КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ
Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.
ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ
Номер проекта 17-75-20039
НазваниеГенетическое разнообразие маркеров антибиотикорезистентности и факторов патогенности инфекций репродуктивного тракта
Руководитель Шаскольский Борис Леонидович, Кандидат химических наук
Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук , г Москва
Конкурс №24 - Конкурс 2017 года по мероприятию «Проведение исследований научными группами под руководством молодых ученых» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными
Область знания, основной код классификатора 05 - Фундаментальные исследования для медицины; 05-109 - Клиническая лабораторная диагностика и нанотехнологии в медицине
Ключевые слова Устойчивость к антибиотикам, возбудители инфекций репродуктивного тракта, детерминанты резистентности, факторы патогенности, Neisseria gonorrhoeae, Treponema pallidum, Mycoplasma genitalium, Ureaplasma sp., адгезины, CEACAM гаплотипы, генетическое разноообразие
Код ГРНТИ76.00.00
ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ
Аннотация
Проект направлен на исследование молекулярных механизмов формирования лекарственной устойчивости возбудителей инфекций репродуктивного тракта (ИРТ), инвентаризацию и систематизацию данных о детерминантах патогенности, патогенезе ИРТ и гаплотипах факторов восприимчивости человека к ИРТ. Будут выявлены корреляции между генетическими профилями адгезинов ИРТ, человеческих гаплотипов рецепторов адгезинов и особенностями патогенеза. Планируется изучение генетического разнообразия ИРТ с последующей разработкой молекулярных многопараметрических методов с целью выявления факторов патогенности и детерминант резистентности к широкому спектру антимикробных препаратов (АМП).
Актуальность проекта определяется возрастающими рисками, связанными с распространением резистентных к терапии форм возбудителей ИРТ. Согласно оценкам ВОЗ, ежегодно миллионы людей заболевают инфекциями, передаваемыми половым путем. Особенные опасения вызывает возбудитель гонореи. К настоящему времени обнаружены штаммы гонореи, устойчивые к основным препаратам, используемым для лечения: β-лактамным препаратам (включая цефалоспорины 3-го поколения), фторхинолонам, макролидам, тетрациклинам, аминоциклитам. Необходимо комплексное исследование как механизмов патогенеза и устойчивости к АМП у этиологических агентов этих заболеваний, так и факторов восприимчивости к ним у человека.
В ходе выполнения проекта будет впервые осуществлено определение генетических детерминант устойчивости к АМП и факторов патогенности наиболее опасных представителей ИРТ, таких как Neisseria gonorrhoeae, Mycoplasma sp., Ureaplasma sp., Treponema pallidum, на фоне генетического разнообразия системы «патоген-хозяин». При изучении механизмов антибиотикорезистентности будут исследованы фенотипические и генетические аспекты устойчивости к актуальным для каждого микроорганизма антимикробным препаратам: β-лактамам, макролидам, линкозамидам, стрептограмину и кетолидам (МЛСК), фторхинолонам, тетрациклинам, аминогликозидам. Исследование факторов патогенности ИРТ будет включать биоинформационный анализ с последующим таргетным секвенированием генов адгезинов и факторов, регулирующих их антигенное разнообразие. Изучение гаплотипического разнообразия генов рецепторов адгезинов будет включать анализ анамнеза пациентов, биоинформационный анализ и последующее таргетное секвенирование соответствующих генов. Новым является подход, учитывающий не только фенотипические и генетические характеристики этиологического агента ИРТ, но гаплотип человека. Будет также проведено изучение генетического разнообразия российской популяции N. gonorrhoeae, в результате которого будут выявлены тенденции в распространении генетических детерминант устойчивости и факторов патогенности N. gonorrhoeae на территории РФ за последние 10 лет. Обнаружение новых детерминант устойчивости и данные о разнообразии популяции N. gonorrhoeae будут новым вкладом в копилку данных о генетических изменениях патогенов под давлением АМП.
Для решения поставленных задач будут использованы современные микробиологические методы, таргентное секвенирование выбранных участков геномов, а также полногеномное секвенирование для наиболее важных клинических изолятов, биоинформационный анализ. Для N. gonorrhoeae как объекта, представляющего наибольшую клиническую проблему, по результатам анализа полиморфизмов, ассоциированных с антибиотикорезистентностью, будет проведена оценка вклада новых обнаруженных полиморфизмов в фенотипическую устойчивость методами обратной генетики.
Задачи проекта включают также создание молекулярного многопараметрического метода генетического скрининга ИРТ на основе биологических микрочипов, разработку и испытания Наборов реагентов для диагностики in vitro и подачу документов на их регистрацию в Федеральную службу по надзору в сфере здравоохранения (Росздравнадзор) в качестве медицинских изделий.
В результате проекта будут получены новые фундаментальные данные о современных генетических механизмах антибиотикорезистентности, патогенности и изменчивости возбудителей ИРТ, а также причинах их формирования, что в перспективе позволит усовершенствовать методы лабораторной диагностики. Полученные результаты обеспечат рациональное применение антибактериальных препаратов и переход к персонализированной медицине, высокотехнологичному здравоохранению и технологиям здоровьесбережения.
ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ