КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 22-71-10120

НазваниеМатематическое моделирование эффективной магнитоэнцефалографии с применением новых типов магнитометров

РуководительБуторина Анна Валерьевна, Кандидат биологических наук

Организация финансирования, регион Автономная некоммерческая образовательная организация высшего образования «Сколковский институт науки и технологий», г Москва

Период выполнения при поддержке РНФ 07.2022 - 06.2025 

Конкурс№71 - Конкурс 2022 года «Проведение исследований научными группами под руководством молодых ученых» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными.

Область знания, основной код классификатора 01 - Математика, информатика и науки о системах, 01-205 - Математические модели в науках о живом

Ключевые словамагнитоэнцефалография, нейровизуализация, математическое моделирование, магнитометры с оптической накачкой, феррозондовые магнитометры, обратные и некорректные задачи математической физики, дифференциальные уравнения в частных производных

Код ГРНТИ27.41.19


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Грант посвящен исследованию особенностей сигналов, получаемых при применении магнитометров различной природы (с учетом их шумовых характеристик, расстояния от головы до сенсора, их числа в зависимости от геометрических размеров) на основе применения методов математической физики, а также решению обратной задачи при снятии сигнала магнитометрами различной природы с разными размещениями сенсоров на поверхности головы. Проект имеет следующие цели: 1. Исследование алгоритмов моделирования сигнала на сенсорах МЭГ с использованием разных типов магнетометров: магнетометров на основе железо-иттриевого граната (ЖИГ), атомных магнитометров с оптической накачкой (МОН) и сверхпроводящих квантовых интерферометров (СКВИД). 2. Исследование соотношения сигнала к шуму системы сенсоров различной природы на смоделированных данных. Моделирование проводится на анатомических моделях коры головного мозга с источниками, выбранными на базе той или иной нейрокогнитивной задачи. 3. Выбор и расчет прямых метрик. 4. Исследование решения обратной задачи.

Ожидаемые результаты
В результате работы будет исследована применимость и эффективность различных алгоритмов трехмерного моделирования данных магнитоэнцефалографии (МЭГ) в контексте различных типов сенсоров (магнитометров), будет исследована оценка соотношения сигнала к шуму набора магнитометров нового поколения и произведена оценка оптимального расположения сенсоров на поверхности головы. Также результатом данного исследования станет набор рекомендаций о том, какой конкретно тип сенсоров является потенциально наиболее эффективным в контексте МЭГ с учетом количества сенсоров, зависящего от геометрии как каждого сенсора, так и всей системы, собственного шума сенсоров и расстояния от поверхности головы до сенсора. В дополнение будет получена общая интегральная оценка разрешающей способности МЭГ, построенной с применением различных типов сенсоров, и набор рекомендаций по задачно-ориентированному размещению различного (сравнительно небольшого) числа сенсоров различной природы для достижения наибольшего пространственного разрешения локализации электрически-активных областей коры больших полушарий.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2022 году
Моделирование сигнала ЭЭГ/МЭГ сводится к решению граничной задачи для эллиптического уравнения в частных производных, связанного с потенциалом электрического поля, генерируемого мозгом. Распределение электрических токов в мозге предполагается в контексте задачи моделирования известным. Аналитическое решение таких уравнений возможно лишь в частных случаях достаточно простой геометрии проводника. Получение достаточно точного решения эллиптических УрЧП с использованием реальных геометрий, строящихся на основании МРТ/КТ головы, требует применения численных методов и является сложной задачей. Основные численные методы для решения таких уравнений включают метод конечных разностей, метод конечных элементов и метод граничных элементов. На основе анализа литературы и исследований в рамках проекта, можно сделать следующие выводы: -- Самый популярный метод численного моделирования электрического потенциала - метод граничных элементов. Он объединяет высокую производительность с достаточной точностью моделирования в контексте МЭГ/ЭЭГ. Недостатки метода связаны с его формулировкой, которая основана на выделении только границ разделов сред в проводнике (голове) и предположении однородного заполнения пространства между ними. Этот метод неустойчив при дефектах в геометрии границ, что ограничивает его использование в случаях, требующих более точного разделения сред в объеме головы, чем может предоставить МРТ/КТ. -- Популярность МГЭ в контексте моделирования данных МЭГ поддерживается также спецификой конвенциональных МЭГ-систем, регистрирующих лишь радиальные компоненты магнитной индукции. Ряд исследователей показывает в своих работах, что радиальная компонента вектора магнитной индукции в меньшей степени подвержена влиянию магнитных помех, генерируемых вторичными (Омическими) токами в объеме головы, что вызвано особенностями геометрии границ разделов сред в объеме проводника. МГЭ позволяет построение аппроксимации решения прямой задачи в виде матрицы, компоненты которой определяют отклик каждого сенсора на единичные источники в головном мозге (матрица прямого поля). Указанная матрица строится один раз с учетом положения сенсоров в пространстве и всех возможных положений источника, после чего используется для решения как прямых задач ЭЭГ/МЭГ (моделирование), так и обратной задачи локализации источников по данным измерений. -- В целом, метод конечных элементов обеспечивает более высокую точность и адаптивность к дефектам сетки по сравнению с другими методами. Особенно полезен метод смешанных конечных элементов (MFEM) при грубых или дефектных сетках, так как он обеспечивает высокую устойчивость и адаптивность. Однако он менее производителен по сравнению с методами граничных элементов. Расчет матрицы прямого поля требует грубых сеток или вычислительного кластера. Несмотря на сравнительно низкую производительность, с учетом роста вычислительных мощностей метод MFEM предпочтителен для моделирования сигнала сенсоров МЭГ, регистрирующих тангенциальные (или смешанные) компоненты магнитной индукции и будет, наряду с МГЭ, использоваться в ходе дальнейшей работы по проекту. -- Рассматривая метод конечных разностей (МКР), важно отметить, что с учетом сложной геометрии проводника (головы), он обеспечивает сравнимую с методами МГЭ/МКЭ точность лишь в случае крайне высокой плотности сетки, что отрицательно сказывается на производительности. Таким образом, для моделирования задач ЭЭГ/МЭГ метод МКР обычно не применяется и исключается из рассмотрения. Помимо моделирования сигнала МЭГ/ЭЭГ, одной из основных задач подотчетного периода была разработка комплексной методики оценки эффективности сенсорных систем и их сравнительного анализа. Для достижения этой цели были разработаны следующие подходы: -- На основании матрицы, аппроксимирующей решение прямой задачи (матрицы моделирования) выполнена методика построения карт абсолютной чувствительности сенсорной системы к источникам в мозге в зависимости от их положения. Методика позволяет построить корковые карты чувствительности различных сенсорных систем, их сравнения, и, в перспективе, задачно-ориентированной оптимизации малоканальных массивов сенсоров для исследования отдельных зон интереса головного мозга. -- На основании предыдущего пункта, с учетом как собственного шума сенсоров, так и нейронного шума, выполнена методика построения аналогичных карт чувствительности в контексте отношения сигнала к шуму (ОСШ). Эта методика также направлена на сравнение сенсорных систем и их задачно-ориентированную оптимизацию. Стоит отметить, что ОСШ выражается в децибелах и является измеряемой величиной, что в перспективе позволит проводить оценку параметров собственного шума нейронов головного мозга, а также оценивать скоррелированность этого шума, что является отдельной важной задачей и может представлять интерес для нейробиологов и неврологов. -- Была построена методика вычисления количества информации, регистрируемой сенсорами в системе МЭГ. Методика выполнена на основе некоторых аспектов теории информации Шеннона и предоставляет оценку сенсорной системы в виде одного числа, что удобно для сравнения различных сенсорных систем и для оценки влияния количества, чувствительности и прочих параметров сенсоров, присутствующих в системе на информативность системы. Таким образом, оценка дает возможность определения вектора развития сенсоров в контексте числа каналов, размеров, уровня собственного шума, что является актуальной задачей для построения МЭГ на основе сенсоров с примерением пленок железо-иттриевого граната (ЖИГМ), так как изменение любого из указанных выше параметров само по себе требует сложной и дорогостоящей инженерной работы. -- Была построена методика оценки минимального стандартного отклонения восстановления параметров электрических источников (диполей) в головном мозге. Методика (Cramer-Rao Lower Bound, CRLB) выполнена на основе элементов статистической обработки данных: информации Фишера и неравенства Крамера-Рао. CRLB не зависит от конкретного метода решения обратной задачи МЭГ (локализации электрических источников в мозге) и определяет минимальную возможную ошибку определения параметров в зависимости от статистических параметров сенсоров (собственного шума), их расположения, ориентации чувствительных осей. Как и прочие указанные ранее метрики и методики, CRLB позволяет провести сравнительный анализ эффективности сенсорных систем и их оптимизацию. Кроме того отметим, что CRLB строится на основании решения прямой задачи (моделирование сигнала) и, таким образом, позволяет оценить и влияние точности метода решения прямой задачи на точность локализации источников (электрических диполей) в мозге, что будет являться одной из приоритетных задач до окончания подотчетного периода (30.06.23). Все описанные выше методики и метрики реализованы в виде комплекса программ, адаптированного для работы с реальными лабораторными данными МЭГ, физиологическими моделями головы на основании МРТ/КТ сканирования. Комплекс программ выполнен с использованием языка программирования Python и приведен к совместимости с существующими решениями в области (например, MNE Python).

 

Публикации

1. Скидченко Е.А., Буторина А.В., Острась М., Ветошко П.М., Кузмичев А., Явич Н.Б., Маловичко М.С., Кошев Н.А. Yttrium-Iron Garnet Magnetometer in MEG: Advance towards Multi-Channel Arrays Sensors, №. 9, Т. 23, С. 4256 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.3390/s23094256