КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 19-73-10210

НазваниеНовая стратегия асимметрического синтеза биологически активных азотсодержащих гетероциклов на основе реакций активированных циклопропанов с N-гетеродиеновыми системами и пиразолинами

РуководительНовиков Роман Александрович, Кандидат химических наук

Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт органической химии им. Н.Д. Зелинского Российской академии наук, г Москва

Период выполнения при поддержке РНФ 07.2019 - 06.2022 

Конкурс№41 - Конкурс 2019 года «Проведение исследований научными группами под руководством молодых ученых» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными.

Область знания, основной код классификатора 03 - Химия и науки о материалах, 03-101 - Синтез, строение и реакционная способность органических соединений

Ключевые словаАктивированные циклопропаны, N-гетеродиеновые системы, пиразолины, циклоприсоединение, соединения редкоземельных металлов, хиральные лиганды, асимметрический катализ, азотсодержащие гетероциклы, исследования биологической активности, молекулярное моделирование, виртуальный скрининг

Код ГРНТИ31.21.00


СтатусУспешно завершен


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Проект направлен на решение как проблем фундаментальной органической химии, заключающихся в развитии новых синтетических методов и создании эффективных подходов к синтезу сложных молекул, так и важных вопросов практического характера, связанных с выявлением соединений, обладающих полезными прикладными свойствами в области фармацевтической и медицинской химии. В ходе проекта будут всесторонне исследованы реакции активированных циклопропанов, содержащих комбинации либо донорных и акцепторных заместителей в вицинальном положении, либо атомов галогена и фтора, с рядом гетероциклических и гетеродиеновых систем с атомами азота, а также пиразолинов с целью создания полизамещенных функционализированных азотистых гетероциклов, включая инденопиперидиновые, пиразолидиновые, пирролидиновые, диазабициклооктановые и другие гетероциклические каркасы. Использование солей галлия и редкоземельных металлов в качестве катализаторов изучаемых реакций в присутствии хиральных лигандов позволит решить важную задачу по наведению хиральности в целевых молекулах-кандидатах в биологически активные препараты и откроет подход к широкому кругу энантиомерно чистых замещенных полифункциональных азотсодержащих систем, обладающих потенциальными противогрибковыми, противомикробными, противоопухолевыми и антипролиферативными свойствами. Также на основе превращений фторированных циклопропанов с раскрытием цикла будут разработаны энантиоселективные методы синтеза функционализированных фторалкенов и фторциклоалкенов, биоизостерных упомянутым выше структурам. Разработанные методы будут заключаться в использовании фторированных циклопропанов в качестве синтетических эквивалентов 2-фтораллильных электрофилов в реакциях асимметрического палладий-катализируемого нуклеофильного замещения, а также в качестве синтетических эквивалентов хиральных 2-фтораллильных нуклеофилов. В результате реализации проекта будут развиты некоторые существующие и созданы новые мощные синтетические методы получения сложных каркасных, полициклических полифункциональных молекул из сравнительно простых исходных соединений в одну или несколько стадий без применения трудоемких и времязатратных методов. Многократное увеличение молекулярной сложности вкупе с созданием одного или сразу нескольких стереоцентров в разрабатываемых нами процессах с получением одного пространственного изомера позволит получать соединения различных классов, биоизостерных известным биологически активным и природным соединениям. В рамках общей проблематики проекта будет разработана простая и удобная стратегия синтеза широкого круга каркасов органических молекул, в первую очередь азотистых гетероциклических систем, входящих в состав препаратов, уже зарекомендовавших себя в медицинской практике: эффективных ингибиторов клеточной топоизомеразы I (MJ-III-65 и NSC 314622), противораковых препаратов (Индимитекан LMP776), а также препаратов для лечения висцерального лейшманиоза (Индотекан LMP400 и AM13-55) ) и эффективных аналогов антибиотиков и антибактериальных препаратов нового поколения (Цефтазидим, и др.). С помощью построения на основе структурных данных из Protein Data Bank моделей, необходимых для процедуры скрининга и отбора соединений еще до проведения их химического синтеза, будет осуществлен поиск новых потенциальных лекарств путем тестирования большого количества предполагаемых к получению химических структур на способность к связыванию с определенным белком-мишенью. По результатам тестирования in vitro синтезированных соединений-кандидатов на клеточных культурах с использованием человеческой клеточной линии HEK293 и на избранных мишенях (таких как андрогеновый рецептор (AR) и 17α-гидроксилаза / 17,20-лиаза CYP17A1, являющиеся ключевыми белками в андрогеновом сигнальном пути и влияющие на рост и пролиферацию клеток рака простаты) будут выявлены наиболее перспективные вещества для дальнейшего уточнения их фармакофорного потенциала. Некоторые полученные соединения, содержащие инденопиперидиновые, инденохинолиновые или инденоизохинолиновые каркасы, будут протестированы на противомикробную и противогрибковую биологические активности, в том числе и против резистентных штаммов золотистого стафилококка. Также ряд полученных структур будет исследован на несколько видов противоопухолевой активности. Таким образом, в рамках данного проекта планируется не только развитие новых синтетических подходов в химии активированных циклопропанов, но и первая стадия биологических испытаний полученных веществ для выявления новых перспективных кандидатов в лекарственные препараты.

Ожидаемые результаты
В ходе реализации проекта планируется получить как результаты фундаментального характера, связанные с расширением синтетических возможностей активированных циклопропанов, так и практически значимые результаты, включающие в себя изучение биологической активности синтезированных соединений. В результате выполнения проекта участниками будут всесторонне исследованы реакции активированных циклопропанов, содержащих комбинации либо донорных и акцепторных заместителей в вицинальном положении, либо атомов галогена и фтора, с рядом гетероциклических и гетеродиеновых систем с атомами азота, а также пиразолинов. Высокая чувствительность этих реакций к условиям проведения позволит разработать селективные подходы к сложным полициклическим каркасам с получением широкого круга карбо- и гетероциклических систем, таких как инденохинолины, пиразолидины, пирролидины, диазабициклооктаны и др., труднодоступных другими методами. При использовании каталитических количеств галогенидов галлия в реакциях донорно-акцепторных циклопропанов (ДАЦ) с гетероядерными диенофилами: азадиенами и диазенами, а также пиразолинами – впервые не только будет реализована «обращенная» реакционная способность ДАЦ, открытая нашей группой ранее и заключающаяся в генерации четных 1,2- и 1,4-цвиттер-ионов, но и будут выявлены и подробно изучены другие возможные процессы [4+2]- или [2+2]-циклоприсоединения и более сложные превращения, приводящие к новым классам соединений. С применением в качестве катализаторов кислот Льюиса на основе редкоземельных металлов в реакциях донорно-акцепторных циклопропанов с α,β-ненасыщенными иминами и вицинальными дииминами будут реализованы классические направления [4+3]- или [3+2]-циклоприсоединения. Результатом наших исследований станет разработка эффективных методов селективного получения сложных полизамещенных функционализированных азотистых гетероциклов, включая инденопиперидиновые, пиразолидиновые, пирролидиновые, диазабициклооктановые и другие гетероциклические каркасы, из относительно простых исходных молекул в одну или несколько стадий. Благодаря тому, что особое внимание в ходе реализации данного проекта будет направлено на разработку изучаемых процессов в стереоселективном варианте с получением оптически активных веществ, одним из наиболее важных результатов будет являться селективное получение одного заданного стереоизомера целевых соединений. С помощью катализа хиральными кислотами Льюиса или применения хиральных лигандов будет решена важная задача по наведению хиральности в целевых молекулах-кандидатах в биологически активные препараты, что откроет подход к широкому кругу энантиомерно чистых замещенных полифункциональных азотсодержащих систем, обладающих потенциальными противогрибковыми, противомикробными, и противоопухолевыми свойствами. Исследования каталитических реакций ДАЦ с представленными выше субстратами при катализе солями галлия или редкоземельных металлов в асимметрическом и диастереоселективном варианте не имеют аналогов в мировой литературе и будут впервые реализованы нашей научной группой в рамках реализации данного проекта. С использованием современных физико-химических и расчетных методов будут исследованы интермедиаты изучаемых реакций, в результате чего будут сделаны предположения о необходимых изменениях структуры лигандов для увеличения энантиоселективности. На основании полученных данных будут предложены новые типы асимметрических лигандов и разработаны методы их синтеза с последующей проверкой их эффективности. При использовании фторированных циклопропанов в качестве синтетических эквивалентов 2-фтораллильных электрофилов в реакциях асимметрического палладий-катализируемого нуклеофильного замещения, а также в качестве синтетических эквивалентов хиральных 2-фтораллильных нуклеофилов, будут получены функционализированные фторалкены и фторциклоалкены, биоизостерные известным природным или биологически активным соединениям. С помощью хиральных лигандов данные реакции впервые будут проведены а асимметрическом варианте с получением энантиомерно чистых веществ. Результатом выполнения работ по проекту, носящих прикладной характер, станет моделирование получаемых классов соединений in silico для направленного поиска новых потенциальных лекарств и разработка новых алгоритмов для этого. Будет осуществлен поиск новых потенциальных лекарств путем тестирования большого количества предполагаемых к получению химических структур на способность к связыванию с определенным белком-мишенью. По результатам тестирования in vitro синтезированных соединений-кандидатов на клеточных культурах с использованием человеческой клеточной линии HEK293 и на избранных мишенях (таких как андрогеновый рецептор (AR) и 17α-гидроксилаза / 17,20-лиаза CYP17A1, являющиеся ключевыми белками в андрогеновом сигнальном пути и влияющие на рост и пролиферацию клеток рака простаты) будут выявлены наиболее перспективные вещества для дальнейшего уточнения их фармакофорного потенциала. Некоторые полученные соединения, содержащие инденопиперидиновые, инденохинолиновые или инденоизохинолиновые каркасы, будут протестированы на противомикробную и противогрибковую биологические активности, в том числе и против резистентных штаммов золотистого стафилококка. Также ряд полученных структур будет исследован на несколько видов противоопухолевой активности. В результате будет отобрана серия структур, обладающих наиболее ярко выраженными видами биологической активности вместе с низкой токсичностью, которые будут направлены на более углубленные испытания с целью создания новых действующих лекарственных веществ. Таким образом, в рамках данного проекта не только будет осуществлено полноразмерное и гармоничное развитие фундаментальной синтетической части на уровне ведущих зарубежных лабораторий, но и будут выполнены первые этапы крайне важного прикладного использования результатов в будущем, заключающиеся в выявлении новых перспективных кандидатов в лекарственные препараты.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2019 году
Получены результаты как фундаментального характера, заключающиеся в развитии новых синтетических методов и создании эффективных подходов к синтезу сложных молекул, так и важного практического плана, связанные с выявлением соединений, обладающих полезными прикладными свойствами в области фармацевтической и медицинской химии. В ходе реализации проекта успешно продолжает решаться задача разработки новых процессов донорно-акцепторных (Д–А) циклопропанов с диеновыми и азадиеновыми системами и пиразолинами, создания новых методов асимметрического катализа и синтеза хиральных азотистых гетероциклов на основе этих процессов для Д–А циклопропанов, а также раскрытия фторциклопропанов. При детальном изучении реакции Д–А циклопропанов с α,β-ненасыщенными иминами при использовании различных катализаторов, в том числе GaCl3, было обнаружено, что в иминных субстратах затрагивается как связь С=С, так и связь C=N с получением азотсодержащих гетероциклов. Данное превращение было реализовано в асимметрическом варианте при катализе мягкими кислотами Льюиса с использованием хиральных лигандов (Box, PyBox). Из одних и тех же простых и доступных исходных соединений: 2-фенилциклопропан-1,1-дикарбоксилата и тозилимина коричного альдегида – в зависимости от примененных условий был получен ряд циклических продуктов, труднодоступных другим способами (в частности, N-тозилтетрагидропиридины – продукты стереодивергентного синтеза, N-тозилпирролидины, а также циклогексаны, полностью замещенные по всем шести положениям в виде единственного диастереомера – продукты формального [2+2+2]-циклоприсоединения двух молекул тозилимина). Данное превращние было реализовано и для некоторых других тозилиминов с получением продуктов формального [4+2]-циклоприсоединения. Начато систематическое изучение формального [4+3]-циклоприсоединения Д–А циклопропанов с высокоактивными толилиминами в присутствии трифлата лютеция, которое будет продолжено в дальнейшем. Проведена модификация некоторых полученных азотистых гетероциклических продуктов, в результате которой получены некоторые энантиомерно чистые замещенные полифункциональные азотсодержащие системы, обладающие потенциальными противогрибковыми, противомикробными, противоопухолевыми и антипролиферативными свойствами. Всесторонне изучено формальное [3+2] циклоприсоединение 2-фенилциклопропан-1,1-дикарбоксилата к C=N-двойной связи N-бензил замещенного и N-незамещенного 5-метил-2-пиразолин-5-карбоксилатов в присутствии кислот Льюиса и хиральных лигандов. В результате подробной оптимизации, в ходе которой было протестировано около 30 различных кислот Льюиса и несколько лигандов класса Вох, установлено, что наилучшие результаты показывают трифлаты редкоземельных металлов, скандия, иттрия, лютеция и лантана и их более акцепторные аналоги. Впервые получена сложная нетривиальная каталитическая система iPr-PyBox*[Lu(NTf2)2]+(Sb2F11–), эффективность которой доказана на примере данного превращения. По разработанной методике был получен небольшой ряд продуктов при варьировании заместителей в Д–А циклопропане, 2-пиразолине, а также при атоме азота в 2-пиразолинах. На основе проведенных эксперименов было успешно реализовано асимметрическое присоединение бензальдегида к стирилмалонату с получением средних значений "ee". В результате дальнейшей целенаправленной модификации ряда синтезированных субстратов были получены аминопиразолидинонкарбоксилаты, являющиеся центральным фрагментом соединений с противомикробной активностью. Показано, что реакции различных арил-замещенных Д–А циклопропанов с простыми диенами, такими как бутадиен, изопрен, диметилбутадиен, этилбутадиен, под действием хлорида галлия в зависимости от заместителей при сложноэфирных группах приводят к реализации одного из четырех типов превращений: [4+2]-циклоприсоединение, [4+2]-аннелирование, двойной процесс [4+2]-циклоприсоединения/[4+2]-аннелирования и процесс [4+2]-циклоприсоединения с последующей лактонизацией. В результате был получен широкий круг разнообразных полициклических карбоциклов, содержащих в своей структуре шестичленные циклы в различных комбинациях, а также лактонный фрагмент. Открыты уникальные, не имеющие литературных аналогов процессы [2+2]-циклоприсоединения Д–А циклопропанов с норборнадиеном и двойного [4+2]-аннелирования с Д–А циклопропанов 1,4-дифенилбутадиеном и начато их подробное изучение. При изучении реакции Д–А бициклопропилов с фенилтриазолиндионом (PTAD) при катализе трифлатами Yb, Sc или Ga показано, что в зависимости от условий проведения процесса может быть реализовано формальное [4+2]-циклоприсоединение с формированием дигидропиридазинового скелета либо совершенно беспрецедентное и не имеющее аналогов в литературе формальное [6+2]-циклоприсоединение, приводящее к образованию восьмичленного тетрагидродиазоцинового гетероцикла, содержащего девять атомов азота в молекуле. Данный процесс был реализован в энантиоселективном варианте с использованием коммерчески доступных хиральных лигандов Box или PyBox в комбинации с трифлатами редкоземельных металлов, а круг вовлекаемых субстратов был расширен за счет использования замещенных Д–А бициклопропилов. В ходе дальнейших модификаций полученных на этом этапе соединений были получены полиазотистые гетероциклы, входящие в состав препаратов, уже зарекомендовавших себя в медицинской практике: эффективных ингибиторов клеточной топоизомеразы I (MJ-III-65 и NSC 314622), противораковых препаратов (Индимитекан LMP776), а также препаратов для лечения висцерального лейшманиоза (Индотекан LMP400 и AM13-55) ) и эффективных аналогов антибиотиков и антибактериальных препаратов нового поколения (Цефтазидим, и др.). Разработаны подходы к энантиоселективному синтезу функционализированных фторалкенов на основе Pd-катализируемого кросс-сочетания 2-фтораллилгалогенидов и пиридиниевых солей. Энантиоселективное аллилирование альдегидов ахиральными (2-фтораллил)боронатами было достигнуто за счет использования хиральной фосфорной кислотой (R)-TRIP. При этом различные кислоты Льюиса с хиральными лигандами на основе BINOL, BOX, PyBOX и транс-циклогександиамина оказались совершенно неэффективными. В качестве альтернативных вариантов синтезирован ряд ,3’-дизамещенных галоген, арил, силил-производных BINOL в качестве перспективных органокатализаторов для энантиоселективного аллилирования альдегидов и кетонов (2-фтораллил)пропандиолборонатами. Также синтезированы первые примеры хиральных (2-фтораллил)боронатов с помощью дибороновых реагентов на основе хиральных 1,2-диолов (диизопропил (D) и (L)-тартратов, -(+)-пинандиола). Первые примеры энатиоселективного Pd-катализируемого нуклеофильного замещения в 2-фтораллильных электрофилах были осуществлены с использованием (R)-BINOP в качестве лиганда. При этом требуется дальнейшая оптимизация реакционных условий для увеличения энантиоселективности. Наиболее доступные бидентатные дифосфиновые лиганды (BINAP, BINOP, JosiPhos, TaniaPhos, MandyPhos, DUPHOS) оказались неэффективными и ингибировали как реакции с малонатами в качестве нуклеофилов, так и B2pin2. Начато создание химической библиотеки конкретных соединений-кандидатов, синтез которых проводится в рамках общей проблематики проекта. Предварительное сканирование с целью отбора по сходству химической структуры со структурой известных лекарств, для которых имеются рентгеноструктурные данные комплекса с белком-мишенью, а также дальнейшая сортировка по потенциально подходящим белкам-мишеням позволило выявить ряд соединений-лидеров либо по сходству с известными лекарствами, либо по наибольшему количеству выявленных возможных мишеней. Для некоторых структур проведены первые виртуальные скрининги методом молекулярного докинга с белками-мишенями из библиотеке моделей Protein Data Bank, на основании которых даны рекомендации по отбору наиболее перспективных соединений, являющихся новыми потенциальными лекарствами, еще до проведения их химического синтеза. В ходе реализации проекта активно развиваются некоторые существующие и открываются новые мощные синтетические методы получения сложных каркасных, полициклических полифункциональных молекул из сравнительно простых исходных соединений в одну или несколько стадий без применения трудоемких и времязатратных методов. Многократное увеличение молекулярной сложности вкупе с созданием одного или сразу нескольких стереоцентров в разрабатываемых нами процессах с получением одного пространственного изомера позволо получить соединения различных классов, биоизостерных известным биологически активным и природным соединениям. В рамках общей проблематики проекта успешно продолжается разработка простых и удобных подходов к синтезу широкого круга каркасов органических молекул. Таким образом, в рамках данного проекта уже реализуется развитие новых синтетических подходов в химии активированных циклопропанов, которое в дальнейшем будет дополнена важным практическим аспектом: первой стадией биологических испытаний полученных веществ для выявления новых перспективных кандидатов в лекарственные препараты.

 

Публикации

1. Зотова М.А., Князев Д.А., Новиков Р.А., Томилов Ю.В. "Diels-Alder Reaction" in the Ionic Version: GaCl3-Promoted Formation of Substituted Cyclohexenes from Donor–Acceptor Cyclopropanes and Dienes Tetrahedron Letters, 151990 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1016/j.tetlet.2020.151990

2. Потапов К.В, Денисов Д.А., Глушкова В.В., Новиков Р.А., Томилов Ю.В. Donor–Acceptor Bicyclopropyls as 1,6-Zwitterionic Intermediates: Synthesis and Reactions with 4-Phenyl-1,2,4-triazoline-3,5-dione (PTAD) and Phenylacetylene The Journal of Organic Chemistry, - (год публикации - 2020)

3. Борисова И.А., Денисов Д.А., Борисов Д.Д., Новиков Р.А., Томилов Ю.В. C-H Активация интернальных алкинов под действием GaCl3 в реакциях с донорно-акцепторными циклопропанами и метилиденмалонатами Сборник тезисов конференции "Всероссийская научная конференция Марковниковские чтения: органическая химия от Марковникова до наших дней (WSOC 2020)", сборник тезисов, стр. 109 (год публикации - 2020)

4. Князев Д.А, Зотова М.А., Новиков Р.А. Новый подход к использованию донорно-акцепторных циклопропанов в реакциях с диенами Сборник тезисов конференции "Всероссийская научная конференция Марковниковские чтения: органическая химия от Марковникова до наших дней (WSOC 2020)", сборник тезисов, стр. 125 (год публикации - 2020)

5. Князев Д.А., Новиков Р.А. Новый подход к использованию донорно-акцепторных циклопропанов в реакциях с диенами Сборник тезисов конференции "Международная научная конференция студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов-2020»", - (год публикации - 2020)

6. Новиков Р.А., Томилов Ю.В. Development of an unique gallium chemistry and catalysis of donor–acceptor cyclopropanes and related alkenes Тезисы конференции "21st Tetrahedron Symposium, Elsevier, Gothenburg, Sweden, 21-24 June 2021", тезисы конференции, TETR2020_0223 (год публикации - 2020)

7. Потапов К.В., Денисов Д.А., Глушкова В.В., Новиков Р.А., Томилов Ю.В. Взаимодействие 2'-арил-1,1'-бициклопропил-2,2-дикарбоксилатов с фенилацетиленом и PTAD под действием кислот Льюиса Сборник тезисов конференции "Всероссийская научная конференция Марковниковские чтения: органическая химия от Марковникова до наших дней (WSOC 2020)", сборник тезисов, стр. 147 (год публикации - 2020)


Аннотация результатов, полученных в 2020 году
Получены результаты как фундаментального характера, заключающиеся в развитии новых синтетических методов и создании эффективных подходов к синтезу сложных молекул, так и важного практического плана, связанные с выявлением соединений, обладающих полезными прикладными свойствами в области фармацевтической и медицинской химии. В ходе реализации проекта успешно продолжает решаться задача разработки новых процессов донорно-акцепторных (Д–А) циклопропанов с диеновыми и азадиеновыми системами и пиразолинами, создания новых методов асимметрического катализа и синтеза хиральных азотистых гетероциклов на основе этих процессов для Д–А циклопропанов, а также раскрытия фторциклопропанов. За счет использования рационального дизайна подходов к асимметрическому катализу и подбору хиральных лигандов, и использования синергетического действия нескольких целенаправленно подобранных факторов достигнуты высокие показатели энантиоселективности: e.r. 20:1 для Д–А циклопропанов, и e.r. 28:1 для фторциклопропанов. Для Д–А циклопропанов используется динамическое кинетическое разделение энантиомеров (DYKAT), при котором один энантиомер изомеризуется в другой в ходе реакции, что позволяет использовать исходные циклопропаны в виде рацематов. Изучены катализируемые кислотами Льюиса реакции формального (2+4)-циклоприсоединения между ДАЦ и стирилмалонатами как их синтетическими эквивалентами с конформационно нежесткими азадиенами. Показано изменение региоселективности процесса при переходе от одного синтетического аналога к другому с (3+2)- на (4+2)-присоединение, также исследовано влияние на этот эффект варьирование α-заместителя азадиена. Показано, что в описываемых реакциях выбор стирилмалонатов является предпочтительным. Результатом проведенной работы стало оптимизированное (4+2)-циклоприсоединение между стирилмалонатами и азадиенами, обеспечившее доступ к высоко диастереоселективному синтезу замещенных тетрагидропиридинов с высокими выходами. Несмотря на то, что использование GaCl3 в качестве кислоты Льюиса не было лучшим выбором для данной реакции, нестандартный минорный продукт формального (2+2+2)-циклоприсоединения был выделен в качестве единственного диастереомера именно в его присутствии. Исходя из этого, была предложена приемлемая стереохимическая модель для объяснения диастереоселективности и с целью изучения влияния GaCl3 на процесс. Проведена детальная оптимизация условий асимметрического формального [3+2]-циклоприсоединения донорно-акцепторных циклопропанов к 5-замещенным 2-пиразолинам. Было показано, что лиганды на основе оксазолинового фрагмента (R-BOX и R-PyBOX) являются перспективными асимметрическими вспомогательными реагентами для реакций данного типа. Причем энантиоселективность разработанного процесса может эффективно регулироваться путем внедрения в структуру исходных соединений объемных заместителей, и особенно фрагментов хиральных спиртов, таких как (-)-ментол и (-)-борнеол, служащих не только для создания дополнительной стерической нагрузки, но также для усиления действия хирального лиганда в наведении оптической активности. В результате дальнейшей целенаправленной модификации ряда синтезированных субстратов были получены замещенные пиразолидины и аминопиразолидинонкарбоксилаты, являющиеся центральным фрагментом соединений с противомикробной активностью. За счет использования синергетического действия нескольких целенаправленно подобранных факторов достигнуты высокие показатели энантиоселективности: e.r. 20:1, значительно превышающие показатели, достигнутые за первый год проекта (e.r. не более 4:1). Обнаружено, что использование более акцепторных кислот Льюиса – Sc(NTf2)3, Yb(NTf2)3 и Yb(NTf2)2(SbF6) – повышает эффективность рассматриваемого превращения, и является перспективным инструментом для дальнейшего улучшения энантиоселективности процесса. По разработанной методике был получен небольшой ряд продуктов при варьировании заместителей в Д–А циклопропане, 2-пиразолине, а также при атоме азота в 2-пиразолинах. Исследованы реакции (2+4)-циклоприсоединения ДАЦ к сопряжённым диенам, в результате был разработан подход к замещённым циклогексен-1,1-дикарбоксилатам. Далее было показано, что при изменении условий реакция не останавливается на образовании циклогексена. Последний вступает во внутримолекулярную реакцию по типу Фриделя-Крафтса, катализируемую GaCl3, приводя к производным бензобициклононана. Также была проведена простейшая модификация одного из продуктов, в результате был получен соответствующий амин. Кроме того, мы подробно исследовали процесс формального (4+2)-циклоприсоединения замещенных метилиденмалонатов с сопряженными диенами в условиях катализа кислотами Льюиса, используя вместо ДАЦ непосредственно арилметилиденмалонаты. Было установлено, что оптимальной кислотой Льюиса в данной реакции является AlCl3. В результате был разработан региоселективный метод получения 6-арил-4-метилциклогекс-3-ен-1,1-дикарбоксилатов. В ходе дальнейших модификаций полученных на этом этапе соединений были получены полиазотистые гетероциклы, входящие в состав препаратов, уже зарекомендовавших себя в медицинской практике: эффективных ингибиторов клеточной топоизомеразы I (MJ-III-65 и NSC 314622), противораковых препаратов (Индимитекан LMP776), а также препаратов для лечения висцерального лейшманиоза (Индотекан LMP400 и AM13-55) ) и эффективных аналогов антибиотиков и антибактериальных препаратов нового поколения (Цефтазидим, и др.). Проведена детальная оптимизация структуры асимметрического лиганда для реакции (2-фтораллил)палладиевых комплексов с аминами и анилинами с целью последующего использования разработанной каталитической системы для энантиоселективного аминирования (2-фтораллил)пиридиниевых солей. Показано, что лиганды на основе O,O´-дифосфин-BINOL являются перспективным классом асимметрических лигандов для энантиоселективного аминирования (2-фтораллил)пиридиниевых солей вторичными аминами. При этом энантиоселективность процесса может быть изменена на противоположную за счет варьирования заместителей в 3,3´-положениях лиганда без смены (R)-конфигурации исходного BINOL. Разработан процесс асимметрического Pd/(S)-tBu-PHOX-катализируемого аминирования (2-фтораллил)пиридиниевых солей пара-анизидином как синтетическим эквивалентом NH2-группы для энантиоселективного получения первичных 2-фтораллиламинов. При этом процесс может применен как к симметричным, так и к несимметричным 1,3-дизамещенным аллилпиридиниевым солям без существенной потери в энантиоселективности. Была разработана расчетная платформа для проведения «обратного скрининга» – поиска потенциальных белков-мишеней для ряда соединений, синтезированных с помощью реакций с участием ДАЦ, в основе которой лежит генерация виртуальных библиотек с помощью заложенной реакционной схемы, поиск и фильтрация по топологическим и пространственным фармакофорным дескрипторам, а также гибкий докинг. В качестве структур рецепторов для гибкого докинга используется построенная база данных известных белков-мишеней, модели комплексов которых с молекулами лекарственных средств были взяты из банка данных белковых структур PDB (886 одноцепочечных моделей). Были построены виртуальные библиотеки возможных соединений-кандидатов, и определены потенциальные мишени для соединений, которые могут быть синтезированы с помощью реакций с участием ДАЦ. Результатом выборки из полученных библиотек в соответствии с фармакофорными критериями Липинского и проведение «обратного скрининга» с помощью химических дескрипторов и гибкого докинга явился весьма значительный класс мишеней, образующий, однако, в основном лишь слабосвязанные комплексы. Вариации заместителей, такие, как замена карбоксиметильных групп на нитрильные после генерации библиотеки, хотя и позволили улучшить фармакофорный потенциал выборок (в соответствии с критериями Липинского), однако в корне не изменили ситуацию со сложностью идентификации единственной «первичной» мишени, вероятной причиной чему служит значительный разброс геометрических параметров сайтов связывания в использованных структурах белков-мишеней. Тем не менее, использованная методология показала, что можно успешно производить фильтрацию невозможных мишеней. Идентифицированные на данный момент мишени включают широкий класс важных фармацевтических мишеней, что подтверждает перспективность использованных синтетических схем с участием ДАЦ, однако требуется разработка более узких критериев для отбора результатов докинга. В ходе реализации проекта активно развиваются некоторые существующие и открываются новые мощные синтетические методы получения сложных каркасных, полициклических полифункциональных молекул из сравнительно простых исходных соединений в одну или несколько стадий без применения трудоемких и времязатратных методов. Многократное увеличение молекулярной сложности вкупе с созданием одного или сразу нескольких стереоцентров в разрабатываемых нами процессах с получением одного пространственного изомера позволо получить соединения различных классов, биоизостерных известным биологически активным и природным соединениям. В рамках общей проблематики проекта успешно продолжается разработка простых и удобных подходов к синтезу широкого круга каркасов органических молекул. Таким образом, в рамках данного проекта уже реализуется развитие новых синтетических подходов в химии активированных циклопропанов, которое в дальнейшем будет дополнена важным практическим аспектом: первой стадией биологических испытаний полученных веществ для выявления новых перспективных кандидатов в лекарственные препараты.

 

Публикации

1. Белая, М.А., Денисов, Д.А., Новиков, Р.А., Томилов, Ю.В. Катализируемая AlCl3 реакция Дильса—Альдера между арилметилиденмалонатами и сопряженными диенами Известия Академии наук, Серия Химическая, - (год публикации - 2021)

2. Белая, М.А., Князев, Д.А., Борисов, Д.Д., Новиков, Р.А., Томилов, Ю.В. GaCl3-Mediated Cascade [2+4]-Cycloaddition / [4+2]- Annulation of Donor-Acceptor Cyclopropanes with Conjugated Dienes: Strategy for the Construction of Benzobicyclo[3.3.1]nonane Skeleton The Journal of Organic Chemistry, - (год публикации - 2021) https://doi.org/10.1021/acs.joc.1c00564

3. Новиков Р.А., Борисов Д.Д., Денисов Д.А., Ткачев Я.В., Томилов Ю.В. The Concept of Gallium-Controlled Double C–H Functionalization of Aliphatic CH2-Groups driven by Vinyl Carbocations Nature Chemistry, - (год публикации - 2021)

4. Потапов К.В., Денисов Д.А., Глушкова В.В., Новиков Р.А., Томилов Ю.В. Donor−Acceptor Bicyclopropyls as 1,6-Zwitterionic Intermediates: Synthesis and Reactions with 4-Phenyl-1,2,4-triazoline-3,5-dione and Terminal Acetylenes The Journal of Organic Chemistry, J. Org. Chem. 2020, 85, 23, 15562–15576 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1021/acs.joc.0c02293

5. Сергеев, П.Г., Новиков, Р.А., Томилов, Ю.В. Lewis acid‐catalyzed formal (4+2)‐ and (2+2+2)‐cycloaddition between 1‐azadienes and styrylmalonates as analogues of donor‐acceptor cyclopropanes Advanced Synthesis & Catalysis, - (год публикации - 2021) https://doi.org/10.1002/adsc.202100453

6. Потапов К.В., Денисов Д.А., Глушкова В.В., Новиков Р.А., Томилов Ю.В. 2´-Арил-1,1´-бициклопропил-2,2-дикарбоксилаты как аналоги донорно-акцепторных циклопропанов: реакции с фенилацетиленом и PTAD под действием кислот Льюиса Сборник тезисов конференции "Международная научная конференция Актуальные вопросы органической химии и биотехнологии", (18–21 ноября 2020 года, Екатеринбург, Россия), сборник тезисов, стр. 414-415 (год публикации - 2020)

7. Потапов К.В., Денисов Д.А., Глушкова В.В., Новиков Р.А., Томилов Ю.В. Обложка к статье "Donor−Acceptor Bicyclopropyls as 1,6-Zwitterionic Intermediates: Synthesis and Reactions with 4-Phenyl-1,2,4-triazoline-3,5-dione and Terminal Acetylenes" The Journal of Organic Chemistry, Обложка к статье "J. Org. Chem. 2020, 85, 23, 15562–15576" (год публикации - 2020)

8. - Ученые ИОХ РАН открыли новые грани реакционной способности донорно-акцепторных циклопропанов Информационный новостной сайт ИОХ РАН, - (год публикации - )


Аннотация результатов, полученных в 2021 году
Получены результаты как фундаментального характера, заключающиеся в развитии новых синтетических методов и создании эффективных подходов к синтезу сложных молекул, так и важного практического плана, связанные с выявлением соединений, обладающих полезными прикладными свойствами в области фармацевтической и медицинской химии. В ходе реализации проекта успешно продолжает решаться задача разработки новых процессов донорно-акцепторных (Д–А) циклопропанов с диеновыми и азадиеновыми системами и пиразолинами, создания новых методов асимметрического катализа и синтеза хиральных азотистых гетероциклов на основе этих процессов для Д–А циклопропанов, а также раскрытия фторциклопропанов. За отчетный период были исследованы реакции стирилмалонатов с кросс-замещенными азатриенами. В результате были получены соответствующие диастереомерно чистые транс,транс-замещенные тетрагидропиридины, содержащие диеновый фрагмент при защищенном атоме азота и потому представляющие интерес с точки зрения дальнейшей функционализации. Исследована возможность введения в реакцию ряда несимметрично замещенных азатриенов; показано, что существует возможность увеличения региоселективности процесса за счет использования стерически нагруженных заместителей и снижения температуры вплоть до 4/1. Для полученных тетрагидропиридинов исследована возможность введения в реакции [4+2]-циклоприсоединения с участием активного диенофила PTAD, а также превращения продукта на силикагеле. Также на основе тетрагидропиридинов была предложена стратегия создания нового типа азадиенов, являющихся продуктом удаления защитной группы с атома азота и последующей миграции двойной связи и сохраняющих конфигурации наведенных ранее стереоцентров. Данные соединения потенциально могут открывать доступ для диастереоселективного получения насыщенных азотсодержащих полигетероциклов. Параллельно для реакций стирилмалонатов с 1-азадиенами были продолжены эксперименты по энантиоселективной модификации. С целью развития тематики была предложена идея введения в реакцию азадиенов, содержащих алифатические заместители и представляющих собой смесь диастереомеров по C=C-связи, в частности, аза-производных доступного цитраля. Продолжены исследования возможности перехвата 1,2-цвиттер-иона, генерируемого из соответствующих ДАЦ в присутствии GaCl3, конформационно жесткими 1-азадиенами. Проведена детальная оптимизация условий асимметрического формального [3+2]-циклоприсоединения донорно-акцепторных циклопропанов к 5-замещенным 2-пиразолинам. Было показано, что лиганды на основе оксазолинового фрагмента (R-BOX и R-PyBOX) являются перспективными асимметрическими вспомогательными реагентами для реакций данного типа. Причем энантиоселективность разработанного процесса может эффективно регулироваться путем внедрения в структуру исходных соединений объемных заместителей, и особенно фрагментов хиральных спиртов, таких как (-)-ментол и (-)-борнеол, служащих не только для создания дополнительной стерической нагрузки, но также для усиления действия хирального лиганда в наведении оптической активности. За счет использования синергетического действия нескольких целенаправленно подобранных факторов достигнуты высокие показатели энантиоселективности: e.r. 40:1, значительно превышающие показатели, достигнутые за первый год проекта (e.r. не более 4:1) и второй год проекта (e.r. не более 20:1). Обнаружено, что использование более акцепторных кислот Льюиса – Sc(NTf2)3, Pr(NTf2)3, Yb(NTf2)3 и Yb(NTf2)2(SbF6) – повышает эффективность рассматриваемого превращения, и является перспективным инструментом для дальнейшего улучшения энантиоселективности процесса. По разработанной методике был получен ряд продуктов при варьировании заместителей в Д–А циклопропане, 2-пиразолине, а также при атоме азота в 2-пиразолинах. В результате дальнейшей целенаправленной модификации ряда синтезированных субстратов были получены замещенные пиразолидины и аминопиразолидинонкарбоксилаты, являющиеся центральным фрагментом соединений с противомикробной активностью. Исследованы реакции (2+4)-циклоприсоединения ДАЦ к сопряжённым диенам, в результате был разработан подход к замещённым циклогексен-1,1-дикарбоксилатам. Далее было показано, что при изменении условий реакция не останавливается на образовании циклогексена. Последний вступает во внутримолекулярную реакцию по типу Фриделя-Крафтса, катализируемую GaCl3, приводя к производным бензобициклононана. Также была проведена простейшая модификация одного из продуктов, в результате был получен соответствующий амин. Кроме того, мы подробно исследовали процесс формального (4+2)-циклоприсоединения замещенных метилиденмалонатов с сопряженными диенами в условиях катализа кислотами Льюиса, используя вместо ДАЦ непосредственно арилметилиденмалонаты. Было установлено, что оптимальной кислотой Льюиса в данной реакции является AlCl3. В результате был разработан региоселективный метод получения 6-арил-4-метилциклогекс-3-ен-1,1-дикарбоксилатов. Завершена оптимизация асимметрического лиганда для реакций (2-фтораллил)палладиевых комплексов с первичными и вторичными аминами — ключевой энантиоселективность-определяющей стадии нашего нового подхода к хиральным биологически-ориентированным 2-фтораллиламинам. Показано, что оптимальным лигандом для первичных и циклических вторичных аминов является tBu-PHOX, обеспечивающий ее более 90%. Для ациклических вторичных аминов, являющихся менее реакционно-способными субстратами вследствие стерических факторов, необходимо использование лиганда (R)-BinolPhos и понижение температуры до –78°С для достижения ee более 80%. Обнаружен беспрецедентный эффект палладиевых наночастиц (Pd-NPs) на скорость окислительного присоединения, а также сформулировать концепцию двойного катализа Pd-NPs и мономолекулярными комплексами. Суть этой концепции заключается в протекании окислительного присоединения Pd-NPs к аллильному субстрату с образованием комплексов (аллил)Pd-NPs, дальнейшая реакция с амином для которых невозможно вследствие электронных факторов. Однако образующиеся обратимо в результате личинга моно-Pd-комплексы с хиральным лигандом L* способны реагировать с амином, давая целевой продукт с высокой энантиоселективностью. В ходе проекта была разработана расчетная платформа для проведения «обратного скрининга» – поиска потенциальных белков-мишеней для ряда соединений, синтезированных с помощью реакций с участием ДАЦ. С ее помощью были построены виртуальные библиотеки возможных соединений-кандидатов, и определены потенциальные мишени для соединений, которые могут быть синтезированы с помощью реакций с участием ДАЦ. Несмотря на то, что идентификация единственной «первичной» мишени оказалась затруднена, использованная методология показала, что можно успешно производить фильтрацию невозможных мишеней. В результате анализа стереоизомеров замещенных фторсодержащих производных циклогептена было выявлено, что они представляют собой перспективные лиганды для связывания с ацетилхолинэстеразой (АХЭ), и установлены стереохимические критерии для наилучшего связывания и конформационной стабильности. Ряд из 154 синтезированных соединений был использован для биологических испытаний на эстроген-зависимых клетках карциномы молочной железы, причем два соединения показали значительную антипролиферативную активность, предположительно, цитостатического характера, что указывает на их возможное влияние на сигнальный путь эстрогенового рецептора (ER). Таким образом, результаты моделирования и биологических испытаний на клетках человека подтвердили перспективность синтетических схем с участием ДАЦ для синтеза новых биологически активных соединений.

 

Публикации

1. Боброва А.Ю., Новиков М.А., Новиков Р.А., Дороватовский П.В., Володин А.Д., Корлюков А.А., Томилов Ю.В. Highly enantioselective amination of h3-(2-fluorocycloheptenyl)palladium complexes bearing chiral P,P- and P,N-ligands Mendeleev Communication, - (год публикации - 2022)

2. Князев Д.А., Белая М.А., Володин А.Д., Корлюков А.А., Новиков Р.А., Томилов Ю.В. GaCl3-Mediated Reactions of «Double» Donor−Acceptor Cyclopropanes with Unsaturated Substrates Mendeleev Communication, - (год публикации - 2022)

3. Новиков Р.А., Борисов Д.Д., Менчиков Л.Г., Томилов Ю.В. Донорно-акцепторные циклопропаны. Реакции циклоприсоединения и аннелирования Рецензируемая монография "Донорно-акцепторные циклопропаны. Реакции циклоприсоединения и аннелирования", Москва, Издательство МАКС-Пресс, - (год публикации - 2022)

4. Новиков Р.А., Борисов Д.Д., Томилов Ю.В. Cycloaddition and Annulation Reactions of Donor-Acceptor Cyclopropanes Chapter in the Book, Title: "Donor-Acceptor Cyclopropanes in Organic Synthesis", Wiley-VCH, Editors: Prabal Banerjee, Akkattu T. Biju, - (год публикации - 2022)

5. Князев Д.А., Белая М.А., Новиков Р.А., Томилов Ю.В. Каскадное [2+4]-циклоприсоединение/[4+2]-аннелирование донорно-акцепторных циклопропанов с сопряженными диенами в присутствии хлорида галлия(III) Сборник тезисов конференции "IX Молодежная конференция ИОХ РАН", (11–12 ноября 2021 года, Москва, Россия), сборник тезисов, стр. 24 (год публикации - 2021)

6. Потапов К.В., Денисов Д.А., Новиков Р.А., Томилов Ю.В. Донорно-акцепторные бициклопропаны: синтез и реакции с 4-фенил-1,2,4-триазол-3,5-дионом при катализе трифлатами РЗЭ Сборник тезисов конференции "IV Российский конгресс по катализу (Роскатализ)", (20–25 сентября 2021 года, Казань, Россия), сборник тезисов, стр. 384-385 (год публикации - 2021)

7. Сергеев П.Г., Новиков Р.А., Томилов Ю.В. Lewis acid-catalyzed formal (4+2)- and (2+2+2)-cycloaddition between 1-azadienes and styrylmalonates as analogues of donor-acceptor cyclopropanes Сборник тезисов конференции "XII International conference on chemistry for young scientists (Mendeleev 2021)", (6–10 сентября 2021 года, Санкт-Петербург, Россия), сборник тезисов, стр. 646 (год публикации - 2021)

8. Сергеев П.Г., Новиков Р.А., Томилов Ю.В, Обложка к статье "Lewis acid‐catalyzed formal (4+2)‐ and (2+2+2)‐cycloaddition between 1‐azadienes and styrylmalonates as analogues of donor‐acceptor cyclopropanes" Advanced Synthesis & Catalysis, Обложка (Front Cover Picture) к статье "Adv. Synth. Catal., 2021, 363, 5293–5300" (год публикации - 2021) https://doi.org/10.1002/adsc.202101198

9. - Исследователи ИОХ РАН продолжают изучение химических свойств донорно-акцепторных циклопропанов Новостной сайт ИОХ РАН, - (год публикации - )

10. - Ученые ИОХ РАН открыли новые грани реакционной способности донорно-акцепторных циклопропанов Новостной сайт ИОХ РАН, - (год публикации - )


Возможность практического использования результатов
Проект относится к фундаментальной органической химии и области ее практического приложения (медицинской химии и медицины) для создания нового поколения антибактериальных, противогрибковых, и противоопухолевых, в том числе противоопухолевых и противораковых, препаратов. Таким образом, данный проект отлично соответствует Стратегии НТР РФ «Н3» «Переход к персонализированной медицине, высокотехнологичному здравоохранению и технологиям здоровьесбережения, в том числе за счет рационального применения лекарственных препаратов (прежде всего антибактериальных)». Главной задачей настоящего проекта является всестороннее изучение реакций активированных циклопропанов с рядом гетероциклических и гетеродиеновых систем с целью создания полифункционализированных гетероциклических каркасов, являющихся аналогами известных лекарственных препаратов или природных соединений с ярко выраженной биологической активностью. В последние десятилетия многие микробные и грибковые микроорганизмы выработали различные резистентные штаммы, устойчивые к действию известных препаратов. Мутационные изменения таких микроорганизмов требуют создания новых лекарственных форм, способных эффективно противостоять резистентным штаммам микроорганизмов и грибов. Аналогичные изменения происходят и в опухолевых клетках, что приводит к постепенной потери эффективности существующих лекарственных средств. Виртуальный скрининг in silico на сегодняшний день является зарекомендовавшим себя методом в разработке лекарств, и позволяет осуществлять поиск новых потенциальных лекарственных препаратов путем тестирования большого количества химических структур на способность к связыванию с определенным белком-мишенью. Этот метод обеспечивает экономичную альтернативу высокопроизводительному скринингу, поскольку он позволяет относительно легко провести предварительное тестирование соединений, которые еще предстоит синтезировать. Потенциальные кандидаты в противомикробные и противоопухолевые препараты должны, с одной стороны, иметь структуру, подобную соединениям, уже зарекомендовавшим себя на фармацевтическом рынке, а с другой – принципиально отличаться от них наличием специфических фармакофорных групп, увеличивающих их эффективность в определенных видах биологической активности. Поэтому проект направлен на разработку простых и удобных стратегий синтеза широкого круга каркасов органических молекул, в первую очередь, азотистых гетероциклических систем, поскольку именно они входят в большое число структур применяемых лекарственных препаратов. Например, предлагаемые нами подходы позволят конструировать инденопиперидиновые, циклопентапирролидиноновые, и др. каркасы, являющиеся основой препаратов для лечения висцерального лейшманиоза (Индотекан LMP400 и AM13-55), эффективных ингибиторов клеточной топоизомеразы I (MJ-III-65 и NSC 314622), а также противораковых препаратов (Индимитекан LMP776), и эффективных аналогов антибиотиков и антибактериальных препаратов нового поколения (Цефтазидим, и др.). Фундаментом предлагаемого проекта является всестороннее исследование реакций активированных циклопропанов, содержащих комбинации либо донорных и акцепторных заместителей в вицинальном положении, либо атомов галогена и фтора, с рядом гетероциклических и гетеродиеновых систем с атомами азота, а также пиразолинов, с целью создания полизамещенных функционализированных азотистых гетероциклов, включая инденопиперидиновые, пиразолидиновые, пирролидиновые, диазабициклооктановые, и другие гетероциклические каркасы.