КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ
Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.
ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ
Номер проекта 17-74-20074
НазваниеМорфологические, экологические и молекулярные критерии биоразнообразия и таксономии трематод (Platyhelminthes: Trematoda) морских и пресноводных видов рыб Дальнего Востока
Руководитель Атопкин Дмитрий Матвеевич, Кандидат биологических наук
Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное учреждение науки «Федеральный научный центр Биоразнообразия наземной биоты Восточной Азии» Дальневосточного отделения Российской академии наук , Приморский край
Конкурс №24 - Конкурс 2017 года по мероприятию «Проведение исследований научными группами под руководством молодых ученых» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными
Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни; 04-109 - Паразитология
Ключевые слова трематоды, паразиты, рыбы, Дальний Восток, биоразнообразие, адаптация
Код ГРНТИ34.33.23
ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ
Аннотация
Проект направлен на изучение особенностей формирования биоразнообразия у паразитических плоских червей (трематод) за счет адаптаций на разных уровнях организации. Изучаемые виды инфицируют представителей морской и пресноводной ихтиофауны Дальнего Востока. Актуальность решаемой проблемы и, соответственно, поставленных задач обусловлена тем, что формирование морфо-анатомических, экологических и молекулярных особенностей у трематод носит исключительно адаптивный характер и направлено на расширение возможностей освоения новых видов хозяев. Изучение этих критериев одновременно у нескольких групп трематод позволит прояснить наличие общих закономерностей формирования адаптивной изменчивости у трематод, а также делать прогнозы эволюционных путей в пространственно-временном аспекте. Кроме того будет проведена ревизия некоторых таксономически сложных групп трематод (например, семейств Hemiuridae, Lecithasteridae и др.). Имеющиеся на сегодняшний день морфо-анатомические данные, используемые для идентификации таких групп трематод (ключи) в корне не соответствуют результатам оценки сходства/различия, основанным на молекулярных данных и должны быть пересмотрены в свете последних. Например, согласно Gibson and Bray (1979), основным диагностическим признаком трематод внутри семейства Hemiuridae является экзома - структура в хвостовой части тела, предположительно отвечающая за защиту трематод во время нахождения в пищеварительном тракте хозяина. Распределение этого признака в подсемействах Hemiuridae не согласуется с результатами молекулярных исследований. Так, подсемейство Aphanurinae, характеризующееся отсутствием экзомы, значительно ближе к трематодам с экзомой, а некоторые группы трематод без экзомы оказались в базальной части дерева Hemiuridae, что указывает на зачаточное, а не рудиментарное, как принято считать сейчас, состояние экзомы. Эти предварительные данные указывают на необходимость реконструкции филогенетических связей Hemiuroidea с их дальнейшим сравнительным анализом с имеющимися морфологическими данными, результаты которого должны лечь в основу таксономической ревизии исследуемых групп трематод.
В рамках проекта будут выполнены морфологические, экологические и молекулярно-генетические исследования фауны трематод дальневосточных видов морских и пресноводных рыб. Основное внимание будет уделено представителям двух отрядов: Azygiida и Plagiorchiida. Полученные результаты послужат основой для разработки стратегий по сохранению хозяйственно ценных видов животных и универсальных методов борьбы с гельминтозами, а также в качестве рекомендаций для таксономической ревизии отдельных семейств.
ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ
Публикации
1.
Атопкин Д.М., Беспрозванных В.В., Ха Д.Н., Нгуен В.Х., Нгуен В.Т., Чаленко К.П.
A new subfamily, Pseudohaploporinae subfam. n. (Digenea: Haploporidae), with morphometric and molecular analyses of two new species: Pseudohaploporus vietnamensis n. g., sp. n. and Pseudohaploporus planilizum n. g., sp. n. from Vietnamese mullet
Parasitology International, V. 69, P. 17-24 (год публикации - 2019)
10.1016/j.parint.2018.11.001
2.
Атопкин Д.М. Накао М., Беспрозванных В.В., Ха Д.Н., Нгуен В.Х.,Sasaki M.
Morphological and molecular data for species of Lecithaster Lühe, 1901 and Hysterolecithoides Yamaguti, 1934 (Digenea: Lecithasteridae) from fish of East Asia and phylogenetic relationships within the Hemiuroidea Looss, 1899
Journal of Helminthology, P. 1-13 (год публикации - 2018)
10.1017/S0022149X18001049
3. Атопкин Д.М., Беспрозванных В.В.., Ха Д.Н., Накао М. Молекулярная характеристика четырех видов трематод родов Lecithaster Luhe, 1901 и Hysterolecithoides Yamaguti, 1934 Дальнего Востока и анализ взаимосвязей внутри семейства Lecithasteridae Odhner, 1905 (Digenea: Hemiuroidea) Труды Центра паразитологии, С. 19-21 (год публикации - 2018)
4. Атопкин Д.М., Беспрозванных В.В., Ха Д.Н., Нгуен В.Х., Нгуен В.Т., Чаленко К.П. Молекулярная характеристика взаимоотношений трематод внутри семейства Haploporidae (Digenea: Haploporoidea): данные секвенирования рибосомной ДНК Материалы VI Съезда Паразитологического общества, C. 21. (год публикации - 2018)
5.
Соколов С.Г., Атопкин Д.М., Урабе М.
Redescription and supplementary molecular characteristics of Aspidogaster ijimai Kawamura, 1915 (Trematoda, Aspidogastrea, Aspidogastridae), a parasite of Cyprinus carpio Linnaeus, 1758 s. lato (Actinopterygii) and freshwater bivalves in East Asia
Parasitology International, Vol. 71, p. 167-176 (год публикации - 2019)
10.1016/j.parint.2019.04.017
6.
Атопкин Д.М., Беспрозванных В.В., Ха Д.Н., Нгуен В.Х., Хаматова А.Ю., Вайнутис К.С.
Morphometric and molecular analyses of Carassotrema koreanum Park, 1938 and Elonginurus mugilus Lu, 1995 (Digenea: Haploporidae) Srivastava, 1937 from the Russian Far East and Vietnam
Parasitology Research (год публикации - 2019)
10.1007/s00436-019-06328-4
7. Атопкин Д.М. COMPARATIVE POPULATION GENETIC ANALYSIS OF FAR EASTERN TREMATODE SPECIES OF THE FAMILY HAPLOPORIDAE NICOLL, 1914 – A PARASITES OF MULLETS Programm & Abstracts of Modern Achievements in Population, Evolutionary, and Ecological Genetics 2019: International Symposium, V. 1., P. 11. (год публикации - 2019)
8.
Атопкин Д.М., Чаленко К.П., Нгуен Х.В.
Population genetic analysis of trematode Parasaccocoelium mugili Zhukov, 1971 (Haploporidae Nicoll, 1914) from the Russian Far East and Vietnam based on ribosomal ITS and mitochondrial COI gene partial sequence data
Parasitology Research, Vol. 118, p. 2575–2581 (год публикации - 2019)
10.1007/s00436-019-06401-y
9.
Д.М. Атопкин, В.В. Безпрозванных, Д.Н. Ха, Х.В. Нгуен, Т.В, Нгуен
New species and new genus of Pseudohaploporinae (Digenea): Pseudohaploporus pusitestis sp. n. and Parahaploporus elegantus n. g., sp. n. (Digenea: Pseudohaploporinae) from Vietnamese mullet fish
Parasitology International (год публикации - 2019)
10.1016/j.parint.2019.102023
10. Атопкин Д.М., Чаленко К.П. ПОПУЛЯЦИОННО-ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ТРЕМАТОДЫ PARASACCOCOELIUM MUGILI ZHUKOV, 1971 (DIGENEA: HAPLOPORIDAE) ЮГА ДАЛЬНЕГО ВОСТОКА РОССИИ И ВЬЕТНАМА Сборник тезисов (приложение) Международного конгресса "VII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров (ВОГиС)", с.5 (приложение) (год публикации - 2019)
11. Атопкин Д. М., Беспрозванных В. В., Ха Д. Н., Нгуен В. Х. Сравнительный молекулярный анализ внутривидового разнообразия дальневосточных трематод семейства Haploporidae – паразитов кефалевых рыб Тезисы докладов VII Всероссийской конференции с международным участием "Школа по теоретической и морской паразитологии", Т. 1, с. 62 (год публикации - 2019)
12.
Атопкин Д.М,, Соколов С.Г., Вайнутис К.С.,Воропаева Е.Л., Шедько М.Б., Хоудхури А.
Amended diagnosis, validity and relationships of the genus Acrolichanus Ward, 1917 (Digenea: Allocreadiidae) based on the 28S rRNA gene, and observations on its lineage diversity
Systematic Parasitology, 97, 143–156 (год публикации - 2020)
10.1007/s11230-020-09901-z
13.
Соколов С.Г.,Воропаева Е.Л., Атопкин Д.М.
A new species of deropristid trematode from the sterlet Acipenser ruthenus (Actinopterygii: Acipenseridae) and revision of superfamily affiliation of the family Deropristidae
Zoological Journal of Linnean Society, zlaa015 (год публикации - 2020)
10.1093/zoolinnean/zlaa015
14.
Атопкин Д.М., Соколов С.Г.,Шедько М.Б., Вайнутис К.В., Орловская О.М.
Diversity of the genus Bunodera Railliet, 1896 (Trematoda: Allocreadiidae) in the northern part of Eastern Europe and North-eastern Asia, estimated from 28S rDNA sequences, with a description of Bunodera vytautasi sp. nov.
Parasitology Research (год публикации - 2018)
10.1007/s00436-018-5858-y
Публикации
1.
Атопкин Д.М., Беспрозванных В.В., Ха Д.Н., Нгуен В.Х., Нгуен В.Т., Чаленко К.П.
A new subfamily, Pseudohaploporinae subfam. n. (Digenea: Haploporidae), with morphometric and molecular analyses of two new species: Pseudohaploporus vietnamensis n. g., sp. n. and Pseudohaploporus planilizum n. g., sp. n. from Vietnamese mullet
Parasitology International, V. 69, P. 17-24 (год публикации - 2019)
10.1016/j.parint.2018.11.001
2.
Атопкин Д.М. Накао М., Беспрозванных В.В., Ха Д.Н., Нгуен В.Х.,Sasaki M.
Morphological and molecular data for species of Lecithaster Lühe, 1901 and Hysterolecithoides Yamaguti, 1934 (Digenea: Lecithasteridae) from fish of East Asia and phylogenetic relationships within the Hemiuroidea Looss, 1899
Journal of Helminthology, P. 1-13 (год публикации - 2018)
10.1017/S0022149X18001049
3. Атопкин Д.М., Беспрозванных В.В.., Ха Д.Н., Накао М. Молекулярная характеристика четырех видов трематод родов Lecithaster Luhe, 1901 и Hysterolecithoides Yamaguti, 1934 Дальнего Востока и анализ взаимосвязей внутри семейства Lecithasteridae Odhner, 1905 (Digenea: Hemiuroidea) Труды Центра паразитологии, С. 19-21 (год публикации - 2018)
4. Атопкин Д.М., Беспрозванных В.В., Ха Д.Н., Нгуен В.Х., Нгуен В.Т., Чаленко К.П. Молекулярная характеристика взаимоотношений трематод внутри семейства Haploporidae (Digenea: Haploporoidea): данные секвенирования рибосомной ДНК Материалы VI Съезда Паразитологического общества, C. 21. (год публикации - 2018)
5.
Соколов С.Г., Атопкин Д.М., Урабе М.
Redescription and supplementary molecular characteristics of Aspidogaster ijimai Kawamura, 1915 (Trematoda, Aspidogastrea, Aspidogastridae), a parasite of Cyprinus carpio Linnaeus, 1758 s. lato (Actinopterygii) and freshwater bivalves in East Asia
Parasitology International, Vol. 71, p. 167-176 (год публикации - 2019)
10.1016/j.parint.2019.04.017
6.
Атопкин Д.М., Беспрозванных В.В., Ха Д.Н., Нгуен В.Х., Хаматова А.Ю., Вайнутис К.С.
Morphometric and molecular analyses of Carassotrema koreanum Park, 1938 and Elonginurus mugilus Lu, 1995 (Digenea: Haploporidae) Srivastava, 1937 from the Russian Far East and Vietnam
Parasitology Research (год публикации - 2019)
10.1007/s00436-019-06328-4
7. Атопкин Д.М. COMPARATIVE POPULATION GENETIC ANALYSIS OF FAR EASTERN TREMATODE SPECIES OF THE FAMILY HAPLOPORIDAE NICOLL, 1914 – A PARASITES OF MULLETS Programm & Abstracts of Modern Achievements in Population, Evolutionary, and Ecological Genetics 2019: International Symposium, V. 1., P. 11. (год публикации - 2019)
8.
Атопкин Д.М., Чаленко К.П., Нгуен Х.В.
Population genetic analysis of trematode Parasaccocoelium mugili Zhukov, 1971 (Haploporidae Nicoll, 1914) from the Russian Far East and Vietnam based on ribosomal ITS and mitochondrial COI gene partial sequence data
Parasitology Research, Vol. 118, p. 2575–2581 (год публикации - 2019)
10.1007/s00436-019-06401-y
9.
Д.М. Атопкин, В.В. Безпрозванных, Д.Н. Ха, Х.В. Нгуен, Т.В, Нгуен
New species and new genus of Pseudohaploporinae (Digenea): Pseudohaploporus pusitestis sp. n. and Parahaploporus elegantus n. g., sp. n. (Digenea: Pseudohaploporinae) from Vietnamese mullet fish
Parasitology International (год публикации - 2019)
10.1016/j.parint.2019.102023
10. Атопкин Д.М., Чаленко К.П. ПОПУЛЯЦИОННО-ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ТРЕМАТОДЫ PARASACCOCOELIUM MUGILI ZHUKOV, 1971 (DIGENEA: HAPLOPORIDAE) ЮГА ДАЛЬНЕГО ВОСТОКА РОССИИ И ВЬЕТНАМА Сборник тезисов (приложение) Международного конгресса "VII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров (ВОГиС)", с.5 (приложение) (год публикации - 2019)
11. Атопкин Д. М., Беспрозванных В. В., Ха Д. Н., Нгуен В. Х. Сравнительный молекулярный анализ внутривидового разнообразия дальневосточных трематод семейства Haploporidae – паразитов кефалевых рыб Тезисы докладов VII Всероссийской конференции с международным участием "Школа по теоретической и морской паразитологии", Т. 1, с. 62 (год публикации - 2019)
12.
Атопкин Д.М,, Соколов С.Г., Вайнутис К.С.,Воропаева Е.Л., Шедько М.Б., Хоудхури А.
Amended diagnosis, validity and relationships of the genus Acrolichanus Ward, 1917 (Digenea: Allocreadiidae) based on the 28S rRNA gene, and observations on its lineage diversity
Systematic Parasitology, 97, 143–156 (год публикации - 2020)
10.1007/s11230-020-09901-z
13.
Соколов С.Г.,Воропаева Е.Л., Атопкин Д.М.
A new species of deropristid trematode from the sterlet Acipenser ruthenus (Actinopterygii: Acipenseridae) and revision of superfamily affiliation of the family Deropristidae
Zoological Journal of Linnean Society, zlaa015 (год публикации - 2020)
10.1093/zoolinnean/zlaa015
14.
Атопкин Д.М., Соколов С.Г.,Шедько М.Б., Вайнутис К.В., Орловская О.М.
Diversity of the genus Bunodera Railliet, 1896 (Trematoda: Allocreadiidae) in the northern part of Eastern Europe and North-eastern Asia, estimated from 28S rDNA sequences, with a description of Bunodera vytautasi sp. nov.
Parasitology Research (год публикации - 2018)
10.1007/s00436-018-5858-y
Публикации
1.
Атопкин Д.М., Беспрозванных В.В., Ха Д.Н., Нгуен В.Х., Нгуен В.Т., Чаленко К.П.
A new subfamily, Pseudohaploporinae subfam. n. (Digenea: Haploporidae), with morphometric and molecular analyses of two new species: Pseudohaploporus vietnamensis n. g., sp. n. and Pseudohaploporus planilizum n. g., sp. n. from Vietnamese mullet
Parasitology International, V. 69, P. 17-24 (год публикации - 2019)
10.1016/j.parint.2018.11.001
2.
Атопкин Д.М. Накао М., Беспрозванных В.В., Ха Д.Н., Нгуен В.Х.,Sasaki M.
Morphological and molecular data for species of Lecithaster Lühe, 1901 and Hysterolecithoides Yamaguti, 1934 (Digenea: Lecithasteridae) from fish of East Asia and phylogenetic relationships within the Hemiuroidea Looss, 1899
Journal of Helminthology, P. 1-13 (год публикации - 2018)
10.1017/S0022149X18001049
3. Атопкин Д.М., Беспрозванных В.В.., Ха Д.Н., Накао М. Молекулярная характеристика четырех видов трематод родов Lecithaster Luhe, 1901 и Hysterolecithoides Yamaguti, 1934 Дальнего Востока и анализ взаимосвязей внутри семейства Lecithasteridae Odhner, 1905 (Digenea: Hemiuroidea) Труды Центра паразитологии, С. 19-21 (год публикации - 2018)
4. Атопкин Д.М., Беспрозванных В.В., Ха Д.Н., Нгуен В.Х., Нгуен В.Т., Чаленко К.П. Молекулярная характеристика взаимоотношений трематод внутри семейства Haploporidae (Digenea: Haploporoidea): данные секвенирования рибосомной ДНК Материалы VI Съезда Паразитологического общества, C. 21. (год публикации - 2018)
5.
Соколов С.Г., Атопкин Д.М., Урабе М.
Redescription and supplementary molecular characteristics of Aspidogaster ijimai Kawamura, 1915 (Trematoda, Aspidogastrea, Aspidogastridae), a parasite of Cyprinus carpio Linnaeus, 1758 s. lato (Actinopterygii) and freshwater bivalves in East Asia
Parasitology International, Vol. 71, p. 167-176 (год публикации - 2019)
10.1016/j.parint.2019.04.017
6.
Атопкин Д.М., Беспрозванных В.В., Ха Д.Н., Нгуен В.Х., Хаматова А.Ю., Вайнутис К.С.
Morphometric and molecular analyses of Carassotrema koreanum Park, 1938 and Elonginurus mugilus Lu, 1995 (Digenea: Haploporidae) Srivastava, 1937 from the Russian Far East and Vietnam
Parasitology Research (год публикации - 2019)
10.1007/s00436-019-06328-4
7. Атопкин Д.М. COMPARATIVE POPULATION GENETIC ANALYSIS OF FAR EASTERN TREMATODE SPECIES OF THE FAMILY HAPLOPORIDAE NICOLL, 1914 – A PARASITES OF MULLETS Programm & Abstracts of Modern Achievements in Population, Evolutionary, and Ecological Genetics 2019: International Symposium, V. 1., P. 11. (год публикации - 2019)
8.
Атопкин Д.М., Чаленко К.П., Нгуен Х.В.
Population genetic analysis of trematode Parasaccocoelium mugili Zhukov, 1971 (Haploporidae Nicoll, 1914) from the Russian Far East and Vietnam based on ribosomal ITS and mitochondrial COI gene partial sequence data
Parasitology Research, Vol. 118, p. 2575–2581 (год публикации - 2019)
10.1007/s00436-019-06401-y
9.
Д.М. Атопкин, В.В. Безпрозванных, Д.Н. Ха, Х.В. Нгуен, Т.В, Нгуен
New species and new genus of Pseudohaploporinae (Digenea): Pseudohaploporus pusitestis sp. n. and Parahaploporus elegantus n. g., sp. n. (Digenea: Pseudohaploporinae) from Vietnamese mullet fish
Parasitology International (год публикации - 2019)
10.1016/j.parint.2019.102023
10. Атопкин Д.М., Чаленко К.П. ПОПУЛЯЦИОННО-ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ТРЕМАТОДЫ PARASACCOCOELIUM MUGILI ZHUKOV, 1971 (DIGENEA: HAPLOPORIDAE) ЮГА ДАЛЬНЕГО ВОСТОКА РОССИИ И ВЬЕТНАМА Сборник тезисов (приложение) Международного конгресса "VII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров (ВОГиС)", с.5 (приложение) (год публикации - 2019)
11. Атопкин Д. М., Беспрозванных В. В., Ха Д. Н., Нгуен В. Х. Сравнительный молекулярный анализ внутривидового разнообразия дальневосточных трематод семейства Haploporidae – паразитов кефалевых рыб Тезисы докладов VII Всероссийской конференции с международным участием "Школа по теоретической и морской паразитологии", Т. 1, с. 62 (год публикации - 2019)
12.
Атопкин Д.М,, Соколов С.Г., Вайнутис К.С.,Воропаева Е.Л., Шедько М.Б., Хоудхури А.
Amended diagnosis, validity and relationships of the genus Acrolichanus Ward, 1917 (Digenea: Allocreadiidae) based on the 28S rRNA gene, and observations on its lineage diversity
Systematic Parasitology, 97, 143–156 (год публикации - 2020)
10.1007/s11230-020-09901-z
13.
Соколов С.Г.,Воропаева Е.Л., Атопкин Д.М.
A new species of deropristid trematode from the sterlet Acipenser ruthenus (Actinopterygii: Acipenseridae) and revision of superfamily affiliation of the family Deropristidae
Zoological Journal of Linnean Society, zlaa015 (год публикации - 2020)
10.1093/zoolinnean/zlaa015
14.
Атопкин Д.М., Соколов С.Г.,Шедько М.Б., Вайнутис К.В., Орловская О.М.
Diversity of the genus Bunodera Railliet, 1896 (Trematoda: Allocreadiidae) in the northern part of Eastern Europe and North-eastern Asia, estimated from 28S rDNA sequences, with a description of Bunodera vytautasi sp. nov.
Parasitology Research (год публикации - 2018)
10.1007/s00436-018-5858-y