КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер проекта 21-14-00381

НазваниеПрогнозирование ответа больных ревматоидным артритом на лечение генно-инженерными биологическими препаратами и ингибиторами Янус (JAK)-киназ

Руководитель Кайшева Анна Леонидовна, Доктор биологических наук

Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича" , г Москва

Конкурс №55 - Конкурс 2021 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами»

Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни; 04-207 - Системная биология; биоинформатика

Ключевые слова Персонализированная медицина, масс-спектрометрия, протеомный анализ, метаболомный анализ, коннективная модель, нейронные сети, ревматоидный артрит, молекулярные предикторы.

Код ГРНТИ34.15.00


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Ревматоидный артрит (РА) является широко распространенным хроническим заболеванием с поражением около 1% численности населения. РА характеризуется воспалением синовиальной оболочки суставов, которое может привести к разрушению костно-хрящевых структур сустава и стать причиной ряда системных осложнений. РА представляет собой серьезную медико-социальную проблему в Российской Федерации с высоким уровнем инвалидизации. В последние годы генно-инженерные биологические препараты (ГИБП) и таргетная терапия ингибиторами Янус (JAK)-киназ (JAK-и) стали популярным компонентом лечения тяжелых вариантов РА, что нашло отражение в российских и международных клинических рекомендациях (1,2). Несмотря на широкое применение данных групп препаратов, многие больные не отвечают в достаточной степени на терапию. Согласно клиническим рекомендациям, оценка эффективности лечения проводится при РА в срок от 3 до 6 месяцев от начала лечения (1,2). Лечение ГИБП и JAK-и является дорогостоящим. Стоимость препаратов без учета расходов на услуги медицинского персонала составляет в среднем 700 000 - 1 000 000 рублей в год. Назначение ГИБП и таргетной терапии JAK-и пациентам, которые недостаточно отвечают на предлагаемые препараты, приводят к существенным расходам отечественного здравоохранения. Актуальным представляется разработка эффективных подходов прогнозирования ответа больных на лекарственные препараты из групп ГИБП и JAK-и. Поиск молекулярных предикторов ответа на лечение до воздействия лекарственного средства является компонентом персонализированной медицины, направленный на обоснование эффективных стратегий лечения для конкретного пациента в данный момент времени. Большие данные, обобщающие клинические, биохимические показатели (метаданные) в комбинации с молекулярными протеомно-метаболомными результатами, характеризуются высоким диагностическим и прогностическим значением, и в перспективе обеспечат выбор эффективных схем лечения для конкретного пациента. До сих пор в клинической практике РА отсутствуют пригодные для практического применения методы прогнозирования ответа на лечение препаратами из групп ГИБП и JAK-и. В настоящем исследовании предлагается разработать новый подход выявления пациентов с недостаточно выраженным иммуномодулирующим действием препаратов группы ГИБП (ингибиторы фактора некроза опухоли, ФНО-и) и JAK-и для последующей рекомендации замены терапии. Планируется исследовать ответ пациентов на наиболее активно применяющиеся в клинической практике терапии РА: 1) ГИБП из группы ингибиторы ФНО (ФНО-и) и, 2) ингибиторы JAK (JAK-и). Данные группы препаратов различаются по механизмам действия на иммунную систему, характеризуются разными терапевтическими мишенями. Предлагается выполнить динамическое научное исследование метаболомно-протеомных изменений в образцах крови пациентов с РА продолжительностью наблюдения 12 месяцев. Мониторинг молекулярно-клинических изменений будет осуществляться для 7 временных точек забора плазмы крови – до назначения лечения, через 2 недели, через 1, 3, 6, 9 и 12 месяцев после назначения лечения. Будет исследовано 2 группы сравнения (ГИБП из группы ФНО-и, и из группы JAK-и). В каждой группе сравнения примут участие 30 пациентов. Клинической оценкой достижения / недостижение ответа на лечение будет проводится с использованием индекса CDAI (≤10.0). Вторичными точками оценки ответа будут являться: 1) достижение ремиссии болезни по индексу CDAI (≤2.8); 2) достижение низкой активности болезни по индексу DAS28-СОЭ (≤3.2). 3) достижение ремиссии болезни по индексу DAS28-СОЭ (≤2.6). 4) достижение минимального клинически значимого улучшения функции пациента в повседневной жизни – снижения индекса HAQ на ≥0.22 балла. Предполагаемая новизна проекта заключается в изучении молекулярных основ развития ответа у больных РА на иммуномодулирующие препараты с различными механизмами действия, создании математической модели выбора пациентов, отвечающих на терапию препаратами конкретной группы с применением математических алгоритмов и нейронных сетей. Литература 1. Насонов Е.Л., Каратеев Д.Е. Ревматоидный̆ артрит. В кн.: Российские клинические рекомендации. Ревматология/ Под. Ред. Е. Л. Насонова - М.: ГЭОТАР-Медиа, 2020. - 448 с. - ISBN 978-5-9704-5398-8, с. 17-57. 2. G. Chatzidionysiou K., Dougados M., et al. EULAR recommendations for the management of rheumatoid arthritis with synthetic and biological disease-modifying antirheumatic drugs: 2016 update. Ann Rheum Dis. 2017;76(6):960- 977. doi: 10.1136/annrheumdis-2016-210715.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


 

Публикации

1. Руднев В.Р., Куликова Л.И., Никольский К.С., Мальсагова К.А., Копылов А.Т., Кайшева А.Л. Current Approaches in Supersecondary Structures Investigation International Journal of Molecular Sciences (год публикации - 2021)
10.3390/ijms222111879


 

Публикации

1. Талдаев А., Руднев В.Р., Никольский К.С., Куликова Л.И., Кайшева А.Л. Molecular Modeling Insights into Upadacitinib Selectivity upon Binding to JAK Protein Family Pharmaceuticals, 15(1):30 (год публикации - 2022)
10.3390/ph15010030

2. Кондратьев М., Руднев В.Р., Никольский К.С., Степанов А.А., Петровский Д.В., Куликова Л.И., Копылов А.Т., Мальсагова К.А., Кайшева А.Л. Atomic Simulation of the Binding of JAK1 and JAK2 with the Selective Inhibitor Ruxolitinib International Journal of Molecular Sciences, 23(18), 10466 (год публикации - 2022)
10.3390/ijms231810466


 

Публикации

1. Степанов А.А., Мальсагова К.А., Копылов А.Т., Руднев В.Р., Каратеев Д.Е., Маркелова Е.И., Лучихина Е.Л., Борисова Е.Е., Кайшева, А.Л. Determination of Heterogeneous Proteomic and Metabolomic Response in anti-TNF and anti-IL-6 Treatment of Patients with Rheumatoid Arthritis Life, 13, 2, 596. (год публикации - 2023)
10.3390/life13020596

2. Петровский Д.В., Мальсагова К.А., Руднев В.Р., Куликова Л.И., Пустовойт В.И., Балакин Е.И., Юрку К.А., Кайшева А.Л. Bioinformatics Methods for Constructing Metabolic Networks Processes, 11(12), 3430. (год публикации - 2023)
10.3390/pr11123430