fluorescens, Yersinia ruckery, Flavobacterium psychrophilum, Flavobacterium columnare, Vibrio anguillarum. Комплект будет включать набор для изотермической амплификации и набор для детекции продукта изотермической амплификации.
Набор для изотермической амплификации будет включать следующие компоненты:
готовые смеси для амплификации, содержащие оптимизированный буфер для каждого патогена, полимеразу для амплификации, растворы праймеров и пробирки с положительными и отрицательными контрольными материалами.
Набор для детекции продукта амплификации будет включать следующие компоненты: растворы с ДНК-наносенсорами, в которые будет необходимо перенести часть ампликонов, и пробирки, содержащие контрольные пробы.
Анализ образцов с помощью данного набора будет занимать не более 120 минут, включая этап пробоподготовки. Ожидаемая чувствительность метода будет не менее 1*10^4 копий/мл, аналитическая точность - не менее 99%.
Предложенная платформа заложит фундамент для создания быстрых и точных методов диагностики заболеваний рыб. Создание новых методов диагностики, не защищенных патентным законодательством, может обеспечить развитие научно-технического прогресса и создание новых экономических возможностей и рабочих мест. Создание быстрых методов диагностики сможет эффективнее проводить противоэпизоотические и профилактические мероприятия предотвращающие заражения рыб на аквакультурных хозяйствах и в природных водоемах.
В процессе работы будут также решены следующие фундаментальные задачи:
1. Будет показана возможность использования ДНК-наносенсоров на основе аптамеров для определения однонуклеотидных замен, что может существенно улучшить дифференциальную диагностику.
2. Будет исследована возможность использования ДНК-наносенсоров на основе аптамерного ядра для детекции сложных структур нуклеиновых кислот, ДНК и/или РНК со сложной вторичной укладкой, формирующихся в процессе изотермических амплификаций, что открывает новые перспективы в разработке высокоспецифичных диагностических систем, а также в изучении различных процессов генной регуляции.
3. исследование структуры аптамерного ядра - аптамера, который его составляет, химических модификаций красителя, точки разделения аптамера, состава буфера реакции