КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 20-74-00116

НазваниеРазработка гибридных липидных наночастиц, содержащих берлинскую лазурь, для подавления активных форм кислорода и доставки миРНК в печень

РуководительАбакумова Татьяна Олеговна, Кандидат биологических наук

Организация финансирования, регион Автономная некоммерческая образовательная организация высшего образования «Сколковский институт науки и технологий», г Москва

Период выполнения при поддержке РНФ 07.2020 - 06.2022 

Конкурс№49 - Конкурс 2020 года «Проведение инициативных исследований молодыми учеными» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными.

Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни, 04-209 - Биотехнология (в том числе бионанотехнология)

Ключевые словаЛипидные частицы, частицы берлинской лазури, активные формы кислорода, малые интерферирующие РНК, оксидативный стресс, заболевания печени

Код ГРНТИ34.57.21


СтатусУспешно завершен


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Терапия заболеваний печени является актуальной задачей современной медицины. Активные формы кислорода (АФК) являются непосредственным участником процессов в клетках печени, однако их содержание при различных патологических состояниях увеличивается. Избыток АФК ведет к индукции воспалительных процессов, замедлению репарации, а также повреждению биомолекул – белков, липидов, ДНК и других. Снижение АФК возможно за счет доставки препаратов, обладающих антиоксидантной активностью – ферментативного (супероксиддисмутазы, каталазы) и неферментативного происхождения (частицы церия, берлинской лазури и др.). Частицы берлинской лазури обладают преимуществом ввиду их эффективности, биосовместимости и стабильности. Данный проект направлен на создание нового типа гибридных липидных частиц, одновременно содержащих малые интерферирующие РНК (миРНК) и частицы берлинской лазури. В результате реализации проекта будет показано влияние подавления АФК частицами берлинской лазури при одновременном подавлении экспрессии терапевтических мишеней с помощью миРНК на прогрессирование гепатоклеточной карциномы на животных моделях, в основе развития которой лежит избыток АФК и хроническое воспаление. В качестве перспективных мишеней для миРНК будут использованы убиквитин-лигазы (Ubr1, Ubr2, Ubr4, Ubr5), Ras-связанный белок Rab35 или Gankyrin. Разработанные гибридные наночастицы, содержащие выбранные миРНК и частицы берлинской лазури, будут исследованы in vitro и in vivo, что позволит определить вклад подавления АФК в подавление развития гепатоклеточной карциномы. Таким образом, комбинация двух подходов (РНК-интерференции и антиоксидантной защиты) может стать основой для разработки нового способа терапии двойного действия на основе нуклеиновых кислот

Ожидаемые результаты
В рамках данного проекта нами планируется разработать эффективную систему доставки миРНК на основе липидных частиц и частиц берлинской лазури для терапии гепатоклеточной карциномы. По результатам первого года проекта нами будут получены модифицированные липидные частицы с берлинской лазурью, содержащие загруженную терапевтическую миРНК, проведена их физико-химическая характеристика. Нами будут проанализированы ряд мишеней - убиквитин-лигазы (UBR1, UBR2, UBR4, UBR5), Ras-связанный белок Rab35 и Gankyrin: будет осуществлен дизайн и синтез миРНК Rab35 и Gankyrin, проанализирована их эффективность на культуре опухолевых клеток печени мыши Hepa 1-6 и нормальных гепатоцитов AML12. Будет оценена цитотоксичность полученных частиц и определена их антиоксидантная активность и эффективность подавления экспрессии выбранных мишеней in vitro. В результате будут получены и охарактеризованы гибридные липидные частицы, содержащие частицы берлинской лазури и миРНК для последующих экспериментов. По результатам второго года будут получена и валидирована наиболее распространенная модель гепатоклеточной карциномы – гидродинамической трансфекции клеток печени плазмидами, кодирующими с-met, b-catenin, sleeping beauty и/или DENА-индуцированного роста опухоли, будет проанализирован уровень АФК и оценен уровень экспрессии мРНК мишеней. Также будет проведена оценка эффективности гибридных наночастиц при нормальном и повышенном уровне АФК на различных мышиных клеточных линиях in vitro (Hepa 1-6, Raw 264.7, AML12). В результате будут отобраны эффективные препараты для дальнейшей проверки in vivo. Для них будет охарактеризовано биораспределение в животных и активность ингибирования выбранной мишени при внутривенном введении. Разработанные гибридные наночастицы позволят снизить АФК в опухолевых клетках печени и увеличить терапевтическую эффективность липидных частиц с миРНК.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2020 году
В рамках данного проекта мы планируем создать эффективную систему доставки миРНК на основе липидных наночастиц и частиц берлинской лазури для терапии заболеваний печени. Присутствие частиц берлинской лазури будет обеспечивать снижение уровня активных форм кислорода (АФК) в клетках (антиоксидантная активность) и уменьшение воспаления, а также защищать миРНК от действия АФК. На первом году проекта нами были отвалидированы миРНК к различным белка-мишеням (убиквитин-лигазы, Ras-связанный белок, ганкирин). Также были синтезированы наночастиц берлинской лазури различного диаметра, проведена их физико-химическая харатеристика, оценена каталитическая активность, проведена оценка цитотоксичности и антиоксидантной активности. Полученные наночастицы стабильны при хранении в растворе электролита 0.1М КСl/0.1M HCl и сохраняют свой гидродинамический размер (38, 57 или 98 нм) после диспергирования и обработки в ультразвуковой ванне. Было показано, что с увеличением диаметра наночастиц берлинской лазури растет их каталитическая активность (от 610±50 с-1 для 38 нм НЧ БЛ до 5371±80 с-1 для 98 нм НЧ БЛ.). С помощью проточной цитометрии было показано, что все полученные частицы обладают антиоксидантной активностью и не обладают цитотоксическим эффектом на культуре гепатоцитов мыши. Синтезированные наночастицы берлинской лазури были использованы для разработки методики синтеза липидных наночастиц. Липидные наночастицы синтезировали путем смешения растворов липидов, миРНК и НЧ БЛ различного диаметра в микрофлюидном картридже. Увеличение размеров НЧ БЛ ведет к увеличению диаметра итоговых частиц (с 150 нм до 250 нм), а также их каталитической активности (до 667 с-1). Эффективность загрузки НЧ БЛ составила не менее 85-90%, что также было подтверждено с помощью крио-электронной микроскопии. Было показано, что все липидные наночастицы содержат НЧ БЛ. На основе полученных данных было принято решение попробовать уменьшить загрузку НЧ БЛ в липидные наночастицы с целью возможности уменьшения итогового размера. Было показано, снижение эффективности загрузки НЧ БЛ, а также уменьшение количества загружаемых НЧ БЛ (50 нм) в 4 раза возможно получить гибридные липидные частицы с диаметром 95 нм. В следующем году планируется оценить влияние снижения загрузки НЧ БЛ на антиоксидантную активность итоговых частиц. Также была оценена цитотоксичность синтезированных гибридных липидных наночастиц, содержащие НЧ БЛ и миРНК к ганкирину. Данные частицы эффективно подавляют пролиферацию клеток и влияют на их жизнеспособность по сравнению с контрольными частицами (липидные наночастицы с миРНК к ганкирину, липидные наноастицы с миРНК к люциферазе, липидные наночастицы с НЧ БЛ и миРНК к люциферазе). Полученные данные позволяют предположить эффективность разработанных частиц, которую планируется оценить в рамках проекта в следующем году

 

Публикации

1. Приказчикова Т.А., Абакумова Т.О., Cергеева О.В., Зацепин Т.С. Дизайн и валидация малых интерферирующих РНК для подавления экспрессии ганкирина в печени мыши Биорганическая химия, Номер 2, Том 47, Стр. 228-234 (год публикации - 2021) https://doi.org/10.1134/S1068162021020229

2. Абакумова Т.О., Приказчикова Т.А., Комкова М.А., Карякин А.А., Зацепин Т.С. Prussian-blue lipid nanoparticles for effective siRNA delivery to liver Proceedings of the First virtual Bilateral Conference on Functional Materials (BiC-FM), - (год публикации - 2020)


Аннотация результатов, полученных в 2021 году
В рамках второго года проекта нами были запланированы работы по оценке эффективности разработанных гибридных наночастиц для улучшенной доставки миРНК в печень в экспериментах на культуре гепатоцитов, а также в модели гепатоклеточной карциномы. Ранее было показано, что наночастицы берлинской лазури обладают высокой антиоксидантной активностью и не обладают цитотоксичным эффектом, при этом увеличение размера НЧ БЛ ведет к повышению каталитической активности и как сдествие, увеличнению результирующего диаметра при загрузке в липидные частицы (с 150 нм до 250 нм). Нами было проведена оценка биораспределения частиц различного диаметра и продемонстрировано, что оптимальным размером для доставки миРНК в печень являются частицы диаметром 80-110 нм. В связи с этим на второго году проекта была проведена оптимизация синтеза гибридных липидных частиц и получены частицы с различным соотошением миРНК: НЧ БЛ, используя НЧ БЛ различного диаметра (30, 50 и 120 нм), проведена их физико-химическая характеристика. Было показано, что при загрузке НЧ БЛ в липидные частицы при соотношении миРНК:НЧ БЛ =1:8 получаются частицы диаметром 87 нм и высокой каталитической активностью (k cat 2.2*10^3 c-1). Эффективность загрузки миРНК при этом составила около 50% при любом варианте синтеза. С помощью проточной цитометрии было показано, что липидные наночастицы с НЧ БЛ демонстрируют более высокую антиоксидантную активность по сравнению с неинкапсулированными НЧ БЛ на культуре клеток AML12. Методом ОТ-ПЦР было показано, что полученные частицы также улучшают эффективность ингибирования мРНК ганкирина по сравнению с липидными наночастицами без НЧ БЛ на культуре гепатоцитов Hepa 1-6. Полученные данные были также подтверждены в эксперименте при введении гибридных липидных частиц здоровым животным. Частицы, содержащие НЧ БЛ, позволяют увеличить эффективность ингибирования мРНК ганкирина, по сравнению с контрольными частицами через 72 часа после внутривенного введения. На основе совокупности полученных данных нами были выбраны частицы, содержащие НЧ БЛ 120 нм, для дальнейших экспериментов. Для финального этапа работ нами была проведена валидация модели гепатоклеточной карциномы на мышах путем гидродинамической инъекции плазмид в хвостовую вену мыши. Было показано, что с 3 по 14 день развития опухолевого процесса наблюдается повышение провоспалительных цитокинов, маркеров активации антиоксидантных систем (пероксиредоксинов, глутатионпероксидаз), повышение АЛТ/АСТ в сыворотке крови. Развития опухолевого процесса было также подтверждено с помощью гистологического анализа (гематоксилин-эозин) и соотношения веса печени к общему весу мыши. Повышение уровня активных форм кислорода было также подтверждено с помощью электрохимической микроскопии. Было показано, что однократно введение гибридных НЧ БЛ-липидных наночастиц с миРНК позволяет снизить уровень мРНК ганкирина после однократного введения. Полученные системы могут стать перспективным инструментом для доставки малых интерферирующих РНК в терапии гепатоклеточной карциномы.

 

Публикации

1. Абакумова Т.О., Ванеева А., Науменков В., Шохина А., Белоусов В., Микаелян А.С., Горелкин П., Ерофеев А., Зацепин Т.С. Intravital electrochemical microscopy as a tool for measurement of reactive oxygen/nitrogen species in liver diseases Jounal of nanobiotechnology, - (год публикации - 2022)

2. Абакумова Т.О., Кузькина А.A., Абакумов М.А., Кошкин Ф.А., Поздеева Д.A., Мельников П.А., Ионова К.П., Губский И.Л., Гурина О.И, Нуколова Н.В, Чехонин В.П. Localized permeability of blood brain barrier in the cuprizone model of demyelination Journal of neurochemistry, на рассмотрении редактора (год публикации - 2022)

3. Абакумова Т.О., Ветошева П., Комкова М., Ветошев К.Р., Мельник Д., Карякин А., Зацепин Т.С. Neutralization of reactive oxygen species by Prussian blue – lipid nanoparticles for siRNA delivery FEBS OPEN BIO, Том 11, стр. 276-277 (год публикации - 2021)

4. Абакумова Т.О., Ветошева П.И., Комкова М.А., Ветошев К.Р., Карякин А.А., Зацепин Т.С. НЕЙТРАЛИЗАЦИЯ АКТИВНЫХ ФОРМ КИСЛОРОДА ДЛЯ УЛУЧШЕНИЯ ДОСТАВКИ миРНК В ГЕПАТОЦИТЫ МЫШИ НАУЧНЫЕ ТРУДЫ. Том 2., НАУЧНЫЕ ТРУДЫ. Том 2. – М.: Издательство «Перо», 2021, cтр.229 (год публикации - 2021)


Возможность практического использования результатов
В результате данного проекта нами была разработана новая улучшенная система доставки малых интерферирующих РНК для патологий печени. Данная разработка показала свою эффективность в экспериментах на клетках и на животных с опухолевыми заболеваниями. Полученные системы доставки могут быть использованы как платформа для лечения других патологий, ассоциированных с оксидативным стрессом (демиелинизация, опухолевые заболевания других локализаций, офтальмологические заболеваний и многие другие). Также в ходе выполнения второго года проекта нами были изучены перспективы дальнейшего использования полученных частиц для других применений. Известно, что частицы берлинской лазури могут применяться для оптоакустической томографии, магнитно-резонансной томографии, для фототермальной терапии опухолей. Совместно с коллегами из Сколковского института науки и технологий (Марина Новоселова, группа профессора Дмитрия Горина) было показана эффективность применения наночастиц берлинской лазури для визуализации лимфатических узлов с помощью метода оптоакустической томографии. Совместно с коллегами из РНИМУ им.Н.И.Пирогова также была исследована возможность использования полученных частиц в качестве МРТ контрастного агента. В частности, была исследована релаксивность полученных липидных частиц, содержащих наночастицы берлинской лазури. Было показано, что данные частицы обладают контрастирующей способностью, однако их значения релаксивности гораздо меньше по сравнению с существующими аналогами и требуют модификации для применения в качестве МРТ контрастных агентов (например, допирование Gd). Также были оценены перспективы применения полученных частиц в качестве фототермального агента. Было показано, что липидные частицы, содержащие наночастицы берлинской лазури, способны нагреваться под воздействием лазера 808 нм, но в меньшей степени по сравнению с неинкапсулированными НЧ БЛ. Полученные данные могут быть использованы для контролируемого высвобождения препарата при использовании термочувствительных липидов. Таким образом, полученные результаты в ходе выполнения проекта, являются не только самостоятельной разработкой с перспективой применения в терапии заболеваний печени, а также научным заделом для дальнейшего развития исследования в области мультимодальных систем доставки.