КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ
Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.
ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ
Номер проекта 22-23-01118
НазваниеСпецифические взаимодействия при молекулярном узнавании пептидов различной структуры с фрагментами нуклеиновых кислот в жидких средах как основа их биологической функции
Руководитель Баранников Владимир Петрович, Доктор химических наук
Организация финансирования, регион федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт химии растворов им. Г.А. Крестова Российской академии наук , Ивановская обл
Конкурс №64 - Конкурс 2021 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований малыми отдельными научными группами»
Область знания, основной код классификатора 03 - Химия и науки о материалах; 03-404 - Растворы, расплавы – структура и свойства
Ключевые слова Пептиды, нуклеиновые основания, межмолекулярное взаимодействие, мицеллы, калориметрия, денсиметрия, динамическое светорассеяние, квантово-химическое моделирование, молекулярная динамика
Код ГРНТИ31.15.21
ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ
Аннотация
Проект посвящен изучению специфических взаимодействий пептидов как модельных соединений протеинов с основаниями нуклеиновых кислот как составными фрагментов нуклеиновых кислот, анализу баланса межмолекулярных взаимодействий в зависимости от химической структуры пептида. В результате выполнения проекта будут впервые получены термодинамические характеристики взаимодействия в водных буферных растворах пептидов (Gly-Phe, GlyTyr, Car), содержащих в боковой цепи различные функциональные группы, с модельными соединениями РНК (основаниями нуклеиновых кислот). Будет проведен анализ влияния природы, структуры и зарядового типа реагирующих веществ на термодинамические характеристики процессов межчастичных взаимодействий в трехкомпонентных растворах. Будут установлены основные закономерности влияния молекулярной структуры пептидов на процессы образования комплексов в системах с нуклеиновыми основаниями. Планируется разработать основные критерии комплексообразования и поведения реагентов в условиях усложнения структуры исходных молекул и изменения кислотности среды. Будут найдены наиболее вероятные конфигурации комплексов пептидов с нуклеиновыми основаниями, изучен энергетический вклад водородного связывания и стэкинг-взаимодействия в комплексах. Будет изучено влияние мицеллярной среды, приближающей условия существования реагентов к билогическим средам, на закономерности взаимодействия пептидов с нуклеиновыми основаниями.
ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ
Публикации
1. Баранников В.П., Тюнина Е.Ю., Тарасова Г.Н., Ставнова А.А. EFFECT OF COMPLEX FORMATION ON VOLUME PROPERTIES OF URACIL IN BUFFER SOLUTIONS WITH GLYCYL-L-TYROSINE AT VARIOUS TEMPERATURES XXIII International Conference on Chemical Thermodynamics in Russia, August 22-27, 2022, Kazan, Russia, 2022, P.177 (год публикации - 2022)
2.
Смирнов В.И., Баранников В.П.
Thermochemical characteristics of some glycylpeptides interaction with anionic micelles in a phosphate-buffered saline solution of sodium dodecyl sulfate
The Journal of Chemical Thermodynamics, V.174, 106853 (год публикации - 2022)
10.1016/j.jct.2022.106853
3.
Баранников В.П., Тюнина Е.Ю.
REGULARITIES OF CHANGES IN THERMODYNAMIC PARAMETERS INDUCED BY THE COMPLEXES FORMATION OF URACIL WITH SOME AROMATIC AMINO ACIDS IN A BUFFER SOLUTION AT PH 7.4
ChemChemTech [Izv. Vyssh. Uchebn. Zaved. Khim. Khim. Tekhnol.], V. 65, 10, P.38-46 (год публикации - 2022)
10.6060/ivkkt.20226510.6673
4. Баранников В.П., Колтышев Д.Р., Смирнов В.И., Межевой И.Н. THERMODYNAMICS OF INTERACTION BETWEEN SOME PEPTIDES AND NUCLEIC ACID BASES: URACIL AND CYTOSINE XXIII International Conference on Chemical Thermodynamics in Russia, August 22-27, 2022, Kazan, Russia, 2022, P.178 (год публикации - 2022)
Публикации
1.
Владимир П. Баранников, Валерий И. Смирнов, Игорь Н. Межевой, Дамир Р. Колтышев
Thermochemical Study of the Interaction of Cytosine and Uracil with Peptides in a Buffered Saline: Complex Formation with beta-Endorphin 30-31 (Human), L-Glutathion (Reduced) and -L-Alanyl-L-Tyrosine
International Journal o f Molecular Sciences, V. 24, article number 9764. (год публикации - 2023)
10.3390/ijms24119764
2.
В.П. Баранников, Е.Ю. Тюнина, Г.Н. Тарасова
Changes in the volumetric properties of uracil in a buffered saline upon interaction with peptides: The effect of glycyl-L-tyrosine and glycyl-L-glutamic acid
The Journal of Chemical Thermodynamics, V. 185, article number 107113 (год публикации - 2023)
10.1016/j.jct.2023.107113
3.
М.С. Курбатова, В.П. Баранников
Комплексы ионизированных дипептидов глицил-L-глутамиловой ки-слоты и аланил-L-тирозина с нуклеиновыми основаниями пиримидинового ряда
Журнал структурной химии / Journal of Structural Chemistry, Т.64, №11, 118607 (год публикации - 2023)
10.26902/JSC_id118607
4. Колтышев, Д. Р. Межевой, И. Н. Баранников, В. П. ТЕРМОХИМИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ КОМПЛЕКСООБРАЗОВАНИЯ ГЛУТАТИОНА С УРАЦИЛОМ И ЦИТОЗИНОМ В БУФЕРНОМ ФИЗИОЛОГИЧЕСКОМ РАСТВОРЕ тезисы докладов XXXIII Российской молодежной научной конференции с международным участием, Екатеринбург : Издательство Уральского университета, 2023., тезисы докладов XXXIII Российской молодежной научной конференции с международным участием, Екатеринбург : Издательство Уральского университета, 2023. — C. 256. (год публикации - 2023)
5. Колтышев, Д. Р. Межевой, И. Н. Баранников, В. П. ТЕРМОХИМИЧЕСКОЕ ИССЛЕДОВАНИЕ КОМПЛЕКСООБРАЗОВАНИЯ ГЛУТАТИОНА С УРАЦИЛОМ И ЦИТОЗИНОМ В БУФЕРНОМ ФИЗИОЛОГИЧЕСКОМ РАСТВОРЕ тезисы докладов XXXIII Российской молодежной научной конференции с международным участием, Екатеринбург, 24-27 апреля 2023 года — Екатеринбург : Издательство Уральского университета, 2023. — C. 256. (год публикации - 2023)