КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер проекта 23-23-00387

НазваниеДизайн монолигандных комплексов с помощью методов машинного анализа кристаллоструктурных данных

Руководитель Шевченко Александр Петрович, Кандидат химических наук

Организация финансирования, регион федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Самарский государственный технический университет" , Самарская обл

Конкурс №78 - Конкурс 2022 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований малыми отдельными научными группами»

Область знания, основной код классификатора 03 - Химия и науки о материалах; 03-705 - Хемоинформатика

Ключевые слова дизайн кристаллов, лиганды, металлы-комплексообразователи, монолигандные координационные соединения, металл-органические координационные полимеры, структурные строительные блоки, топологический тип, базы знаний, интеллектуальные системы

Код ГРНТИ31.01.77


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Целью проекта является машинный прогноз кристаллического строения координационных соединений и металлорганических координационных полимеров (МОКП), в их числе, на основании данных о структурно охарактеризованных монолигандных комплексах (более 35 тыс. структурных исследований) и их структурных строительных блоках (ССБ), а также изучение влияния ССБ на характеристики свободного пространства кристалла. В качестве ССБ будут рассмотрены атомы металлов-комплексообразователей, лиганды, а также сольваты и гостевые молекулы, которые не связаны с атомом металла. Для решения этой задачи будут отобраны из баз данных ICSD (Inorganic Crystal Structure Database) и CSD (Cambridge Structural Database) качественно определенные кристаллические структуры монолигандных координационных соединений (МКС) и будет проверен баланс ионных зарядов ССБ в них. Степени окисления атомов металлов и величины ионных зарядов лигандов, сольватов, гостевых молекул будут использованы в качестве электронных дескрипторов при построении прогностических схем (моделей). Расчета геометрико-топологических характеристик МКС и ССБ будет выполнен с помощью созданного нами ранее программного комплекса ToposPro. При этом будут использованы топологические базы знаний (TTD, TTO, TTA, TTL, TTM) для хранения и обработки информации, программа SaCryDes и веб-сервис TopCryst для анализа и поиска закономерностей в данных. Все эти программные средства были разработаны в рамках Мегагранта Правительства РФ № 14.В25.31.0005, а также проектов РФФИ 13-07-00001, 14-03-97034, 17-57-10001, 18-07-00183 и 18-29-04010. Информация о дескрипторах МКС и ССБ будет собрана в системе управления объектно-реляционными базами данных PostgreSQL, что упростит работу с объемными данными и позволит организовать удаленный доступ к ним через веб-сервис. Программная среда Python будет использована для машинного обучения и тестирования модели, оценивающей результаты сборки кристаллической структуры из заданного набора ССБ и прогнозирующей свойства ее свободного пространства. Корректность разработанной модели будет проверена прогнозом строения не менее 20 новых структур, состоящих из заданного набора ССБ, их виртуальной сборкой с помощью программных конструкторов и последующими расчетами их устойчивости и пористости. Будет создан веб-сервис, позволяющий пользователям удаленно обращаться к базам знаний ССБ и использовать их, совместно с разработанными нами прогностическими схемами, для практического дизайна МКС и оценки их пористости. Такая возможность будет предоставлена пользователю впервые.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


 

Публикации

1. М. И. Смольков, Е. Д. Барабанова, У. С. Плотник, А. П. Шевченко Mining Knowledge from Crystal Structures of Homoleptic Complexes: Oxidation States of Metal Atoms Pattern Recognition and Image Analysis, 2024, Vol. 34, No. 3, pp. 877–891. (год публикации - 2024)
10.1134/S1054661824700779


Аннотация результатов, полученных в 2024 году
Для известных структур монолигандных координационных и ионных соединений обновлена база данных структурных строительных блоков. Для каждого их вида рассчитаны и внесены в базу данных геометрические и топологические дескрипторы. Подготовленная информация была использована для статистического анализа свойств структурных строительных блоков, классификации механизмов топологической сборки структур монолигандных координационных соединений, а также при создании дашборда (https://datalens.yandex/1l4332hz1k2co?state=d90e2284764) для анализа адсорбционных свойств кристаллических структур. Данные о структурных строительных блоках монолигандных координационных соединений доступны через веб-сервисы сайта https://topcryst.com/index.php.

 

Публикации

1. М. И. Смольков, Е. Д. Барабанова, У. С. Плотник, А. П. Шевченко Mining Knowledge from Crystal Structures of Homoleptic Complexes: Oxidation States of Metal Atoms Pattern Recognition and Image Analysis, 2024, Vol. 34, No. 3, pp. 877–891. (год публикации - 2024)
10.1134/S1054661824700779


Возможность практического использования результатов
Создание новых материалов и метаматериалов с нужными оптическими, каталитическими и адсорбционными свойствами, а также для нужд микроэлектроники. Сокращение срока создания новых материалов благодаря использованию хранилищ данных и систем искусственного интеллекта, локализованных в России. Прогноз оптических и колебательных спектров координационных соединений для их научных исследований и поиска в межзвездной среде. Обучение с использованием подготовленных в ходе проведенного исследования выборок студентов-химиков машинному анализу данных и продуктивному использованию накопленной информации в их работе.