КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ
Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.
ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ
Номер проекта 19-16-00070
НазваниеКартирование QTL и идентификация генов-кандидатов, ассоциированных c жироотложением у российских пород овец, на основе применения геномных технологий
Руководитель Денискова Татьяна Евгеньевна, Кандидат биологических наук
Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Федеральный исследовательский центр животноводства - ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста" , Московская обл
Конкурс №35 - Конкурс 2019 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами»
Область знания, основной код классификатора 06 - Сельскохозяйственные науки; 06-204 - Животноводство
Ключевые слова овцы, жирный хвост, QTL картирование, гены-кандидаты, SNP-маркеры, ресурсная популяция
Код ГРНТИ68.39.31
ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ
Аннотация
Домашние овцы по сравнению с другими видами сельскохозяйственных животных производят огромный спектр продукции – от шерсти и овчин до мяса, молока и жира. Изменение потребительского спроса на тот или иной вид продукции вносит существенные коррективы в направление селекции овец. Реализация новой селекционной программы, в свою очередь, занимает определенное время. Разработка и внедрение геномных технологий позволяет выяснять генетические механизмы, лежащие в основе наследования экономически-значимых признаков, и тем самым способствует ускорению селекционного процесса в желаемом направлении.
Одним из значимых и сложных постдоместикационных фенотипических признаков 25% всех мировых пород овец является повышенное жироотложение в области хвоста, приводящее к формированию жирного хвоста и курдюка. Жирный хвост играет важную роль как ценный источник энергии и механизм выживания овец в периоды нехватки кормов. В свою очередь, формирование и искусственное закрепление данного фенотипа связывают, прежде всего, с расселением древних кочевых племен в Евразии и Африке, так как овцы с жирными хвостами и курдюками легко переносят длительные перегоны, являются выносливыми и неприхотливыми даже в самых неблагоприятных климатических условиях.
Несмотря на сравнительное большое число жирнохвостых пород овец, генетические основы наследования данного фенотипа остается практически не изученными. В связи с этим, целью настоящего проекта является выявление генов-кандидатов, ответственных за формирование жирных хвостов у российских пород овец, на основе применения современных геномных технологий.
Следует отметить, что позиции селекционеров в отношении жирных хвостов сильно различаются. С одной стороны, все больше возрастает потребность населения в качественной баранине с пониженным содержанием жира. В свою очередь, депонирование жира, особенно в области хвоста, снижает мясную ценность у молодых ягнят. В этой связи, для производителей наличие жирного хвоста у ряда пород нерентабельно, хотя по остальным критериям (энергия роста, неприхотливость к кормам, устойчивость к инфекциям и т.д.) эти породы хорошо вписываются в технологические системы производства. С другой стороны, многие народности, в том числе проживающие в субъектах Российской Федерации, в силу приверженности традициям продолжают активно использовать бараний жир из хвостов и курдюков в пищевых и косметических целях, а также в качестве средства народной медицины.
Выявление генетических механизмов, лежащих в основе формирования жирного хвоста, позволит селекционерам разрабатывать целевые стратегии селекции для обоих перечисленных групп в зависимости от спроса в регионе разведения путем отбора в сторону уменьшения или увеличения размеров жировой подушки в хвостах у овец. В связи с этим, настоящий проект является актуальным.
Научная новизна настоящего проекта заключается в том, что поиск генов, ответственных за формирование исследуемого фенотипического признака, будет проводиться двумя различными современными методами, а именно: на основе поиска регионов, находящихся под давлением позитивной селекции по изучаемому признаку, и путем картирования QTL, ассоциированных с процессами жироотложения в хвостовой области, в специально созданной ресурсной популяции овец, полученной при скрещивании жирнохвостой и тощехвостой пород.
ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ
Публикации
1. Денискова Т.Е., Кунц Э., Медугорак И., Доцев А.В., Брем Г., Зиновьева Н.А. A study of genetic mechanisms underlying the fat tail phenotype in sheep: methodological approaches and identified candidate genes (overview) Sel'skokhozyaistvennaya Biologiya [Agricultural Biology], 2019, Vol. 6, in press. (год публикации - 2019)
2.
Денискова Т.Е., Доцев А.В., Лущихина Е.М., Шахин А.В, Кунц Е., Медугорак И., Рейер Х., Виммерс К., Хаяцаде Н., Солкнер Й., Сермягин А.А., Жунушов А.Т., Брем Г., Зиновьева Н.А.
Population Structure and Genetic Diversity of Sheep Breeds in the Kyrgyzstan
Frontiers in Genetics, 10:1311 (год публикации - 2019)
10.3389/fgene.2019.01311
3.
Денискова Т.Е., Абдельманова А.С., Доцев А.В., Рейер Х., Селионова М.И., Форнара М.С., Виммерс К., Брем Г., Зиновьева Н.А.
The distribution of runs of homozygosity in nine native Russian sheep breeds
JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, V.98, Issue Supplement_4, November 2020, P. 456–457 (год публикации - 2020)
10.1093/jas/skaa278.795
4.
Денискова Т.Е., Абдельманова А.С., Доцев А.В., Самбу-Хоо Ч.С., Рейер Х., Селионова М.И., Форнара М.С., Виммерс К., Брем Г., Зиновьева Н.А.
High-density genomic description of Russian native sheep breed of the Republic of Tyva
JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, V. 98, Issue Supplement_4, November 2020, P. 453–454 (год публикации - 2020)
10.1093/jas/skaa278.789
5.
Кошкина О.А., Бардуков Н.В., Зимина А.А.
Поиск и валидация регионов CNV в геноме жирнохвостых пород овец
Сборник тезисов докладов 20-й Всероссийской конференции молодых учёных, посвященной памяти академика РАСХН Георгия Сергеевича Муромцева. Москва, С. 107 (год публикации - 2020)
10.48397/ARRIAB.2020.20.062
6.
Денискова Т.Е., Доцев А.В., Селионова М.И., Брем Г., Зиновьева Н.А.
Biodiversity of Russian Local Sheep Breeds Based on Pattern of Runs of Homozygosity
Diversity, 13 (8): 360 (год публикации - 2021)
10.3390/d13080360
7.
Денискова Т.Е., Абдельманова А.С., Доцев А.В., Лущихина Е.М., Жунушев А.Т., Рейер Х., Селионова М.И., Виммерс К., Брем Г., Зиновьева Н.А.
PSXVI-17 Estimation of inbreeding in local sheep breeds of west Asian and central Asian origin based on high-density SNP-genotypes
Journal of Animal Science, Volume 99, Issue Supplement_3, Pages 222–223 (год публикации - 2021)
10.1093/jas/skab235.405
8.
Гхорейшифар С.М., Рохус С.М., Могнаддассаден-Анрави С., Давуди П., Салек Рдестани С., Зиновьева Н.А., Денискова Т.Е., Йоханссон А.М.
Shared Ancestry and Signatures of Recent Selection in Gotland Sheep
Genes, 12(3):433 (год публикации - 2021)
10.3390/genes12030433
Публикации
1. Денискова Т.Е., Кунц Э., Медугорак И., Доцев А.В., Брем Г., Зиновьева Н.А. A study of genetic mechanisms underlying the fat tail phenotype in sheep: methodological approaches and identified candidate genes (overview) Sel'skokhozyaistvennaya Biologiya [Agricultural Biology], 2019, Vol. 6, in press. (год публикации - 2019)
2.
Денискова Т.Е., Доцев А.В., Лущихина Е.М., Шахин А.В, Кунц Е., Медугорак И., Рейер Х., Виммерс К., Хаяцаде Н., Солкнер Й., Сермягин А.А., Жунушов А.Т., Брем Г., Зиновьева Н.А.
Population Structure and Genetic Diversity of Sheep Breeds in the Kyrgyzstan
Frontiers in Genetics, 10:1311 (год публикации - 2019)
10.3389/fgene.2019.01311
3.
Денискова Т.Е., Абдельманова А.С., Доцев А.В., Рейер Х., Селионова М.И., Форнара М.С., Виммерс К., Брем Г., Зиновьева Н.А.
The distribution of runs of homozygosity in nine native Russian sheep breeds
JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, V.98, Issue Supplement_4, November 2020, P. 456–457 (год публикации - 2020)
10.1093/jas/skaa278.795
4.
Денискова Т.Е., Абдельманова А.С., Доцев А.В., Самбу-Хоо Ч.С., Рейер Х., Селионова М.И., Форнара М.С., Виммерс К., Брем Г., Зиновьева Н.А.
High-density genomic description of Russian native sheep breed of the Republic of Tyva
JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, V. 98, Issue Supplement_4, November 2020, P. 453–454 (год публикации - 2020)
10.1093/jas/skaa278.789
5.
Кошкина О.А., Бардуков Н.В., Зимина А.А.
Поиск и валидация регионов CNV в геноме жирнохвостых пород овец
Сборник тезисов докладов 20-й Всероссийской конференции молодых учёных, посвященной памяти академика РАСХН Георгия Сергеевича Муромцева. Москва, С. 107 (год публикации - 2020)
10.48397/ARRIAB.2020.20.062
6.
Денискова Т.Е., Доцев А.В., Селионова М.И., Брем Г., Зиновьева Н.А.
Biodiversity of Russian Local Sheep Breeds Based on Pattern of Runs of Homozygosity
Diversity, 13 (8): 360 (год публикации - 2021)
10.3390/d13080360
7.
Денискова Т.Е., Абдельманова А.С., Доцев А.В., Лущихина Е.М., Жунушев А.Т., Рейер Х., Селионова М.И., Виммерс К., Брем Г., Зиновьева Н.А.
PSXVI-17 Estimation of inbreeding in local sheep breeds of west Asian and central Asian origin based on high-density SNP-genotypes
Journal of Animal Science, Volume 99, Issue Supplement_3, Pages 222–223 (год публикации - 2021)
10.1093/jas/skab235.405
8.
Гхорейшифар С.М., Рохус С.М., Могнаддассаден-Анрави С., Давуди П., Салек Рдестани С., Зиновьева Н.А., Денискова Т.Е., Йоханссон А.М.
Shared Ancestry and Signatures of Recent Selection in Gotland Sheep
Genes, 12(3):433 (год публикации - 2021)
10.3390/genes12030433
Публикации
1. Денискова Т.Е., Кунц Э., Медугорак И., Доцев А.В., Брем Г., Зиновьева Н.А. A study of genetic mechanisms underlying the fat tail phenotype in sheep: methodological approaches and identified candidate genes (overview) Sel'skokhozyaistvennaya Biologiya [Agricultural Biology], 2019, Vol. 6, in press. (год публикации - 2019)
2.
Денискова Т.Е., Доцев А.В., Лущихина Е.М., Шахин А.В, Кунц Е., Медугорак И., Рейер Х., Виммерс К., Хаяцаде Н., Солкнер Й., Сермягин А.А., Жунушов А.Т., Брем Г., Зиновьева Н.А.
Population Structure and Genetic Diversity of Sheep Breeds in the Kyrgyzstan
Frontiers in Genetics, 10:1311 (год публикации - 2019)
10.3389/fgene.2019.01311
3.
Денискова Т.Е., Абдельманова А.С., Доцев А.В., Рейер Х., Селионова М.И., Форнара М.С., Виммерс К., Брем Г., Зиновьева Н.А.
The distribution of runs of homozygosity in nine native Russian sheep breeds
JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, V.98, Issue Supplement_4, November 2020, P. 456–457 (год публикации - 2020)
10.1093/jas/skaa278.795
4.
Денискова Т.Е., Абдельманова А.С., Доцев А.В., Самбу-Хоо Ч.С., Рейер Х., Селионова М.И., Форнара М.С., Виммерс К., Брем Г., Зиновьева Н.А.
High-density genomic description of Russian native sheep breed of the Republic of Tyva
JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, V. 98, Issue Supplement_4, November 2020, P. 453–454 (год публикации - 2020)
10.1093/jas/skaa278.789
5.
Кошкина О.А., Бардуков Н.В., Зимина А.А.
Поиск и валидация регионов CNV в геноме жирнохвостых пород овец
Сборник тезисов докладов 20-й Всероссийской конференции молодых учёных, посвященной памяти академика РАСХН Георгия Сергеевича Муромцева. Москва, С. 107 (год публикации - 2020)
10.48397/ARRIAB.2020.20.062
6.
Денискова Т.Е., Доцев А.В., Селионова М.И., Брем Г., Зиновьева Н.А.
Biodiversity of Russian Local Sheep Breeds Based on Pattern of Runs of Homozygosity
Diversity, 13 (8): 360 (год публикации - 2021)
10.3390/d13080360
7.
Денискова Т.Е., Абдельманова А.С., Доцев А.В., Лущихина Е.М., Жунушев А.Т., Рейер Х., Селионова М.И., Виммерс К., Брем Г., Зиновьева Н.А.
PSXVI-17 Estimation of inbreeding in local sheep breeds of west Asian and central Asian origin based on high-density SNP-genotypes
Journal of Animal Science, Volume 99, Issue Supplement_3, Pages 222–223 (год публикации - 2021)
10.1093/jas/skab235.405
8.
Гхорейшифар С.М., Рохус С.М., Могнаддассаден-Анрави С., Давуди П., Салек Рдестани С., Зиновьева Н.А., Денискова Т.Е., Йоханссон А.М.
Shared Ancestry and Signatures of Recent Selection in Gotland Sheep
Genes, 12(3):433 (год публикации - 2021)
10.3390/genes12030433