КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 19-75-10046

НазваниеSERS как метод для in vivo мониторинга лекарственных препаратов и их эффектов

РуководительШеремет Евгения Сергеевна, кандидат наук (признаваемый в РФ PhD)

Организация финансирования, регион федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Национальный исследовательский Томский политехнический университет", Томская обл

Период выполнения при поддержке РНФ 07.2019 - 06.2021 

Конкурс№41 - Конкурс 2019 года «Проведение исследований научными группами под руководством молодых ученых» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными.

Область знания, основной код классификатора 05 - Фундаментальные исследования для медицины, 02-304 - Спектроскопия

Ключевые словарамановская спектроскопия, поверхностно-усиленная рамановская спектроскопия, терапевтический лекарственный мониторинг, механизм гибели клеток, in vitro, in vivo, плазменные наноструктуры

Код ГРНТИ29.31.26


СтатусУспешно завершен


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Во многих областях медицины индивидуальные особенности организма пациента и заболевания в существенной степени определяют ход и успех лечения. Например, при определении эффективности лечения онкологических заболеваний или определении уровня лекарств с высокой внутрииндивидуальной вариабельностью. Существующие методы анализа имеют большое время отклика, являются дорогими и не способны обеспечить in vivo мониторинг. Импланты на основе поверхностно-усиленной рамановской спектроскопии (surface-enhanced Raman spectroscopy) могут стать таким решением поскольку, по сравнению с другими предложенными методами, обладают высокой химической селективностью и менее подвержены влиянию неспецифической адсорбции белков. Большинство технологий для in vivo SERS измерений основаны на использовании изолированных наночастиц, которые в силу своей подвижности не подходят для мониторинга концентраций химических веществ в течение долгого времени. В связи с этим в рамках данного проекта мы предлагаем разработку и оптимизацию SERS подложек, которые могут быть имплантированы для проведения in vivo мониторинга, а также их испытание для решения вопросов онкологии и фармакологии.

Ожидаемые результаты
In many fields of medicine the individual patient's reactions strongly determine the treatment approach and efficiency. For example, when determining the efficiency of the tumor treatment in oncology or the level of drug concentration for the medicines with high interindividual variability. The existing analytical methods have long response time, are expensive and cannot provide in vivo monitoring. Surface-enhanced Raman spectroscopy (SERS) implants can provide a solution since when compared to other methods have high chemical selectivity and are less prone to effects the surface biofouling. Most in vivo SERS measurements are performed on the use of isolated nanoparticles that due to their mobility aren't suitable for the long-term monitoring of the chemical compounds. Thus we propose to develop and optimize implantable SERS substrates that can be applied for in vivo monitoring, and their application to the challenges of oncology and pharmacology.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2019 году
Проект “SERS как метод для in vivo мониторинга лекарственных препаратов и их эффектов” направлен на разработку системы мониторинга лекарственных препаратов in vivo в режиме реального времени на основе метода поверхностно-усиленной рамановской спектроскопии (англ. surface-enhanced Raman spectroscopy, SERS). Необходимость разработки такого подхода обусловлена большой индивидуальной вариативностью метаболизма лекарств и реакций раковых опухолей на химиотерапевтические препараты. Первый этап работы требует разработки подложек SERS, которые имеют потенциал для in vivo применений. Поэтому были определены требования к SERS подложкам, которые включали высокую чувствительность, равномерность усиления сигнала, использование биосовместимых материалов в качестве основы и механическая и химическая стабильность. В литературе имеется очень ограниченное количество подложек, удовлетворяющих этим требованиям. В связи с этим было реализовано шесть протоколов изготовления подложек совместно с коллегами из Германии, Литвы, Франции: 1. g-C3N4, функционализированный полимерными “коврами” с интегрированными наночастицами. С помощью этого подхода была получена чувствительность вплоть до 10ˆ-9 М для родамина 6G, что соответствует фактору усиления 2,4х10ˆ7. Работа опубликована в ACS Appl. Mater. Interfaces 2020, 12, 9797−9805 (Q1, IF 8,456). 2. Фотонный кристалл. Реализована SERS подложка на поверхности градиентного фотонного кристалла, что позволило реализовать различные условия усиления в разных позициях подложки. Такой подход также привел к увеличению чувствительности подложки примерно в 9 000 раз. Работа опубликована в Sensors & Actuators: B. Chemical 311 (2020) 127837 (Q1, IF 6,393). 3. Электрохимическое осаждение наночастиц на поверхность кардиологических стентов. Зафиксировано усиление сигнала за счет эффекта SERS. 4. Трехмерные структуры, изготовленные методом двухфотонной полимеризации. Получено два пика плазмонного резонанса, соответствующие формированию плазмонных наночастиц и их агрегатов. 5. Функционализация диазониевыми солями. Эксперименты показали значительное усиление поглощения в области плазмонного резонанса. Однако, ширина пика составляла 80-150 нм, что говорит о неоднородной агрегации частиц на поверхности, что также подтверждается данными SEM. Как известно, это ограничивает воспроизводимость сигнала в SERS. Результаты были представлены на 14 международном форуме стратегических технологий "IFOST 2019", Томск, 14-17 октября 2019 г. 6. Получение подложек методом Френца с последующей лазерной обработкой. За счет свой электропроводности, подложка показала свою перспективность для применений в качестве как SERS подложки, так и электрохимического электрода. Такая комбинация подходов может позволить одновременно использовать два аналитических подхода и таким образом разрешить важнейшее ограничение подхода SERS - получение количественных данных. Предварительные результаты были представлены на приглашенных семинарах в INP Greifswald и TU Chemnitz (Германия). Одним из важнейших вопросов при выполнении экспериментов в биологических матриксах является увеличение чувствительности и селективности детектирования за счет функционализации поверхности. Один из простых в реализации подходов основан на последовательной функционализации поверхности наночастиц гидрофильными и гидрофобными тиолами для захвата малых гидрофильных молекул. Тем не менее, в литературе не представлено пространственно-разрешенных исследований таких иерархических поверхностей, хотя именно распределение молекул по поверхности определяет их уникальные свойства. Это связано с ограничениями химических методов анализа, которые не позволяют получить достаточное пространственное разрешение. В связи с этим был разработан подход для анализа гетерогенных (гидрофильных/гидрофобных) областей функционализированной поверхности для обеспечения чувствительности и селективности SERS подложки к молекулам лекарственных препаратов, который планируется развить при дальнейшем выполнении проекта. Для выполнения модельных экспериментов проведены все предварительные работы, включая анализ SERS подложек различными методами, определение их параметров с использованием модельных молекул, тестовые SERS эксперименты. Также, определены ключевые параметры (концентрация и время экспозиции) применения третбутилгидропероксида* (TBHP) для индуцирования гибели клеток. Подготовлен русскоязычный текст литературного обзора по теме “Возможности SERS при различных типовых патологических процессах” на основе 198 литературных источников. Развитие SERS имплантов для ключевых применений позволит лучше понять индивидуальные особенности организма и сделать шаг к персонализированной медицине за счет мониторинга биомолекул в организме в режиме реального времени. Использование имплантов позволит зафиксировать наночастицы для оптической фокусировки при мониторинге процессов в течение нескольких дней. Уже на этом раннем этапе развития технологии возможно определить ряд задач, где такой подход мог бы привести к прорыву как в качестве здравоохранения, так и в понимании индивидуальных реакций. *ТВНР - аналог перекиси водорода, активирующего внутриклеточное свободнорадикальное окисление.

 

Публикации

1. Деделаите Л., Родригес Р.Д., Шреибер Б., Раманависиус А., Цан Д.Р.Т., Шеремет Е. Multiwavelength optical sensor based on a gradient photonic crystal with a hexagonal plasmonic array Sensors and Actuators B: Chemical, 311 (2020) 127837 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1016/j.snb.2020.127837

2. Шенг В., Ли В., Тан Д., Жанг П., Жанг Е., Шеремет Е., Шмидт Б.В.К., Фенг К., Родригес Р.Д., Джордан Р., Амин И. Polymer brushes on graphitic carbon nitride for patterning and as SERS active sensing layer via incorporated nanoparticles ACS Applied materials & interfaces, 12, 9797−9805 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1021/acsami.9b21984

3. - Фотонный кристалл поможет точнее определять химический состав сложных веществ Служба новостей Томского политехнического университета, Фотонный кристалл поможет точнее определять химический состав сложных веществ // Служба новостей Томского политехнического университета. URL: https://news.tpu.ru/news/2020/05/14/36204/ (дата обращения: 15.05.2020) (год публикации - )


Аннотация результатов, полученных в 2020 году
Второй этап проекта “SERS как метод для in vivo мониторинга лекарственных препаратов и их эффектов” направлен на разработку системы мониторинга лекарственных препаратов in vivo в режиме реального времени на основе метода поверхностно-усиленной рамановской спектроскопии (англ. surface-enhanced Raman spectroscopy, SERS). Необходимость разработки такого подхода обусловлена большой индивидуальной вариативностью метаболизма лекарств и реакций раковых опухолей на химиотерапевтические препараты. На этом этапе было запланировано завершение модельных экспериментов по детектированию лекарственных препаратов и их эффектов и определению механизма гибели раковых клеток методом SERS. Для этого использовались подложки, изготовленные методом Франца, которые представляют собой полиуретан с интегрированным золотыми наноструктурами. Данные подложки являются проводящими, что позволяет реализовать метод электрохимического детектирования параллельно с оптическими подходами. С использованием этих подложек были реализованы запланированные в проекте модельные эксперименты. При этом получены следующие пределы обнаружения: 1Е-6 М для венлафаксина и О-дезметилвенлафаксина, 1Е-3 М для адреналина. К сожалению, данные пределы обнаружения существенно выше, чем концентрации, которые необходимо детектировать в in vivo применениях. Вторым подходом, реализуемым в проекте, была методика определения механизма гибели клеток (некроза или апоптоза), что важно для отслеживания реакция опухоли на лекарственные препарат. По результатам проведения ряда экспериментов, спектральный отклик клеток оказался невоспроизводим. В связи с этим, было признано, что обе концепции не перспективны для реализации in vivo, так как в этом случае добавятся дополнительные сложности измерения, такие как паразитные сигналы, неспецифичная адсорбция белков на поверхности и низкая эффективность оптической схемы сбора сигнала. В связи с этим был предложен принципиально другой принцип детектирования с использованием SERS меток как более перспективный для in vivo применений, а именно, функционализация поверхности молекулами, спектр которых зависит от детектируемого параметра (в данном случае, рН среды). В результате была реализована следующая концепция SERS подложки: сама подложка представляет собой композитную структуру на основе полиэтилентерефталата (ПЭТ) и серебряных наночастиц, обработанных лазерным излучением для их фиксации на поверхности полимера, затем электрохимически дополнительно осаждались серебряные плазмонные частицы. Серебро было функционализированно 4-нитробензолтиолом (4-NBT) в качестве SERS метки. Данная молекула была выбрана потому, что на поверхности серебра и при лазерном облучении она постепенно восстанавливается до аминобензолтиола (4-ABT), что выражается в появлении NH2 моды в спектрах, и затем димеризуется в 4,4’-димеркаптоазобензол (DMAB), что выражается в появлении N=N моды на 1437 см-1. На скорость этого процесса влияет рН среды и концентрация активных кислородных радикалов. Был поставлен модельный эксперимент, в котором спектр 4-NBT детектировался в питательных средах, в которых культивировались клетки рака молочной железы, собранные на разных сроках культивации (вплоть до 12го дня). Было показано, что рамановские спектры действительно зависят от свойств среды, был предложен механизм, объясняющая влияние рН среды на SERS спектр за счет влияния концентрации ионов водорода на скорость фотокаталитической реакции димеризации 4-ABT. Более того, была изучена структура такой подложки, описан механизм ее формирования, показано, что такая подложка обладает высокой стабильностью (как механической, так и стабильностью в биологической среде), подтвержден ее бактерицидный эффект. При использовании данного подхода, SERS сигнал детектируется с использованием портативного рамановского спектрометра через кожу, что позволяет говорить о перспективе данного принципа формирования SERS подложек для in vivo применений. Популярная статья о проекте: https://news.tpu.ru/news/2021/05/07/38310/

 

Публикации

1. Родригес Р., Виллагомес К., Ходадади А., Купфер С., Аверкиев А., Деделаите Л., Танг Ф., Хайва М., Кольчужин В., Раманавичиус А., Адам П.-М., Грэфе С., Шеремет Е. Chemical-enhancement vs. molecule-substrate geometry in plasmon-enhanced spectroscopy ACS Photonics, - (год публикации - 2021)

2. Родригес Р., Виллагомес К., Ходадади А., Купфер С., Аверкиев А., Деделаите Л., Танг Ф., Хайва М., Кольчужин В., Раманавичиус А., Адам П.-М., Грэфе С., Шеремет Е. Chemical-enhancement vs. molecule-substrate geometry in plasmon-enhanced spectroscopy ACS Photonics, 8, 8, 2243–2255 (год публикации - 2021) https://doi.org/10.1021/acsphotonics.1c00001

3. Родригес Р., Гридина М., Петров И., Вилья Н., Мурастов Г., Фаткуллин М., Семенов О., Чернова А., Плотников Е., Липовка А., Губарев Ф., Аверкиев А., Джиа К., Шенг В., Амин И., Бразовский К., Шеремет Е. Molecular plasmonic three-dimensional forests as chemical sensors compatible with flexible electronics and photocatalysis Nano Letters, - (год публикации - 2021)

4. Фаткуллин М., Родригес Р.Д., Петров И., Виллья Н.Е., Липовка А., Гридина М., Мурастов Г., Чернова А., Плотников Е., Аверкиев А., Чешев Д., Семенов О., Губарев Ф., Бразовский К., Шэн В., Амин И., Лю Дж., Цзя С. и Шеремет Е. Molecular Plasmonic Silver Forests for the Photocatalytic-Driven Sensing Platforms MDPI, Nanomaterials 2023, 13, 923 (год публикации - 2023) https://doi.org/10.3390/nano13050923

5. Канун О., Лазаревич-Пашти Т., Пашти И., Насрауи С., Талби М., Браге., Адираджу А., Шеремет Е., Родригес Р.Д., Бен Али М., Аль-Хамри А. A Review of Nanocomposite-Modified Electrochemical Sensors for Water Quality Monitoring Sensors, 2021, 21(12), 4131 (год публикации - 2021) https://doi.org/10.3390/s21124131

6. Козик А., Павлова М., Петров И., Бычков В., Ким Л., Дорожко Е., Чен Ч., Родригес Р.Д., Шеремет Е. A review of surface-enhanced Raman spectroscopy in pathological processes Analytica Chimica Acta, - (год публикации - 2021)

7. Козик А., Павлова М., Петров И., Бычков В., Ким Л., Дорожко Е., Чен Ч., Родригес Р.Д., Шеремет Е. A review of surface-enhanced Raman spectroscopy in pathological processes Analytica Chimica Acta, Volume 1187, 338978 (год публикации - 2021) https://doi.org/10.1016/j.aca.2021.338978

8. Танг Х., Ванг Р., Ши Л., Шеремет Е., Родригес Р.Д., Сан Дж. Post-processing strategies for improving the electrical and mechanical properties of MXenes Chemical Engineering Journal, 425 (2021) 131472 (год публикации - 2021) https://doi.org/10.1016/j.cej.2021.131472

9. - Ученые ТПУ усилили сигнал спектрального «паспорта» молекул для биомедицинских применений Служба новостей Томского Политехнического Университета, - (год публикации - )


Возможность практического использования результатов
Во многих областях медицины индивидуальные реакции пациента во многом определяют подход к лечению и его эффективность. In vivo мониторинг биохимических показателей в живом организме может перевернуть эту область науки и медицины. Однако, существующие аналитические методы имеют длительное время отклика, дороги и не могут обеспечить мониторинг in vivo. Имплантаты с поверхностно-усиленной рамановской спектроскопией (SERS) могут стать таким решением, поскольку по сравнению с другими методами они обладают высокой химической селективностью и менее подвержены влиянию поверхностного биообрастания. В рамках проекта был разработан ряд SERS подложек, и показан подход для определения кислотного рН в биологической среде с помощью SERS подложек на основе использования молекулы-репортера, участвующей в реакции димеризации под влиянием лазерного излучения. Уменьшение рН является косвенным признаком некоторых патологических процессов, в первую очередь гипоксии и воспаления, в том числе характерных для раковых опухолей. В дальнейшем предложенная концепция может получить дальнейшее развитие с точки зрения расширения количества диагностируемых параметров, улучшения чувствительности и специфичности подхода.