КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ
Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.
ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ
Номер проекта 16-14-00216
НазваниеИзучение системы кобальт-зависимой экспрессии генов в бактериях Rhodococcus и создание на её основе платформы для получения биокатализаторов синтеза акриловых мономеров
Руководитель Яненко Александр Степанович, Доктор биологических наук
Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное учреждение "Государственный научно-исследовательский институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов Национального исследовательского центра "Курчатовский институт" , г Москва
Конкурс №11 - Конкурс 2015 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований по приоритетным тематическим направлениям исследований» (11)
Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни; 04-209 - Биотехнология (в том числе бионанотехнология)
Ключевые слова экспрессия генов, генная инженерия, Rhodococcus, нитрилаза, ациламидаза, нитрилгидратаза, кобальт, акриловые мономеры, биотехнология
Код ГРНТИ34.15.27
ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ
Аннотация
В рамках настоящего проекта предполагается изучить особенности системы кобальт-зависимой экспрессии генов в бактериях Rhodococcus, обеспечивающей высокий уровень накопления ферментов в клетке (свыше 40% от белков клетки) и разработать на основе этой системы универсальную платформу для создания штаммов родококков с высокой активностью ферментов нитрилгидратазы, нитрилазы и амидазы для синтеза акриловых мономеров. Изучение механизма высокоэффективной кобальт-зависимой системы экспрессии генов в бактериях Rhodococcus и выяснение причин высокой экспрессии позволит использовать важнейшие преимущества бактерий Rhodococcus в качестве биокатализаторов - клетки родококков обладают ценными технологическими свойствами, такими как механическая прочность, термо- и осмотолерантность, устойчивость в широком диапазоне рН, устойчивость к действию органических растворителей.
ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ
Публикации
1. Лавров К.В., Новиков А.Д., Калинина Т.И., Шемякина А.О., Гречишникова Е.Г., Рябченко Л.Е., Яненко А.С. New cblA gene participates in regulation of cobalt-dependent expression of nitrile hydratase genes in Rhodococcus rhodochrous Microbiological research (год публикации - 2017)
2. Новиков А.Д., Рябченко Л.Е., Леонова Т.Е., Ларикова Г.А., Лавров К.В., Глинский С.А., Яненко А. С. Бактериальный штамм Alcaligenes denitrificans С-32 содержит две нитрилазы с разной субстратной специфичностью Биотехнология / Applied Biochemistry and Microbiology, Том 32, номер 6 (год публикации - 2016)
Публикации
1. Новиков А.Д., Лавров К.В., Касьянов А.С., Герасимова Т.В., Яненко А.С. Draft Genome Sequence of Rhodococcus sp. M8, which can degrade a broad range of nitriles Genome Announcements (год публикации - 2017)
2. Лавров К.В., Шемякина А.О., Гречишникова Е.Г., Новиков А.Д., Калинина Т.И., Яненко А.С Nickel ions can activate transcription of Co-type nitrile hydratase in Rhodococcus rhodochrous Microbiological Research (год публикации - 2018)
3. Новиков А.Д., Лавров К.В., Гречишникова Е.Г., Шемякина А.О., Герасимова Т.В., Калинина Т.И., Яненко А.С Оптимизация экспрессии нитрилазы из Alcaligenes denitrificans в Rhodococcus rhodochrous для биокаталитического получения акрилата аммония Биотехнология/Applied Biochemistry and Microbiology (год публикации - 2017)
Публикации
1. Лавров К.В., Шемякина А.О., Гречишникова Е.Г., Калинина Т.И., Новиков А.Д., Яненко А.С. Новая высокоэффективная микробная платформа для получения ферментов синтеза акриловых мономеров в бактериях Rhodococcus на основе кобальт-зависимой системы экспрессии генов Acta Naturae, 2017 год, спецвыпуск (год публикации - 2017)
2.
Лавров К. В., Яненко А.С.
Биокаталитические технологии синтеза акриловых мономеров
Биотехнология, 2018, спецвыпуск (год публикации - 2018)
10.21519/0234-2758-2018-S-37-37
3.
Шемякина А.О., Гречишникова Е.Г., Новиков А.Д., Калинина Т.А., Лавров К. В., Яненко А.С.
Направленная регуляция активности промотора нитрилгидратазы в экспрессионной системе в бактериях Rhodococcus rhodochrous
Биотехнология, 2018, спецвыпуск (год публикации - 2018)
10.21519/0234-2758-2018-S-57-57
4.
Лавров К.В., Шемякина А.О., Гречишникова Е.Г., Новиков А.Д., Дербиков Д.Д., Калинина Т.И., Яненко А.С.
New cblA gene participates in regulation of cobalt-dependent transcription of nitrile hydratase genes in Rhodococcus rhodochrous
Research in Microbiology, Volume 169, Issues 4–5, Pages 227-236 (год публикации - 2018)
10.1016/j.resmic.2018.03.006
5.
Новиков А. Д., Рябченко Л. Е., Леонова Т.Е., Ларикова Г.А., Лавров К. В., Глинский С.А., Яненко А. С.
Bacterial strain Alcaligenes denitrificans C-32 containing two nitrilases with different substrate specificities.
Applied Biochemistry and Microbiology, Volume 53, Issue 8, pp 786–791 (год публикации - 2017)
10.1134/S0003683817080051
6.
Новиков А.Д., Лавров К.В., Касьянов А.С., Герасимова Т.В., Яненко А.С.
Draft genome sequence of Rhodococcus sp. Strain M8, which can degrade a broad range of nitriles.
Microbiology Resource Announcements, Volume 6 (год публикации - 2018)
10.1128/genomeA.01526-17.
7. Е.Г. Гречишникова, К.В. Лавров, А.О. Шемякина, А.Д. Новиков, А.С. Епремян, А.С. Яненко. Инструменты генетической инженерии для конструирования штаммов для биотехнологии на базе бактерий рода Rhodococcus Биотехнология (год публикации - 2019)
8. Лавров К.В., Шемякина А.О., Гречишникова Е.Г., Калинина Т.И., Яненко А.С, Efficient expression of an acylamidase in Rhodococcus rhodochrous for biocatalytic synthesis of functionalized acrylic monomers - N-substituted acrylamides Applied Microbiology and Biotechnology (год публикации - 2019)
9. Лавров К.В., Гречишникова Е.Г., Шемякина А.О., Новиков А.Д., Калинина Т.И., Глинский С.А., Минасян Р.А., Воронин С.П., Яненко А.С. Гетерологичная экспрессия нитрилазы в Rhodococcus rhodochrous для конструирования биокатализатора синтеза акрилата аммония. Биотехнология (год публикации - 2019)
10. Лавров К.В. Шемякина А.О., Гречишникова Е.Г., Калинина Т.И., Яненко А.С. In vivo metal selectivity of metal-dependent biosynthesis of Co-type nitrile hydratase in Rhodococcus bacteria: a new look at the nitrile hydratase maturation mechanism? Metallomics (год публикации - 2019)