КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 22-26-00066

НазваниеИз почвы на колос: исследование путей колонизации колоса яровой пшеницы почвенными фитопатогенами

РуководительТоропова Елена Юрьевна, Доктор биологических наук

Организация финансирования, регион федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Новосибирский государственный аграрный университет", Новосибирская обл

Период выполнения при поддержке РНФ 2022 г. - 2023 г. 

Конкурс№64 - Конкурс 2021 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований малыми отдельными научными группами».

Область знания, основной код классификатора 06 - Сельскохозяйственные науки, 06-102 - Агрономия

Ключевые словафитопатоген, колос, яровая пшеница, корневая гниль, колонизация, конкуренция, Fusarium, Helmithosporium

Код ГРНТИ68.37.31


СтатусУспешно завершен


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Предлагаемое исследование направлено на исследование путей колонизации колоса яровой пшеницы наиболее распространенными в умеренных зонах всех континентов Земли и высоко вредоносными почвенными фитопатогенами - грибами рода Fusarium Link. и Helmithosporium sativum Pam., King et Bakke. Ограничение распространения фузариоза и гельминтоспориоза колоса пшеницы, предотвращение загрязнения продуктов питания микотоксинами требует детального исследования путей расширения на колос экологических ниш почвенными микромицетами, уточнения характера межвидовых отношений, сроков и глубины колонизации ими колоса и зерна пшеницы. Проект направлен на исследование путей и сроков колонизации колоса дискретными видами почвенных фитопатогенных микромицетов по сосудам растений-хозяев и (или) воздушно-капельным путем. Впервые будет исследована связь способа и срока колонизации отдельными видами фитопатогенов генеративных органов яровой пшеницы с глубиной проникновения микромицетов в колос и зерновку, определяющей вредоносность фузариоза и гельминтоспориоза. Динамическое, по фазам вегетации, определение видового состава микоценоза генеративных органов и детальное изучение попарных межвидовых отношений микромицетов (конкуренция, антагонизм, протокооперация, синергизм, нейтрализм) позволит объяснить закономерности формирования и прогнозировать состав сообществ фитопатогенов. Реализация предлагаемого проекта будет способствовать познанию фундаментальных закономерностей функционирования паразитарных систем и путей реализации патогенными микромицетами фундаментальных экологических ниш, позволит разрабатывать прогностические пространственно-временные модели формирования ареалов обитания фитопатогенных микромицетов, обеспечит научно-технологический приоритет Российской Федерации в решении мировой проблемы ограничения фузариоза и гельминтоспориоза колоса пшеницы.

Ожидаемые результаты
1. Будут детально исследованы механизмы и сроки колонизации колосьев пшеницы H. sativum и отдельными видами грибов из рода Fusarium, установлен размер реализованных ниш отдельных видов по органам колоса и зерновки, выявлено влияние сортов пшеницы с разным строением стебля и колоса на эти показатели. Это позволит уточнить размер экологических ниш видов фузариевых грибов и H. sativum, степень их перекрытия, определить направление сукцессии патогенного микоценоза генеративных органов пшеницы на сортах разного происхождения и строения. 2. Будут расширены представления о функционировании паразитарной системы «пшеница-почвенные патогенные микромицеты» в пространстве (по сосудистому или воздушно-капельному механизму колонизации колоса) и во времени (по фазам органогенеза), выявлены новые закономерности эволюции экологических ниш микроорганизмов. Будут определены ценные для практической селекции сорта, ограничивающие колонизацию колоса H. sativum и наиболее опасными токсикогенными видами из рода Fusarium, что будет иметь значение для практической селекции устойчивых сортов. 3. Будут получены новые знания о зависимости глубины проникновения микромицетов в колос и зерновку, вредоносности фитопатогенов от способа и срока колонизации отдельными видами генеративных органов яровой пшеницы, что имеет большое практическое значение для прогноза эпифитотического процесса инфекций колоса и усовершенствования систем защиты растений. 4. Будет получена информация о попарных межвидовых отношениях микромицетов (конкуренция, антагонизм, протокооперация, синергизм, нейтрализм), что позволит выявить наиболее конкурентоспособные виды микромицетов, объяснить закономерности формирования сообществ фитопатогенов и прогнозировать их состав. 5. Будет определены виды патогенных микромицетов из рода Fusarium, достигающие колоса яровой пшеницы преимущественно или только по сосудам, выявлены наиболее опасные виды фитопатогенов, колонизирующие колос и зерновки на ранних этапах их формирования, обладающие высокой конкурентной способностью по отношению к другим членам патогенного микоценоза. Это позволит в дальнейшем целенаправленно использовать технологические приемы для регулирования паразитарной системы «пшеница - почвенный микромицет», предотвратить реализацию дополнительных экологических ниш вредоносными почвенными фитопатогенами и раннее развитие гельминтоспориоза, фузариоза колоса и микотоксикоза зерна пшеницы, повысить экологическую безопасность защитных агротехнологий и создать условия для получения безопасных и качественных продуктов питания.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2022 году
Для реализации всех целей проекта были проведены детальные исследования механизмов и сроков колонизации колосьев пшеницы 11 сортов яровой пшеницы из разных регионов РФ и Мира патогенным микромицетом Helminthosporium sativum (sin. Bipolaris sorokiniana) и отдельными видами грибов из рода Fusarium по пяти фазам развития растений. Впервые выяснено, что уже на IV этапе органогенеза стержни зачатков колосьев сортов Jin Chun 2 (Китай) и Karee (ЮАР) были колонизированы F. poae, F. oxysporum, F.sporotrichioides, что указывает на их способность к продвижению по сосудам растений и раннему заражению колосьев. B. sorokiniana был выделен из стержней колосьев сорта Зауралочка из Курганской области и канадского сорта Nill Thatcer Lr-35 до выхода колосьев из трубки (IV-VII этапы органогенеза), что также указывает на его способность к росту по сосудам растений яровой пшеницы. Динамика колонизации колосьев показала более раннее заселение микромицетами стержней колосьев, по сравнению с зерновками, явную приуроченность B.sorokiniana и грибов рода Fusarium к стержням колосьев и тенденцию к снижению инфицирования зерновок грибами рода Fusarium к фазе полной спелости по сравнению с предыдущей фазой молочной спелости. Доминирующими видами микромицетов на органах колосьев (стержень, зерно) и зерновок (зародыш, эндосперм, оболочка) в конце вегетации были B. sorokiniana и грибы родов Alternaria и Fusarium, которые имели 100% встречаемость на сортах яровой пшеницы. Устойчивых к микромицетам сортов выявлено не было. На всех органах зерновок доминировал B. sorokiniana, особенно в зародышах и эндоспермах зерен. Вторую позицию по средним данным занимали грибы рода Alternaria. Среди грибов рода Fusarium на органах колоса и зерновок доминировал F. oxysporum, который встречался на 93,2% образцов. К дополнительным видам, с 43,2% встречаемости были отнесены F. poae и F. equiseti. Редкими видами были F. sporotrichioides, и F. avenaceum с частотой встречаемости 25% и 13,6% соответственно. Самым редким был F. sambucinum с частотой 4,6%, он был выделен из зародышей и оболочек зерен только сорта LТ-3 из Ленинградской области. Общее биологическое разнообразие видов микромицетов колебалось от 3 (сорт Зауралочка из Курганской области) до 7 (финский сорт Manu). По органам колоса и зерновки - 7 видов было выявлено в зародышах и оболочках зерновок, 6 – в стержнях колосьев и эндоспермах зерновок. B.sorokiniana и F. oxysporum инфицировали органы колоса и зерновок равномерно. Выявлена приуроченность F. poae к стержням колосьев, а F. equiseti – к стержням колосьев и оболочкам зерен. Коэффициенты общности видового состава микромицетов по сортам составляли от 1 (NIL Thatcher Lr13, LT-3, Karee) до 0,44 у сортов Remus (Германия) и Зауралочка (Курганская область) с сортом Manu (Финляндия). Анализ перекрытия экологических ниш микромицетов по частоте совместной встречаемости показал, что максимальное перекрытие 93,2% было у B.sorokiniana с F. oxysporum. Умеренное перекрытие ниш 36,4-43,2% было выявлено у B.sorokiniana и F. oxysporum с F.poae и F. equiseti. Относительно небольшое, на уровне 11,4-25% перекрытие ниш было у B.sorokiniana, F. oxysporum и F. poae с F. sporotrichioides, у F. poae с F. equiseti и F. avenaceum, а также у F. sporotrichioides с F. avenaceum. В остальных комбинациях видов перекрытие отсутствовало или было незначительным до 4,6%. С целью получения информации о попарных межвидовых отношениях микромицетов и выявления наиболее конкурентоспособных видов было проведено наблюдение за ростом встречных культур наиболее распространенных видов фитопатогенов. Была разработана новая шкала количественной оценки конкурентной способности видов микромицетов по комплексу из 4 групп показателей: 1) изменение скорости радиального роста колоний, 2) изменение характера роста колоний культур микромицетов по 10 показателям, 3) наличие и ширина зоны лизиса, 4) изменение интенсивности споруляции микромицетов. В качестве контроля использовали чистые колонии микромицетов, которые выращивали одновременно с опытными вариантами. В настоящее время идет оформление заявки на патент «Шкала количественной оценки межвидовых отношений микромицетов», планируется получение патента в 2023 году. Взаимоотношения между отдельными видами микромицетов носили индивидуальный характер и значительно отличались по остроте и характеру. Число набранных отдельными микромицетами баллов по новой шкале различалось в 8 раз, от 2 баллов, набранных B. sorokiniana, при взаимодействии с F. sambucinum, до 16 баллов у F. oxysporum во встречной культуре с F. poae. Мы предлагаем взаимодействие видов считай нейтральными, если оба набрали 10 и более баллов, а разница между видами не превышает 3 баллов. Такого рода отношения были выявлены у F. sporotrichioides, F. equiseti, F. poae, F. oxysporum, F. avenaceum с пятью другими видами рода Fusarium. Конкурентные отношения сложились у всех фузариевых грибов с B. sorokiniana, причем он доминировал над F. sporotrichioides, F. solani и F. avenaceum. Напротив, F. sambucinum, F. equiseti, F. poae и F. oxysporum доминировали при их совместном культивировании с B. sorokiniana, отмечено сильное взаимное угнетение. F. sambucinum показал конкурентное подавление таких видов, как F. equiseti, F. solani и F. oxysporum, и равные по силе, но конкурентные отношения с F. sporotrichioides, F. poae и F. avenaceum. Конкуренция выражалась в снижении скорости радиального роста колоний (до 2,5 раз), значительным морфологических отклонениях от чистых культур (до 7 признаков из 10), в формировании зоны лизиса шириной более 7 мм (максимально 12 мм), а также в изменении интенсивности споруляции как в сторону стимуляции (максимально до 20 раз), так и угнетения (максимально до 30 раз). В пределах исследованных сочетаний конкурентные отношения были выявлены в 46,4% случаев, а нейтральные – в 53,6%. По итогам исследований 2022 года подготовлен промежуточный отчет и 4 публикации: 1 – в журнале Scopus и WoS, 2 - в журналах ядра РИНЦ, 1 – в сборнике трудов конференции (РИНЦ). Результаты исследований были доложены на 2 конференциях.

 

Публикации

1. Воробьева И.Г., Торопова Е.Ю. Ecological Niches of Fusarium poae (Peck) Wollenw. in Western Siberia Contemporary Problems of Ecology, Vol. 15, No. 4, pp. 393–399 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.1134/S1995425522040114

2. Казакова О.А., Трунов Р.И., Торопова Е.Ю., Воробьева И.Г. Локализация фитопатогенов в органах зерновок сортов яровой пшеницы Современная интегрированная защита растений: Сборник трудов Всерос. научн.-практ. конф. Сибирской научной школы по защите растений. Новосибирск, 2022, Издательский центр Новосибирского государственного аграрного университета "Золотой колос", Сборник трудов Всероссийской научно-практической конференции Сибирской научной школы по защите растений. - Новосибирск, 2022. - С. 36-38. (год публикации - 2022)

3. Торопова Е.Ю., Воробьева И.Г., Казакова О.А., Пискарев В.В., Гришин В.М. Инфицированность органов зерновок сортов яровой пшеницы почвенными фитопатогенами Труды Кубанского государственного аграрного университета, № 100, С.185-192. (год публикации - 2022) https://doi.org/10.21515/1999-1703-100-185-192

4. Торопова Е.Ю., Воробьева И.Г., Казакова О.А., Трунов Р.И. Биологическое разнообразие фитопатогенных почвенных микромицетов на сортах яровой пшеницы в Западной Сибири Агрохимия, № 12. - 47-54 С. (год публикации - 2022) https://doi.org/10.31857/S000218812210012X


Аннотация результатов, полученных в 2023 году
Проект был направлен на выявление путей и сроков колонизации колосьев сортов яровой пшеницы видами почвенных фитопатогенных микромицетов, а также на детальное исследование межвидовых отношений между фитопатогенами. С целью исследования механизмов и сроков колонизации колосьев пшеницы Bipolaris sorokiniana Sacc. Shoemaker, и отдельными видами грибов из рода Fusarium, а также влияния сортов пшеницы на эти процессы был проведен анализ интактных и изолированных колосьев 11 сортов из разных регионов РФ и Мира по пяти фазам развития яровой пшеницы. В 2023 году, несмотря на экстремальные условия вегетации, была выявлена ранняя, в фазу выхода в трубку, колонизация колосьев яровой пшеницы почвенными фитопатогенами Fusarium oxysporum Schltdl., F.poae (Peck) Wollenw. и B. sorokiniana, причем F. oxysporum, кроме стержней, был выделен и из зачатков зерен. Это свидетельствуют о способности указанных микромицетов инфицированию колоса по сосудам растений-хозяев. Динамика колонизации колосьев сортов яровой пшеницы в 2023 году показала более раннее заселение микромицетами рода Fusarium и B. sorokiniana стержней колосьев, по сравнению с зерновками: интенсивность заражения стержней в фазу цветения была в 20 раз выше, чем зачатков зерен. а также тенденцию к снижению инфицирования зерновок микромицетами к фазе полной спелости по сравнению с фазой молочной спелости. Доминирующими видами микромицетов на органах зерновок (зародыш, эндосперм, оболочка) были B.sorokiniana и грибы родов Alternaria и Fusarium, которые имели 100% встречаемость. Все сорта яровой пшеницы, независимо от региона происхождения и генетической разновидности были относительно равномерно инфицированы комплексом микромицетов, устойчивых сортов выявлено не было. На всех органах доминировал B.sorokiniana, вторую позицию занимали грибы рода Alternaria, грибы рода Fusarium были на третьей позиции. В микоценозах зерновок сортов Nil Thatcher Lr35 (Канада) и Manu (Финляндия) B. sorokiniana занимал более половины микоценоза. Органы зерновок сорта Quarna (Швейцария) были инфицированы преимущественно грибами рода Fusarium. Среди грибов рода Fusarium на органах колоса и зерновок доминировал F. oxysporum, который встречался на 100% образцов. Кодоминантом с встречаемостью 90.9% был F.poae, дополнительным видом с 36.4% встречаемости был F. equiseti. Редкими видами были F. sporotrichioides, F. avenaceum и F. solani с частотой встречаемости 27,3-18,2%. Общее биологическое разнообразие видов микромицетов (кроме альтернариевых грибов) колебалось от 2 (немецкий сорт Remus) до 7 (австралийский сорт Calingiri). По органам колоса и зерновки - 7 видов было выделено из стержней колосьев, 5 – из зародышей и эндоспермов, 4 - из оболочек зерновок. Коэффициенты общности видового состава микромицетов по сортам составляли от 1 (Сибирская 17, Jin Chun 2) до 0,29 у сортов Remus (Германия) и Calingiri (Австралия). Анализ перекрытия экологических ниш микромицетов по частоте совместной встречаемости показал, что максимальное перекрытие 100% было у B. sorokiniana с F. oxysporum. Значительное перекрытие ниш 54,5 - 90,9% было выявлено у B. sorokiniana и F. oxysporum с F.poae. Умеренное (9,1-36,4%) перекрытие экологических ниш в генеративных органах сортов было выявлено у B. sorokiniana и F. oxysporum с F. equiseti. Относительно небольшое, на уровне 9,1-18,2% перекрытие ниш было у B. sorokiniana и F. oxysporum с F. sporotrichioides, F. avenaceum, F.solani. В остальных комбинациях видов перекрытие экологических ниш отсутствовало или было незначительным. В ходе исследования попарных межвидовых отношениях микромицетов и выявления наиболее конкурентоспособных видов была разработана новая шкала количественной оценки конкурентной способности видов микромицетов по комплексу из 4 групп показателей. Подготовлен патент на изобретение «Способ оценки попарных межвидовых биотических отношений микромицетов», № 2023105019/10(010902) от 05.03.2023г. Данные наблюдений 2023 года подтвердили, что взаимоотношения между отдельными видами микромицетов носили индивидуальный характер и значительно отличались по остроте и характеру. Число набранных отдельными микромицетами баллов по новой шкале различалось в 8 раз, от 2 баллов, набранных B. sorokiniana, при взаимодействии с F. sambucinum, до 16 баллов у F. oxysporum во встречной культуре с F. poae. Конкуренция выражалась в снижении скорости радиального роста колоний (до 2,5 раз), значительным морфологических отклонениях от чистых культур (до 7 признаков из 10), в формировании зоны лизиса шириной более 7 мм (максимально 12 мм), а также в изменении интенсивности споруляции как в сторону стимуляции (максимально до 20 раз), так и угнетения (максимально до 30 раз). В пределах исследованных сочетаний конкурентные отношения были выявлены в 46,4% случаев, а нейтральные – в 53,6%. Отношения между видами предложено признать конкурентными: 1) если хотя бы один из видов набрал меньше 10 баллов, 2) разница в набранных баллах между видами превышает 3, 3) по одной из групп показателей хотя бы один из видов набрал 0 или 1 балл. Во всех остальных случаях отношения между видами следует признать нейтральными. Исследования вновь разрабатываемым в 2023 году методом совместного роста комбинаций микромицетов на жидкой среде и влияния их культуральных жидкостей на развитие проростков яровой пшеницы показало логическое совпадение результатов, полученных другими ранее использованными методами. Выявлено, что перекрытие реализованных экологических ниш фитопатогенных микромицетов приводит к усилению конкурентных отношений между видами, которые достоверно влияют на развитие проростков растений-хозяев. По результатам исследований в течение 2023 года подготовлены 8 публикаций: в базе Scopus -1; в RCCI – 4, в РИНЦ – 3. Сделаны 2 доклада на международных конференциях. Подготовлен патент на изобретение «Способ оценки попарных межвидовых биотических отношений микромицетов». Сделан 1 пресс-релиз по статье: https://rscf.ru/news/release/biologi-otsenili-po-ballnoy-shkale-konkurentosposobnost-gribov-porazhayushchikh-zlaki/.

 

Публикации

1. Торопова Е. Ю., Стецов Г.Я. , Воробьева И.Г. , Казакова О. А., Трунов Р.И. Факторы совместного паразитирования Bipolaris sorokiniana и Fusarium oxysporum на яровой пшенице в северной лесостепи Приобья Достижения науки и техники АПК, - (год публикации - 2024)

2. Торопова Е.Ю., Воробьева И.Г., Казакова О.А. A New Approach to Assessing the Interspecific Relationships of Micromycetes from the Genus Fusarium Link. with Bipolaris sorokinana Sacc. Shoem Contemporary Problems of Ecology, Vol. 16, No. 3, pp. 330–338. (год публикации - 2023) https://doi.org/10.1134/S1995425523030125

3. Торопова Е.Ю., Воробьева И.Г., Казакова О.А. Новый подход к оценке межвидовых отношений микромицетов из рода Fusarium Link. с Bipolaris sorokiniana Sacc. Shoem Сибирский экологический журнал, Т. 30, № 3,С. 310-320. (год публикации - 2023) https://doi.org/10.15372/SEJ20230308

4. Торопова Е.Ю., Селюк М. П., Воробьева И. Г. Динамика и механизмы колонизации колосьев яровой пшеницы фитопатогенными микромицетами Успехи медицинской микологии, Т. 25, С. 448-452. (год публикации - 2023)

5. Торопова Е.Ю., Селюк М.П., Стецов Г.Я., Трунов Р.И. Колонизация почвенными фитопатогенами колосьев яровой пшеницы в лесостепи Западной Сибири Вестник НГАУ, № 3 (68), С. 120-128. (год публикации - 2023) https://doi.org/10.31677/2072-6724-2023-68-3-120-128

6. Торопова Е.Ю., Стецов Г.Я., Воробьева И.Г., Трунов Р.И. Основные и дополнительные экологические ниши почвенных фитопатогенов на сортах яровой пшеницы в Западной Сибири Агрохимия, - (год публикации - 2024)

7. Трунов Р. И., Лепешкина Д.С. Bipolaris sorokiniana и Fusarium oxysporum на генеративных органах сортов яровой пшеницы в северной лесостепи Приобья Актуальные проблемы агропромышленного комплекса: сб. трудов научно-практической конференции преподавателей, аспирантов, магистрантов и студентов Новосибирского ГАУ. - г. Новосибирск, Вып. 8, С.-101-103. (год публикации - 2023)

8. Трунов Р.И., Торопова Е.Ю., Воробьева И.Г. Пути колонизации почвенными фитопатогенами колосьев яровой пшеницы Теория и практика современной аграрной науки. Сборник VI национальной (всероссийской) научной конференции с международным участием. - Новосибирск., С. 206-208. (год публикации - 2023)

9. Торопова Е.Ю., Казакова О.А. Способ оценки попарных межвидовых биотических отношений микромицетов -, 2023105019/10(010902) (год публикации - )

10. - Биологи оценили по балльной шкале конкурентоспособность грибов, поражающих злаки Пресс-служба РНФ, - (год публикации - )


Возможность практического использования результатов
Вновь разработанные оригинальные малозатратные методы изучения межвидовых отношений микромицетов могут быть использованы в научных исследованиях из области микологии, фитопатологии, экологии, защиты растений для получения новых знаний о закономерностях формирования фитопатогенных микоценозов и расширения представлений о реализации фундаментальных экологических ниш микроорганизмами. Выявление способности доминирующих в системах подземных и генеративных органов яровой пшеницы микромицетов из рода Fusarium и Bipolaris sorokinana инфицировать колосья яровой пшеницы по сосудам и колонизировать колос и зерновки на ранних этапах их формирования позволит целенаправленно использовать, ранее установленные, технологические приемы для регулирования паразитарной системы «пшеница - почвенный микромицет» через повышение супрессивности почвы, предотвратить реализацию дополнительных экологических ниш вредоносными почвенными фитопатогенами и раннее развитие гельминтоспориоза, фузариоза колоса и микотоксикоза зерна пшеницы, усовершенствовать системы мониторинга и прогноза фитопатогенов, повысить экологическую безопасность защитных агротехнологий и создать условия для получения безопасных и качественных продуктов питания. Информация о приуроченности видов фитопатогенов к паразитированию на определенных сортах яровой пшеницы может быть использованы в практической селекции растений на устойчивость к болезням. Полученные новые фундаментальные знания о функционировании паразитарных систем с участием яровой пшеницы и космополитических почвенных фитопатогенов могут быть использованы в учебном процессе профильных вузов для расширения преподавания дисциплин «Экология», «Микология», «Фитопатология», «Интегрированная защита растений», «Прогноз болезней растений».