КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ
Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.
ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ
Номер проекта 18-14-00322
НазваниеСтруктурные исследования механизма контроля метаболического пути Эшвелла в Escherichia coli факторами транскрипции ExuR и UxuR.
Руководитель Никулин Алексей Донатович, Доктор химических наук
Организация финансирования, регион федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт белка Российской академии наук , Московская обл
Конкурс №28 - Конкурс 2018 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами»
Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни; 04-208 - Молекулярная биология
Ключевые слова Регуляция транскрипции, факторы транскрипции, ExuR, UxuR, метаболический путь Эшвелла, D-глюкуроновая кислота
Код ГРНТИ34.15.17
ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ
Аннотация
Известно, что помимо D-глюкозы, независимыми источниками углерода для роста клеток в естественных условиях может служить целый ряд сахаров, в том числе, гексуроновых кислот. Так, например, D-глюкуронат и D-галактуронат утилизируются по энергетически более выгодным по сравнению с гликолизом метаболическим путям Эшвелла и Энтнера-Дудорова. Предлагаемый проект направлен на структурно-функциональные исследования белков UxuR и ExuR, вовлеченных в регуляцию метаболизма D-гексуроновых кислот (метаболический путь Эшвелла). Этот путь является альтернативой метаболических путей окисления глюкозы в бактериях и обеспечивает выживание клеток при экстремальных условиях. В результате выполнения проекта предполагается получить исчерпывающую информацию о механизме контроля метаболизма D-гексуроновых кислот в клетках Escherichia coli регуляторами транскрипции UxuR и ExuR на структурном уровне, а также о влиянии различных моносахаридов на функционирование этих белков. Полученные данные существенно дополнят имеющуюся картину метаболических путей в протеобактериях.
ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ
Публикации
1. Леконцева Н., Бессонова Т., Фандо М., Тищенко С., Озолинь О., Гельфанд М., Тутукина М., Никулин А. Structural studies of the UxuR and ExuR proteins, regulators of hexuronate metabolism in gammaproteobacteria FEBS OPEN BIO, Том: 8 Приложение: 1 Стр.: 434-434 (год публикации - 2018)
2. Пуртов Ю.А., Тутукина М.Н., Никулин А.Д., Озолинь О.Н. Топология контактов потенциальных лигандов фактора транскрипции UxuR E. coli, полученная методом гибкого докинга Биофизика (год публикации - 2019)
Публикации
1. Леконцева Н., Михайлина А., Бессонова Т., Фандо М., Тищенко С., Озолинь О., Гельфанд М., Тутукина М., Никулин А. Investigation of DNA-binding properties of the UxuR and ExuR proteins, regulators of hexuronate metabolism in gammaproteobacteria FEBS OPEN BIO, Том: 9 Стр.: 266-266 (год публикации - 2019)
2.
Бессонова Т.А., Леконцева Н.В., Швырева У.С., Никулин А.Д., Тутукина М.Н., Озолинь О.Н.
Overproduction and purification of the Escherichia coli transcription factors "toxic" to a bacterial cell
PROTEIN EXPRESSION AND PURIFICATION, Том: 161 Стр.: 70-77 (год публикации - 2019)
10.1016/j.pep.2019.05.001
3. Никулин А.Д., Леконцева Н.В., Бессонова Т.А., Швырева У.С., Фандо М.С., Тищенко С.В., Тутукина М.Н., Пуртов Ю.А., Озолинь О.Н. Исследование механизма контроля метаболического пути Эшвелла в Escherichia coli факторами транскрипции UxuR и ExuR Acta Naturae, специальный выпуск,, том 2, стр. 125 (год публикации - 2019)
Публикации
1. Тищенко С.В., Михайлина А.О., Леконцева Н.В., Столбоушкина Е.А., Никонова Е.Ю., Никонов О.С., Никулин А.Д. Структурные исследования РНК-белковых комплексов в пост-рибосомную эру журнал "Кристаллография" (год публикации - 2021)
2. Фандо М.С., Тутукина М.Н., Озолинь О.Н., Тищенко С.В., Никулин А.Д. Анализ влияния инактивации генов белков-регуляторов гексауронатного метаболизма uxur и exur на протеом Escherichia coli Биохимия (год публикации - 2021)
3. Леконцева Н.В., Михайлина А.О., Бессонова Т.А., Швырева У.С., Тутукина М.Н., Озолинь О.Н., Тищенко С.В., Никулин А.Д. Метаболизм гексуронатов в протеобактериях: взаимодействие белков-регуляторов транскрипции UxuR и ExuR с промоторной областью гена uxuAB Сборник тезисов 24-ой Международной Пущинской школы-конференции молодых ученых "Биология - наука XXI века", том 1, стр. 63-64 (год публикации - 2020)
4. Пуртов Ю.А., Тищенко С.В., Никулин А.Д. МОДЕЛИРОВАНИЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ ГЕТЕРОДИМЕРА UxuR-ExuR С КОМПОНЕНТАМИ МЕТАБОЛИЧЕСКОГО ПУТИ УТИЛИЗАЦИИ ГЕКСУРОНАТОВ В Escherichia coli Биофизика (год публикации - 2021)
5.
Бессонова Т.А., Фандо М.С., Костарева О.С., Тутукина М.Н., Озолинь О.Н., Гельфанд М.С., Никулин А.Д., Тищенко С.В.
Differential Impact of Hexuronate Regulators ExuR and UxuR on the Escherichia coli Proteome
International Journal of Molecular Science, 23, 8379 (год публикации - 2022)
10.3390/ijms23158379