Современные молекулярно-генетические технологии для разработки новых алгоритмов персонализации терапии сарком мягких тканей

КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ

Номер проекта 23-65-00003

НазваниеСовременные молекулярно-генетические технологии для разработки новых алгоритмов персонализации терапии сарком мягких тканей

Руководитель Якубовская Марианна Геннадиевна, Доктор медицинских наук

Организация финансирования, регион Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Российский университет дружбы народов имени Патриса Лумумбы" , г Москва

Конкурс №83 - Конкурс 2023 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований по поручениям (указаниям) Президента Российской Федерации» (генетические исследования)

Область знания, основной код классификатора 05 - Фундаментальные исследования для медицины; 05-208 - Онкология

Ключевые слова саркомы мягких тканей, химиорезистентность опухоли к противоопухолевым препаратам, массовое параллельное секвенирование, секвенирование РНК единичных клеток, биоинформатический анализ результатов секвенирования, микроокружение опухолевых клеток, опухоль-ассоциированные макрофаги, генотоксичные препараты, генетические нарушения, экспериментальное тестирование химиорезистентности in vitro, геномное редактирование, РНК-интерференция, транслокации, точечные мутации, клеточный сигналинг.

Код ГРНТИ76.29.49

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ

Аннотация
Современные успехи в клинической и экспериментальной онкологии, молекулярной биологии, онкогенетике и биоинформатике позволяют в каждом отдельном случае злокачественного новообразования детально характеризовать особенности молекулярного патогенеза опухоли и проводить персонализированную терапию. В предлагаемом проекте эта задача поставлена в отношении сарком мягких тканей (СМТ). Среди пациентов трудоспособного возраста от СМТ в России погибает более 4500 человек ежегодно. В отсутствии адекватной терапии данное заболевание характеризуется агрессивным течением и быстрым летальным исходом. Многокомпонентное лечение СМТ, включающее хирургическую резекцию опухолевого узла, радио- и химиотерапию, оказывается эффективным лишь у 30-40% пациентов и сопровождается быстрым развитием рецидивов. Несмотря на прогресс в развитии таргетной терапии злокачественных новообразований, «золотым стандартом» химиотерапии СМТ первой и второй линий продолжают оставаться комбинации цитостатиков. Отсутствие алгоритмов выбора персонализированного курса химиотерапии для большинства пациентов с СМТ приводит к бесполезному расходованию дорогостоящих препаратов и нанесению неоправданного ущерба здоровью пациентов из-за токсичности цитостатиков. Одной из причин низкой эффективности химиотерапевтического лечения СМТ является ограниченность данных о молекулярно-генетических особенностях опухолей. Это свидетельствует об актуальности темы совершенствования химиотерапии СМТ на основе современных технологий анализа генома и его функционирования, а также о высокой социальной значимости представленного проекта. Молекулярно-генетический анализ СМТ исключительно сложен, так как согласно классификации ВОЗ, среди СМТ выделяют 16 нозологических типов, включающих более 100 нозологических подтипов с различным гистогенезом. Создание Ассоциацией специалистов по изучению сарком на базе НМИЦ онкологии им. Н.Н.Блохина общероссийского специализированного канцер-реестра больных с первичными и метастатическими опухолями мягких тканей (RUSSARCOMA) впервые открыло возможность для выполнения масштабного проекта по изучению генетических и транскриптомных особенностей различных типов СМТ. За рубежом к настоящему времени опубликованы лишь несколько исследований генома СМТ, которые сопоставимы по масштабу с представленным проектом по количеству анализируемых случаев недифференцированных плеоморфных сарком, однако количество рассмотренных в этих исследованиях случаев липосарком и синовиальных сарком ниже запланированного нами на основании анализа данных по потоку пациентов в НМИЦ онкологии им. Н.Н.Блохина. В проекте впервые будут использованы первичные культуры клеток СМТ, методика получения которых была отработана в наших предыдущих исследованиях, и разработан набор реагентов для экспериментального выявления in vitro химиорезистентности СМТ. В опубликованных исследованиях с использованием биоинформатического анализа транскриптомов единичных клеток рассмотрены лишь отдельные случаи СМТ, что не позволяет подойти к решению проблемы определения молекулярно-генетических особенностей различных подтипов СМТ на системном уровне и провести последующую приоритетную разработку соответствующей молекулярно-генетической классификации трех наиболее распространенных типов СМТ. С помощью геномного редактирования, РНК-интерференции и репортерного анализа будет впервые проанализирована функциональная значимость выявленных нарушений в развитии химиорезистентности. Впервые будут разработаны наборы для проведения количественного ПЦР и определены алгоритмы иммуногистохимического анализа для проведения экспрессного и общедоступного молекулярно-генетического тестирования СМТ на химиорезистентность, позволяющего провести обоснованный выбор персонализированного протокола лечения. Полученные данные будут способствовать совершенствованию химиотерапии СМТ и определят пути создания новых таргетных препаратов для лечения этого заболевания.

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ

Публикации

1. Э. Джуманиязова, А.Лохонина, Д.Джалилова, А.Косырева, Т.Фатхудинов Immune Cells in the Tumor Microenvironment of Soft Tissue Sarcomas Cancers, Cancers 2023, 15, 5760 (год публикации - 2023)
10.3390/cancers15245760

2. Г.А. Белицкий, К.И. Кирсанов, Е.А. Лесовая, В.П. Максимова, Л.В. Кривошеева, М.Г. Якубовская Молекулярные механизмы полового диморфизма в канцерогенезе Успехи молекулярной онкологии, 2023;10(3):24–35 (год публикации - 2023)
10.17650/2313-805X-2023-10-3-24-35

3. Э.Джуманиязова, А.Лохонина, Д.Джалилова, А.Косырева, Т.Фатхудинов Role of Microenvironmental Components in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma Journal of Personalized Medicine, J. Pers. Med. 2023, 13, 1616 (год публикации - 2023)
10.3390/jpm13111616

4. Л.Г. Соленова, Н.И. Рыжова, И.А. Антонова, Г.А. Белицкий, К.И. Кирсанов, М.Г. Якубовская Механистические и эпидемиологические данные о взаимосвязи микробиоты и канцерогенеза Успехи молекулярной онкологии (год публикации - 2024)

5. А.А. Тарарыкова, А.К. Валиев, П.В. Кононец, Э.Р. Чарчян, Р.М. Кабардаев, А.В. Федорова, Г.С. Батырова, А.Р. Шин, Н. А. Козлов Эффективность комбинированного лечения при остеосаркоме грудного позвонка с солитарным метастазом в предсердии: клинический случай Cаркомы костей, мягких тканей и опухоли кожи, . Саркомы костей, мягких тканей и опухоли кожи 2023;15(4):56-63 (год публикации - 2023)
10.17650/2219-4614-2023-15-4-00-00

6. М.Третьякова, У.Бокова, А.Щеголева, Е.Денисов Experimental models of tumor growth in soft tissue sarcomas RUDN Journal of Medicine, RUDN Journal of Medicine. 2023;27(4) (год публикации - 2023)

Аннотация результатов, полученных в 2024 году
В ходе реализации проекта, направленного на детальное изучение особенностей молекулярного патогенеза сарком мягких тканей (СМТ) с целью формирования теоретической основы и практических инструментов для реализации персонализированной терапии данного злокачественного новообразования, в 2024г. выполнены все запланированные работы. Проведена актуализация сложной логистической схемы масштабного исследования от поступления образцов из клиники до стадии консолидации информации по результатам проведенных исследований, и оптимизированы пути взаимодействия исполнителей проекта, сотрудников НИИ молекулярной и клеточной медицины медицинского института ФГАОУ ВО «Российский университет дружбы народов имени Патриса Лумумбы» Минобрнауки РФ (РУДН), НИИ канцерогенеза, НИИ клинической онкологии ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н.Блохина» Минздрава России. В текущем году в нашу коллекцию образцов тканей пациентов с СМТ были включены поступившие от 38 пациентов наборы образцов опухолей, нормальной перитуморальной ткани и/или крови. Для всех образцов опухолей проведена верификация гистологического диагноза и получены первичные культуры клеток СМТ, проведена оценка химиорезистентности опухолевых клеток этих культур к используемым в 1 и 2 линиях химиотерапии препаратам и их комбинациям. Количество резистентных и чувствительных образцов соответственно составило: к доксорубицину – 18 и 20, к ифосфамиду – 28 и 10, к комбинации доксорубицина и ифосфамида – 12 и 26, к доцетакселу – 30 и 8, к гемцитабину – 32 и 6 и к комбинации доцетаксела и гемцитабина – 20 и 18. Проведено полногеномное секвенирование опухолевого материала и периферической крови от 27 больных СМТ с гистологическими типами: миксофибросамкома, плеоморфная саркома, липосаркома и синовиальная саркома. Проведен биоинформатический анализ данных полногеномного секвенирования ДНК опухолевой ткани больных синовиальной саркомой (n=10). Выявлено 19 генов-драйверов канцерогенеза, которые были нарушены у всех 10 пациентов с синовиальной саркомой. Проведено секвенирование РНК единичных клеток для опухолевых образцов 24-х больных СМТ с гистологическими типами: плеоморфная саркома, миксофибросаркома, липосаркома и синовиальная саркома. Данные секвенирования РНК единичных клеток по 11 пациентам с синовиальной саркомой (образцы 2023 и 2024 гг) были объединены и охарактеризованы 19 кластеров клеток (14 – опухолевых клеток и 5 – клеток микроокружения). Охарактеризован транскриптомный ландшафт клеток синовиальных сарком и определены гены «Топ 20» для каждого кластера клеток. На основании ручного типирования по высоко представленным генам, активности сигнальных путей, кариотипирования идентифицирован популяционный состав кластеров. За 2 года выполнения проекта для анализа особенностей эпигенетической регуляции в клетках СМТ получена геномная ДНК из 5 липосарком, 7 миксофибросарком, 7 плеоморфных сарком и 9 синовиальных сарком. После проверки целостности геномной ДНК исследовали уровень её метилирования. Установлено, что процент метилирования ДНК относительно снижен в плеоморфных и синовиальных саркомах, а относительный уровень модификаций гистонов H3K36me3, H3K79me3, H3K9me2, H4K20me3, H3K9me3в опухолевых клетках СМТ не подвергся существенным изменениям. Проведен анализ наличия генетических нарушений в опухолях синовиальных сарком в сопоставлении с данными по резистентности к химиопрепаратам полученными in vitro. Определены гены, нарушение которых влияет на ответ клетки на определенную химиотерапию. Далее среди всех генов, мутации которых обнаружены в синовиальных саркомах, выделены гены-драйверы канцерогенеза. При резистентности пациентов к доксорубицину в опухолевых клетках гиперэкспрессированы гены PTGDS, COL1A2, CENPM, FOSB. При резистентности пациентов к доксетацелу и его комбинации с гемцитабином в опухолевых клетках гиперэкспрессированы гены IGFBP2, CCNL2, COL1A2, FOSB, WIF1, COL4A1, TYMS. В опухолевых клетках пациентов, резистентных к ифосфамиду, гиперэкспрессированы гены FN1, CCNL2, IGFBP5, NUSAP1. При проведении морфологической и иммуногистохимической характеристики синовиальных сарком показана экспрессия маркера апоптоза каспазы 3 в 9 образцах из 10, ТР53 – во всех образцах, а Е-кадгерин в большинстве опухолей не экспрессирован. Все исследованные опухоли были инфильтрированы CD45+ лейкоцитами. У 6 пациентов из 10 CD68+ макрофаги инфильтрировали опухолевую ткань. CD4 лимфоциты и CD20+ В- лимфоциты были обнаружены только в бифазной синовиальной саркоме. В остальных образцах лимфоциты были обнаружены в перитуморальной области, но не в опухоли. FAP+ фибробласты определялись в 7 образцах из 10. Проводимая терапия не оказывала значимого влияния на соотношение макрофагов и лимфоцитов в микроокружении сарком, а также не приводила к изменениям в экспрессии онкосупрессора p53, маркера апоптоза каспазы 3, маркера клеточных контактов Е-кадгерина. В связи с отсутствием в базах клеточных линий охарактеризованных линий некоторых гистотипов СМТ запланировано получение стабильных клеточных культур из первичных, в том числе для моделирования процессов канцерогенеза на следующих этапах. Из 38 первичных культур получено 8 клеточных линий, из которых наиболее стабильным и продолжительным ростом характеризуются опухолевые линии, прошедшие более 40 пассажей, а именно линии плеоморфной саркомы UPS39 и UPS36 и синовиальной саркомы SyS34. Для моделирования развития химиорезистентности получены линии генно-мидифицированных клеток плеоморфных сарком – UPS39 и UPS36 – с нокаутом гена TP53, что подтверждено вестерн-блоттингом. Для определения уровня активности фактора STAT3 в люциферазном репортерном тесте в клетках сарком, была сконструирована плазмида, обеспечивающая трансдукцию респонсивной последовательности в геном по механизму транспозиции. Последовательность подтверждена секвенированием. Была успешно осуществлена трансдукция репортерной конструкции в линии клеток сарком UPS39 и UPS36 и продемонстрирована ее функциональная активность. При проведении сравнительного анализа предикторной значимости результатов тестирования химиорезистентности in vitro, полученных на 2D- и 3D-культурах опухолевых клеток показано, что чувствительность клеток к препаратам в некоторых случаях различается при культивировании 2D и 3D, при этом не наблюдается однонаправленного изменения резистентности в 3D условиях. Таким образом, вопрос о том, какой тест на хеморезистентность более точно предсказывает ответ на проводимую химиотерапию, остается открытым, и исследование необходимо продолжить для увеличения выборки и сопоставления полученных результатов с клиническими данными. За 2024 год опубликовано 8 статей: 1 статья в журнале RSСI и 7 статей в журналах Scopus и WoS, включая 4 статьи WoS, Scopus Q1, в том числе 1 статья в журнале Nature Publishing Group. В настоящее время на рассмотрении в редакциях журналов, индексируемых Scopus и WoS, находится 4 публикации.

Публикации

1. Соленова Л.Г., Рыжова Н.И., Белицкий Г.А., Антонова И.А., Кирсанов К.И., Якубовская М.Г. Микробиота в диагностике, терапии и профилактике рака Российский биотерапевтический журнал, 2024;23(4):10–21 (год публикации - 2024)
10.17650/1726-9784-2024-23-4-10-21

2. Соленова Л.Г., Рыжова Н.И., Антонова И.А., Белицкий Г.А., Кирсанов К.И., Якубовская М.Г. Особенности микробиоты при различных злокачественных новообразованиях Исследования и практика в медицине, 2024. T.11, № 3. C. 85-102 (год публикации - 2024)
10.17709/2410-1893-2024-11-3-7

3. Меняйло М., Копанцева Е., Хозяинова А., Коробейникова А., Денисов Е. Soft tissue sarcomas at the single-cell and spatial resolution: new markers and targets Cancer Gene Therapy, Cancer Gene Ther (2024). https://doi.org/10.1038/s41417-024-00856-7 (год публикации - 2024)
10.1038/s41417-024-00856-7

4. Фетисов Т., Меняйло М., Иконников А., Хозяинова А., Тарарыкова А., Копанцева Е., Коробейникова А., Сенченко М., Бокова У., Кирсанов К., Якубовская М., Денисов Е. Decoding Chemotherapy Resistance of Undifferentiated Pleomorphic Sarcoma at the Single Cell Resolution: A Case Report Journal of clinical medicine, d. 2024, 13, 7176. https://doi.org/10.3390/jcm13237176 (год публикации - 2024)
10.3390/jcm13237176

5. Лохонина А.В., Джуманиязова Э.Д., Джалилова Д.Ш., Косырева А.М., Казарян Г.Г., Фатхудинов Т.Х. Компоненты микроокружения сарком мягких тканей. Часть 1. Саркомы костей, мягких тканей и опухоли кожи Саркомы костей, мягких тканей и опухоли кожи, 2024;16(1):25–33 (год публикации - 2024)
10.17650/2219-4614-2024-16-1-25-33

6. Лесовая Е., Фетисов Т., Бохян Б., Максимова В., Куликов Е., Белицкий Г., Кирсанов К., Якубовская М. Genetic and Molecular Heterogeneity of Synovial Sarcoma and Associated Challenges in Therapy Сells, 2024, 13, 1695 (год публикации - 2024)
10.3390/cells13201695

7. Лесовая Е., Фетисов Т., Бохян Б., Максимова В., Куликов Е., Белицкий Г., Кирсанов К., Якубовская М. Genetic, Epigenetic and Transcriptome Alterations in Liposarcoma for Target Therapy Selection Cancers, 2024, 16, 271 (год публикации - 2024)
10.3390/ cancers16020271

8. Косырева А., Джуманиязова Е., Лохонина А., Джалилова Д., Сентябрева А., Мирошниченко Е., Фетисов Т. Molecular-biologic and immunohistochemical features of undifferentiated pleomorphic sarcomas Вестник Российского университета дружбы народов. Серия: Медицина (год публикации - 2024)

Аннотация результатов, полученных в 2025 году
На III этапе выполнения нашего проекта, направленного на детальное изучение особенностей молекулярного патогенеза сарком мягких тканей (СМТ) с помощью современных молекулярно-генетических технологий для формирования теоретической основы и разработки практических инструментов реализации персонализированной терапии данного злокачественного новообразования, выполнены все запланированные работы. Этому способствовали хорошо отлаженные в предыдущие 2 года взаимодействия сотрудников НИИ молекулярной и клеточной медицины медицинского института ФГАОУ ВО «Российский университет дружбы народов имени Патриса Лумумбы» Минобрнауки РФ (РУДН), НИИ канцерогенеза и НИИ клинической онкологии ФГБУ «НМИЦ онкологии им. Н.Н.Блохина» Минздрава России и отработанная сложная логистическая схема масштабного исследования от поступления образцов из клиники до стадии консолидации информации по результатам проведенных исследований. В текущем году в нашу коллекцию образцов тканей пациентов с СМТ были включены поступившие от 34 пациентов наборы образцов опухолей, нормальной перитуморальной ткани и/или крови. Проведена актуализация клинических данных пациентов, включенных в исследование в 2023-2024гг. Для всех новых образцов опухолей проведена верификация гистологического диагноза и получены первичные культуры клеток СМТ, проведена оценка химиорезистентности опухолевых клеток этих культур к используемым в 1 и 2 линиях химиотерапии препаратам и их комбинациям. Проведено полногеномное секвенирование опухолевого материала и периферической крови от 21 пациента с СМТ с гистологическими типами: плеоморфная саркома, миксофибросаркома, липосаркома, и синовиальная саркома. Проведен биоинформатический анализ данных полногеномного секвенирования ДНК липосарком (n=13). Выявлено 13 генетических нарушений во всех опухолевых образцах пациентов с липосаркомами. Получены данные по различиям генетических нарушений в липосаркомах в зависимости от данных in vitro тестирования по чувствительности/резистентности к доксорубицину, ифосфамиду, доцетакселу, гемцитабину и 2-м их комбинациям. Выявленным отличием опухолевых клеток резистентных к комбинации доксорубицина и ифосфамида оказались мутации в генах POTEM и FOCAD. Показана потенциальная роль мутации гена ZNF442 в развитии резистентности к доцетакселу. Проведено секвенирование РНК единичных клеток 26 образцов опухолевой ткани пациентов с СМТ. Консолидация накопленных данных по 16 образцам ЛПС от 15 пациентов была использована для определения профиля экспрессии генов, лиганд-рецепторных взаимодействий, специфической активации сигнальных путей. Анализ данных секвенирования единичных клеток для выявления изменений транскриптомного ландшафта клеток липосарком с помощью теста дифференциальной экспрессии выявил ряд генов (IL7R, VWF, COL3A1, F13A1, PRKG1, HDC, HIST1H1B, IGKC, HRG), гиперэкспресированных в липосаркомах. Также на основе данных секвенирования РНК единичных клеток проведена кластеризации клеток образцов (n=42778) в 9 кластеров и охарактеризованы 3 основные кластера клеток лимфосарком (опухолевых, лимфоидных и миелоидных клеток) по специфическим изменениям уровней экспрессии генов, соответствующих изменений сигнальных путей и биологических процессов, а также по специфическим лиганд-рецепторным взаимодействиям. Проведен анализ эпигенетических изменений в опухолях пациентов с СМТ по уровню метилирования ДНК и по уровню посттрансляционных модификаций гистонов H3K36me3, H3K79me3, H3K9ac, H3K9me2, H3K27me3, H3K9me3, H4K20me3. Для ряда посттрансляционных модификаций показаны статистически значимые различия между разными типами СМТ. В 2025 г. проведена морфологическая и иммуногистохимическая характеристика микроокружения опухолевых клеток миксоидных (n=8), плеоморфных (n=4) и дедифференцированных (n=4) липосарком. По данным ИГХ во всех липосаркомах выявлена экспрессия маркера адипоцитов S-100b. Для дедифференцированных сарком выявлена высокая экспрессия белка Bcl2 и отсутствие Т-лимфоцитов в микроокружении, а в миксоидных и плеоморфных саркомах – инфильтрация Т-хелперами. Для всех типов исследованных сарком характерно наличие В-лимфоцитов и CD68 макрофагов в микроокружении. По данным проточной цитометрии липосаркомы характеризуются скудным микроокружением, в котором доминируют макрофаги. При этом в дедифференцированных липосаркомах отмечено снижение числа CD4+ Т-хелперов, CD86 М1- и CD163 М2-макрофагов. По данным ПЦР-РВ для миксоидных, плеоморфных и дедифференцированных липосарком характерна высокая экспрессия S100B и отсутствие экспрессии ECM1. Для дедифференцированных сарком характерны потеря экспрессии CD34 и снижение уровня экспрессии мРНК P16 на фоне повышенного уровня экспрессии MMP11, PI3K и MET. В миксоидных липосаркомах обнаружена высокая экспрессия фибронектина FN1. Показана роль мутации р53 в клетках СМТ в формировании резистентности к химиотерапии и возможность преодоления этой резистентности с помощью ингибирования активности STAT3 или Src нетоксичными дозами саракатиниба. Из первичных культур получена и охарактеризована клеточная линия UPS134, а также получено 6 новых стабильных линий СМТ с продолжительным ростом, прошедшие более 40 пассажей. При сравнительном анализе предикторной значимости тестирования химиорезистентности in vitro в условиях 2D- и 3D-культивирования показано, что условия культивирования влияют на индекс резистентности клеток к препаратам, но однонаправленное увеличение резистентности выявлено лишь при действии гемцитабина при 2D условиях. Плановые показатели по опубликованию результатов исследования в 2025г. выполнены. Научным коллективом исполнителей проекта опубликовано 4 статьи в журналах SCOPUS Q1 c импакт-факторами превышающими 4,8 и 2 статьи в российских журналах, индексируемых в SCOPUS. В настоящее время 1 статья находится на рассмотрении в журнале Scientific Reports (Nature publishing group), Q1 и одна статья в журнале Medical Sciences (MDPI), Q1. По результатам выполнения проекта в 2025г. представлены 7 докладов на 5 научных конференциях (2 российских и 3 международных).

Публикации

1. Копанцева Е., Торопов А., Иконников А., Меняйло М., Фетисов Т., Тарарыкова А., Кирсанов К., Якубовская М., Денисов Е. Single-cell analysis of tumor population diversity in synovial sarcoma Molecular cancer therapeutics, Proceedings of the AACR-NCI-EORTC International Conference on Molecular Targets and Cancer Therapeutics; 2025 Oct 22-26; Boston, MA. Philadelphia (PA): AACR; Mol Cancer Ther 2025;24(10 Suppl):Abstract nr A019. (год публикации - 2025)
10.1158/1535-7163.TARG-25-A019

2. Е.Копанцева, А.Иконников, М.Меняйло, Т.Фетисов, А.Коробейникова, К.Кирсанов, А.Тарарыкова, Б.Бохян, Н.Козлов, М.Якубовская, Е.Денисов Single-Cell Sequencing Reveals Novel Tumor Populations and Their Interplay with the Immune Microenvironment in a Pleomorphic Rhabdomyosarcoma International Journal of Molecular Sciences, J. Mol. Sci. 2025, 26, 11420. https://doi.org/10.3390/ijms262311420 (год публикации - 2025)
10.3390/ijms262311420

3. Е.А.Лесовая, Т.И.Фетисов, В.Ю.Бохян, М.А.Сенченко, Д.В.рогожин, В.П.Максимова, А.Н.Демко, Г.А.Белицкий, М.Г.Якубовская, К.И.Кирсанов Genetic Heterogeneity of Undifferentiated Pleomorphic Sarcoma: Is There Potential for Targeted Therapy? Cancers, Genetic Heterogeneity of Undifferentiated Pleomorphic Sarcoma: Is There Potential for Targeted Therapy? Cancers 2025, 17, 3613. https://doi.org/10.3390/cancers17223613 (год публикации - 2025)
10.3390/cancers17223613

4. Энар Джуманиязова, Анастасия Лохонина, Джулия Джалилова, Екатерина Мирошниченко, Анна Косырева, Тимур Фатхудинов The Role of Macrophages in Various Types of Tumors and the Possibility of Their Use as Targets for Antitumor Therapy Cancers, Cancers 2025, 17, 342. https:// doi.org/10.3390/cancers17030342 (год публикации - 2025)
10.3390/cancers17030342

5. А.Косырева, Э.Джуманиязова, А.Сентябрева, Е.Мирошниченко, Д.Джалилова, Т.Фетисов, А.Тарарыкова, А.Лохонина, Т.Фатхудинов Comparative Characterization of Tumor Microenvironments in Monophasic and Biphasic Synovial Sarcomas International Journal of Molecular Sciences, Int. J. Mol. Sci. 2025, 26, 10119. https://doi.org/10.3390/ijms262010119 (год публикации - 2025)
10.3390/ijms262010119

6. М. А. Сенченко, А. А. Тарарыкова, Н. А. Козлов, Т. И. Фетисов, К. И. Кирсанов, Д. В. Рогожин Синовиальная саркома: современный взгляд на основы патогенеза и терапевтические подходы Саркомы костей, мягких тканей и опухоли кожи, Саркомы костей, мягких тканей и опухоли кожи 2025;17(3):26–37. DOI: https://doi.org/10.17650/2219-4614-2025-17-3-26-37 (год публикации - 2025)
10.17650/2219-4614-2025-17-3-26-37

7. Штомпель П.А., Хазанова С.А., Трапезникова Е.С., Зиновьева В.Ю., Ловенгер А.А., Тарарыкова А.А., Бохян А.Ю., Хромова Н.В., Копнин П.Б., Фетисов Т.И., Якубовская М.Г., Кирсанов К.И Новая клеточная линия недифференцированной плеоморфной саркомы UPS134 для исследований in vitro и in vivo Российский биотерапевтический журнал (год публикации - 2026)