КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 16-11-10098

НазваниеМатематическое моделирование и анализ индуцированных шумом явлений в биологических системах

РуководительРяшко Лев Борисович, Доктор физико-математических наук

Организация финансирования, регион федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Уральский федеральный университет имени первого Президента России Б.Н. Ельцина", Свердловская обл

Период выполнения при поддержке РНФ 2019 г. - 2020 г. 

Конкурс Конкурс на продление сроков выполнения проектов, поддержанных грантами Российского научного фонда по приоритетному направлению деятельности Российского научного фонда «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами».

Область знания, основной код классификатора 01 - Математика, информатика и науки о системах, 01-205 - Математические модели в науках о живом

Ключевые словапопуляционная динамика, нейродинамика, биохимические колебания, динамические модели восприятия, пространственно-временная самоорганизация, случайные возмущения, устойчивость, чувствительность, бифуркации, хаос, управление

Код ГРНТИ27.35.00


СтатусУспешно завершен


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Предлагаемый проект является продолжением Проекта 2016 года и направлен на дальнейшее решение фундаментальной научной проблемы математического моделирования биологических систем, связанной с изучением общих закономерностей их динамического поведения в условиях нелинейности связей и неизбежных случайных возмущений. В ходе выполнения Проекта 2016 были успешно решены все поставленные научные задачи. При этом в ходе проведения научных работ по выявлению основных механизмов и закономерностей стохастических явлений в широком круге биологических систем, возникли новые, не менее важные и значимые задачи, требующие сделать следующий шаг в изучении рассматриваемой научной проблемы. На решение этих вновь возникших задач и направлен предлагаемый Проект 2019. Как и Проект 2016, настоящий проект включает в себя основные направления по моделированию и стохастическому анализу нейронной динамики, динамики популяций, биохимической кинетики и пространственно-временной самоорганизации биосистем. Решение новых актуальных задач по этим направлениям, представляющим различные уровни организации живых систем, требует дальнейшего развития общей математической теории индуцированных шумами переходов и методов аппроксимации стохастических аттракторов нелинейных динамических систем в зонах, охватывающих как регулярные, так и хаотические режимы. Задачи, составляющие эти направления исследований, являются новыми, оригинальными и важными как с фундаментальной точки зрения, так и с точки зрения возможных приложений. Актуальность и значимость научной проблемы, на изучение которой направлены предыдущий и настоящий проекты, не только сохранилась, но и еще более возросла. Это подтверждается, например, созданием в мировых научных центрах эффективно работающих междисциплинарных групп, объединяющих биологов и математиков, ростом количества проводимых международных конференций и статей в высокоимпактных научных журналах по этой тематике. Актуальность задач предлагаемого Проекта 2019 обусловлена целым рядом факторов. Во-первых, присутствие случайных возмущений является неизбежным атрибутом функционирования любой живой системы. Во-вторых, взаимосвязь стохастичности и сильной нелинейности в биосистемах приводит к новым явлениям, не имеющим аналогов в исходных детерминированных моделях. В-третьих, в условиях, когда традиционным инструментом исследования стохастических процессов пока является затратное прямое численное моделирование, необходимой является разработка аналитических методов исследования. Наконец, рост актуальности планируемых в Проекте 2019 разработок универсальных методов изучения сложной стохастической динамики нелинейных систем объясняется очевидным усилением роли междисциплинарных исследований и пониманием общности законов, управляющих динамическими системами разной физической природы. Работы в рамках Проекта 2019 предусматривают взаимосогласованное проведение компьютерного моделирования возможных стохастических феноменов в исследуемых биологических системах, статистической обработки полученных результатов и их теоретического анализа на основе новых математических разработок авторов. Таким образом, научная новизна данного проекта состоит в сочетании универсальности разрабатываемого авторского численно-аналитического подхода, позволяющего проводить анализ широкого круга стохастических явлений, и креативности в обнаружении новых явлений в конкретных моделях, отражающих разнообразие и сложность поведения живых систем. Математической основой этого подхода, мотивированного исследованиями вероятностных явлений в биологических системах, является планируемое в Проекте 2019 дальнейшее развитие авторской техники функции стохастической чувствительности и метода доверительных областей для пространственных аттракторов в зонах сложных бифуркаций. Таким образом, Проект 2019 направлен на дальнейшее развитие Проекта 2016 в следующих направлениях математического моделирования живых систем. 1) Исследование на базе динамических моделей со сложными бифуркациями вероятностных механизмов ключевых феноменов нейронной активности, таких как стохастическая генерация и подавление возбуждения, индуцированные шумом переходы между режимами покоя, тонического спайкинга и берстинга, вызванная шумом трансформация порядок-хаос. 2) Исследование новых стохастических явлений в нелинейных системах взаимодействующих популяций с учетом различных биологических факторов, связанных с внутри- и межвидовыми отношениями, сочетанием нескольких иерархических уровней, наличием перетока в метапопуляциях. Разработка методов анализа и управления для стохастических популяционных систем вблизи опасных границ, переход через которые может привести к катастрофическим последствиям, например, к вымиранию видов или взрывному росту популяции раковых клеток. 3) Анализ кинетических особенностей стохастической генерации сложных осцилляционных регулярных и хаотических режимов в моделях ферментативных реакций с разными типами нелинейных связей субстрата и продукта. 4) Исследование вероятностных механизмов пространственно-временной самоорганизации в распределенных биологических системах с мультистабильностью. Параметрический анализ совместного влияния диффузии и шума на процессы генерации и подавления паттернов. 5) Разработка математической теории, численных алгоритмов и программных средств, обеспечивающих решение планируемых в проекте задач по моделированию и стохастическому анализу недавно обнаруженных сложных вероятностных процессов в живых системах.

Ожидаемые результаты
Круг задач, которые предполагается решить в рамках Проекта 2019, охватывает различные уровни живых систем, поэтому является достаточно масштабным. Ожидается, что в ходе выполнения работ будут получены новые научные результаты, представляющие интерес как для биологов, так и для математиков. 1) Моделирование и анализ стохастической динамики нейрона. Планируется продолжение исследований сложных режимов нейронной активности, связанных с сочетанием особых типов бифуркаций детерминированных аттракторов и воздействия случайных возмущений. Будет дано подробное параметрическое описание механизмов стохастической генерации и разрушения пачечных колебаний, расщепления торов-канардов, индуцированных шумами переходов между сосуществующими предельными циклами спайкового и бёрстового типа. Планируется исследование этих феноменов на базе трехмерной нейронной модели Хиндмарш-Роуз вблизи бифуркаций «катастрофы голубого неба», Неймарка-Сакера, Лукьянова-Шильникова, и четырехмерной нейронной модели Ходжкина-Хаксли в зоне возбудимости с использованием авторских разработок по стохастической чувствительности многомерных аттракторов. Здесь, в описании вариативности нейронной динамики наряду с непрерывными моделями планируется привлечь дискретные модели. На базе дискретных моделей Рулькова будет получено параметрическое описание стохастической динамики систем связанных нейронов в зависимости от структуры и параметров связи. 2) Популяционная динамика и экология. Для популяционной модели Базыкина «хищник-жертва», сочетающей стабилизирующие факторы внутривидовой конкуренции каждой популяции и дестабилизирующий фактор насыщения хищника, и воздействие случайных возмущений, будет дано параметрическое описание зон моно- и мультистабильности. Будет получено вероятностное описание возможных выходов случайных траекторий из бассейнов притяжения аттракторов через сепаратрисы, что позволит объяснить механизм стохастической возбудимости и генерации стохастических осцилляций смешанных мод. Для популяционной модели Лесли-Гувера с быстро-медленной динамикой, связанной с наличием циклов-канардов, будет получено параметрическое описание стохастической чувствительности равновесных и осцилляционных режимов в зонах канардовского взрыва, а также описан механизм возникновения соответствующих P- и D-бифуркаций. Для стохастической модели Хасселя, учитывающей зависимость динамики от численности предыдущих поколений и Олли эффект, будет дано параметрическое описание возможных бифуркаций, приводящих к качественному изменению режимов динамики. На основе анализа стохастической чувствительности аттракторов (регулярных и хаотических) будет детально изучен механизм индуцированного шумом вымирания. Для стохастического варианта популяционной модели Чаттопадхая (2016), учитывающей наряду с комплексом биологических факторов дополнительное деление на здоровых и инфицированных особей, будет дано описание возможных регулярных и хаотических аттракторов, зон моно- и бистабильности, различных сценариев индуцированного шумом вымирания. На базе техники анализа стохастической чувствительности многомерных аттракторов для этой модели будут описаны механизмы индуцированных шумами переходов между регулярными и хаотическими режимами. На базе двумерной модели Кузнецова (1994), учитывающей взаимодействие иммунных и опухолевых клеток, будет дано описание вероятностного механизма возможных стохастических переходов между режимами «спящей» и «активной» опухоли. Далее с помощью трехмерной модели, учитывающей наряду с взаимодействием иммунных и опухолевых клеток динамику здоровых клеток, будет получено параметрическое описание возможных стохастических режимов, выявлен характер зависимости их стохастической чувствительности от основных биологических факторов, определена роль шума в задаче подавления роста опухолевых клеток. Будут продолжены работы по анализу механизмов предотвращения экологических катастроф, вызванных случайными факторами. Для задачи управления дискретными популяционными моделями будет построен метод регулирования, позволяющий удержать систему в параметрической зоне устойчивого существования, охватывающей регулярные (равновесные, периодические, квазипериодические) и хаотические режимы, и обеспечить должную степень структурной стабилизации. Будут разработаны методы анализа и управления стохастическими популяционными системами вблизи опасных границ, переход через которые может привести к катастрофическим последствиям, например, к вымиранию видов или взрывному росту популяции раковых клеток. Для популяционных систем с притоком особей извне (иммиграция), или в более общей постановке – перетока особей в системах связанных популяций (метапопуляций) будет получено описание динамики в условиях случайных возмущений в зависимости от структуры связей и интенсивности перетока. 3) Моделирование и стохастический анализ индуцированных шумом явлений в колебательных биохимических реакциях. Планируется исследование кинетических особенностей ферментативных реакций в зоне циклов-канардов на базе модели Голдбетера, описывающей взаимную динамику субстрата и продукта. Будет получено параметрическое описание механизма индуцированного шумом расщепления канардовских осцилляций, приводящего к перемежаемости колебаний разных амплитуд и стохастической трансформации регулярной кинетики в хаотическую. Будут исследованы стохастические эффекты в модели, учитывающей в ферментативной кинетике нелинейную рециркуляцию продукта в субстрат. Будет дано параметрическое описание режимов моно- и бистабильности, соответствующих аттракторов, бассейнов их притяжения, проведен частотный и амплитудный анализ возможных стохастических осцилляций и дана классификация сценариев их качественных изменений. Планируются работы по анализу новых стохастических явлений в многомерных биохимических моделях, допускающих сложные пространственные регулярные и хаотические осцилляции. 4) Анализ пространственно-временной самоорганизации биосистем. Будет проведен параметрический анализ новых явлений пространственно-временной самоорганизации обнаруженных в Проекте 2016 в диффузионных моделях популяционной динамики, брюсселятора и гликолиза. Будет дано описание бифуркационных границ, разделяющих в области тьюринговской неустойчивости параметрические зоны с пространственными структурами разной модальности, их стохастической чувствительности, модальных и амплитудных характеристик. Буде дано параметрическое описание стохастических пространственных структур, генерируемых шумом в зоне тьюринговской устойчивости. Будет проведен параметрический анализ корпоративного влияния диффузии и случайных возмущений на автоколебательные режимы. 5) Для решения задач моделирования и стохастического анализа биологических систем Проекта 2019 планируется дальнейшее развитие математической теории индуцированных шумами переходов и методов аппроксимации стохастических аттракторов нелинейных динамических систем в зонах, охватывающих как регулярные, так и хаотические режимы. Будет разработана математической теории стохастической чувствительности большеамплитудных осцилляций, генерируемых шумом в зоне устойчивых равновесий возбудимых систем. Будет получено описание механизма стохастической генерации фантомного аттрактора в двух- и трехмерных нелинейных динамических моделях. Будут разработаны методы анализа механизмов совокупного взаимодействия нелинейных осцилляторов для класса дискретных моделей в регулярных и хаотических режимах с разной структурой и интенсивностью связей. 6) Будут разработаны численные алгоритмы и программные средства, обеспечивающие решение планируемых в проекте задач по моделированию и стохастическому анализу недавно обнаруженных сложных вероятностных процессов в живых системах. Ожидаемые результаты имеют принципиальную значимость для существенного продвижения в понимании тонких механизмов поведения живых систем в присутствии случайных возмущений. Эти результаты не только соответствуют, но в большей части опережают мировой уровень исследований. Свидетельством обоснованности этого соответствия является тот факт, что полученные в рамках Проекта 2016 года научные результаты были опубликованы в цикле статей в рецензируемых российских и зарубежных научных изданиях, индексируемых в базе данных Web of Science и Scopus, в частности, 14 статей - в таких входящих в первый квартиль (Q1) журналах как Physical Review E, Chaos: An Interdisciplinary Journal of Nonlinear Science, Communications in Nonlinear Science and Numerical Simulation, Chaos, Solitons & Fractals, International Journal of Bifurcation and Chaos, Journal of Physics A: Mathematical and Theoretical, Theoretical Population Biology, Mathematical Biosciences, Bulletin of Mathematical Biology. Отметим, что одна из публикаций Проекта 2016 (Noise-induced torus bursting in the stochastic Hindmarsh-Rose neuron model, Phys. Rev. E (2017) 96, 032212) вошла в «Топ-10 исследований российских ученых 2017 года по версии РНФ». Разрабатываемые в проекте подходы и конструктивные методы прогнозирования и управления сложными биологическими системами могут быть использованы при решении конкретных задач в экономике и социальной сфере, связанных с экологией и медициной. Междисциплинарный характер проводимых исследований и фундаментальность теоретических результатов позволит добиться существенного продвижения в разработке конструктивных методов анализа сложных нелинейных стохастических систем различной физической природы. Важным приложением результатов проекта является разработка учебных курсов для подготовки кадров высшей квалификации, способных решать стоящие перед обществом современные научно-технические и социальные задачи.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2019 году
1) Для трехмерной нейронной модели Хиндмарш-Роуз вблизи бифуркации «катастрофы голубого неба» исследованы механизмы стохастической генерации бёрстов в зоне тонического спайкинга с помощью техники функций стохастической чувствительности, метода доверительных областей в сечениях Пуанкаре и метрики Махаланобиса. Показано, что это явление сопровождается переходом к хаосу. 2) Для четырехмерной нейронной модели Ходжкина-Хаксли дано параметрическое описание явления стохастического возбуждения бёрстовых осцилляций в зоне устойчивых равновесий с привлечением геометрического аппарата многомерных доверительных областей и статистического анализа частотных характеристик. Для анализа этого явления разработан и применен конструктивный геометрический метод главных направлений, учитывающей взаимосвязь стохастической чувствительности аттрактора и его удаленность от сепаратных поверхностей. 3) Для дискретной одномерной нейронной модели Рулькова, задаваемой кусочно-гладким разрывным отображением, дано параметрическое описание результатов воздействия шума на аттракторы в зоне гомоклинических и кризисных бифуркаций. Выявлены вероятностные механизмы индуцированных шумами переходов как между сосуществующими аттракторами, так и между их отдельными частями. Для двумерного варианта этой модели исследованы стохастические переходы от покоя к спайкингу и от спайкинга к стохастическому бёрстингу. Получено параметрическое описание соответствующих изменений вероятностных распределений и статистик межспайковых и межбёрстовых интервалов. 4) Для системы двух связанных нейронов, моделируемых дискретным отображением Рулькова, получено параметрическое описание мультистабильности и возможных переходов между аттракторами в зависимости от структуры и параметров связи. Детально исследованы трансформации: равновесие – цикл, цикл – квазипериодический аттрактор, порядок-хаос, хаос-порядок. 5) Для популяционной модели Базыкина «хищник-жертва», сочетающей стабилизирующие факторы внутривидовой конкуренции каждой популяции и дестабилизирующий фактор насыщения хищника, исследован механизм стохастической возбудимости и генерации стохастических осцилляций смешанных мод. Проведено систематическое сравнение результатов воздействия аддитивных и параметрических шумов. 6) Для стохастического варианта экологической модели Хасселя с Олли эффектом, учитывающей зависимость динамики от численности предыдущих поколений, дано параметрическое описание возможных бифуркаций, приводящих к качественному изменению режимов динамики. Детально изучены механизмы индуцированных шумом экологических сдвигов, связанных с вымиранием и деформацией зон устойчивого существования. 7) Для трехмерной популяционной стохастической модели, учитывающей дополнительное деление на здоровых и инфицированных особей, получена классификация возможных сценариев индуцированного шумом вымирания. Найдены условия, при которых случайные возмущения, вызывая рост доли инфицированных жертв, приводят к вымиранию всей популяции жертв, а вслед за этим и популяции хищников. Показана возможность и другого варианта, когда вымирает хищник, а популяция жертв переходит в устойчивый режим осцилляций здоровых и инфицированных особей. 8) Для двумерной модели Кузнецова, учитывающей взаимодействие популяций иммунных и опухолевых клеток, получено параметрическое описание возможных стохастических переходов между режимами «спящей» и «активной» опухоли. Локализованы параметрические зоны, в которых случайные возмущения могут перевести популяцию опухолевых клеток из «активной» фазы в «спящую» и наоборот спровоцировать обратный переход из «спящей» фазы в «активную». 9) Для задачи управления популяциями с Олли эффектом и запаздыванием был построен конструктивный метод регулирования, позволяющий удерживать стохастически возмущаемую систему в параметрической зоне устойчивого существования, охватывающей регулярные (равновесные, периодические, квазипериодические) и хаотические режимы, и обеспечить должную степень структурной стабилизации, препятствующей вымиранию. Конструктивность результатов продемонстрирована на примере дискретной популяционной модели Рикера. 10) На базе модели Голдбетера, описывающей взаимную динамику субстрата и продукта, получено параметрическое описание кинетических особенностей и стохастических эффектов ферментативных реакций в зоне циклов-канардов. Вблизи этой зоны сверхвысокой чувствительности исследованы вероятностные механизмы расщепления канардовских осцилляций, генерации колебаний смешанных мод и стохастической трансформации регулярной кинетики в хаотическую. 11) Для расширенной модели Голдбетера, дополнительно учитывающей нелинейную рециркуляцию продукта в субстрат, проведен анализ индуцированных шумом переходов в зоне бистабильности. Получено параметрическое описание частотных и амплитудных характеристик кинетических режимов и сценариев их качественных изменений под действием случайных возмущений. 12) Для трехмерной системы Голдбетера, моделирующей кинетическое взаимодействие субстрата и двух продуктов, получено параметрическое описание бифуркаций и наблюдаемых как регулярных, так и хаотических аттракторов. Для зоны сосуществования цикла и хаотического аттрактора проведен компьютерный анализ индуцированных шумом переходов с регулярных аттракторов на хаотические. 13) Для распределенных моделей брюсселятора и Хиггинса в области тьюринговской неустойчивости найдены бифуркационные границы, разделяющие параметрические зоны с пространственными структурами разной модальности. Описаны типы многостадийных переходных процессов, наблюдаемых при генерации аттракторов-паттернов в зоне тьюринговской неустойчивости. Для стохастических вариантов распределенных моделей исследованы индуцированные шумами переходы между пространственными паттернами разной модальности. В условиях мультистабильности обнаружено явление доминирования стохастических паттернов определенной модальности. Описана зависимость модальных и амплитудных характеристик стохастических пространственных структур, генерируемых шумом в зоне тьюринговской устойчивости. 14) Построена математическая теория стохастической чувствительности большеамплитудных осцилляций, генерируемых шумом в зоне устойчивых равновесий возбудимых систем. Для канонической системы Адлера, моделирующей седло-узловую бифуркацию на инвариантной кривой, разработан метод построения доверительных областей, аппроксимирующих распределение случайных состояний в режиме стохастической генерации большеамплитудных осцилляций. 15) Дано параметрическое описание процесса формирования фантомного аттрактора, связанного с локализацией случайных состояний вдали от аттракторов исходной детерминированной системы. Установлена связь такого сдвига вероятностных распределений с важной особенностью фазового портрета - наличием так называемого транзиентного аттрактора. На примере двумерной биохимической модели Голдбетера объяснен механизм стохастической генерации фантомного аттрактора, приводящего к резкому изменению кинетического режима ферментативной реакции. 16) Для системы трех однонаправленно связанных отображений логистического типа, широко используемых в моделировании популяционной динамики, получено параметрическое описание переходов от периодических к квазипериодическим колебаниям и локализованы зоны жесткой седло-узловой бифуркации на инвариантной кривой и мягкой бифуркации Неймарка-Сакера. Обнаружено явление структурной стабилизации корпоративной динамики при увеличении интенсивности случайных возмущений, входящих в параметр связи. 17) Получено теоретическое описание разброса случайных состояний вокруг хаотических аттракторов двумерных дискретных стохастических систем с необратимым отображением. Разработан конструктивный метод аппроксимации дисперсии с привлечением асимптотики, основанной на технике стохастической чувствительности. Эффективность этой новой теории была продемонстрирована для хаотического аттрактора в модели Спротта. 18) В рамках проекта разработаны новые численные методы, алгоритмы и программы по решению задач, связанных с компьютерным моделированием и анализом новых стохастических явлений в нейронных, популяционных и биохимических системах.

 

Публикации

1. Абрамова Е.П., Рязанова Т.В. Динамические режимы стохастической модели «хищник-жертва» с учетом конкуренции и насыщения Компьютерные Исследования и Моделирование, №3, Т.11, С. 515–531 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.20537/2076-7633-2019-11-3-515-531

2. Абрамова Е.П., Рязанова Т.В. Анализ влияния параметрического шума на динамику двух взаимодействующих популяций Известия Института математики и информатики Удмуртского государственного университета, Том 53. С.3-14 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.20537/2226-3594-2019-53-01

3. Башкирцева И.А. Stochastic phenomena in the dynamical tumor-immune system AIP Conference Proceedings, Vol. 2172, p. 070003 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1063/1.5133539

4. Башкирцева И.А., Зайцева С.С. Order and chaotic regimes in 3D Goldbeter model AIP Conference Proceedings, Vol. 2164, p. 060002 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1063/1.5130804

5. Башкирцева И.А., Зайцева С.С. Анализ мультимодальных стохастических осцилляций в модели биохимической реакции Известия Института математики и информатики Удмуртского государственного университета, Том 53. С.27-35 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.20537/2226-3594-2019-53-03

6. Башкирцева И.А., Зайцева С.С., Писарчик А.Н. Noise-induced phantom attractor in the enzyme kinetics AIP Conference Proceedings, Vol. 2164, p. 060003 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1063/1.5130805

7. Башкирцева И.А., Панкратов А.А. Stochastic Higgins model with diffusion: pattern formation, multistability and noise-induced preference European Physical Journal B, Vol. 92, Issue 10, p. 238 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1140/epjb/e2019-100291-4

8. Башкирцева И.А., Писарчик А.Н. Variability and effect of noise on the corporate dynamics of coupled oscillators AIP Conference Proceedings, Vol. 2172, p. 070004 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1063/1.5133540

9. Башкирцева И.А., Ряшко Л.Б. Stochastic sensitivity analysis of chaotic attractors in 2D non-invertible maps Chaos, Solitons & Fractals, Vol.126, pp. 78-84 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1016/j.chaos.2019.05.032

10. Башкирцева И.А., Ряшко Л.Б. Preventing noise-induced ecological shifts: stochastic sensitivity analysis and control European Physical Journal B, Vol. 92, p. 248 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1140/epjb/e2019-100369-y

11. Башкирцева И.А., Ряшко Л.Б. Stochastic sensitivity and method of principal directions in the excitability analysis of Hodgkin-Huxley model International Journal of Bifurcation and Chaos, - (год публикации - 2019)

12. Башкирцева И.А., Ряшко Л.Б., Зайцева С.С. Analysis of nonlinear stochastic oscillations in the biochemical Goldbeter model Communications in Nonlinear Science and Numerical Simulation, Vol. 73, pp. 165-176 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1016/j.cnsns.2019.02.008

13. Башкирцева И.А., Ряшко Л.Б., Рязанова Т.В. Stochastic variability and transitions to chaos in a hierarchical three-species population model Chaos, Solitons & Fractals, Vol.119, pp. 276-283 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1016/j.chaos.2018.12.035

14. Башкирцева И.А., Ряшко Л.Б., Слепухина Е.С. Noise-induced spiking-bursting transition in the neuron model with the blue sky catastrophe Physical Review E, Vol. 99(6), p. 062408 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1103/PhysRevE.99.062408

15. Беляев А.В., Рязанова Т.В. Метод функции стохастической чувствительности в анализе кусочно-гладкой модели популяционной динамики Известия Института математики и информатики Удмуртского государственного университета, Том 53. С. 36-47 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.20537/2226-3594-2019-53-04

16. Беляев А.В., Рязанова Т.В. Stochastic sensitivity of attractors for a piecewise smooth neuron model Journal of Difference Equations and Applications, Vol. 25, 9-10, pp.1468-1487 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1080/10236198.2019.1678596

17. Колиниченко А.П., Ряшко Л.Б. Modality analysis of patterns in reaction-diffusion systems with random perturbations Известия Института математики и информатики Удмуртского государственного университета, Том 53. С. 73-82 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.20537/2226-3594-2019-53-07

18. Писарчик А.Н., Башкирцева И.А., Ряшко Л.Б. Noise-induced quasiperiodicity in a ring of unidirectionally-coupled nonidentical maps Physics Letters A, Vol. 383, Issue 14, pp. 1571-1577 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1016/j.physleta.2019.02.029

19. Ряшко Л.Б. Stochastic sensitivity analysis of noise-induced oscillations in Adler model AIP Conference Proceedings, Vol. 2172, p.100001 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1063/1.5133594

20. Ряшко Л.Б., Цветков И.Н., Спаньоло Б. Noise-induced shifts in the ecological model with delay AIP Conference Proceedings, Vol. 2172, p. 070002 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1063/1.5133538

21. Башкирцева И.А., Зайцева С.С. Анализ стохастической динамики двумерной модели Голдбетера (Analysis_Stoch_2DGold) -, №2019661992 (год публикации - )

22. Беляев А.В., Рязанова Т.В. Генерация стохастического спайкинга в нейронной модели Рулькова (Gen_Stoch_Spiking_1DRM) -, 2019661758 (год публикации - )


Аннотация результатов, полученных в 2020 году
1. Для трехмерной нейронной модели Хиндмарш-Роуз в параметрической зоне бифуркации Лукьянова-Шильникова проведено исследование индуцированных шумом переходов между сосуществующими предельными циклами спайкового и бёрстового типов. Для анализа этого явления был развит теоретический подход, основанный на технике функции стохастической чувствительности и доверительных областей для трехмерных осцилляционных аттракторов. Разработан метод оценки критической интенсивности шума, соответствующей началу стохастических переходов, использующий построенную аппроксимацию сепаратной поверхности, стохастическую чувствительность аттракторов и доверительные области. С помощью метрики Махаланобиса были выявлены вероятностные механизмы когерентного резонанса и переходов от порядка к хаосу. 2. Для трехмерной нейронной модели Хиндмарш-Роуз в параметрической зоне бифуркации Неймарка-Сакера проведен детальный параметрический анализ стохастического явления деформации тороидальных колебаний. Исследованы механизмы стохастической трансформации инвариантного тора канардового типа в тор большой амплитуды, что соответствует индуцированному шумом переходу от амплитудно-модулированной спайковой нейронной активности к бёрстовой. Исследованы явления когерентного резонанса в берстовых режимах и антикогерентного резонанса в спайковых режимах. 3. Для двумерной дискретной нейронной модели Рулькова с разрывным отображением получено параметрическое описание стохастической чувствительности равновесных, периодических и квазипериодических режимов. На основе результатов анализа геометрии доверительных областей, аппроксимирующих разброс случайных состояний, выявлены пространственно-вероятностные механизмы и проведен параметрический анализ вызываемых шумом переходов от покоя к спайкингу и от спайкинга к стохастическому берстингу. 4. Для системы двух связанных нейронных осцилляторов, моделируемых отображениями Рулькова, дано параметрическое описание стохастических бифуркаций и вероятностных механизмов переходов между синфазными и противофазными режимами регулярной и хаотической динамики. 5. Для системы трех связанных нейронов, моделируемых дискретными отображениями Рулькова, получено описание вариантов корпоративного поведения в зависимости от типов изолированных подсистем (равновесных, периодических, хаотических) и величины параметров связи. Проведен параметрический бифуркационный анализ, локализованы и описаны типы бифуркаций, определяющие качественные изменения режимов совместной динамики. Локализованы параметрические зоны, в которых регулярные изолированные нейроны, будучи связанными, демонстрируют хаотическое поведение и наоборот, связанные хаотические нейроны синхронизируются в корпоративный регулярный осцилляционный режим. 6. Для популяционной модели Лесли-Гувера с быстро-медленной динамикой проведен детальный бифуркационный анализ модели с локализацией зоны канардовского взрыва. Получено параметрическое описание стохастической чувствительности аттракторов системы и расположения доверительных областей в до- и надпороговых зонах фазовой плоскости. Получена оценка критической интенсивности шума, генерирующего большеамплитудные спайки в зоне устойчивых равновесий. Дано параметрическое описание зависимости статистик межспайковых интервалов от параметров системы. Для расширенного диффузионного варианта модели Лесли-Гувера с одной пространственной переменной найдена зона тьюринговской неустойчивости, получено описание генерируемых в этой зоне пространственных паттернов и соответствующих переходных процессов. 7. Для стохастического варианта экологической популяционной модели Хасселя с Олли эффектом, учитывающей зависимость динамики от численности предыдущих поколений, дано теоретическое описание и проведен параметрический анализ явления индуцированного шумом вымирания на основе анализа стохастической чувствительности аттракторов, метода доверительных областей и метрики Махаланобиса. 8. Для трехмерной популяционной модели Чаттопадхая, учитывающей дополнительное деление на здоровых и инфицированных особей, получено параметрическое описание индуцированных шумами переходов в зоне мультиритмичности. С помощью разрабатываемой в проекте техники стохастической чувствительности многомерных аттракторов и пространственных доверительных областей описан вероятностный механизм наблюдаемых стохастических явлений, сопровождающихся изменениями в характере осцилляций и переходами от порядка к хаосу. 9. Для трехмерной популяционной модели «хищник–две жертвы» с учетом конкуренции получено детальное описание вероятностных механизмов различных сценариев индуцированного шумом вымирания. 10. Для дискретного варианта популяционной модели Лотки – Вольтерра построена двупараметрическая карта режимов, описаны области существования регулярных и хаотических осцилляционных аттракторов вблизи бифуркаций удвоения периода, Неймарка–Сакера и кризиса и получено описание разброса случайных состояний вокруг сложных инвариантных кривых и хаотических аттракторов. 11. Для популяционной модели с эффектом Олли, флуктуациями среды и разными возрастными группами, исследованы индуцированные шумом трансформации: вызванное шумом вымирание, стохастическая регенерация и возбуждение случайных колебаний смешанных мод. 12. Для двумерной модели Кузнецова, описывающей совместную динамику популяций иммунных и опухолевых клеток, получено параметрическое описание стохастической чувствительности сосуществующих равновесных режимов и соответствующих доверительных областей. На основе этих теоретических результатов дано описание механизмов индуцированных шумами переходов в зоне гистерезиса, определен комплекс условий, при которых случайные возмущения вызывают резкий рост или, наоборот, подавляют популяцию опухолевых клеток. 13. Для трехмерной модели, учитывающей взаимодействие иммунных, опухолевых и здоровых клеток, построена бифуркационная диаграмма, и выявлены зоны регулярных и хаотических режимов, дано описание зон моно- и бистабильности, определены границы бассейнов притяжения. Для стохастического варианта модели исследован механизм индуцированных шумом переходов между аттракторами, отвечающими спящему и активному режиму опухоли. Определен комплекс биологических факторов, при которых шум начинает играть конструктивную роль в снижении численности популяции опухолевых клеток. 14. На базе концептуальной модели Нортона-Симона проведен сравнительный анализ программ лечения, сочетающих лучевую и химиотерапию, позволяющих переводить популяцию опухолевых клеток из «активного» режима в «спящий». 15. Для системы двух связанных популяций, моделируемых отображением Рикера, дано параметрическое описание вариантов совместной динамики в зависимости от интенсивности перетока и типа поведения изолированных популяций. Выявлены условия, при которых метапопуляция переходит в режимы динамики, принципиально отличные от режимов поведения изолированных популяций. Дано параметрическое описание переходов между порядком и хаосом, исследованы сценарии вызванных шумами трансформаций динамики. 16. Для двумерной биритмичной модели Голдбетера, учитывающей нелинейную рециркуляцию продукта в субстрат, получено параметрическое описание стохастической чувствительности сосуществующих аттракторов (равновесий и предельных циклов), их бассейнов притяжения и доверительных областей, исследован механизм стохастической генерации сложных биритмичных колебаний и явление «стохастического предпочтения» одного из двух сосуществующих циклов. Проведен параметрический анализ статистик спайковых осцилляций и антикогерентности. 17. Для трехмерной системы Голдбетера, моделирующей кинетику взаимодействия субстрата и двух продуктов биохимической реакции, выявлены механизмы стохастических переходов между пространственными циклами и хаотическими аттракторами. Разработаны алгоритмы конструктивного анализа, связанные с построением и исследованием доверительных эллипсоидов вокруг равновесий и доверительных торов вокруг циклов. С помощью этих алгоритмов проведен параметрический анализ индуцированного шумом возбуждения с переходами от порядка к хаосу и генерацией мультимодальных большеамплитудных осцилляций. 18. Разработана техника исследования переходных процессов формирования паттернов в распределенных моделях на основе коэффициентов модальности. Эта техника применена к анализу возможных сценариев самоорганизации в моделях популяционной динамики (хищник-жертва), брюсселятора и гликолиза. Для пространственных структур разной модальности получено параметрическое описание стохастической чувствительности и установлена ее связь с явлением стохастического предпочтения в условиях мультистабильности. Проведен параметрический анализ влияния диффузии на автоколебательные режимы, обнаружен и исследован эффект подавления автоколебаний диффузией. В распределенной популяционной модели хищник-жертва со стадным поведением исследован феномен стохастического резонанса при генерации паттернов. Для быстро-медленной популяционной модели Лесли-Гувера с диффузией исследована мультистабильность и транзиенты в процессах пространственно-временной самоорганизации. Разработан аналитический аппарат параметрического описания стохастической чувствительности неоднородных пространственных структур, позволяющий давать конструктивные оценки разброса случайных состояний. 19. Для возбудимых двумерных систем, у которых единственным аттрактором является устойчивое равновесие, построена теория стохастической чувствительности генерируемых шумами большеамплитудных осцилляций. Для трехмерной модели Лангфорда с тороидальными аттракторами получено описание механизма стохастической генерации фантомного аттрактора. Разработана теория стохастической генерации фантомных аттракторов в быстро - медленных системах с приложением к моделям гликолиза и нейронной активности. 20. В рамках направления по развитию теории стохастического анализа нелинейных динамических систем разработаны новые численные методы, программы и алгоритмы анализа индуцированных шумами переходов между пространственными аттракторами и генерации сложных мультимодальных стохастических осцилляций в трехмерных динамических моделях, используемых в проекте для исследования нейронной, популяционной и биохимической динамики. Ссылки на информационные ресурсы в сети Интернет: 1. "Математики создали модель взаимодействия иммунных и раковых клеток" https://urfu.ru/ru/news/32715/ 2. "Ученые создали математическую модель для прогнозирования развития рака" https://poisknews.ru/themes/medicine/uchenye-sozdali-matematicheskuyu-model-dlya-prognozirovaniya-razvitiya-raka/ 3. "Ученые выяснили, как шум влияет на нейронные сети" https://urfu.ru/ru/news/34280/

 

Публикации

1. Абрамова Е.П., Перевалова Т.В. Influence of random effects on the equilibrium modes in the population dynamics model Izvestiya instituta matematiki i informatiki-Udmurtskogo gosudarstvennogo universiteta, том 55, страницы 3-18 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.35634/2226-3594-2020-55-01

2. Башкирцева И.А., Валенти Д., Спаньоло Б. Analysis of ecological shifts in the two-age structured population model with Allee effect and environmental noise Mathematical Methods in the Applied Sciences, - (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1002/mma.6778

3. Башкирцева И.А., Насырова В.М., Ряшко Л.Б. Stochastic spiking-bursting excitability and transition to chaos in a discrete-time neuron model International Journal of Bifurcation and Chaos, том 30, выпуск 10, страница 2050153 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1142/S0218127420501539

4. Башкирцева И.А., Панкратов А.А. Suppression of self-oscillations and formation of heterogeneous structures by diffusion in the non-linear glycolytic model European Physical Journal: Special Topics, том 229, выпуск 19-20, страницы 3033-3042 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1140/epjst/e2020-000070-y

5. Башкирцева И.А., Перевалова Т.В., Ряшко Л.Б. Noise-induced shifts in dynamics of multi-rhythmic population SIP-model Chaos, Solitons and Fractals, том 136, страница 109816 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1016/j.chaos.2020.109816

6. Башкирцева И.А., Ряшко Л.Б. Analysis of noise-induced phenomena in the nonlinear tumor-immune system Physica A: Statistical Mechanics and its Applications, том 549, страница 123923 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1016/j.physa.2019.123923

7. Башкирцева И.А., Ряшко Л.Б. Stochastic bifurcations, chaos and phantom attractors in the Langford system with tori International Journal of Bifurcation and Chaos, - (год публикации - 2020)

8. Башкирцева И.А., Ряшко Л.Б. How additive noise forms and shifts phantom attractors in slow-fast systems Journal of Physics A: Mathematical and Theoretical, Journal of Physics A: Mathematical and Theoretical (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1088/1751-8121/aba76f

9. Башкирцева И.А., Ряшко Л.Б., Зайцева С.С. Stochastic sensitivity analysis of noise-induced transitions in a biochemical model with birhythmicity Journal of Physics A: Mathematical and Theoretical, том 53, выпуск 26, страница 265601 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1088/1751-8121/ab8ff3

10. Башкирцева И.А., Ряшко Л.Б., Зайцева С.С. Noise-induced variability of nonlinear dynamics in 3D model of enzyme kinetics Communications in Nonlinear Science and Numerical Simulation, том 90, страница 105351 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1016/j.cnsns.2020.105351

11. Башкирцева И.А., Ряшко Л.Б., Лопез А.Г., Сеоане Х.М., Санхуан М.А.Ф. Tumor stabilization induced by T-cell recruitment fluctuations International Journal of Bifurcation and Chaos, том 30, выпуск 12, статья 2050179 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1142/S0218127420501795

12. Башкирцева И.А., Ряшко Л.Б., Писарчик А.Н. Ring of map -based neural oscillators: From order to chaos and back Chaos, Solitons and Fractals, том 136, страница 109830 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1016/j.chaos.2020.109830

13. Башкирцева И.А., Ряшко Л.Б., Писарчик А.Н. Stochastic transitions between in-phase and anti-phase synchronization in coupled map-based neural oscillators Communications in Nonlinear Science and Numerical Simulation, - (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1016/j.cnsns.2020.105611

14. Башкирцева И.А., Ряшко Л.Б., Рязанова Т.В. Analysis of regular and chaotic dynamics in a stochastic eco-epidemiological model Chaos, Solitons and Fractals, том 131, страница 109549 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1016/j.chaos.2019.109549

15. Башкирцева И.А., Ряшко Л.Б., Спаньоло Б. Combined impacts of the Allee effect, delay and stochasticity: Persistence analysis Communications in Nonlinear Science and Numerical Simulation, том 84, страница 105148 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1016/j.cnsns.2019.105148

16. Башкицева И.А., Панкратов А.А., Слепухина Е.С., Цветков И.Н. Constructive role of noise and diffusion in an excitable slow-fast population system Philosophical Transactions of the Royal Society A: Mathematical, Physical and Engineering Sciences, том 378, выпуск 2171, номер статьи 0253 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1098/rsta.2019.0253

17. Беляев А.В., Перевалова Т.В. Stochastic sensitivity of quasiperiodic and chaotic attractors of the discrete Lotka–Volterra model Izvestiya instituta matematiki i informatiki-Udmurtskogo gosudarstvennogo universiteta, том 55, страницы 19-32 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.35634/2226-3594-2020-55-02

18. Беляев А.В., Ряшко Л.Б. Regular and Chaotic Regimes in the System of Coupled Populations AIP Conference Proceedings, - (год публикации - 2020)

19. Колиниченко А.П., Писарчик А.Н., Ряшко Л.Б. Stochastic phenomena in pattern formation for distributed nonlinear systems Philosophical Transactions of the Royal Society A: Mathematical, Physical and Engineering Sciences, том 378, выпуск 2171, страница 20190252 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1098/rsta.2019.0252

20. Колиниченко А.П., Ряшко Л.Б. Multistability and stochastic phenomena in the distributed Brusselator model Journal of Computational and Nonlinear Dynamics, том 15, выпуск 1, страница 011007 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1115/1.4045405

21. Колиниченко А.П., Ряшко Л.Б. Analysis of stochastic sensitivity of Turing patterns in distributed reaction–diffusion systems Izvestiya instituta matematiki i informatiki-Udmurtskogo gosudarstvennogo universiteta, Том 55, страницы 155–163 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.35634/2226-3594-2020-55-10

22. Колиниченко А.П., Ряшко Л.Б. Stochastic sensitivity analysis of stationary patterns in spatially extended systems Mathematical Methods in the Applied Sciences, - (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1002/mma.6892

23. Ряшко Л.Б., Башкирцева И.А., Санхуан М.А.Ф. Сontrol of treatment in tumor dynamical model with hysteresis IEEE Proceedings, номер статьи 9117782, страницы 132-135 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1109/USBEREIT48449.2020.9117782

24. Ряшко Л.Б., Слепухина Е.С. Noise-induced toroidal excitability in neuron model Communications in Nonlinear Science and Numerical Simulation, том 82, страница 105071 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1016/j.cnsns.2019.105071

25. Слепухина Е.С., Башкирцева И.А., Ряшко Л.Б. Stochastic spiking-bursting transitions in a neural birhythmic 3D model with the Lukyanov-Shilnikov bifurcation Chaos, Solitons and Fractals, том 138, страница 109958 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1016/j.chaos.2020.109958

26. Абрамова Е.П., Перевалова Т.В. Компьютерное моделирование стохастических эффектов в модели «хищник-жертва» (Comp_Model_Stoch_Phen_PPM) -, № 2020613980 (год публикации - )

27. Башкирцева И.А. Синтез стохастической чувствительности дискретных систем (Synthesis_Stoch_Sens) -, № 2020615062 (год публикации - )

28. Башкирцева И.А. Управление стохастическими системами при неполной информации (Stoch_Control_Incomplete) -, № 2020616063 (год публикации - )

29. Башкирцева И.А., Перевалова Т.В., Ряшко Л.Б. Стохастический анализ осцилляционных режимов трех взаимодействующих популяций (Stoch_Anal_OscReg_3InP) -, № 2020613828 (год публикации - )

30. Беляев А.В., Перевалова Т.В. Стохастическая динамика в одномерной дискретной популяционной модели (Stoch_Din_1DPM) -, № 2020613979 (год публикации - )

31. - Математики создали модель взаимодействия иммунных и раковых клеток Портал УрФУ, - (год публикации - )

32. - Ученые выяснили, как шум влияет на нейронные сети Портал УрФУ, - (год публикации - )


Возможность практического использования результатов
Полученные в проекте результаты имеют принципиальную значимость для существенного продвижения в понимании тонких механизмов поведения живых систем. Разработанные в проекте конструктивные методы прогнозирования и управления сложными биологическими системами в присутствии случайных факторов могут быть использованы при решении конкретных задач в экономике и социальной сфере, связанных с экологией и медициной. Важным приложением результатов проекта является их использование при разработке учебных курсов для подготовки кадров высшей квалификации, способных решать стоящие перед обществом современные научно-технические задачи.