Роль изоформ фактора инициации трансляции eIF4E в восприимчивости картофеля к вирусу Y

КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ

Номер проекта 21-76-10050

НазваниеРоль изоформ фактора инициации трансляции eIF4E в восприимчивости картофеля к вирусу Y

Руководитель Злобин Николай Евгеньевич, Кандидат биологических наук

Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной биотехнологии" , г Москва

Конкурс №61 - Конкурс 2021 года «Проведение исследований научными группами под руководством молодых ученых» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными

Область знания, основной код классификатора 06 - Сельскохозяйственные науки; 06-104 - Агробиотехнологии

Ключевые слова Устойчивость растений к биотическому стрессу, фактор восприимчивости, фактор устойчивости, eIF4E, вирус Y картофеля

Код ГРНТИ68.37.07

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ

Аннотация
Вирусные заболевания растений наносят огромный вред сельскому хозяйству. Одной из причин их высокой вредоносности является неэффективность применения химических методов для борьбы с вирусами, являющимися облигатными внутриклеточными паразитами. Наиболее эффективным и экономически выгодным методом борьбы с вирусными заболеваниями является создание устойчивых сортов. Важнейшая незерновая сельскохозяйственная культура – картофель – является особенно восприимчивой к вирусным заболеваниям, поскольку вследствие вегетативного размножения накапливает большое количество различных вирусов, наиболее вредоносным из которых является вирус Y картофеля (PVY). Этот вирус способен вызывать снижение урожайности картофеля на 80% и более. PVY относится к группе Потивирусов. Для трансляции потивирусной РНК в клетке необходимо связывание вирусного белка VPg, ковалентно соединенного с 5'-концом этой РНК, с фактором инициации трансляции eIF4E растения-хозяина. В растениях содержится несколько изоформ факторов инициации трансляции eIF4E. Изоформы eIF4E, используемые потивирусом для трансляции собственной РНК, различаются для разных систем вирус-растение. Какая изоформа (изоформы) eIF4E используются PVY для заражения растений картофеля, к настоящему моменту не установлено. В рамках проекта с помощью нескольких взаимодополняющих подходов будет установлена роль изоформ eIF4E картофеля при заражении PVY. Достижение этой цели не только позволит получить фундаментальные знания о взаимодействии картофеля с PVY и растений с потивирусами в целом, но и является необходимым для разработки подхода к получению устойчивых к PVY форм картофеля с помощью геномного редактирования определенных изоформ факторов инициации трансляции eIF4E путем введения в них модификаций, препятствующих взаимодействию с VPg PVY.

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ

Публикации

1. Злобин Н.Е., Таранов В.В. Plant eIF4E isoforms as factors of susceptibility and resistance to potyviruses Frontiers in Plant Science, Frontiers in Plant Science 14 (2023) (год публикации - 2023)
10.3389/fpls.2023.1041868

2. Антипов А.Д., Злобин Н.Е. THE EFFICIENCY OF VARIOUS DNA POLYMERASES FOR AMPLIFICATION OF LONG SEQUENCES FROM GENOMIC DNA AND CDNA OF CULTIVATED POTATO Applied Biochemistry and Microbiology (переводная версия журнала Прикладная Биохимия и Микробиология) (год публикации - 2023)

3. Рогозина Е.В., Гурина А.А. Распространение мозаичных вирусов картофеля на растениях секции Petota Dumort. рода Solanum L. в коллекции ВИР Труды по прикладной ботанике, генетике и селекции, т. 184, вып. 2 (год публикации - 2023)

4. Рогозина Е.В., Гурина А.А. Distribution of potato mosaic viruses on plants of the Petota Dumort. section of Solanum L. in the VIR collection Proceedings on applied botany, genetics and breeding, 184(2), 2023, стр. 227-234 (год публикации - 2023)

5. Антипов А.Д., Злобин Н.Е. The Efficiency of Various DNA Polymerases for Amplification of Long Sequences from Genomic DNA and cDNA of Cultivated Potatoes Applied Biochemistry and Microbiology, Vol. 59, No. 4, pp. 522–529 (год публикации - 2023)
10.1134/S0003683823040026

6. Злобин Н.Е., Таранов В.В. Plant eIF4E isoforms as factors of susceptibility and resistance to potyviruses Frontiers in Plant Science, 14 (2023): 1041868 (год публикации - 2023)

7. Корчинская В.Ю., Карлов В.Д., Клычников О.И. Optimization of recombinant viral protein VPg expression in heterological Escherichia coli system and its purification FEBS Open Bio (год публикации - 2024)

8. Карлов В.Д., Корчинская В.Ю., Клычников О.И. Метод количественной детекции изоформ факторов инициации трансляции 4E в тканях листа картофеля методом мониторинга множественных реакций Journal of Analytical Chemistry (год публикации - 2024)

9. Корчинская В.Ю., Карлов В.Д., Клычников О.И. Identification of eIF4E isoforms in the multisubunit translation initiation complex of the potato virus Y (PVY) PLANT GENETICS, GENOMICS, BIOINFORMATICS, AND BIOTECHNOLOGY (PLANTGEN2023), c.47, ISBN 978-5-9690-1133-5 (год публикации - 2023)

10. А.Д. Антипов, Н.Е. Злобин, А.А. Гурина, Е.В. Рогозина КОРРЕЛЯЦИЯ МЕЖДУ УСТОЙЧИВОСТЬЮ РАСТЕНИЙ ДИКОГО ВИДА КАРТОФЕЛЯ S.CHACOENCE К ВИРУСУ Y И НАЛИЧИЕМ ДНК МАРКЕРОВ НА ГЕН УСТОЙЧИВОСТИ RYCHC V Всероссийский конгресс по защите растений. Сборник тезисов докладов, с 321 ISBN 978-5-6051655-2-1 (год публикации - 2024)

11. Карлов В.Д., Корчинская В.Ю., Клычников О.И. Development of MRMbased assay for the absolute quantitation of eIF4E isoforms in potato leaf tissue FEBS Open Bio (год публикации - 2024)

12. Антипов А.Д., Злобин Н.Е. Identification of polymorphisms in the eIF4E genes of wild potato species «Генетика, Геномика, Биоинформатика и Биотехнология растений» (PlantGen 2023). Сборник тезисов, c. 47 ISBN 978-5-9690-1133-5 (год публикации - 2023)

Публикации