КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 22-24-00912

НазваниеИзучение фармакологического действия и биологической активности APETx-подобных пептидов, модулирующих активность кислоточувствительных ионных каналов, в in vitro и in vivo моделях

РуководительМонастырная Маргарита Михайловна, Доктор химических наук

Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Тихоокеанский институт биоорганической химии им. Г.Б. Елякова Дальневосточного отделения Российской академии наук, Приморский край

Период выполнения при поддержке РНФ 2022 г. - 2023 г. 

Конкурс№64 - Конкурс 2021 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований малыми отдельными научными группами».

Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни, 04-202 - Протеомика; структура и функции белков

Ключевые словакислоточувствительные ионные каналы ASICs, APETx-подобные пептиды, анальгетическая активность

Код ГРНТИ31.23.27


СтатусУспешно завершен


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Согласно современным представлениям, функционирование различных систем живых организмов обусловлено мириадой происходящих химических и биохимических процессов, важную роль в которых играет передача межклеточных сигналов через ионные каналы мембран возбудимых и невозбудимых клеток. Достоверно установлено, что изменение кислотно-щелочного равновесия в тканях организма детектируется кислоточувствительными ионными каналами (Acid-Sensing Ion Channels, ASICs), мембранными белками, обладающими важной сенсорной и регуляторной функцией в нейронах как периферической, так и центральной нервной системы. Нарушение функционирования этих каналов, в том числе вызванное избыточным закислением внеклеточной среды, приводит к развитию тяжелых патологических состояний, таких как мигрень, рассеянный склероз, эпилепсия, ишемический инсульт, болезнь Паркинсона, болезнь Хантингтона, глиобластома, ряд болевых состояний и т.п. Изучение и регуляция механизмов клеточного взаимодействия невозможны без специфических инструментов, тонко воздействующих на сигнальные системы организма. В настоящее время набор используемых в практике лигандов-модуляторов ASIC каналов ограничен в основном амилоридными и нестероидными противовоспалительными средствами, действующими как ингибиторы, и нейропептидами млекопитающих (FMRF-амиды), активирующими ASIC каналы. Более того, все известные низкомолекулярные модуляторы ASIC каналов являются неселективными и/или малоэффективными, или вызывающими нежелательные побочные эффекты, что сильно ограничивает возможность их применения. Проблема болевых синдромов различной этиологии, связанных с дисфункциями ASICs, остается одной из наиболее актуальных в клинической медицине, поэтому востребованность в новых специфических пептидных модуляторах ASIC каналов, имеющих ряд преимуществ перед низкомолекулярными лигандами, мотивирует проведение широкомасштабного поиска новых лигандов и их структурно-функционального исследования. Целью данного проекта является структурно-функциональное исследование APETx-подобных пептидов, модуляторов ASICs, продуцируемых морскими анемонами рода Heteractis, что позволит расширить понимание механизмов функциональной активности различных подтипов ASICs и создаст предпосылки к созданию новых лекарственных препаратов, направленных на данные клеточные мишени. В рамках проекта для получения исчерпывающей информации о разнообразии изучаемых пептидов предлагается использовать высокопроизводительное секвенирование (NGS), а именно глубокое секвенирование ампликонов транскриптов, кодирующих APETx-подобные пептиды морских анемон. Полученные последовательности будут проанализированы с помощью методов биоинформатики, а потенциально перспективные отдельные представители будут в дальнейшем изучены. Кроме того, основной задачей проекта будет исследование двух уже известных перспективных пептидных модуляторов ASICs, которые являются первыми, обнаруженными в морских анемонах, пептидами, способными ингибировать ASIC1a каналы, а один из них является первым потенциатором ASIC3 каналов. С целью выбора наиболее перспективных анальгетиков для их дальнейшего использования в качестве лидерных соединений будут проведены in vivo исследования анальгетической и противовоспалительной активности пептидов. Детальное изучение профилей активности пептидов-модуляторов ASIC каналов с помощью электрофизиологического тестирования, идентификация сайтов, ответственных за тот или иной вид активности, а также разработка и получение на их основе мутантных аналогов может дать мощный толчок к пониманию функционирования как ASIC каналов в целом, так и способствовать целенаправленному конструированию специфичных лигандов к этим каналам в частности.

Ожидаемые результаты
В результате выполнения проекта будет выделено и охарактеризовано не менее двух новых природных пептидов-модуляторов ASIC каналов, а также получен рекомбинантный аналог уникального пептида Hcr 1b-4, ингибитора ASIC1а и потенциатора ASIC3 каналов. Методами масс-спектрометрии, КД- и ЯМР-спектроскопии будут установлены их физико-химические характеристики. Электрофизиологическими методами будут исследованы аффинность и специфичность в отношении разных подтипов ASIC каналов. Будет установлена структура и изучено разнообразие генов, кодирующих пептиды-модуляторы ASIC каналов морских анемон рода Heteractis. Впервые для данного класса соединений будет применен метод глубокого секвенирования ампликонов (NGS), полученных в результате амплификации кДНК морских анемон. Планируется получить и затем проанализировать весь пул пептидов данной группы, синтезирующихся в организме-продуценте, что позволит выявить последовательности минорных изоформ, выделение которых непосредственно из животного сырья практически невозможно (либо связано с необходимостью переработки огромного их количества). Методами молекулярного моделирования будут построены теоретические пространственные модели новых пептидов и проанализирован вклад отдельных аминокислотных остатков в дипольный момент молекулы, определяющий взаимодействие с ASIC каналами, для разработки и получения мутантных аналогов пептидов. Будет протестирована анальгетическая и противовоспалительная активность исследуемых пептидов. Планируется доказать, что исследуемые соединения не оказывают угнетающего влияния на животных, а также выяснить, каким действием будут обладать пептиды, по-разному взаимодействующие с ASIC каналами. Полученные в рамках проекта научные результаты позволят расширить арсенал новых модуляторов ASICs, что, в свою очередь, будет способствовать решению существующих в настоящее время проблем, связанных с созданием новых высокоспецифичных препаратов направленного действия для повышения эффективности терапии различных патологических процессов, и обеспечению перехода к персонализированной медицине, высокотехнологичному здравоохранению и технологиям здоровьесбережения. Полученные данные будут опубликованы в виде научных статей в международных рецензируемых журналах с импакт-фактором 4 и выше, а также в ведущих отечественных журналах. Планируется, что основная часть полученных данных будет опубликована в журналах, принадлежащих к квартилю Q1/2. Все экспериментальные работы будут выполнены на уровне мировых стандартов, с использованием современных методик работы с пептидами, ASIC каналами, экспериментальными животными, а также современного оборудования, которым оснащены лаборатории ТИБОХ ДВО РАН и привлечением ресурсов ЦКП ТИБОХ ДВО РАН.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2022 году
Кислоточувствительные ионные каналы (ASICs – Acid-Sensing Ion Channels) активируются в ответ на снижение значения внеклеточного рН в тканях организма и обладают важной сенсорной и регуляторной функцией в нейронах как периферической, так и центральной нервной системы. Ацидоз тканей, возникающий в результате механических повреждений, развития опухоли, воспаления или более серьезных патологических процессов, сопровождающих нейродегенеративные заболевания, вызывает боль, которая резко снижает качество жизни человека. Все известные низкомолекулярные модуляторы ASIC каналов (амилоридные и нестероидные противовоспалительные препараты, FMRF-амиды) являются неселективными и/или малоэффективными, или вызывающими нежелательные побочные эффекты, что сильно ограничивает возможность их применения. Поэтому поиск новых молекул, специфично действующих на молекулярные механизмы генерации боли с минимальными побочными эффектами, является весьма актуальной задачей. Яд морских анемон богат биологически активными пептидами, включая модуляторы ASIC каналов, обладающие анальгетической и противовоспалительной активностью, и представляет интерес как источник новых потенциальных лекарственных препаратов. В рамках работ по проекту на первом этапе из мукуса морских анемон Heteractis magnifica хроматографическими методами были выделены четыре APETx-подобных пептида, в том числе два новых, названные Hmg 1b-2 Metox и Hmg 1b-5. Последовательности пептидов были определены методом тандемной масс-спектрометрии. Hmg 1b-5 (41 а.о.) отличается пятью аминокислотными остатками от своих ближайших гомологов. Hmg 1b-2 Metox является производным пептида Hmg 1b-2 с окисленным Met16. Установлено, что APETx-подобные пептиды H. magnifica являются новыми лигандами ацетил-холиновых рецепторов (nAChR) мышечного и α7 типов. Пептид Hmg 1b-2 обладал широкой специфичностью, он ингибировал не только ASIC1 и ASIC3 каналы, но и модулировал работу 14-ти подтипов потенциал-зависимых калиевых, 9-ти подтипов натриевых и 3-х подтипов кальциевых каналов, а также избирательно потенцировал вызванный ацетилхолином ток α7, но не nAChR мышечного типа, экспрессированных в ооцитах Xenopus laevis. Показано, что окисление Met16 в Hmg 1b-2 отменяет его ингибирующее действие на каналы ASIC, при сохранении способности конкурировать с радиоактивно меченым α-бунгаротоксином за связывание с nAChR мышечного типа. Новый пептид Hmg 1b-5, в отличие от своих гомологов, ингибировал только ASIC3. Эффективность пептидов Hmg 1b-2 и Hmg 1b-4, как потенциальных анальгетиков и противовоспалительных препаратов, доказана в экспериментах на животных. Пептиды при внутривенном введении мышам достоверно снижали количество и продолжительность корчей, вызванных введением уксусной кислоты. В модели острого местного воспаления, индуцированного λ-каррагинаном, пептиды в дозах 1 и 0,1 мг/кг оказывали достоверное противовоспалительное действие, существенно ингибируя рост воспалительного отёка лапы мышей по сравнению с контрольной группой. Противовоспалительная активность пептида Hmg 1b-4 была в разы выше не только активности его гомолога Hmg 1b-2, но и коммерческого препарата группы НПВП, Диклофенака. Кроме того установлено, что пептид Hmg 1b-2 не оказывает угнетающего действия на ЦНС и обладает выраженным анксиолитическим эффектом. Методами молекулярной биологии и генетической инженерии доказано, что APETx-подобные пептиды формируют в организме-продуценте, H. magnifica, комбинаторную библиотеку в виде множества изоформ с точечными аминокислотными заменами. На основании данных, полученных в результате применения техники 3’- и 5’-RACE, были собраны последовательности транскриптов, кодирующие пептиды Hmg 1b-2 и Hmg 1b-5. Кроме того обнаружено пять различных групп генов APETx-подобных пептидов, имеющих общую экзон-интрон-экзонную структуру, в которой интроны разной длины приходятся на область, кодирующую пропептид. Установлена последовательность гена, кодирующего пептид Hmg 1b-5. На основании анализа (in silico) поверхностного электростатического потенциала и ориентации дипольного момента все APETx-подобные пептиды комбинаторной библиотеки группируются с пептидами-гомологами, способными модулировать ASIC каналы.

 

Публикации

1. Калина Р.С., Кашеверов И.Е., Кошелев С.Г., Синцова О.В., Пейнер С., Пенхейро-Джуниор Э.Л., Попов Р.С., Чаусова В.Е., Монастырная М.М., Дмитренок П.С., Исаева М.П., Титгат Я., Козлов С.А., Козловская Э.П., Лейченко Е.В., Гладких И.Н. Nicotinic Acetylcholine Receptors Are Novel Targets of APETx-like Toxins from the Sea Anemone Heteractis magnifica Toxins (Basel), Выпуск 14(10), С. 697 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.3390/toxins14100697

2. Пенхейро-Джуниор Э.Л., Калина Р.С., Гладких И.Н., Лейченко Е.В., Титгат Я., Пейнер С. A Tale of Toxin Promiscuity: The Versatile Pharmacological Effects of Hcr 1b-2 Sea Anemone Peptide on Voltage-Gated Ion Channels Marine Drugs, Выпуск 20(2), С. 147 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.3390/md20020147

3. Синцова О.В., Калина Р.С., Гладких И.Н., Паликова Ю.А., Паликов В.А., Бороздина Н.А., Климович А.А., Меньшов А.С., Дьяченко И.А., Лейченко Е.В. АНКСИОЛИТИЧЕСКОЕ ДЕЙСТВИЕ ПЕПТИДОВ МОРСКОЙ АНЕМОНЫ HETERACTIS CRISPA, МОДУЛЯТОРОВ TRPV1 И ASIC КАНАЛОВ Доклады Российской академии наук. Науки о жизни, том 505, № 1, с. 263–270 (год публикации - 2022) https://doi.org/10.31857/S268673892204014X


Аннотация результатов, полученных в 2023 году
Ацидоз (увеличение кислотности) тканей, возникающий в результате механических повреждений, воспаления или других серьезных патологических процессов, например, онкологических или нейродегенеративных, вызывает боль, которая резко снижает качество жизни человека. Кислоточувствительные ионные каналы (ASIC каналы), обнаруженные повсеместно в теле организма, ответственны за восприятие снижения внеклеточного значения рН, и, таким образом, участвуют как в физиологических, так и в патологических процессах. Поиск и изучение новых лигандов, модуляторов ASIC каналов пептидной природы, представляет собой актуальное направление исследования ввиду их возможного использования в качестве инструментов для функциональной характеристики разных изоформ ASIC каналов, а также в качестве основы для создания новых анальгетических препаратов. Известно, что яды морских анемон являются ценным источником пептидных молекул, способных специфично модулировать различные типы ионных каналов, в том числе ASIC, а также проявлять анальгетическую и противовоспалительную активности. В рамках работ по гранту на втором этапе реализации проекта была разработана система бактериальной продукции и получен функционально активный рекомбинантный APETx-подобный пептид Hmg 1b-4 морской анемоны Heteractis magnifica. Рекомбинантный Hmg 1b-4, как и природный пептид, ингибировал токи экспрессированных в ооцитах Xenopus laevis крысиных каналов ASIC1a и потенцировал токи ASIC3 на 45 и 29% соответственно, но, как и Hmg 1b-2, ингибировал на 25% быструю компоненту тока ASIC3-∆20 человека. Впервые показано, что Hmg 1b-2 является лигандом пуринергических P2X7 рецепторов и достоверно ингибирует пять из восьми исследованных потенциал-зависимых калиевых каналов подтипа 7, максимально (~60%) блокируя токи гетеромерных каналов Kv7.3/7.5. В экспериментах на животных показано, что Hmg 1b-2 и Hmg 1b-4 не токсичны при внутривенном введении мышам в дозе 1 мг/кг. Прямая инъекция Hmg 1b-4 в дозе 1 мг/кг в подушечку задней лапы мыши не вызывала ноцицептивной реакции. На модели острого воспаления задней лапы мышей, индуцированного полным адъювантом Фрейнда, доказана эффективность пептида Hmg 1b-4 как потенциального противовоспалительного препарата. Пептид Hmg 1b-4 во всех тестируемых дозах ингибировал рост воспалительного отёка лапы мышей по сравнению с контрольной группой и группами, инъецируемыми диклофенаком и Hmg 1b-2, при этом более выражен был эффект пептида в дозе 1 мг/кг. Показано, что оба пептида достоверно повышали исследовательскую активность и снижали тревожность мышей. Однако Hmg 1b-2 оказывал незначительное возбуждающее действие на ЦНС, увеличивая параметры пройденного расстояния и скорости движения животных примерно в 1,5 раза по сравнению с таковыми контрольной группы. В группах животных, инъецированных Hmg 1b-4, наблюдалось умеренное увеличение времени активности, обусловленное стимуляцией исследовательской мотивации и активного поискового поведения, а не возбудимости, что свидетельствует о его противотревожном и возможном нейропротекторном эффекте. В результате in silico анализа аминокислотных остатков, величины и направления дипольных моментов, а также молекулярного электростатического потенциала пептидов Hmg 1b-2, Hmg 1b-4 и 10 его мутантов, выявлено четыре кластера пептидов с различными электростатическими свойствами. Показано, что изменение числа положительно заряженных остатков в молекуле, вероятно, не приведет к значительному увеличению активности Hmg 1b-4.

 

Публикации

1. Гладких И.Н., Климович А.А., Калина Р.С., Кожевникова Ю.В., Хасанов Т.А. , Осмаков Д.И., Кошелев С.Г., Монастырная М.М., Андреев Я.А., Лейченко Е.В., Козлов С.А. Anxiolytic, analgesic and anti-inflammatory effects of peptides Hmg 1b-2 and Hmg 1b-4 from the sea anemone Heteractis magnifica Toxins, T.15 , № 5, С.341 [20] (год публикации - 2023) https://doi.org/10.3390/toxins15050341

2. - Пептиды морской анемоны Heteractis magnifica обладают противотревожным, анальгетическим и противовоспалительным действием Сайт ТИБОХ ДВО РАН, - (год публикации - )


Возможность практического использования результатов
Сформирован научный задел для разработки эффективных анальгетических и противовоспалительных лекарственных препаратов.