КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ
Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.
ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ
Номер проекта 19-74-00086
НазваниеТранскриптомный подход для поиска перспективных литических агентов Lysobacter capsici ВКМ-2533Т
Руководитель Кудрякова Ирина Валерьевна, Кандидат биологических наук
Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное учреждение науки «Федеральный исследовательский центр «Пущинский научный центр биологических исследований Российской академии наук» , Московская обл
Конкурс №40 - Конкурс 2019 года «Проведение инициативных исследований молодыми учеными» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными
Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни; 04-104 - Общая генетика
Ключевые слова антимикробные агенты, бактериолитические ферменты, Lysobacter, геном-транскриптом-протеом, гетерологичная система экспрессии для бактериолитических ферментов, множественноустойчивые бактерии, межбактериальные взаимодействия
Код ГРНТИ34.27.00
ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ
Аннотация
Проект направлен на решение фундаментальной научной проблемы - поиск, выделение и характеристику антимикробных агентов, продуцируемых бактериями.
Для представителей рода Lysobacter характерна мощная литическая активность в отношении конкурентных микроорганизмов. Обусловлено это продукцией комплекса литических агентов: бактериолитических ферментов, антибиотиков, антимикробных пептидов. Среди этих агентов бактериолитические ферменты представляют особый интерес, т.к. микроорганизмы, в т.ч. патогены, не развивают механизмов привыкания к ним. Однако из-за слабой изученности затруднено исследование этих белков в качестве лекарственных средств.
Цель настоящего Проекта - изучить экспрессионный профиль бактерии L. capsici; выделить новый бактериолитический фермент. Для реализации поставленной цели предлагается использовать новый подход: индуцировать синтез антимикробных агентов живыми клетками-мишенями, собрать мРНК в точке роста L. capsici, соответствующей максимальной продукции этих агентов, провести транскриптомный анализ и выбрать ген-кандидат нового бактериолитического фермента, а затем выделить этот фермент, описать его свойства и апробировать гетерологичную систему экспрессии для него. Таких исследований ранее не проводилось.
Научная ценность результатов обоснована получением новой информации о бактериолитических ферментах, антибиотиках и антимикробных пептидах L. capsici, а также выделением и описанием нового белка. В результате реализации Проекта будут заложены идеи для будущего изучения топогенеза бактериолитических ферментов, механизмов регуляции экспрессии их генов, а также биосинтеза других антимикробных агентов Lysobacter. Также это исследование станет основой для будущего изучения механизмов межбактериальных взаимодействий.
Прикладная ценность работы обусловлена тем, что новый бактериолитический белок может являться основой для создания лекарственных препаратов нового поколения, эффективных против патогенов, устойчивых ко всем известным антимикробным препаратам. Необходимо отметить важность полученных результатов для будущих исследований, связанных с редактированием генома L. capsici с целью улучшения литических свойств и получения биотехнологически ценного продуцента бактериолитических ферментов.
ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ