КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 16-13-10475

НазваниеЦитотоксические клеточные комплексы железа(II): структурный дизайн, синтез, термодинамика и кинетика образования и разложения, химические превращения в биологических средах

РуководительВолошин Ян Зигфридович, Доктор химических наук

Организация финансирования, регион федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт элементоорганических соединений им. А.Н.Несмеянова Российской академии наук, г Москва

Период выполнения при поддержке РНФ 2019 г. - 2020 г. 

Конкурс Конкурс на продление сроков выполнения проектов, поддержанных грантами Российского научного фонда по приоритетному направлению деятельности Российского научного фонда «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами».

Область знания, основной код классификатора 03 - Химия и науки о материалах, 03-203 - Химия координационных соединений

Ключевые словаМакроциклы, клатрохелаты, клеточные комплексы, инкапсулирование, кинетика комплексообразование, термодинамика комплексообразования, реакции координированных лигандов, реакционная способность, лекарственная терапия, противоопухолевые препараты, цитотоксическая активность, активные формы кислорода

Код ГРНТИ31.17.29


СтатусУспешно завершен


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Наличие реакционноспособных и функционализирующих заместителей в молекулах клеточных комплексов металлов (клатрохелатов) позволяет проводить их дальнейшую модификацию, изменять физические свойства этих комплексов, оказывает влияние на их биоактивность. В ходе выполнения проекта, будут предложены подходы к получению новых клатрохелатных комплексов с реакционноспособными (в том числе, донорными) терминальными группами основанные как на новых синтетических стратегиях, так и на ранее разработанных методах синтеза клеточных комплексов металлов. Эти подходы базируются на темплатных реакциях с использованием ионов переходных металлов как матрицы, в сочетании с классическими реакциями органической и элементоорганической химии (в частности, нуклеофильном замещении, 1,3-диполярном циклоприсоединении, переметаллировании и т.д.). Для получения рядов клеточных комплексов железа(II) заданной структуры и функциональности с потенциальной цитотоксичностью будут использованы их реакционноспособные клатрохелатные предшественники. Макробициклические с терминальными тройными связями будут использованы для получения клеточных комплексов с функционализирующими клозо-боратными заместителями, а также остатками флуоресцентных красителей, что позволит изучать их биораспределение на клеточном уровне. Клатрохелаты переходных металлов этих типов будут получены впервые, синтетические подходы и методики их синтеза будут оригинальны. Будут также получены данные о взаимодействии с биологическими макромолекулами и биоактивности (в частности, о цитотоксичности) ряда полученных клеточных комплексов. Научный коллектив является мировым лидером в этой области координационной химии, о чем свидетельствует публикация двух монографий в издательстве Springer (2016 и 2017 г.г.) на английском языке и перевода одной из них на русский язык в 2018 г., а также большого числа статей и обзоров в высокорейтинговых российских и международных научных изданиях, что обеспечит успешную реализацию предлагаемого проекта. Актуальность предложенной темы подтверждает её соответствием направлениям Стратегии научно-технологического развития Российской Федерации, подраздел “Переход к персонализированной медицине, высокотехнологичному здравоохранению и технологиям здоровьесбережения, в том числе за счет рационального применения лекарственных препаратов (прежде всего антибактериальных)”, Перечню критических технологий Российской Федерации, подраздел “Биомедицинские и ветеринарные технологии жизнеобеспечения и защиты человека и животных” и Приоритетным направлениям развития науки, технологий и техники в РФ, подраздел “Индустрия наносистем”.

Ожидаемые результаты
1. Методы и методики синтеза моно-N2- и S2-, а также смешанных N2,S2-алициклических ди- и тетрахлороклатрохелатов железа(II) 2. Методы получения C3-несимметричных комплексов железа(II), содержащие флуоресцентные реберные заместители 3. Методики постадийного нуклеофильного замещения гексахлороклатрохелатных предшественников под действием пирокатехолатного дианиона 4. Методики нуклеофильного замещения и 1,3-диполярного циклоприсоединения полученных моно- и диреберно-функционализированных тетра- и дихлороклатрохелатов 5. Методы и методики дальнейшей модификации апикально-функционализированых ди- и тетрагалогеноклатрохелатов железа(II) с терминальными амино-группами 6. Методики синтеза макробициклических производных с терминальными азидными группами 7. Методики их дальнейшей функционализации с использованием реакций 1,3-диполярного циклоприсоединения 8. Новые методы и методики реберной функционализации комплексов – производных дихлорглиоксима – с использованием реакций нуклеофильного замещения и металл-промотируемого (катализируемого) кросс-сочетания. 9. Методы и методики синтеза реберно-функционализированных клатрохелатов путем 1,3-диполярного циклоприсоединения клозо-боратсодержащего азидов 10. Данные о составе и строении синтезированных комплексов, полученные с использованием результатов элементного анализа, ИК, ЭСП, MALDI-TOF и мультиядерных ЯМР-спектров, а также метода РСА. 11. Данные о взаимодействии с биологическими макромолекулами и биоактивности (в частности, о цитотоксичности) ряда полученных клеточных комплексов. 12. Публикация 8 статей в рейтинговых российских и международных научных изданиях.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2019 году
Гетеродифункционализированные клатрохелаты железа(II), молекулы которых содержат терминальные биорелевантные карбоксильные группы и реакционноспособные тройные CC связи, были получены с использованием двухстадийных синтетических процедур последовательным замещением их дихлороклатрохелатного предшественника под действием пара-карбоксифенилтиолят-аниона и 2-пропаргиламина. Полученные комплексы были охарактеризованы с использованием элементного анализа, HR-APPI и MALDI-TOF масс-спектрометрии, ЭСП, 1H, 13C{1H}, 11B и 19F ЯМР-спектров, а также РСА монокристаллов монохлороклатрохелата железа(II) с терминальной пропаргиламинной группой. Его FeN6-координационный полиэдр имеет искаженную тригонально-призматическую – тригонально-антипризматическую геометрию со средним углом искажения φ, равным приблизительно 26.1°. Расстояния Fe–N в этой монореберно-функционализированной молекуле изменяются в узком диапазоне от 1.883(3) до 1.901(4) Å, а высота h вышеуказанного полиэдра составляет 2.30 Å. С целью изучения биоактивных клатрохелатов железа(II) с терминальными карбоксильными заместителями методом флоресцентной спектроскопии биораспределения на клеточном уровне был осуществлен синтез карбоксилсодержащего клатрохелата железа(II) с терминальной флуоресцентной репортерной группой. В качестве клатрохелатного предшественника использовали макробициклические комплексы содержащие терминальную СС связь, которые легко претерпевают реакцию 1,3-диполярного циклоприсоединения с флуоресцентными репортерными молекулами, содержащими терминальную азидную группу. С использованием многостадийной синтетической процедуры был осуществлен синтез моно-N2- и S2-, а также смешанных N2-,S2-алициклических ди- и тетрахлороклатрохелатов железа(II). Было осуществлено постадийное нуклеофильное замещение реакционноспособных атомов хлора 4-карбоксифенилборатного гексахлороклатрохелата железа(II) под действием анионных производных этилендиамина и 1,2-дитиола как N2- и S2-бис-нуклеофилов позволило получить моно-N2- и S2-, а также смешанный N2,S2-алициклические ди- и тетрахлороклатрохелаты железа(II). Синтезированные клеточные комплексы железа(II) были охарактеризованы данными элементного анализа, HR-APPI, MALDI-TOF масс-спектрометрии, ИК, ЭСП, 1H и 13C{1H}, 11B и 19F ЯМР-спектров, а также методом РСА.

 

Публикации

1. Белов А.С., Волошин Я.З., Павлов А.А., Нелюбина Ю.В., Белова С.А., Зубавичус Я.В., Авдеева В.В., Ефимов Н.Н., Малинина Е.А., Жижин К.Ю., Кузнецов Н.Т. Solvent-induced encapsulation of cobalt(II) ion by a boron-capped tris-pyrazoloximate Inorganic Chemistry, - (год публикации - 2019)

2. Ковальска В., Вакаров С., Лосицкий М., Куперман М., Черненька Н., Топоривска Ю., Гуменюк-Контеска Э., Волошин Я., Варзацкий О., Мохир А. Dicarboxyl-terminated iron(II) clathrochelates as ICD-reporters for globular proteins RSC Advances, V. 9, P. 24218–24230 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1039/C9RA04102H

3. Ковальская В., Куперман М., Лосицкий М., Вакаров С., Потоцкий С., Ярмолюк С., Волошин Я., Варзацкий О., Гуменна-Контеска Э. Induced CD of iron(II) clathrochelates: sensing of the structural and conformational alterations of serum albumins Metallomics, V. 11, P. 338–348 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1039/C8MT00278A

4. Селин Р.А., Черненька Н.В., Черний В.Я., Мохир А., Вологжанина А.В., Белов А.С., Помадчик А.Л., Волошин Я.З. Chemical design of the heterodifunctionalized iron(II) clathrochelates with terminal biorelevant carboxyl group and reactive triple C≡C bond: Synthesis, structure, redox properties and their stability in various media Inorganica Chimica Acta, V. 496, P. 119047 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1016/j.ica.2019.119047

5. Волошин Я.З., Белая И.Г., Кремер Р. Инкапсулирование: синтез, реакционная способность и практическое использование инкапсулированных ионов и молекул Граница, Москва, 752 с. (год публикации - 2019)

6. Дудкин С.В., Савкина С.А., Белов А.С., Чуприн А.С., Волошин Я.З. Тетрапирроло-клатрохелаты: стратегии синтеза и пространственное строение 6 Международная конференция «Супрамолекулярные системы на поверхности раздела», посвящённая 150-летию открытия Периодической таблицы химических элементов Д.И. Менделеевым, Туапсе, с. 15 (год публикации - 2019)

7. Дудкин С.В., Савкина С.А., Белов А.С., Чуприн А.С., Волошин Я.З. Стратегии получения и структура гибридных тетрапирроло-сшитых клатрохелатов 3d-металлов 21 Менделеевский съезд по общей и прикладной химии, Санкт-Петербург, Т.1, с. 174 (год публикации - 2019)

8. Дудкин С.В., Савкина С.А., Белов А.С.. Чуприн А.С., Волошин Я.З. Tetrapyrrole-capped clathrochelates: synthesis, spatial and electronic structures 13th International Conference “Synthesis and applications of porphyrins and their analogues”, Кострома, p. 40 (год публикации - 2019)

9. Савкина С.А., Белов А.С., Дудкин С.В., Новиков В.В., Волошин Я.З. Получение апикально-функционализированных гетероциклических трис-оксиматных комплексов 3d-металлов, их строение и свойства 6 Международная конференция «Супрамолекулярные системы на поверхности раздела», посвящённая 150-летию открытия Периодической таблицы Д.И. Менделеевым, Туапсе, с.45 (год публикации - 2019)

10. Чуприн А.С., Дудкин С.В., Зелинский Г.Е., Волошин Я.З. Фталоцианинатоклатрохелаты железа(II) с терминальными донорными группами 6 Международная конференция «Супрамолекулярные системы на поверхности раздела», посвящённая 150-летию открытия Периодической таблицы химических элементов Д.И. Менделеевым, Туапсе, с. 78 (год публикации - 2019)


Аннотация результатов, полученных в 2020 году
Была изучена способность реберно-функционализированных моно-, ди- и гекса-карбоксиалкилсульфидных клатрохелатов железа(II) демонстрировать селективный сигнал кругового дихроизма (КД) при их связывании с глобулярными белками; взаимодействие таких клеточных комплексов с этими белками было также изучено с использованием методов калориметрии, тушения собственной флуоресценции белка, ESI-TOF масс-спектрометрии и компьютерного моделирования. Обнаружена способность глобулярных белков индуцировать сильный оптический отклик в спектрах КД при их супрамолекулярном связывании с вышеупомянутыми функционализированными клатрохелатами железа(II). В частности, изначально оптически-неактивные в спектрах КД клеточные комплексы продемонстрировали селективный КД-отклик на их ассоциацию с человеческим сывороточным альбумином (ЧСА) (моно- и дифункционализированные клатрохелаты), β-лактоглобулином (БЛГ) (дифункционализированный клеточный комплекс) и бычьим сывороточным альбумином (БСА) (гексакарбоксисульфидный клатрохелат железа(II)). Число их карбоксиалкилсульфидных заместителей на макробициклическую молекулу оказывает значительное влияние на интенсивность и селективность соответствующего ИКД-отклика, что связано с образованием супрамолекулярных ансамблей разной геометрии с различным расположением «гостевых» молекул клатрохелатов в них (как это следует из соответствующих спектров ИКД). Образование супрамолекулярных ассоциатов ЧСА с клатрохелатными «гостями» стехиометрии «хозяин – гость» как 1:1, так и 1:2 было подтверждено экспериментально методом ESI-TOF масс-спектрометрии. Результаты проведенного исследования тушения собственной флуоресценции вышеупомянутых альбуминов свидетельствуют о том, что гексакарбоксилсодержащий клатрохелат железа(II) связывается с макромолекулами БСА и ЧСА за счет их сайтов связывания, которые находятся в непосредственной близости от триптофановых остатков этих макромолекул. Эксперименты по флуоресцентному титрованию позволили установить образование соответствующих ассоциатов «клатрохелат – белок» стехиометрии 1:1 и определить величину константы связывания. Напротив, в случае макромолекулы БСА как «хозяина», данные такого флуоресцентного титрования свидетельствуют об образовании супрамолекулярных ассоциатов этого типа, включающих большее число «гостевых» клатрохелатных молекул. Методом ИТК определена константа устойчивости ассоциата 1:1 вышеупомянутого клатрохелатного «гостя» с макромолекулой БСА. Эта ассоциация является энтальпийно-управляемым процессом. По данным расчетов методом молекулярного докинга, как в случае БСА, так и в случае ЧСА, гексакарбоксилсодержащий клатрохелатный «гость» супрамолекулярно связывается с сайтом I и с «дополнительным сайтом» макромолекул этих альбуминов как «хозяев», что энергетически более выгодно, чем его связывание с их сайтом II. Методом КД было проведено изучение супрамолекулярного связывания трех конституционных изомеров (орто-, мета- и пара-замещенных) монометинмонокарбоксифенилсульфидного клатрохелата железа, изначально неактивного в спектрах КД, с глобулярными белками (БСА и ЧСА, лизоцим (ЛИЗ) и БЛГ). Обнаружено, что этот тип изомерии сильно влияет на индуцированную КД-активность клатрохелатов при их связывании с этими белками. Для установления влияния дополнительной реберной функционализации на КД-сенсорные свойства клеточных комплексов железа(II), были изучены ИКД-отклики клатрохелатных аналогов с биорелевантной морфолиновой группой. Установлено, что такая функционализация существенно влияет на их репортерные свойства по отношению к глобулярным белкам. Расчеты методом молекулярного докинга были выполнены для структурного моделирования ассоциатов типа «БСА – клатрохелат» и оценки энергии этих супрамолекулярных процессов. Флуоресцеинсодержащий клеточный комплекс железа(II) с терминальной флуорофорной группой был получен используя двухстадийную синтетическую процедуру, включающую 1,3-диполярное присоединение ацилированного флуоресцеинсодержащего азидного компонента к пропаргиламинсодержащему клатрохелатному предшественнику и последующий ферментативный гидролиз образовавшегося промежуточного ацилированного клатрохелата. Изученный методом РСА монокристалл вышеупомянутого пропаргиламинного макробициклического предшественника с реакционноспособной терминальной связью CC содержит клатрохелатные молекулы двух типов A и B. Инкапсулированный ион железа(II) всех этих макробициклических молекулах находится в центре своего FeN6-координационного полиэдра, геометрия которого промежуточной между тригональной призмой (ТП) и тригональной антипризмой (ТАП). Расстояния Fe – N в них изменяются от 1.8754(6) до 1.9286(4) Å, а высоты h их искаженных TП – TAП полиэдров близки между собой (2.30 и 2.31 Å); величины φ равны 25.3 и 26.6°, соответственно. В этом кристалле молекулы типов A и B образуют Н-связанные клатрохелатные тетрамеры за счет карбоксильных и амидных групп, соответственно. Измеренные ЭСП и спектры флуоресценции исходного флуоресцеин-содержащего азида и его клатрохелатного производного в 0.05 М водном буфере Трис – HCl с рН 7.9 и в метаноле позволили установить, что их молекулы обладают разными спектральными характеристиками в растворителях разной полярности и с различной H-донорной способностью. Их рассчитанные квантовые выходы составляют 0.8 и 0.07, соответственно, что свидетельствует об уменьшении квантового выхода флуоресценции в 11 раз при переходе от исходного флуоресцеин-содержащего красителя к его клатрохелатному производному. Этот эффект объяснен переносом энергии от терминальной флуоресцентной группы клатрохелатной молекулы к ее квазиароматическому π-сопряженному макробициклическому остову. Изучение кинетики гидролиза ацетильных групп исходного флуоресцеин-содержащего азида и его клатрохелатного производного в присутствии одного эквивалента БСА свидетельствует о переходе закрытой формы их флуоресцеинсодержащего фрагмента в его открытую таутомерную форму, что приводит к увеличению интенсивности его поглощения. Проведенные исследования анизотропии флуоресцентного излучения также свидетельствуют о супрамолекулярном связывании флуоресцеинсодержащего клатрохелата железа(II) с макромолекулой БСА, что приводит к значительному увеличению анизотропии такого типа. Полученные флуоресцентные клеточные комплексы представляются перспективными молекулярными метками для изучения субклеточной локализации клатрохелатов этого типа.

 

Публикации

1. Белов А.С., Волошин Я.З., Павлов А.С., Нелюбина Ю.В., Белова С.А., Зубавичус Я.В., Авдеева В.В., Ефимов Н.Н., Малинина Е.А., Жижин К.Ю., Кузнецов Н.Т. Solvent-induced encapsulation of cobalt(II) ion by a boron-capped tris-pyrazoloximate Inorganic Chemistry, 59, 5845−5853 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1021/acs.inorgchem.9b03335

2. Ковальская В., Вакаров С., Чорненькая Н., Гуменна-Контеска Э., Волошин Я Sensing of a protein’s structure using the induced circular dichroism spectra by the mono-carboxyphenylsulfide iron(II) clathrochelates as optical reporters Russian Journal of Inorganic Chemistry, 65, 10,1513-1521 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1134/S0036023620100137

3. Помадчик А.Л., Белов А.С., Лебедь Е.Г.,Волошин Я.З. Kinetics and thermodynamics of the template synthesis and of an acidic decomposition of the clathrochelate Iron(II) tris-cyclohexanedion-1,2-dioximate (nioximate) formed by a cross-linking with methylboronic acid Russian Journal of Inorganic Chemistry, 65, 10, 1503-1512 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1134/S0036023620100162

4. Волошин Я.З., Дудкин С.В. и др. Функциональные супрамолекулярные системы: дизайн и области применения Успехи химии, - (год публикации - 2021)

5. Белова С.А., Белов А.С., Дудкин С.В., Новиков В.В., Волошин Я.З. Синтез гибридных гетероциклических трис-оксиматных комплексов переходных металлов с фталоцианинатами РЗЭ Сборник тезисов докладов 8 Международной конференции по физической химии краун-соединений, порфиринов и фталоцианинов, Туапсе (Россия), С. 49 (год публикации - 2020)

6. Дудкин С.В., Волошин Я.З. Клатрохелаты в синтезе координационных капсул, супрамолекулярных ансамблей и полиядерных систем Сборник тезисов докладов 8 Международной конференции по физической химии краун-соединений, порфиринов и фталоцианинов, Туапсе (Россия), С. 10 (год публикации - 2020)

7. Лимарев И.П., Зелинский Г.Е., Вологжанина А.В., Ольшевская В.А., Макаренков А.В., Дороватовский П.В., Волошин Я.З. Синтез и структура полиэдрических гибридных карборанклатрохелатов железа(II) с функциональными биорелевантными заместителями Сборник тезисов докладов 8 Международной конференции по физической химии краун-соединений, порфиринов и фталоцианинов, Туапсе (Россия), С. 70 (год публикации - 2020)

8. - Создан магнит для молекулярных компьютеров и устройств хранения информации Министерство науки и высшего образования Российской Федерации, Дата публикации: 09.11.2020 14:33 (год публикации - )

9. - Магнит для молекулярных компьютеров и устройств хранения информации НОВОСТИ НАУКИ НА ПОРТАЛЕ «НАУЧНАЯ РОССИЯ», Дата публикации: 10 ноября 2020 г., 12:37 (год публикации - )


Возможность практического использования результатов
В ходе выполнения проекта был осуществлен синтез, установлена структура и изучена реакционная способность новых клатрохелатных предшественников с инкапсулированным ионом железа(II) для их последующего использования в молекулярной индустрии биологически-активных клеточных комплексов металлов, а также разработаны синтетические стратегии и эффективные синтетические процедуры для получения граммовых количеств клеточных комплексов металлов – потенциальных биологических эффекторов и молекулярных меток. Установлено, что некоторые из полученных клатрохелатов являются подходящими трехмерными молекулярными платформами для создания селективных оптических меток, способных распознавать специфические элементы поверхности белка, что, наряду с ранее обнаруженными клеточными комплексами – субмикромолярными транскрипционными ингибиторами систем биосинтеза нуклеиновых кислот, а также таковыми обладающими антифибриллогенными свойствами и цитотоксической активностью, делает соединения этого типа перспективными диагностическими и терапевтическими лекарственными кандидатами. Полученные результаты могут быть использованы для создания предшественников препаратов (т.н. «пролекарств») нового поколения для диагностики и терапии социально-значимых вирусных, онкологических и нейродегенеративных заболеваний; они соответствуют разделу «Н3 Переход к персонализированной медицине, высокотехнологичному здравоохранению и технологиям здоровьесбережения, в том числе за счет рационального применения лекарственных препаратов (прежде всего антибактериальных)» Стратегии НТР Российской Федерации.