КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер проекта 20-15-00271

НазваниеРоль цитоскелетных и Z-диск ассоциированных белков в патогенезе заболеваний миокарда и скелетной мускулатуры.

Руководитель Костарева Анна Александровна, Доктор медицинских наук

Организация финансирования, регион федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный медицинский исследовательский центр имени В.А. Алмазова" Министерства здравоохранения Российской Федерации , г Санкт-Петербург

Конкурс №45 - Конкурс 2020 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами»

Область знания, основной код классификатора 05 - Фундаментальные исследования для медицины; 05-401 - Молекулярная и клеточная медицина

Ключевые слова миокард, саркомер, цитоскелет, Z-диск, кардиомиопатия, миопатия, митохондрии, воспаление, аутофагия, митофагия, микровезикулы, индуцированные плюрипотентные клетки, мутации

Код ГРНТИ76.03.00


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Проект направлен на расшифровку молекулярных механизмов кардиомиопатий, ассоциированных с патологией структурных и цитоскелетных белков, и идентификацию универсальных внутриклеточных путей их патогенеза, которые могут являться мишенями для терапевтического воздействия. Раскрытие этих механизмов является важным для создания новых терапевтических подходов, что позволит снизить частоту инвалидизации и потребность в высокотехнологичных методах лечения среди молодых пациентов и пациентов детской группы. Кардиомиопатии – это тяжелые, чаще всего генетически-обусловленные заболевания миокарда, при которых нарушается его структура и функции, а также развивается синдром сердечной недостаточности. Несмотря на низкую распространенность кардиомиопатий в популяции, их клиническая значимость очень велика и определяется двумя главными аспектами. Во-первых, кардиомиопатии являются наиболее частой причиной синдрома внезапной сердечной смерти в молодом возрасте. Во-вторых, кардиомиопатии являются наиболее частой причиной развития сердечной недостаточности в детском и молодом возрасте. Таким образом, разработка и поиск новых подходов к лечению данной патологии является крайне актуальной задачей современной фундаментальной и трансляционной медицины. Сложность структуры кардиомиоцитов и высокая степень их дифференцировки, большой спектр генов, ассоциированных с развитием кардиомиопатий, индивидуальный характер большинства мутаций и отсутствие доминирующих причинных генов делает крайне сложным и маловероятным применение подходов генной терапии у пациентов с данными заболеваниями миокарда. Методы генной терапии, успешно апробированные для лечения нейромышечной патологии (миодистрофии Дюшена) и методы фермент-заместительной терапии, считающиеся прорывными при лечении некоторых болезней обмена веществ и нарушении метаболизма (болезнь Гоше, болезнь Фабри), не могут быть масштабно использованы в случае генетически-обусловленных кардиомиопатий. В связи с этим необходим интенсивный поиск ключевых молекулярных событий, которые могут лежать в основе развития одновременно нескольких генетических форм кардиомиопатий, что потенциально даст возможность разработки персонифицированных, но одновременно и универсальных терапевтических подходов. В предлагаемом проекте данная задача будет решаться путем изучения молекулярных механизмов асептического воспаления в мышечных клетках с применением транскриптомного анализа, а также путем его подавления. В рамках проекта будут решаться следующие научные задачи: 1. Поиск новых патогенных вариантов в генах, кодирующих цитоскелетные и Z-диск ассоциированные белки, в когорте пациентов с генетически-обусловленными кардиомиопатиями методом целевого секвенирования нового поколения и экзомного секвенирования. Полученные данные о новых и уже известных генетических вариантах позволят создать линии индуцированных плюрипотентных клеток (иПСК) с использованием первичных клеток пациентов (мононуклеаров периферической крови). Эти линии после проведения кардиогенной дифференцировки будут служить моделью для изучения молекулярных механизмов кардиомиопатий. 2. Изучение влияния патогенных вариантов (мутаций) в гене десмина (DES) и в гене филамина C (FLNC) на структурные и функциональные особенности митохондрий, а также исследование роли митохондриальной ДНК (мтДНК) в развитии стерильного воспаления и структурно-функционального повреждения миоцитов. В моделях мышечных клеток линии С2С12, нокаутных по гену DES и нокаутных по гену FLNC, а также в клетках линии С2С12, несущих мутантые формы этих генов, будут оценены: митохондриальный мембранный потенциал, формирование митохондриальных пор неспецифической проницаемости (mPTP), число копий и целостность мтДНК, а также митохондриальная динамика – процессы деления и слияния митохондрий (fission/fusion). Способность мтДНК участвовать в развитии стерильного воспаления будет оценена по степени активации TLR9, а также по уровню экспрессии про-воспалительных цитокинов. 3. Изучение влияния патогенных вариантов (мутаций) в гене DES и в гене FLNC на гомеостаз белков (протеостаз) мышечных клеток. За клеточный гомеостаз, и за протеостаз в частности, в клетке отвечает процесс аутофагии. В моделях мышечных клеток линии С2С12, нокаутных по гену DES и нокаутных по гену FLNC, а также в клетках линии С2С12, несущих мутантые формы этих генов, будут оценены процессы аутофагии и митофагии (направленная утилизация нефункциональных митохондрий). Будет оценен эффект от оверэкспрессии и нокдауна гена BAG3, а также эффект рапамицина в отношении модуляции процессов шаперон-зависимой селективной аутофагии и митофагии в присутствии мутаций генов DES и FLNC. 4. Исследование взаимосвязи между нарушением структуры цитоскелетных белков, формированием внутриклеточных белковых агрегатов, дисфункцией митохондрий и индукцией стерильного внутриклеточного воспаления. В модели клеток линии С2С12, несущих агрегатные и неагрегатные мутантные формы генов DES и FLNC, методом РНК-секвенирования будет оценен клеточный транскриптом и измерена активация системы комплемента и каскада TLR9-p38 MAPK. Будет оценен эффект фармакологического блокатора TLR9 ODN2088 на процесс стерильного внутриклеточного воспаления, индуцированного мутантными формами цитоскелетных и Z-диск ассоциированных белков. 5. Изучение роли белка филамина С (ген FLNC) в процессе пролиферации, миграции и миогенной/кардиогенной дифференцировки клеток, а также его вклад в реализацию сигнального каскада Hippo и динамику актинового цитоскелета в ходе кардиомиогенной и миогенной дифференцировок. 6. Создание экспериментальной модели Danio rerio, несущей мутацию в гене FLNC, с целью исследования ультраструктурных нарушений и изменений наномеханики саркомера, лежащих в основе филамин-ассоциированной кардиомиопатии. Достижимость поставленных задач и высокая вероятность получения запланированных результатов определяется опытом коллектива, большими стажем научной работы в области изучения кардиомиопатий и генетически-обусловленных заболеваний миокарда, наличием большого количества отработанных методических подходов и существенным заделом, сформированными и доступными для анализа когортами пациентов, наличием высокорейтинговых публикаций в области исследования и успешным опытом завершения предыдущих научных проектов по данной тематике, в частности предыдущих грантов РНФ14-15-00745 и РНФ14-15-00745П.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


 

Публикации

1. К. С. Сухарева, Н. А.Смолина, К. К. Калугина, А. А.Худяков, А. А. Костарева Влияние мутации L345P в гене десмина на процесс аутофагии в мышечных клетках линии С2С12 Цитология, ЦИТОЛОГИЯ, 2020, том 62, № 7, с. 493–502 (год публикации - 2020)
10.31857/S0041377120070081

2. Вершинина Т.Л., Фомичева Ю.В., Муравьев А.С., Чуркина А.В., Мельник О.В., Киселев А.М., Козырева А.А., Васичкина Е.С., Первунина Т.М., Костарева А.А. Особенности клинического фенотипа филаминовых кардиомиопатий с дебютом в раннем детском возрасте. Педиатрия, 2020; 99 (3): 18–24. (год публикации - 2020)
10.24110/0031-403X-2020-99-3-88-95

3. Шлык И. В., Стрельцова А.А., Теплов В.М., Гаврилова Е.Г., Куликов А.Н., Крутиков А.Н., Рыбакова М.Г., Кузнецова И.А., Андреева С.Е., Бежанишвили Т.Г., Михайлова В. Б., Костарева А.А., Гудкова А.Я. Кардиомиопатия со смешанным фенотипом, ассоциированная с вариантом в гене DSP Российский кардиологический журнал, Том 25, № 10 (2020) (год публикации - 2020)
10.15829/1560-4071-2020-4102

4. Йорнхольт Дж, Фомичева Ю, Вершинина Т, Киселев А, Муравьев А, Демченко Е, Федотов П, Плотина А, Рыжков Аб Васичкина Е, Сеерсен Т, Костарева А. Two New Cases of Hypertrophic Cardiomyopathy and Skeletal Muscle Features Associated with ALPK3 Homozygous and Compound Heterozygous Variants Genes, 2020 Oct 15;11(10):1201 (год публикации - 2020)
10.3390/genes11101201

5. Князева А, Худяков А, Ваз Р, Муравьев А, Сухарева К, Сериен Т, Костарева А. FLNC expression level influences the activity of TEAD-YAP/TAZ signaling Genes, 2020 Nov 13;11(11):1343 (год публикации - 2020)
10.3390/genes11111343

6. Вершинина Т, Фомичева Ю, Муравьев А, ЙорнхольтД, Киселев А, Козырева А, Гордеев М, Васичкина Е, Сергушичев С, Первунина Т, Съеберг Г, Сеерсен Т, Костарева А Genetic spectrum of left ventricular non-compaction in paediatric patients. Cardiology, 2020;145(11):746-756 (год публикации - 2020)
10.1159/000510439


 

Публикации

1. Калугина К. К., Сухарева К. С., Чуркина А. И., Костарева А. А. Autophagy as a Pathogenetic Link and a Target for Therapy of Musculoskeletal System Diseases Journal of Evolutionary Biochemistry and Physiology, Volume 57 Issue 3 Page666-680, May 2021 (год публикации - 2021)
10.1134/S0022093021030145


 

Публикации

1. Родина Н.Л., Худяков А.А., Перепелина К.И., Муравьев А.С., Бойцов А.С., Злотина А.М., Сокольникова П.С., Костарева А.А. Generation of iPSC line (FAMRCi009-A) from patient with familial progressive cardiac conduction disorder carrying genetic variant FLNC p.Val2264Met Stem Cell Research, Volume 59, March 2022, 102640 (год публикации - 2022)
10.1016/j.scr.2021.102640

2. Вахрушев Ю.А., Муравьев А.С., Козырева А.А., Жук С.В., Ротарь О.П., Костарева А.А. Спектр непатогенных вариантов в гене тайтина и генах внутри- и внесаркомерного цитоскелета (TTN, MYBPC3, FLNC, RBM20) у пациентов с различными вариантами кардиомиопатий Трансляционная медицина, Том 9, № 2 (2022) (год публикации - 2022)
10.18705/2311-4495-2022-9-2-37-49

3. Муравьев А.С., Вершинина Т.Л., Теснер П., Шоберг Г., Фомичева Ю.В., Чайбикова Н.Н., Козырева А.А., Жук С.В., Мамаева Е.А., Тарновская С.И., Йорнхольт Дж., Сокольникова П.С., Первунина Т.М., Васичкина Е.С., Сейерсен Т., Костарева А.А. Rare clinical phenotype of filaminopathy presenting as restrictive cardiomyopathy and myopathy in childhood Orphanet Journal of Rare Diseases, Orphanet J Rare Dis 17 , 358 (2022) (год публикации - 2022)
10.1186/s13023-022-02477-5