КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер проекта 21-74-20134

НазваниеИзучение действия белков высокопатогенных вирусов на клетки: эффекты вирусных белков и компенсаторные реакции клетки

Руководитель Шеваль Евгений Валерьевич, Доктор биологических наук

Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Московский государственный университет имени M.В.Ломоносова» , г Москва

Конкурс №51 - Конкурс 2021 года по мероприятию «Проведение исследований на базе существующей научной инфраструктуры мирового уровня» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными

Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни; 04-205 - Клеточная биология, цитология, гистология

Ключевые слова вирусы, ВИЧ, SARS-CoV-2, клетка, пролиферация, транскрипция, репарация

Код ГРНТИ34.25.29


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
При вирусных инфекциях развитие некоторых патологических процессов связано не столько с прямым действием вирусных белков, сколько с ответными реакциями клетки, которые могут выходить за рамки защитных, приводя к губительным последствиям для организма. Настоящий проект посвящен изучению эффектов вирусных белков на клетки и компенсаторных реакций клетки. Исследования будут сосредоточены на двух различных белках патогенных вирусов человека. Во-первых, будут изучаться эффекты Tat белка вируса иммунодефицита человека на культивируемые лимфоциты. Tat белок способствует развитию В-клеточных лимфом у ВИЧ-инфицированных пациентов, что, по-видимому, связано с модификацией клеточных процессов в неинфицированных клетках под действием Tat белка, секретируемого инфицированными клетками. Во-вторых, будут анализироваться эффекты нуклеокапсидного белка SARS-CoV-2 на клетку. Широко распространённые циркулирующие коронавирусы человека вызывают легкие респираторные заболевания с преимущественным поражением верхних дыхательных путей. В отличии от них высокопатогенные коронавирусы (SARS-CoV, MERS-CoV и SARS-CoV-2) способны инфильтрировать нижние отделы дыхательного тракта и приводить к серьезным поражениям тканей легкого. Какие особенности высокопатогенных вирусов человека приводят к развитию тяжелых респираторных заболеваний, часто приводящих к смерти пациента, понятно плохо. Сравнительный анализ геномов низкопатогенных и высокопатогенных вирусов показал, что отличительной особенностью высокопатогенных вирусов является наличие кластеров положительно заряженных аминокислот в составе нуклеокапсидного (N) белка. Эти кластеры могут играть роль сигналов ядерной локализации, что может влиять на особенности взаимодействия нуклеокапсидного белка с компонентами клетки. Целью проекта является сравнительное изучение взаимодействия с компонентами клетки нуклеокапсидных белков низко- и высокопатогенных коронавирусов человека. Это позволит определить, какие свойства нуклеокапсидных белков влияют на особенности протекания болезни у высокопатогенных коронавирусов, выявить клеточные процессы, которые изменяются под действием нуклеокапсидного белка. Это может послужить основой для поиска новых способов терапии COVID-19.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


 

Публикации

1. Курнаева М.А., Залевский А.О., Арифулин Е.А., Лисицына О.М., Творогова А.В., Шубина М.Ю., Буренков Г.П., Тихомирова М.А., Поташникова Д.М., Качалова А.И., Мусинова Я.Р., Головин А.В., Васецкий Е.С., Шеваль Е.В. Molecular coevolution of nuclear and nucleolar localization signals inside basic domain of HIV-1 Tat Journal of Virology (год публикации - 2022)
10.1128/JVI.01505-21

2. Курнаева М.А., Залевский А.О., Арифулин Е.А., Лисицына О.М., Творогова А.В., Шубина М.Ю., Буренков Г.П., Мусинова Я.Р., Головин А.В., Васецкий Е.С., Шеваль Е.В. Молекулярная коэволюция сигналов ядерной и ядрышковой локализации в составе основного домена Tat белка вируса иммунодефицита человека III Объединенный научный форум физиологов, биохимиков и молекулярных биологов. VII Съезд биохимиков россии. X Российский симпозиум «Белки и пептиды». VII Съезд физиологов СНГ (Сочи, Дагомыс, 3–8 октября 2021). Научные труды. Том 2., М.: Издательство «Перо», 2021. – 313 с. (год публикации - 2021)

3. Валяева А.А., Жарикова А.А., Шеваль Е.В. SARS-CoV-2 cellular tropism and direct multiorgan failure in COVID-19 patients: bioinformatic predictions, experimental observations, and open questions Cell Biology International (год публикации - 2022)
10.1002/cbin.11928

4. Шеваль Е.В. Молекулярная коэволюция сигнальных последовательностей в составе Tat белка вируса иммунодефицита человека Материалы Юбилейной научной конференции «Николай Константинович Кольцов и биология XXI века», М. Издательство Перо, 2022. (год публикации - 2022)

5. Тихомирова М.А., Валяева А.А., Жарикова А.А., Богомазова А.Н., Мусинова Я.Р., Миронов А.А., Васецкий Е.С., Шеваль Е.В. Изучение эффектов Tat белка вируса иммунодефицита человека с использованием клеточных моделей “Коллекции культур клеток человека и животных: современные вызовы и сетевые решения”, сборник тезисов докладов Всероссийской школы-конференции, СПб.: ПОЛИТЕХ-ПРЕСС, 2022 (год публикации - 2022)

6. Валяева А.А., Жарикова А.А., Миронов А.А., Шеваль Е.В. Поиск и изучение полу-экстрагируемых РНК Информационные технологии и системы (ИТиС'22), Информационные технологии и системы (ИТиС'22), Москва, Огниково, Россия (год публикации - 2022)

7. Поташникова Д.М., Сотникова Т.Н., Широкова О.М., Зайратьянц О.В., Васильева Е.Ю., Шеваль Е.В. Cilia impairment in bronchial epithelial cells detected in autopsy material of SARS-CoV-2-infected patient Ultrastructural Pathology, 47(5):382-387 (год публикации - 2023)
10.1080/01913123.2023.2222167

8. Тихомирова М.А., Кузьменко О.Л., Арифулин Е.А., Мусинова Я.Р., Шеваль Е.В. Сравнительный анализ способности нуклеокапсидных белков низко и высоко патогенных коронавирусов к индукции цитоплазматических биомолекулярных конденсатов Cборник материалов конференции и Школы-конференции «Коллекции культур клеток человека и животных: современные вызовы и сетевые решения», стр. 134 (год публикации - 2023)

9. Валяева А.А., Тихомирова М.А., Поташникова Д.М., Богомазова А.Н., Снигирева Г.П., Пенин А.А., Логачева М.Д., Арифулин Е.А., Шмакова А, Джермини Д., Качалова А.И., Саидова А.А., Жарикова А.А., Мусинова Я.Р., Миронов А.А., Васецкий Е.С., Шеваль Е.В. Ectopic expression of HIV-1 Tat modifies gene expression in cultured B cells: Implications for the development of B-cell lymphomas in HIV-1-infected patients PeerJ, 10:e13986 (год публикации - 2022)
10.7717/peerj.13986

10. Арифулин Е.А., Шеваль Е.В. Non-canonical localization of cardiac troponins: expanding functions or causing pathologies? International Journal of Molecular Sciences, International Journal of Molecular Sciences, 25(6):3117, 2024 (год публикации - 2024)
10.3390/ijms25063117

11. Валяева А.А., Шеваль Е.В. Неспецифические взаимодействия в регуляции транскрипции и организации транскрипционных конденсатов Биохимия, Биохимия. 2024. 89(4):651-665 (год публикации - 2024)
10.31857/S0320972524040087

12. Тихомирова М.А., Кузьменко О.Л., Арифулин Е.А., Широкова О.М., Мусинова Я.Р., Шеваль Е.В. The nucleocapsid (N) proteins of different human coronaviruses demonstrate a variable capacity to induce the formation of cytoplasmic condensates International Journal of Molecular Sciences, Int. J. Mol. Sci. 2024, 25(23), 13162 (год публикации - 2024)
10.3390/ijms252313162

13. Валяева А.А., Тихомирова М.А., Фенг Я, Жарикова А.А., Поташникова Д.М., Мусинова Я.Р., Миронов А.А., Васецкий Е.С., Шеваль Е.В. Compensatory reactions of B cells in response to chronic HIV‐1 Tat exposure Journal of Cellular Physiology, J Cell Physiol. 2024;e31459 (год публикации - 2024)
10.1002/jcp.31459

14. Шеваль Е.В. Механизмы обеспечения специфичности белкового состава субъядерных доменов Современные проблемы и перспективы исследований клеточного ядра : сборник тезисов докладов и сообщений XIX Всероссийского симпозиума «Структура и функции клеточного ядра», Современные проблемы и перспективы исследований клеточного ядра : сборник тезисов докладов и сообщений XIX Всероссийского симпозиума «Структура и функции клеточного ядра», Санкт-Петербург, 21–22 мая 2024 г. – СПб. : ПОЛИТЕХ-ПРЕСС, 2024. – 166 с. (год публикации - 2024)


 

Публикации

1. Курнаева М.А., Залевский А.О., Арифулин Е.А., Лисицына О.М., Творогова А.В., Шубина М.Ю., Буренков Г.П., Тихомирова М.А., Поташникова Д.М., Качалова А.И., Мусинова Я.Р., Головин А.В., Васецкий Е.С., Шеваль Е.В. Molecular coevolution of nuclear and nucleolar localization signals inside basic domain of HIV-1 Tat Journal of Virology (год публикации - 2022)
10.1128/JVI.01505-21

2. Курнаева М.А., Залевский А.О., Арифулин Е.А., Лисицына О.М., Творогова А.В., Шубина М.Ю., Буренков Г.П., Мусинова Я.Р., Головин А.В., Васецкий Е.С., Шеваль Е.В. Молекулярная коэволюция сигналов ядерной и ядрышковой локализации в составе основного домена Tat белка вируса иммунодефицита человека III Объединенный научный форум физиологов, биохимиков и молекулярных биологов. VII Съезд биохимиков россии. X Российский симпозиум «Белки и пептиды». VII Съезд физиологов СНГ (Сочи, Дагомыс, 3–8 октября 2021). Научные труды. Том 2., М.: Издательство «Перо», 2021. – 313 с. (год публикации - 2021)

3. Валяева А.А., Жарикова А.А., Шеваль Е.В. SARS-CoV-2 cellular tropism and direct multiorgan failure in COVID-19 patients: bioinformatic predictions, experimental observations, and open questions Cell Biology International (год публикации - 2022)
10.1002/cbin.11928

4. Шеваль Е.В. Молекулярная коэволюция сигнальных последовательностей в составе Tat белка вируса иммунодефицита человека Материалы Юбилейной научной конференции «Николай Константинович Кольцов и биология XXI века», М. Издательство Перо, 2022. (год публикации - 2022)

5. Тихомирова М.А., Валяева А.А., Жарикова А.А., Богомазова А.Н., Мусинова Я.Р., Миронов А.А., Васецкий Е.С., Шеваль Е.В. Изучение эффектов Tat белка вируса иммунодефицита человека с использованием клеточных моделей “Коллекции культур клеток человека и животных: современные вызовы и сетевые решения”, сборник тезисов докладов Всероссийской школы-конференции, СПб.: ПОЛИТЕХ-ПРЕСС, 2022 (год публикации - 2022)

6. Валяева А.А., Жарикова А.А., Миронов А.А., Шеваль Е.В. Поиск и изучение полу-экстрагируемых РНК Информационные технологии и системы (ИТиС'22), Информационные технологии и системы (ИТиС'22), Москва, Огниково, Россия (год публикации - 2022)

7. Поташникова Д.М., Сотникова Т.Н., Широкова О.М., Зайратьянц О.В., Васильева Е.Ю., Шеваль Е.В. Cilia impairment in bronchial epithelial cells detected in autopsy material of SARS-CoV-2-infected patient Ultrastructural Pathology, 47(5):382-387 (год публикации - 2023)
10.1080/01913123.2023.2222167

8. Тихомирова М.А., Кузьменко О.Л., Арифулин Е.А., Мусинова Я.Р., Шеваль Е.В. Сравнительный анализ способности нуклеокапсидных белков низко и высоко патогенных коронавирусов к индукции цитоплазматических биомолекулярных конденсатов Cборник материалов конференции и Школы-конференции «Коллекции культур клеток человека и животных: современные вызовы и сетевые решения», стр. 134 (год публикации - 2023)

9. Валяева А.А., Тихомирова М.А., Поташникова Д.М., Богомазова А.Н., Снигирева Г.П., Пенин А.А., Логачева М.Д., Арифулин Е.А., Шмакова А, Джермини Д., Качалова А.И., Саидова А.А., Жарикова А.А., Мусинова Я.Р., Миронов А.А., Васецкий Е.С., Шеваль Е.В. Ectopic expression of HIV-1 Tat modifies gene expression in cultured B cells: Implications for the development of B-cell lymphomas in HIV-1-infected patients PeerJ, 10:e13986 (год публикации - 2022)
10.7717/peerj.13986

10. Арифулин Е.А., Шеваль Е.В. Non-canonical localization of cardiac troponins: expanding functions or causing pathologies? International Journal of Molecular Sciences, International Journal of Molecular Sciences, 25(6):3117, 2024 (год публикации - 2024)
10.3390/ijms25063117

11. Валяева А.А., Шеваль Е.В. Неспецифические взаимодействия в регуляции транскрипции и организации транскрипционных конденсатов Биохимия, Биохимия. 2024. 89(4):651-665 (год публикации - 2024)
10.31857/S0320972524040087

12. Тихомирова М.А., Кузьменко О.Л., Арифулин Е.А., Широкова О.М., Мусинова Я.Р., Шеваль Е.В. The nucleocapsid (N) proteins of different human coronaviruses demonstrate a variable capacity to induce the formation of cytoplasmic condensates International Journal of Molecular Sciences, Int. J. Mol. Sci. 2024, 25(23), 13162 (год публикации - 2024)
10.3390/ijms252313162

13. Валяева А.А., Тихомирова М.А., Фенг Я, Жарикова А.А., Поташникова Д.М., Мусинова Я.Р., Миронов А.А., Васецкий Е.С., Шеваль Е.В. Compensatory reactions of B cells in response to chronic HIV‐1 Tat exposure Journal of Cellular Physiology, J Cell Physiol. 2024;e31459 (год публикации - 2024)
10.1002/jcp.31459

14. Шеваль Е.В. Механизмы обеспечения специфичности белкового состава субъядерных доменов Современные проблемы и перспективы исследований клеточного ядра : сборник тезисов докладов и сообщений XIX Всероссийского симпозиума «Структура и функции клеточного ядра», Современные проблемы и перспективы исследований клеточного ядра : сборник тезисов докладов и сообщений XIX Всероссийского симпозиума «Структура и функции клеточного ядра», Санкт-Петербург, 21–22 мая 2024 г. – СПб. : ПОЛИТЕХ-ПРЕСС, 2024. – 166 с. (год публикации - 2024)


 

Публикации

1. Курнаева М.А., Залевский А.О., Арифулин Е.А., Лисицына О.М., Творогова А.В., Шубина М.Ю., Буренков Г.П., Тихомирова М.А., Поташникова Д.М., Качалова А.И., Мусинова Я.Р., Головин А.В., Васецкий Е.С., Шеваль Е.В. Molecular coevolution of nuclear and nucleolar localization signals inside basic domain of HIV-1 Tat Journal of Virology (год публикации - 2022)
10.1128/JVI.01505-21

2. Курнаева М.А., Залевский А.О., Арифулин Е.А., Лисицына О.М., Творогова А.В., Шубина М.Ю., Буренков Г.П., Мусинова Я.Р., Головин А.В., Васецкий Е.С., Шеваль Е.В. Молекулярная коэволюция сигналов ядерной и ядрышковой локализации в составе основного домена Tat белка вируса иммунодефицита человека III Объединенный научный форум физиологов, биохимиков и молекулярных биологов. VII Съезд биохимиков россии. X Российский симпозиум «Белки и пептиды». VII Съезд физиологов СНГ (Сочи, Дагомыс, 3–8 октября 2021). Научные труды. Том 2., М.: Издательство «Перо», 2021. – 313 с. (год публикации - 2021)

3. Валяева А.А., Жарикова А.А., Шеваль Е.В. SARS-CoV-2 cellular tropism and direct multiorgan failure in COVID-19 patients: bioinformatic predictions, experimental observations, and open questions Cell Biology International (год публикации - 2022)
10.1002/cbin.11928

4. Шеваль Е.В. Молекулярная коэволюция сигнальных последовательностей в составе Tat белка вируса иммунодефицита человека Материалы Юбилейной научной конференции «Николай Константинович Кольцов и биология XXI века», М. Издательство Перо, 2022. (год публикации - 2022)

5. Тихомирова М.А., Валяева А.А., Жарикова А.А., Богомазова А.Н., Мусинова Я.Р., Миронов А.А., Васецкий Е.С., Шеваль Е.В. Изучение эффектов Tat белка вируса иммунодефицита человека с использованием клеточных моделей “Коллекции культур клеток человека и животных: современные вызовы и сетевые решения”, сборник тезисов докладов Всероссийской школы-конференции, СПб.: ПОЛИТЕХ-ПРЕСС, 2022 (год публикации - 2022)

6. Валяева А.А., Жарикова А.А., Миронов А.А., Шеваль Е.В. Поиск и изучение полу-экстрагируемых РНК Информационные технологии и системы (ИТиС'22), Информационные технологии и системы (ИТиС'22), Москва, Огниково, Россия (год публикации - 2022)

7. Поташникова Д.М., Сотникова Т.Н., Широкова О.М., Зайратьянц О.В., Васильева Е.Ю., Шеваль Е.В. Cilia impairment in bronchial epithelial cells detected in autopsy material of SARS-CoV-2-infected patient Ultrastructural Pathology, 47(5):382-387 (год публикации - 2023)
10.1080/01913123.2023.2222167

8. Тихомирова М.А., Кузьменко О.Л., Арифулин Е.А., Мусинова Я.Р., Шеваль Е.В. Сравнительный анализ способности нуклеокапсидных белков низко и высоко патогенных коронавирусов к индукции цитоплазматических биомолекулярных конденсатов Cборник материалов конференции и Школы-конференции «Коллекции культур клеток человека и животных: современные вызовы и сетевые решения», стр. 134 (год публикации - 2023)

9. Валяева А.А., Тихомирова М.А., Поташникова Д.М., Богомазова А.Н., Снигирева Г.П., Пенин А.А., Логачева М.Д., Арифулин Е.А., Шмакова А, Джермини Д., Качалова А.И., Саидова А.А., Жарикова А.А., Мусинова Я.Р., Миронов А.А., Васецкий Е.С., Шеваль Е.В. Ectopic expression of HIV-1 Tat modifies gene expression in cultured B cells: Implications for the development of B-cell lymphomas in HIV-1-infected patients PeerJ, 10:e13986 (год публикации - 2022)
10.7717/peerj.13986

10. Арифулин Е.А., Шеваль Е.В. Non-canonical localization of cardiac troponins: expanding functions or causing pathologies? International Journal of Molecular Sciences, International Journal of Molecular Sciences, 25(6):3117, 2024 (год публикации - 2024)
10.3390/ijms25063117

11. Валяева А.А., Шеваль Е.В. Неспецифические взаимодействия в регуляции транскрипции и организации транскрипционных конденсатов Биохимия, Биохимия. 2024. 89(4):651-665 (год публикации - 2024)
10.31857/S0320972524040087

12. Тихомирова М.А., Кузьменко О.Л., Арифулин Е.А., Широкова О.М., Мусинова Я.Р., Шеваль Е.В. The nucleocapsid (N) proteins of different human coronaviruses demonstrate a variable capacity to induce the formation of cytoplasmic condensates International Journal of Molecular Sciences, Int. J. Mol. Sci. 2024, 25(23), 13162 (год публикации - 2024)
10.3390/ijms252313162

13. Валяева А.А., Тихомирова М.А., Фенг Я, Жарикова А.А., Поташникова Д.М., Мусинова Я.Р., Миронов А.А., Васецкий Е.С., Шеваль Е.В. Compensatory reactions of B cells in response to chronic HIV‐1 Tat exposure Journal of Cellular Physiology, J Cell Physiol. 2024;e31459 (год публикации - 2024)
10.1002/jcp.31459

14. Шеваль Е.В. Механизмы обеспечения специфичности белкового состава субъядерных доменов Современные проблемы и перспективы исследований клеточного ядра : сборник тезисов докладов и сообщений XIX Всероссийского симпозиума «Структура и функции клеточного ядра», Современные проблемы и перспективы исследований клеточного ядра : сборник тезисов докладов и сообщений XIX Всероссийского симпозиума «Структура и функции клеточного ядра», Санкт-Петербург, 21–22 мая 2024 г. – СПб. : ПОЛИТЕХ-ПРЕСС, 2024. – 166 с. (год публикации - 2024)


Аннотация результатов, полученных в 2024 году
Последний год реализации проекта был посвящен завершению начатых ранее экспериментов, обработке полученных данных (анализ изображений и биоинформационный анализ), а также подготовке к печати полученных результатов. Экспериментальная часть была посвящена работе с нуклеокапсидными белками коронавирусов человека. С использованием полученных ранее клеточных линий были изучены эффекты нуклеокапсидных белков коронавирусов человека на эффективность индукции стресс-гранул под действием арсенида натрия. Показано, что все нуклеокапсидные белки несколько подавляют образование стресс-гранул, при этом нуклеокапсидный белок из HCoV-OC43 не способен включаться в состав индуцируемых арсенидом натрия стресс-гранул. Было изучено влияние разных нуклеокапсидных белков на пролиферацию клеток и устойчивость к действию токсических веществ. Нуклеокапсидные белки не оказывают существенного влияния на пролиферацию клеток. Кроме того в 2024 году были завершены работы по изучению ультраструктуры клеток с экспрессией нуклеокапсидных белков коронавирусов человека. Важным результатом стало описание изменение мембранных структур клетки, наблюдаемое через 48 часов после трансфекции. Можно предполагать, что нуклеокапсидные белки могут влиять на организацию мембранных структур и на их перестройку в ходе вирусной инфекции. Был завершен биоинформационный анализ результатов экспериментов по изучению транскриптомов клеток с экспрессией нуклеокапсидного белка SARS-CoV-2. В отличии от Tat белка вируса иммунодефицита человека, изученного ранее, нуклеокапсидный белок SARS-CoV-2 не оказывает существенного влияния на экспрессию клеточных генов непосредственно, но вызывает клеточные компенсаторные реакции. В 2024 году мы завершили публикацию серии статей, касающихся действия Tat белка вируса иммунодефицита человека и компенсаторных реакций клеток. Итоговая статья опубликована в Journal of Cellular Physiology. Первая статья по нуклеокапсидным белкам коронавирусов человека опубликована в International Journal of Molecular Sciences. Опубликованы два обзора, результаты проекта были представлены на XIX всероссийском симпозиуме «Структура и функции клеточного ядра».

 

Публикации

1. Курнаева М.А., Залевский А.О., Арифулин Е.А., Лисицына О.М., Творогова А.В., Шубина М.Ю., Буренков Г.П., Тихомирова М.А., Поташникова Д.М., Качалова А.И., Мусинова Я.Р., Головин А.В., Васецкий Е.С., Шеваль Е.В. Molecular coevolution of nuclear and nucleolar localization signals inside basic domain of HIV-1 Tat Journal of Virology (год публикации - 2022)
10.1128/JVI.01505-21

2. Курнаева М.А., Залевский А.О., Арифулин Е.А., Лисицына О.М., Творогова А.В., Шубина М.Ю., Буренков Г.П., Мусинова Я.Р., Головин А.В., Васецкий Е.С., Шеваль Е.В. Молекулярная коэволюция сигналов ядерной и ядрышковой локализации в составе основного домена Tat белка вируса иммунодефицита человека III Объединенный научный форум физиологов, биохимиков и молекулярных биологов. VII Съезд биохимиков россии. X Российский симпозиум «Белки и пептиды». VII Съезд физиологов СНГ (Сочи, Дагомыс, 3–8 октября 2021). Научные труды. Том 2., М.: Издательство «Перо», 2021. – 313 с. (год публикации - 2021)

3. Валяева А.А., Жарикова А.А., Шеваль Е.В. SARS-CoV-2 cellular tropism and direct multiorgan failure in COVID-19 patients: bioinformatic predictions, experimental observations, and open questions Cell Biology International (год публикации - 2022)
10.1002/cbin.11928

4. Шеваль Е.В. Молекулярная коэволюция сигнальных последовательностей в составе Tat белка вируса иммунодефицита человека Материалы Юбилейной научной конференции «Николай Константинович Кольцов и биология XXI века», М. Издательство Перо, 2022. (год публикации - 2022)

5. Тихомирова М.А., Валяева А.А., Жарикова А.А., Богомазова А.Н., Мусинова Я.Р., Миронов А.А., Васецкий Е.С., Шеваль Е.В. Изучение эффектов Tat белка вируса иммунодефицита человека с использованием клеточных моделей “Коллекции культур клеток человека и животных: современные вызовы и сетевые решения”, сборник тезисов докладов Всероссийской школы-конференции, СПб.: ПОЛИТЕХ-ПРЕСС, 2022 (год публикации - 2022)

6. Валяева А.А., Жарикова А.А., Миронов А.А., Шеваль Е.В. Поиск и изучение полу-экстрагируемых РНК Информационные технологии и системы (ИТиС'22), Информационные технологии и системы (ИТиС'22), Москва, Огниково, Россия (год публикации - 2022)

7. Поташникова Д.М., Сотникова Т.Н., Широкова О.М., Зайратьянц О.В., Васильева Е.Ю., Шеваль Е.В. Cilia impairment in bronchial epithelial cells detected in autopsy material of SARS-CoV-2-infected patient Ultrastructural Pathology, 47(5):382-387 (год публикации - 2023)
10.1080/01913123.2023.2222167

8. Тихомирова М.А., Кузьменко О.Л., Арифулин Е.А., Мусинова Я.Р., Шеваль Е.В. Сравнительный анализ способности нуклеокапсидных белков низко и высоко патогенных коронавирусов к индукции цитоплазматических биомолекулярных конденсатов Cборник материалов конференции и Школы-конференции «Коллекции культур клеток человека и животных: современные вызовы и сетевые решения», стр. 134 (год публикации - 2023)

9. Валяева А.А., Тихомирова М.А., Поташникова Д.М., Богомазова А.Н., Снигирева Г.П., Пенин А.А., Логачева М.Д., Арифулин Е.А., Шмакова А, Джермини Д., Качалова А.И., Саидова А.А., Жарикова А.А., Мусинова Я.Р., Миронов А.А., Васецкий Е.С., Шеваль Е.В. Ectopic expression of HIV-1 Tat modifies gene expression in cultured B cells: Implications for the development of B-cell lymphomas in HIV-1-infected patients PeerJ, 10:e13986 (год публикации - 2022)
10.7717/peerj.13986

10. Арифулин Е.А., Шеваль Е.В. Non-canonical localization of cardiac troponins: expanding functions or causing pathologies? International Journal of Molecular Sciences, International Journal of Molecular Sciences, 25(6):3117, 2024 (год публикации - 2024)
10.3390/ijms25063117

11. Валяева А.А., Шеваль Е.В. Неспецифические взаимодействия в регуляции транскрипции и организации транскрипционных конденсатов Биохимия, Биохимия. 2024. 89(4):651-665 (год публикации - 2024)
10.31857/S0320972524040087

12. Тихомирова М.А., Кузьменко О.Л., Арифулин Е.А., Широкова О.М., Мусинова Я.Р., Шеваль Е.В. The nucleocapsid (N) proteins of different human coronaviruses demonstrate a variable capacity to induce the formation of cytoplasmic condensates International Journal of Molecular Sciences, Int. J. Mol. Sci. 2024, 25(23), 13162 (год публикации - 2024)
10.3390/ijms252313162

13. Валяева А.А., Тихомирова М.А., Фенг Я, Жарикова А.А., Поташникова Д.М., Мусинова Я.Р., Миронов А.А., Васецкий Е.С., Шеваль Е.В. Compensatory reactions of B cells in response to chronic HIV‐1 Tat exposure Journal of Cellular Physiology, J Cell Physiol. 2024;e31459 (год публикации - 2024)
10.1002/jcp.31459

14. Шеваль Е.В. Механизмы обеспечения специфичности белкового состава субъядерных доменов Современные проблемы и перспективы исследований клеточного ядра : сборник тезисов докладов и сообщений XIX Всероссийского симпозиума «Структура и функции клеточного ядра», Современные проблемы и перспективы исследований клеточного ядра : сборник тезисов докладов и сообщений XIX Всероссийского симпозиума «Структура и функции клеточного ядра», Санкт-Петербург, 21–22 мая 2024 г. – СПб. : ПОЛИТЕХ-ПРЕСС, 2024. – 166 с. (год публикации - 2024)