КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ
Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.
ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ
Номер проекта 23-24-00362
НазваниеУчастие каротиноидов в образовании активных форм кислорода и их взаимодействие со светособирающими пигмент-белковыми комплексами LH2 пурпурных серных бактерий.
Руководитель Большаков Максим Александрович, Кандидат биологических наук
Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное учреждение науки «Федеральный исследовательский центр «Пущинский научный центр биологических исследований Российской академии наук» , Московская обл
Конкурс №78 - Конкурс 2022 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований малыми отдельными научными группами»
Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни; 04-110 - Общая и молекулярная микробиология; вирусология
Ключевые слова Пурпурные фотосинтезирующие бактерии, светособирающие комплексы LH2, каротиноиды, бактериохлорофилл, активные формы кислорода, супероксидный анион-радикал, синглетный кислород.
Код ГРНТИ34.27.00
ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ
Аннотация
Проект посвящён изучению механизма открытой нами уникальной способности бактериальных каротиноидов - участвовать в фотообразовании активных форм кислорода (АФК). АФК способны взаимодействовать с множеством мишеней в клетке, включая белки, пигменты, липиды и т.д., нарушая их структуру и, соответственно, функции. У фотосинтезирующих бактерий, по общепринятому мнению, АФК образуются при получении энергии молекулой кислорода от возбужденной молекулы фотосенсибилизатора, которым является бактериохлорофилл (БХл). Однако, недавние исследования (Москаленко и Махнева, 2007; Махнева и др., 2009; Makhneva et al., 2021) показали, что эта концепция нуждается в корректировке. Предположено, что каротиноиды способны генерировать АФК, в том числе синглетный кислород, которые и окисляют БХл850, что нашло подтверждение с помощью тушителей синглетного кислорода, которые ингибировали фотоокисление БХл850 на сине-зелёном свету (Москаленко и Махнева, 2007; Махнева и др., 2009; Makhneva et al., 2021).
В ходе реализации проекта с помощью разработанных нами методов и подходов будут впервые получены данные о механизме генерации АФК с участием каротиноидов. Работа будет проводиться на светособирающих комплексах LH2, выделенных из клеток Allochromatium (Alc.) vinosum, Ectothiorhodospira (Ect.) haloalkaliphila и т.д., как с нативным, так и с модифицированным каротиноидным составом. Будет определено как количественный и качественный каротиноидный состав комплексов LH2 и содержание кислорода в среде влияют на фотоокисление БХл850, образование АФК и их взаимодействие с компонентами комплексов LH2. Будет выявлено, какие отдельные каротиноиды, встроенные в комплекс LH2, способны наиболее эффективно генерировать АФК и вызывать окисление БХл850 и другие повреждения комплексов. Будет исследована возможность взаимодействия АФК как с пигментами, так и с белками, входящими в состав комплексов LH2. По изменению гидратационного радиуса комплексов LH2 и температурной зависимости вязкости их раствора будут оценены происходящие структурные перестройки в белковой части комплексов LH2.
Совокупность полученных результатов позволит развить нашу гипотезу о генерации АФК бактериальными каротиноидами, что будет существенным фундаментальным вкладом в эту область биологии и расширит наши представления о свойствах бактериальных каротиноидов.
ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ
Публикации
1. Яныкин Д.В., Пасхин М.О., Ашихмин А.А., Большаков М.А. Carotenoid-dependent singlet oxygen photogeneration in light-harvesting complex 2 of Ectothiorhodospira haloalkaliphila leads to the formation of organic hydroperoxides and damage to both pigments and protein matrix PeerJ (год публикации - 2024)
2. Большаков М.А., Ашихмин А.А., Яныкин Д.А., Стародубов А.С., Пасхин М.О. УЧАСТИЕ КАРОТИНОИДОВ В ОБРАЗОВАНИИ АКТИВНЫХ ФОРМ КИСЛОРОДА И ИХ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ СО СВЕТОСОБИРАЮЩИМИ ПИГМЕНТ-БЕЛКОВЫМИ КОМПЛЕКСАМИ LH2 ПУРПУРНОЙ СЕРНОЙ БАКТЕРИИ ECTOTHIORHODOSPIRA (ECT.) HALOALKALIPHILA X СЪЕЗД РОССИЙСКОГО ФОТОБИОЛОГИЧЕСКОГО ОБЩЕСТВА КОНФЕРЕНЦИЯ «СОВРЕМЕННЫЕ ПРОБЛЕМЫ ФОТОБИОЛОГИИ», X Съезд Российского фотобиологического общества. Конференция «Современные проблемы фотобиологии». Материалы съезда. Пущино: ФИЦ ПНЦБИ РАН, 2023. – 300 с. (год публикации - 2023)
3. Яныкин Д.В., Пасхин М.О., Шуменко С.А., Ашихмин А.А., Большаков М.А. Effect of Carotenoid Composition on Stability and Light-Induced Oxidative Damage of the LH2 Complexes Isolated from Ectothiorhodospira Haloalkaliphila MDPI (год публикации - 2025)
4. Большаков М.А., Яныкин Д.В. УЧАСТИЕ КАРОТИНОИДОВ В ОБРАЗОВАНИИ АКТИВНЫХ ФОРМ КИСЛОРОДА И ИХ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ СО СВЕТОСОБИРАЮЩИМИ ПИГМЕНТ-БЕЛКОВЫМИ КОМПЛЕКСАМИ LH2 ПУРПУРНЫХ СЕРНЫХ БАКТЕРИЙ Коллектив авторов © Федеральное государственное бюджетное учреждение науки «Федеральный исследовательский центр «Пущинский научный центр биологических исследований Российской академии наук» (год публикации - 2024)
Аннотация результатов, полученных в 2024 году
Ингибирование биосинтеза каротиноидов при выращивании клеток Ect. haloalkaliphila в присутствии 71 и 36 ДФА привело к сборке LH2-комплексов с почти полной потерей окрашенных каротиноидов и с 50% сборкой краотиноидов, соответственно. Препараты ДФА-LH2 содержали следовые количества нейроспорина, ζ-каротина, фитоина и фитофлуина. Инкубация препаратов ДФА-LH2 в присутствии очищенных нейроспорина, сфероидена или родопина приводила к встраиванию каротиноидов в светособирающие комплексы и образованию соответствующих комплексов LH2-каротиноид (LH2-Neu (+нейроспорин), LH2-Sph (+сфероиден) или LH2-Rho (+ родопин), соответственно). Эффективность встраивания нейроспорина, сфероидена или родопина составила 86%, 52% или 72%, соответственно. Каротиноидный состав полученных препаратов был следующим. ДФА-LH2-со встроенным нейроспорином: 0,07, 6,78 и 0,02 молекул ликопина, нейроспорина и ζ-каротина на один комплекс LH2 соответственно; ДФА-LH2-со встроенным сфероиденом: 4,16 молекул сфероидена на один комплекс LH2; ДФА-LH2-со встроенным родопином: 0,22, 5,46 и 0,07 молекул дидегидрородопина, родопина и спириллоксантина на один комплекс LH2 соответственно; LH2 с 50% содержанием каротиноидов: 0,4, 0,4, 1,2, 1,3 0,7 молекул дидегидрородопина, родопина, спириллоксантина, ангидрородовибрина и ликопина, соответственно.
Известно, что повреждение белков обычно сопровождается изменением их флуоресцентных свойств. Однако светоиндуцированные изменения интенсивности флуоресценции белкового компонента препаратов ДФА-LH2 были незначительными, как и LH2-Neu и LH2-Sph. LH2-Rho продемонстрировал небольшое увеличение интенсивности флуоресценции белкового компонента. Обнаружено, что при освещении сине-зеленым светом (375˃λ˃600 нм) всех препаратов комплексов LH2 из Ect. haloalkaliphila не происходит фотоиндуцированного образования перикиси водорода и суперокидного анион-радикала.
Освещение (20 мин, 375 > λ > 600 нм, область поглощения каротиноидов) препаратов LH2 приводило к изменению спектра поглощения. Было показано фотовыцветание полосы БХл850 и появление полосы 3-ацетил-хлорофилла в препаратах LH2-контроль. Спектр поглощения препаратов LH2 без каротиноидов не претерпевает существенных изменений после освещения. Показано, что освещение комплексов LH2, выделенных из Ect. Haloalkaliphila, в область поглощения каротиноидов приводит к фотопоглощению молекулярного кислорода со скоростью 993 мкмоль O2 (мкмоль LH2)-1 ч-1 в первую минуту непрерывного освещения. У комплексов со встроенными каротиноидами (сфероиден и нейроспорин) фотопоглощение молекулярного кислорода зарегистрировано не было, отметим, что в комплексах LH2 со встроенным родопином отмечено небольшое фотопоглощение кислорода, но разрешающая способность установки не позволила достоверно его зарегистрировать.
Общее количество гидропероксидов (R-OOH) в образцах возрастало с увеличением времени освещения и своего максимального количества они достигали к 20-й минуте, за чем следовало снижение их концентрации. Было выявлено два типа органических гидропероксидов, образующихся при освещении (20 мин, 375 > λ >600 нм) препаратов LH2-контроль: высоколипофильные (LP-OOH, 11,4 молекул на один LH2) и относительно гидрофобные (HP-OOH, 70 на один LH2). Однако фотообразование R-OOH в препаратах ДФА-LH2 не обнаружено. Добавление бенгальского розового (RB, фотосенсибилизатор, генерирующий синглетный кислород) перед облучением контрольных образцов LH2 не приводило к увеличению фотопродукции R-OOH. RB снижал фотопродукцию LP, не влияя на HP, что согласуется с ранее полученными данными. Более того, RB не увеличивал фотообразование R-OOH в других препаратах (ДФА-LH2, LH2-Neu, LH2-Sph или LH2-Rho). С одной стороны, это может указывать на то, что молекулы-предшественники гидропероксида не образуются в LH2 из-за действия ДФА. С другой стороны, встраивание каротиноидов в LH2 не способствует их появлению.
Освещение сине-зеленым светом препаратов комплексов ДФА-LH2, выделенных из Ect. haloalkaliphila, а также комплексов со встроенными каротиноидами (сфероиден и нейроспорин) не приводило к изменениям гидроционного радиуса комплексов. Комплексы ДФА-LH2 со встроенными родопином при освещении увеличивались (приблизительно на 10-15%) с 9 нм до 10-10,5 нм), однако анализ не выявил статистически значисых изменений. Что коррелирует с полученными данными по фотовыцветанию БХл и фотообразованию органических гидропероксидов. Известно, что окислительное повреждение белковых частиц (в том числе в результате действия активных форм кислорода) сопровождается изменением ζ-потенциала. Обработка ДФА приводит к сдвигу ζ-потенциала коллоида LH2 примерно от -30 мВ до -12 мВ. Повторное встраивание каротиноидов смягчает этот эффект. Эти данные свидетельствуют о существенном влиянии каротиноидов на поверхностный заряд белков комплекса, что может иметь большое значение для функционирования антенного комплекса in vivo. Термическая стабильность комплексов LH2 без каротиноидов значительно снижена. Если в препаратах LH2-контроль тепловой переход начинался при ≈50⁰C, то в препаратах ДФА-LH2 такой переход наблюдался уже при 31-33⁰C, что указывает на нестабильность комплексов. Удивительно, но встраивание родопина, а также нейроспорина, сфероидена не повысило температуры перехода состояния комплексов. Предварительное освещение препаратов ДФА-LH2, LH2-Neu, LH2-Sph и LH2-Rho не привело к какому-либо дополнительному сдвигу точки перехода в область более низких температур.
Таким образом, наши данные свидетельствуют о том, что каротиноиды, с одной стороны, стабилизируют комплексы LH2, а с другой стороны, участвуют в светоиндуцированном окислительном повреждении LH2, вероятно, за счет окислительно-восстановительной активности синглетного кислорода, а родопин может быть одним из каротиноидов, способных участвовать в генерации синглетного кислорода в препаратах LH2-контроля.
Публикации
1. Яныкин Д.В., Пасхин М.О., Ашихмин А.А., Большаков М.А. Carotenoid-dependent singlet oxygen photogeneration in light-harvesting complex 2 of Ectothiorhodospira haloalkaliphila leads to the formation of organic hydroperoxides and damage to both pigments and protein matrix PeerJ (год публикации - 2024)
2. Большаков М.А., Ашихмин А.А., Яныкин Д.А., Стародубов А.С., Пасхин М.О. УЧАСТИЕ КАРОТИНОИДОВ В ОБРАЗОВАНИИ АКТИВНЫХ ФОРМ КИСЛОРОДА И ИХ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ СО СВЕТОСОБИРАЮЩИМИ ПИГМЕНТ-БЕЛКОВЫМИ КОМПЛЕКСАМИ LH2 ПУРПУРНОЙ СЕРНОЙ БАКТЕРИИ ECTOTHIORHODOSPIRA (ECT.) HALOALKALIPHILA X СЪЕЗД РОССИЙСКОГО ФОТОБИОЛОГИЧЕСКОГО ОБЩЕСТВА КОНФЕРЕНЦИЯ «СОВРЕМЕННЫЕ ПРОБЛЕМЫ ФОТОБИОЛОГИИ», X Съезд Российского фотобиологического общества. Конференция «Современные проблемы фотобиологии». Материалы съезда. Пущино: ФИЦ ПНЦБИ РАН, 2023. – 300 с. (год публикации - 2023)
3. Яныкин Д.В., Пасхин М.О., Шуменко С.А., Ашихмин А.А., Большаков М.А. Effect of Carotenoid Composition on Stability and Light-Induced Oxidative Damage of the LH2 Complexes Isolated from Ectothiorhodospira Haloalkaliphila MDPI (год публикации - 2025)
4. Большаков М.А., Яныкин Д.В. УЧАСТИЕ КАРОТИНОИДОВ В ОБРАЗОВАНИИ АКТИВНЫХ ФОРМ КИСЛОРОДА И ИХ ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ СО СВЕТОСОБИРАЮЩИМИ ПИГМЕНТ-БЕЛКОВЫМИ КОМПЛЕКСАМИ LH2 ПУРПУРНЫХ СЕРНЫХ БАКТЕРИЙ Коллектив авторов © Федеральное государственное бюджетное учреждение науки «Федеральный исследовательский центр «Пущинский научный центр биологических исследований Российской академии наук» (год публикации - 2024)
Возможность практического использования результатов
Результаты, которые полученные в данной работе, позволяют расширить современные представления о механизмах функционирования бактериального фотосинтетического аппарата и будут полезны при конструировании искусственных фотосистем и создания на их основе альтернативных источников энергии в будущем.