КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 22-73-00088

НазваниеНовый синтетический подход к производным пирроло[2,1-b][1,3]бензотиазола на основе реакции сужения 1,4-тиазинового цикла в пирроло[2,1-c][1,4]бензотиазине под действием нуклеофильных реагентов

РуководительХрамцова Екатерина Евгеньевна, Кандидат химических наук

Организация финансирования, регион Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Пермский государственный национальный исследовательский университет", Пермский край

Период выполнения при поддержке РНФ 07.2022 - 06.2024 

Конкурс№70 - Конкурс 2022 года «Проведение инициативных исследований молодыми учеными» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными.

Область знания, основной код классификатора 03 - Химия и науки о материалах, 03-101 - Синтез, строение и реакционная способность органических соединений

Ключевые словапирроло[2,1-c][1,4]бензотиазин, пирроло[2,1-b][1,3]бензотиазол, сужение цикла, нуклеофильные реагенты, поликарбонильные соединения, биологическая активность

Код ГРНТИ31.21.27


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Проблема разработки эффективных методов направленного синтеза гетероциклических соединений с заданными структурой и свойствами является центральной для органической химии. Эта проблема носит не только фундаментальный, но и прикладной характер, связанный с разработкой препаративных методов синтеза новых органических соединений, пригодных для дальнейшего использования в органическом синтезе (малотоннажная химия, тонкий органический синтез), и исследованием наличия у них полезных свойств (новые биологически активные соединения, антиоксиданты, флуорофоры, красители, и др. функциональные материалы). Актуальность решения этой проблемы была подчеркнута событиями последних двух лет, связанными с пандемией COVID-19. Оперативное создание новых лекарств невозможно без наличия разработанных эффективных методов синтеза разнообразных лекарственноподобных гетероциклических соединений, которые будут доступны для скринингов (особенно невиртуальных). Современные скрининговые подходы значительно интенсифицированы методами компьютерного моделирования и позволяют предсказывать химическую структуру, которая будет обладать нужными свойствами. Однако синтетические методы к предсказанным структурам не всегда бывают известны и доступны. Колоссальное структурное разнообразие потенциальных гетероциклических структур, которые могут быть в любой момент востребованы современными технологиями, требуют огромного набора синтетических подходов к ним, основанных на разных принципах сборки гетероциклического остова и позволяющих варьировать заместители в широком диапазоне. Создание таких структур невозможно без прогресса в области разработки методов построения новых функционализированных производных гетероциклов и исследования биологической активности полученных продуктов. Поэтому проблема разработки эффективных методов направленного синтеза гетероциклических соединений с заданными структурой и свойствами остается одной из самых актуальных для тонкого органического синтеза, медицинской химии и фармакологии. Данный проект направлен на развитие новой для научного коллектива тематики, поскольку центральные объекты исследования не описаны в литературе и данных об их химических превращениях нет. Ожидается, что целевые соединения будут обладать химическими свойствами, которые не могут иметь их окса- и аза-аналоги, поскольку тиоэфирная группа сильно отличается по свойствам от эфирной и амидной групп (легче реагирует с нуклеофилами, обладает меньшими электроноакцепторными свойствами), что кардинально повлияет на изменение реакционной способности целевых соединений в сравнении с их окса- и аза-аналогами. Целевые соединения не описаны в литературе и данных об их химических превращениях нет, потому что до 2020 года не было описано воспроизводимой методики синтеза их прекурсоров. Недавно коллективом проекта был разработан метод синтеза необходимых прекурсоров – гетероциклических енаминов на базе 1,4-бензотиазин-2-она, которые не были известны ранее (из-за наличия ряда публикаций с ошибочным методом их синтеза). На основе этих енаминов впервые были получены пирролобензотиазинтрионы – центральные структуры данного проекта. Изучая реакционную способность этих соединений, коллективом проекта была обнаружена редкая реакция сужения цикла. В базах данных Reaxys и SciFinder-n имеется около двух десятков публикаций, в которых описано протекание похожего сужения цикла. Как правило, реакция сужения цикла в шестичленных серусодержащих гетероциклах до пятичленных серусодержащих гетероциклов протекает под действием кислот Льюиса, УФ-излучения или окислителей. В случае реакции, предлагаемой для реализации, проекта наблюдается редкий случай сужения тиазинового цикла под действием нуклеофильного реагента. Таким образом, научная новизна данного проекта складывается из трех составляющих: – исследование химических превращений ранее недоступного класса химических соединений, – изучение свойств новых химических соединений, наработанных в результате исследованных превращений, – поиск новых классов биологически активных соединений в недоступной ранее области химического пространства. Перспективность поиска биологически активных соединений среди структур, на которые нацелен проект, обусловлена двумя фактами. Во-первых, целевые соединения близки по структуре к известным противоопухолевым соединениям – ингибиторам центромер-ассоциированного белка Е. Во-вторых, близкие аналоги целевых структур обладают выраженной противотуберкулезной активностью.

Ожидаемые результаты
В случае успешной реализации проекта будут найдены новые эффективные методы направленного синтеза гетероциклических соединений с заданными структурой и свойствами, пригодных для дальнейшего использования в органическом синтезе (малотоннажная химия, тонкий органический синтез), и исследованием наличия у них полезных свойств (новые биологически активные соединения, антиоксиданты, ингибиторы коррозии, флуорофоры, красители, и др. функциональные материалы). Будут впервые получены данные о реакционной способности пирроло[2,1-c][1,4]бензотиазинов (беспрецедентных гетарено[e]пиррол-2,3-дионов, содержащих тиолактонный фрагмент), которые на данный момент не описаны в литературе. Это даст начало возможности разработок новых структурно-разнообразных библиотек новых гетероциклов, обладающих полезными свойствами, на основе химических превращений пирроло[2,1-c][1,4]бензотиазинов. Будут впервые изучены закономерности протекания ранее неизвестной реакции сужения цикла в пирроло[2,1-c][1,4]бензотиазине под действием нуклеофильных реагентов, ведущей к новым производным пирроло[2,1-b][1,3]бензотиазола. В результате чего будут расширены теоретические знания о реакционной способности тиагетероциклов. Открытые пути синтеза новых гетероциклических систем будут применены для синтеза практически значимых аналогов соединений, проявляющих выраженную биологическую активность. Полученные библиотеки уникальных производных гетероциклов будут проверяться на наличие цитотоксической и противомикробной активностей. В результате реализации исследования будут получены фундаментальные знания в области органической химии (химические превращения новых гетероциклов и их свойства) и фармакологии (данные о биологической активности новых химических соединений), которые будут полезны для решения актуальных мировых проблем. В результате планируется разработка препаративных методов синтеза новых гетероциклических систем: пирроло[2,1-b][1,3]бензотиазолов (в том числе содержащих дополнительную функциональную группу, аннелированных по стороне [3,3a] разнообразными гетероциклами или содержащих мостиковый фрагмент между атомами 2 и 3а), 2-замещенных 3-ацил-2-гидрокси-1H-бензо[b]пирроло[1,2-d][1,4]тиазин-1,4(2H)-дионов, 3а-замещенных 3-ацил-2-гидрокси-1H-бензо[b]пирроло[1,2-d][1,4]тиазин-1,4(3aH)-дионов, 2,4-диоксо-3-(2-оксо-2H-бензо[b][1,4]тиазин-3(4H)-илиден)-4-ацилбутаноилов. В целом проект имеет как практическое, так и теоретическое значение. С теоретической стороны это исследование ранее неизвестной химической реакции (сужение цикла в пирролобензотиазине до пирролобензотиазола), получение новых знаний для теоретической органической химии, получение данных о биологической активности новых гетероциклических структур, получение новых знаний для медицины и фармации. С практической стороны это разработка препаративных методов синтеза новых гетероциклических соединений, близких аналогов соединений, обладающих выраженной биологической активностью, что может быть использовано для разработки новых лекарственных средств, которые могут быть использованы для борьбы с социально-значимыми заболеваниями.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2022 году
Пирроло[2,1-b][1,3]бензотиазолы представляют собой важный класс конденсированных серо- и азотсодержащих гетероциклов, интенсивно изучаемых в медицинской химии и фармакологии. Нами разработан новый синтетический подход к пирролобензотиазолам, основанный на реакции сужения 1,4-тиазинового цикла в 3-ароилпирроло[2,1-c][1,4]бензотиазин-1,2,4-трионах под действием нуклеофилов. Установлено, что предлагаемый подход хорошо работает в случае алканолов, бензиламина и ариламинов. Изучены возможности и ограничения разработанного подхода. Синтезированные производные пирролобензотиазола представляют интерес для фармацевтики, поскольку их близкие аналоги проявляют ингибирующую активность в отношении CENP-E, интересную для разработки таргетной терапии рака. В течение первого года реализации проекта взаимодействием ацилпировиноградных кислот о-аминотиофенолом в присутствии дициклогексилкарбодиимида наработаны исходные гетероциклические енамины, ацилированием которых оксалилхлоридом наработаны целевые пирролобензотиазинтрионы. При попытках расширения ряда доступных пирролобензотиазинтрионов на более широкий ряд ацильных заместителей, при использовании условий из разработанной нами ранее методики, вместо целевых пирролобензотиазинтрионов образовывались ранее неизвестные пирролобензотиазолдионы или их неразделимые смеси. Образование пирролобензотиазолдионов, по-видимому, происходило в результате взаимодействия пирролобензотиазинтрионов с HCl, образующимся в реакции ацилирования. Исходя из этого предположения, нам удалось оптимизировать синтез пирролобензотиазинтрионов, снизив образование пирролобензотиазолдионов до следовых количеств, выдуванием образующегося HCl пропусканием безводного аргона через реакционные смеси ацилирования енаминов оксалилхлоридом. Взаимодействием пирролобензотиазинтрионов с водой получены ранее неизвестные продукты гидратации. Взаимодействием пирролобензотиазинтрионов с алканолами получено два ряда продуктов: продукты нуклеофильного присоединения алканолов по атому C3a пирролобензотиазинтрионов и искомые продукты сужения 1,4-тиазинового цикла. Удалось найти условия для селективного синтеза каждого из этих рядов. Взаимодействием пирролобензотиазинтрионов с первичными аминами (ариламины и бензиламин) получено два ряда продуктов: продукты нуклеофильного присоединения аминов по атому C1 пирролобензотиазинтрионов с последующим раскрытием цикла по связи C1–N и продукты сужения 1,4-тиазинового цикла. В реакции пирролобензотиазинтрионов с морфолином удалось выделить продукты нуклеофильного присоединения NH морфолина по атому C1 пирролобензотиазинтрионов с последующим раскрытием цикла по связи C1–N. Для исследования оптимизации условий проведения исследованных реакций методом ВЭЖХ-УФ пришлось дериватизировать in situ образующиеся продукты сужения цикла для получения хорошего сигнала на ВЭЖХ. Дериватизация велась аминированием 3-гидроксипиррол-2-оного фрагмента дициклогексилкарбодиимидом. Интересные результаты были получены со стерически затруднёнными и/или слабыми мононуклеофилами (трет-бутиловый спирт, бензиловый спирт, бензгидрол, 2-аминобензотиазол). При взаимодействии пирролобензотиазинтрионов с ними вместо ожидаемых продуктов сужения 1,4-бензотиазинового цикла были получены пирролобензотиазолдионы. В данном случает реакция, по-видимому, протекает по схеме аналогичной схеме реакции пирролобензотиазинтрионов с HCl. Поскольку разработанные соединения близки по структуре к известным противоопухолевым соединениям – ингибиторам центромер-ассоциированного белка Е (CENP-E), представлялось интересным исследовать возможности их связывания с этой мишенью методом молекулярного докинга. Согласно полученным результатам, исследованные соединения показали очки связывания на уровне лиганда сравнения или выше, чем у него, что может свидетельствовать о большем сродстве этих соединений к исследуемому протеину. По результатам молекулярного докинга было отобрано несколько представителей синтезированных соединений, и исследованы их цитотоксические свойства в отношении раковых клеток колоректальной карциномы и нормальных клеток человека. В результате установлено, что одно из них обладает выраженным селективным цитотоксическим эффектом. Кроме того, ряды синтезированных соединений были исследованы на противомикробные свойства в отношении патогенов Staphylococcus aureus, Escherichia coli. В результате установлено, что несколько представителей обладают ингибирующей активностью в отношении S. aureus. Ряды синтезированных соединений были исследованы на росторегулирующую активность в отношении зеленых микроводорослей Chlorella vulgaris. В результате предварительного скрининга установлено, что часть из этих соединений обладает ростостимулирующей активностью.

 

Публикации

1. Лысцова Е.А., Дмитриев М.В., Масливец А.Н., Храмцова Е.Е. Nucleophile-induced ring contraction in pyrrolo[2,1-c][1,4]benzothiazines: access to pyrrolo[2,1-b][1,3]benzothiazoles Beilstein Journal of Organic Chemistry, 2023, 19, 646–657 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.3762/bjoc.19.46


Аннотация результатов, полученных в 2023 году
Нами расширены границы применения нового синтетического подхода к пирролобензотиазолам, основанного на реакции сужения 1,4-тиазинового цикла в 3-ароилпирроло[2,1-c][1,4]бензотиазин-1,2,4-трионах под действием нуклеофилов. Установлено, что предлагаемый подход хорошо работает и в случае оснований Шиффа и карбодиимидов. Изучены возможности и ограничения разработанного подхода на 1,3-бинуклеофилах и C=N нуклеофилах. Синтезированные производные пирролобензотиазола представляют интерес для фармацевтики, поскольку их близкие аналоги проявляют ингибирующую активность в отношении CENP-E, интересную для разработки таргетной терапии рака. В течение второго года реализации проекта при исследовании взаимодействия пирролобензотиазинтрионов с первичными β-CH енаминами, содержащими электроноакцепторные заместители при двойной связи удалось выделить лабильные продукты реакции – спиробисгетероциклы. Поскольку результаты исследования реакции пирролобензотиазинтрионов с енаминами были не особо удовлетворительными, мы исследовали реакции пирролобензотиазинтрионов с индолом и 2,3-диметилхиноксалином. Взаимодействием бензоилпирролобензотиазинтриона с 2,3-диметилхиноксалином был получен ранее неизвестный хиноксалинилпирролобензотиазин. Взаимодействием пирролобензотиазинтрионов с индолом были получены ранее недоступные индолилпирролобензотиазины. В целом реакции пирролобензотиазинтрионов с енаминами, 2,3-диметилхиноксалином и индолом протекали по классическим путям взаимодействия гетарено[e]пиррол-2,3-дионов (5-окса- и 5-аза-аналогов пирролобензотиазинтрионов) с такими реагентами, и искомых продуктов сужения цикла обнаружено не было. С N,N´-диалкилзамещенными мочевинами обнаружено новое направление нуклеофильной трансформации пирролобензотиазинтрионов, сопровождаемое сужением тиазинового цикла, ведущее к образованию 5-(1-(бензо[d]тиазол-2-ил)-1,3-диоксопропан-2-илиден)-имидазолов. Подобный каскад нуклеофильных рециклизаций ранее не встречался в химии 1H-пиррол-2,3-дионов. В реакциях пирролобензотиазинтрионов с енолами удалось выделить два ряда продуктов – гетероциклические альдоли и гетероциклические ансамбли. В реакциях пирролобензотиазинтрионов с основаниями Шиффа впервые были выделены тетрациклические алкалоидоподобные продукты. Образование этих соединений происходит диастереоселективно через стадии сужение тиазинового цикла под действием нуклеофила – внутримолекулярная циклизация. Кроме того, при оптимизации реакции пирролобензотиазинтрионов с основаниями Шиффа были выделены побочные продукты этой реакции – бензотиазинилиденпирролы. В реакциях пирролобензотиазинтрионов с диалкилкарбодиимидами впервые были выделены тетрациклические алкалоидоподобные продукты. Поскольку разработанные соединения близки по структуре к известным противоопухолевым соединениям – ингибиторам центромер-ассоциированного белка Е (CENP-E), представлялось интересным исследовать возможности их связывания с этой мишенью методом молекулярного докинга. Согласно полученным результатам, исследованные соединения показали очки связывания не выше уровня лиганда сравнения, что может свидетельствовать о сродстве этих соединений к исследуемому протеину. По результатам молекулярного докинга было отобрано несколько представителей синтезированных соединений, и исследованы их цитотоксические свойства в отношении раковых клеток колоректальной карциномы и нормальных клеток человека. В результате установлено, что ни одно из них не обладает выраженным селективным цитотоксическим эффектом. Кроме того, ряды синтезированных соединений были исследованы на противомикробные свойства в отношении патогенов Staphylococcus aureus, Escherichia coli. В результате установлено, что несколько представителей обладают ингибирующей активностью в отношении S. aureus. Ряды синтезированных соединений были исследованы на росторегулирующую активность в отношении зеленых микроводорослей Chlorella vulgaris. В результате предварительного скрининга установлено, что часть из этих соединений обладает ростостимулирующей активностью.

 

Публикации

1. Лысцова Е.А., Храмцова Е.Е. 3-Benzoyl-2-hydroxy-3a-[(3-methylquinoxalin-2-yl)methyl]-1H-pyrrolo[2,1-c][1,4]benzothiazine-1,4(3aH)-dione Molbank, 2023. – № 4. – M1749 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.3390/M1749

2. Лысцова Е.А.,Новокшонова А.Д., Храмцов П.В., Новиков А.С., Дмитриев М.В., Масливец А.Н., Храмцова Е.Е. Reaction of pyrrolobenzothiazines with Schiff bases and carbodiimides: approach to angular 6/5/5/5-tetracyclic spiroheterocycles Molecules, 29(9), 2089 (год публикации - 2024) https://doi.org/10.3390/molecules29092089

3. Лысцова Е.А., Масливец А.Н., Храмцова Е.Е. Нуклеофильная трансформация пирролобензотиазинтрионов под действием оснований Шиффа и карбодиимидов Всероссийская молодежная научная школа-конференция «Актуальные проблемы органической химии»: Сборник тезисов, Шерегеш, 2024., С. 70 (год публикации - 2024)

4. Лысцова Е.А., Храмцова Е.Е., Масливец А.Н. Новый подход к производным пирролобензотиазола на основе реакций пирролобензотиазинтрионов с OH- и NH-нуклеофилами Сборник тезисов VII международной конференции "Современные синтетические методологии для создания лекарственных препаратов и функциональных материалов (MOSM2023)", c. 142 (год публикации - 2023)


Возможность практического использования результатов
Результаты проекта могут быть востребованы при создании библиотек химических соединений для высокопроизводительного скрининга (HTS). Разработанные методы синтеза могут быть использованы на предприятиях, работающих в области тонкого органического синтеза. Результаты исследований биологической активности (противомикробной, цитотоксической, росторегулирующей в отношении микроводорослей) могут быть использованы в проектах по фармакологии и биотехнологии.