Исследование роли архейных РНК-связывающих белков Lsm в регуляции экспрессии генов

КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ

Номер проекта 14-14-00496

НазваниеИсследование роли архейных РНК-связывающих белков Lsm в регуляции экспрессии генов

Руководитель Никулин Алексей Донатович, Доктор химических наук

Организация финансирования, регион федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт белка Российской академии наук , Московская обл

Конкурс №1 - Конкурс 2014 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами»

Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни; 04-202 - Протеомика; структура и функции белков

Ключевые слова Экспрессия генов, регуляция трансляции, археи, Lsm белки, SmAP

Код ГРНТИ34.15.17

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ

Аннотация
Регуляция экспрессии генов (процесса преобразования наследственной информации от гена в белок или нетранслируемую РНК) определяет состояние и функцию каждой живой системы (клетки или организма). Важную роль в регуляции экспрессии генов играют взаимодействия белков с ДНК и РНК, которые зачастую определяют скорость и направление происходящих процессов. Структурно-функциональные исследования белков-регуляторов транскрипции и трансляции, а также детализация их взаимодействий со специфически узнаваемыми участками ДНК и РНК, имеет большую значимость для понимания регуляции экспрессии генов во всех живых организмах. Предлагаемый нами проект направлен на структурно-функциональные исследования архейных РНК-связывающих Sm-подобных белков SmAP и определение их роли в регуляции экспрессии генов. Археи обладают рядом генетических и биохимических признаков, объединяющих их как с прокариотами, так и эукариотами. Бактериальные Lsm белки Hfq выполняют роль РНК-шаперонов, способствующих взаимодействию регуляторных РНК с мРНК. Эукариотические Sm/Lsm белки выполняют в основном роль каркасных белков, входя в состав сплайсосом и теломераз. В археях отсутствует развитая эукариотическая система процессинга РНК и структурная организация SmAP белков ближе к бактериальной. Выполнение предлагаемого проекта позволит не только выяснить участие и роль SmAP белков в регуляции экспрессии генов архей, но и позволит прояснить картину эволюцию ключевых этапов процессинга РНК в эукариотах.

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ

Публикации

1. Мурина В.Н., Никулин А.Д. Bacterial Small Regulatory RNAs and Hfq Protein Biochemistry (Moscow), v. 80, No 13, pp. 33-48 (год публикации - 2015)
10.1134/S0006297915130027

2. Никулин А.Д., Михайлина А.О., Леконцева Н.В., Балобанов В.А., Никонова Е.Ю., Тищенко С.В. Characterization of RNA-binding properties of the archaeal Hfq-like protein from Methanococcus jannaschii Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, Epub ahead of print (год публикации - 2016)
10.1080/07391102.2016.1189849

3. Мурина В.Н., Селиванова О.М., Михайлина А.О., Казаков А.С., Никонова Е.Ю., Леконцева Н.В., Тищенко С.В., Никулин А.Д. НАДМОЛЕКУЛЯРНАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ ФИБРИЛЛ Hfq-ПОДОБНЫХ БЕЛКОВ Биохимия, т. 80, вып 4, с. 517-526 (год публикации - 2015)
10.1134/S0006297915040070

4. Немчинова М., Балобанов В., Никонова Е., Леконцева Н., Михайлина А., Тищенко С., Никулин А. An Experimental Tool to Estimate the Probability of a Nucleotide Presence in the Crystal Structures of the Nucleotide–Protein Complexes Protein J., 36(3):157-165 (год публикации - 2017)
10.1007/s10930-017-9709-y

5. Мурина В. Н., Никулин А. Д. БАКТЕРИАЛЬНЫЕ МАЛЫЕ РЕГУЛЯТОРНЫЕ РНК И БЕЛОК HFQ Успехи биологической химии, т. 55, с. 33-48 (год публикации - 2015)

6. Суворина М.Ю., Селиванова О.М., Григорашвили Е.И., Никулин А.Д., Марченков В.В., Сурин А.К., Галзитская О.В. Studies of Polymorphism of Amyloid-42 Peptide from Different Suppliers Journal of Alzheimer’s Disease, v. 47, pp. 583-593 (год публикации - 2015)
10.3233/JAD-150147

7. Леконцева Н.В., Немчинова М.С., Балобанов В.А., Мурина В.Н., Никулин А.Д. Структурные исследования нуклеотид- и РНК-связывающих свойств белков-регуляторов транскрипции АКТУАЛЬНЫЕ ВОПРОСЫ БИОЛОГИЧЕСКОЙ ФИЗИКИ И ХИМИИ, 1-1, 246-250 (год публикации - 2016)

8. Леконцева Н., Мурина В., Никонова Е., Селиванова О., Тищенко С., Никулин А. Investigation of RNA-binding properties and oligomerization behavior of Sm-like archaeal proteins FEBS JOURNAL, v. 282, Issue Supplement S1, p. 341 (год публикации - 2015)
10.1111/febs.13339

Публикации