КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 18-73-10131

НазваниеИзучение взаимодействий «гость-хозяин» и динамических процессов в соединениях включения на основании данных анализа скалярных полей, определяемых в реальном пространстве и применяемых для описания межатомного связывания.

РуководительАнаньев Иван Вячеславович, Кандидат химических наук

Организация финансирования, регион федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт элементоорганических соединений им. А.Н.Несмеянова Российской академии наук, г Москва

Период выполнения при поддержке РНФ 07.2018 - 06.2021 

Конкурс№30 - Конкурс 2018 года по мероприятию «Проведение исследований научными группами под руководством молодых ученых» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными.

Область знания, основной код классификатора 03 - Химия и науки о материалах, 03-502 - Кристаллохимия

Ключевые словасоединения включения, кристаллическая структура, взаимодействия "гость-хозяин", скалярные поля, электронная плотность, прочность взаимодействия, молекулярная динамика, рентгенодифракционные исследования, квантово-химические расчеты, модель "инвариомов"

Код ГРНТИ31.15.17


СтатусУспешно завершен


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Практическая значимость материалов на основе соединений включения не может быть переоценена. Во многом, разнообразие их приложений обусловлено спецификой т.н. взаимодействий «гость-хозяин», которая в сочетании с размером пор придает соединениям включения уникальные адсорбционные свойства. В этом смысле моделирование динамики молекул «гостя», позволяющее не только объяснять, но и предсказывать адсорбционные свойства соединений включения, является одним из наиболее важных направлений теоретических исследований в этой области. В настоящее время большинство методов моделирования динамики соединений включения, да и вообще, супрамолекулярных ассоциатов, основано на подходах молекулярной механики, сопоставляющих геометрии системы определенную энергию при помощи т.н. парных потенциалов. Эти методы, несмотря на их удобство и относительную простоту в использовании, имеют, по крайней мере, два существенных недостатка: физическая «нестрогость» и необходимость выбора типа силовых полей молекулярной механики для решения конкретной задачи. С другой стороны, физически обоснованные методы расчетов, такие как теория волновых функций или теория функционала плотности, чрезвычайно ресурсозатратны, что ограничивает их применимость для моделирования динамики атомных агрегатов. Эти недостатки имеющихся теоретических методов делают весьма актуальными исследования, направленные на разработку других подходов к описанию взаимодействий «гость-хозяин», позволяющих, с одной стороны, проводить экспрессное моделирование динамики молекул «гостя» в любых соединениях включения, а с другой, предсказывать свойства нанопористых материалов с приемлемой точностью. Настоящий проект направлен на создание общей, свободной от ограничений используемых в настоящее время методов, методологии моделирования взаимодействий «гость-хозяин» и динамики молекул «гостя» в соединениях включения. Путем решения задачи проекта, определяющим его новизну, являются систематические исследования взаимодействий «гость-хозяин» с использованием подходов анализа скалярных полей, определяемых в реальном пространстве и применяемых для описания межатомного связывания. Характеристики скалярных полей, как язык описания межатомных взаимодействий, являются физически обоснованной альтернативой подходам молекулярной и квантовой механики и могут быть получены как экспериментально, для монокристаллических тел, так и теоретически, в том числе с использованием моделей, не требующих проведения ресурсозатратных квантово-химических расчетов. В качестве подходов к описанию связывания «гость-хозяин» будут апробированы различные скалярные поля. В частности, выявление и определение свойств невалентных взаимодействий «гость-хозяин» будет проводиться на основании топологического анализа и анализа изоповерхностей распределения электронной плотности, электростатического потенциала, плотностей кинетической, потенциальной и полной электронной энергии, лапласиана электронной плотности, функций LOL, ELF и RDG. Основными объектами исследований выступят супрамолекулярные соединения металлоорганических каркасов и цеолитов. В то же время, методы описания взаимодействий «гость-хозяин» и изучения динамики молекул в кристалле также будут отрабатываться на кристаллах органических солей, кристаллах с Z'>1, сокристаллах и сольватоморфах. Важно отметить, что систематические исследования взаимодействий «гость-хозяин» с использованием методов анализа скалярных полей ранее не проводились, а анализ скалярных полей до сих пор фактически не рассматривался как метод описания взаимодействий, пригодный для целей моделирования динамики атомно-молекулярных или супрамолекулярных систем. Таким образом, поставленная задача проекта характеризуется значительным элементом научной новизны, поскольку направлена на поиск новых метрик (характеристик некоторых скалярных полей) для разработки переносимого подхода к моделированию динамики супрамолекулярных систем, в том числе и соединений включения, и их скринингу для получения корреляций «структура-свойство». Помимо отработки общей методологии изучения соединений включения, как и любых других супрамолекулярных систем, исследования по тематике данного проекта, очевидно, позволят решить целый ряд локальных задач, связанных с описанием конкретных систем.

Ожидаемые результаты
В рамках выполнения данного проекта будет предложен и апробирован принципиально новый подход к количественному описанию взаимодействий «гость-хозяин» и динамики молекул «гостя» в соединениях включения, что является необходимым этапом направленного дизайна соединений включения и материалов на их основе. Будут детально сопоставлены различные подходы, основывающиеся на анализе скалярных полей, их топологических характеристик и изоповерхностей, для создания методологии наиболее полного описания связывания «гость-хозяин» в целях разработки переносимого метода моделирования динамики молекулы «гостя». Будет получена информация о природе и прочности взаимодействий «гость-хозяин» в зависимости от типа молекулы «гостя» и изучена предпочтительность супрамолекулярной ассоциации как с точки зрения направленности и ковалентного вклада взаимодействия «гость-хозяин», так и с точки зрения положения молекулы «гостя» в порах «хозяина». Помимо отработки общей методологии изучения соединений включения, как и любых других супрамолекулярных систем, исследования в рамках данного проекта, очевидно, позволят решить целый ряд локальных задач, связанных с описанием конкретных систем – потенциальных материалов.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2018 году
Проведены прецизионные рентгенодифракционные исследования и квантово-химические расчеты ряда модельных соединений для получения информации об особенностях скалярных полей в областях слабых невалентных взаимодействий – моделей взаимодействий «гость-хозяин». Основное внимание уделено 1) оценке применимости аппарата теории «Атомы в Молекулах» для описания природы и оценки прочности слабых и ненаправленных взаимодействий, характерных для соединений включения в том числе с атомами металла, 2) апробированию упрощенных подходов к построению функции электронной плотности и скалярных полей на ее основе, таких как модель «промолекулы» и модель «инвариомов», для получения релевантной информации о связывании «гость-хозяин». Обнаружено, что изменение распределения электронной плотности в области координационной сферы металла ZnN2O2, являющейся моделью полиэдра многих металлоорганических каркасов, при образовании дополнительного взаимодействия и изменения полиэдра мало, а энергетически более стабильным полиэдром является тетраэдр. Предложено использовать аппарат анализа прочности взаимодействий в рамках теории «Атомы в Молекулах» для оценки стабильности образования специфических взаимодействий с металлом при адсорбции «гостя». При этом на модельных супрамолекулярных ассоциатах оценена применимость концепции критических точек функции электронной плотности и градиентных «связевых путей» для описания очень слабых и ненаправленных взаимодействий и предложен метод верификации графа связности через анализ кривизны и устойчивости функции электронной плотности. На комплексах малых молекул с клеточными структурами типа гидратных оболочек и додекаэдрана также показано, что устойчивость функции электронной плотности в области взаимодействий «гость-хозяин» в ходе колебательной динамики «гостя» определяет объем «гостя» и общую энергию системы. Разработан метод достаточно точных оценок энергии когезии и энергии кристаллической решетки, лишенный недостатков рассмотрения локальных характеристик в критических точках и основанный на анализе межмолекулярных поверхностей нулевого потока функции электронной плотности. При этом обнаружено, что подобный подход может давать удовлетворительные результаты даже при использовании модели «промолекулы» для построения функции электронной плотности. Также, показано, что упрощенные методы построения функции электронной плотности в достаточной мере чувствительны для определения прочности и описания характера взаимодействий «гость-хозяин» как в системах со значительным переносом заряда, так и без такового, и могут применяться для изучения взаимодействий «гость-хозяин» в различных органических системах, в том числе в солях и кристаллосольватах. Так, проведена оценка прочности взаимодействий «гость-хозяин» и ее влияние на объем/плотность компонент кристалла для кристаллосольватов, содержащих молекулу бензола, и ряда высокоэнергетических солей тетразолилфуроксана. На основании полученных данных опубликовано две статьи (одна из них в журнале уровня Q1), а одна принята к печати.

 

Публикации

1. Ананьев И.В. Альтернативные траектории электронной плотности для построения графа связности атомов в области ненаправленных взаимодействий Известия академии Наук, Серия химическая, - (год публикации - 2019)

2. Ларин А.А., Муравьев Н.В., Пивкина А.Н., Супоницкий К.Ю., Ананьев И.В., Хакимов Д.В., Ферштат Л.Л., Махова Н.Н. Assembly of Tetrazolylfuroxan Organic Salts: Multipurpose Green Energetic Materials withHigh Enthalpies of Formation and ExcellentDetonation Performance Chemistry: A European Journal, 25, 4225-4233 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1002/chem.201806378

3. Фарат О.К., Ананьев И.В., Варениченко С.А., Татарец А.Л., Марков В.И. Vilsmeier-Haack reagent: An efficient reagent for the transformation of substituted 1,3-naphthoxazines into xanthene-type dyes Tetrahedron, - (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1016/j.tet.2019.04.007


Аннотация результатов, полученных в 2019 году
В ходе второго этапа проекта исследования были направлены как на изучение методических/фундаментальных вопросов, связанных с оценкой прочности невалентных взаимодействий – основной движущей силой агрегации соединений включения, так и на решение конкретных практических задач, включающих, в том числе, определение устойчивости взаимодействий «гость-хозяин» в сокристаллах и выявление влияния природы атома металла на специфику невалентных взаимодействий с ним. Так, в ходе методических исследований усовершенствованы алгоритмы оценки прочности невалентных взаимодействий и энергии кристаллической решетки на основании анализа межатомной поверхности нулевого потока функции электронной плотности. В частности, на основании теоретических выкладок и квантово-химических расчетов ряда систем, в том числе и соединений включения, обнаружено, что учет кривизны поверхности требуется для описания обменного взаимодействия между топологическими атомами, причем соответствующий поверхностный интеграл электронной плотности определяет энергию такого взаимодействия только в равновесном состоянии системы. Имплементация соответствующих алгоритмов интегрирования, учитывающих кривизну поверхности, позволила не только повысить точность оценок энергии кристаллической решетки и изучить ряд фундаментальных вопросов, касающихся ненаправленных межатомных взаимодействий, но и получить детальную информацию для ряда конкретных кристаллических систем, в том числе в сокристаллах. Так, при изучении изолированных супрамолекулярных ассоциатов, стабилизированных межмолекулярными взаимодействиями различной природы, обнаружено, что энергия взаимодействия двух топологически связанных атомов из разных молекул не является определяющей для полной энергии межмолекулярного взаимодействия, если взаимодействие между этими атомами ненаправленно. При этом, полная энергия межмолекулярного взаимодействия определяется интегралом электронной плотности по поверхности нулевого потока между молекулами во всех случаях и не зависит от малой вариации графа связности для ненаправленных взаимодействий. Подобная вариация, тем не менее, может быть изучена и предсказана на основании детального анализа поверхности между атомами/молекулами и распределений по ней производных электронной плотности даже при наличии формально устойчивых критических точек (3,-1) функции электронной плотности. При помощи анализа большого массива критических точек, полученных в промолекулярном приближении для ряда сокристаллов и кристаллов нитроорганических соединений, выявлена взаимосвязь устойчивости графа связности атомов (устойчивости критических точек функции) и частоты встречаемости (плотности распределения критических точек) невалентных взаимодействий. Показано, что набор критических точек (3,-1) для атома/молекулы в различных окружениях может являться отражением некоторой усредненной поверхности. На основании этих данных обнаружено, что интегральное упрочнение взаимодействий в том числе и ковалентно-связанных функциональных групп приводит к уменьшению вариации объема рассматриваемого атомного агрегата, наблюдаемой в различных кристаллических окружениях. На основании исследований особенностей связывания в боргидридных комплексах металлов и в кристаллах, содержащих невалентные взаимодействия с атомами переходного металла, выявлена важная роль переноса заряда в стабилизации конформации комплексных соединений и, в частности, геометрии слабых взаимодействий с металлом с малой направленностью. Более того, показано, что даже прочные, направленные взаимодействия оказываются весьма лабильны под влиянием внешних условий в случаях, когда они образованы атомом металла.

 

Публикации

1. Антон В. Рожков, Даниил М. Иванов, Александр С. Новиков, Иван В. Ананьев, Надежда А. Бокач, Вадим Ю. Кукушкин Metal-involving halogen bond Ar–I⋯[dz2PtII] in a platinum acetylacetonate complex CrystEngComm, 22, 554-563 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1039/C9CE01568J

2. Жилин Е.С., Быстров Д.М., Ананьев И.В., Ферштат Л.Л., Махова Н.Н. Straightforward Access to the Nitric Oxide Donor Azasydnone Scaffold by Cascade Reactions of Amines WILEY-V C H VERLAG GMBH, POSTFACH 101161, 69451 WEINHEIM, GERMANY, 25, 63, 14284-14289 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1002/chem.201903526


Аннотация результатов, полученных в 2020 году
В отчетном периоде продолжены работы по изучению устойчивости и прочности невалентных взаимодействий в модельных изолированных ассоциатах и кристаллических системах, в том числе сокристаллах. Удалось продемонстрировать возможности анализа интегральных характеристик скалярных полей, таких как интегралы функции электронной плотности по межатомным поверхностям и усредненное множество критических точек этой функции, для подобных исследований. В разработанное программное обеспечение имплементирована возможность последовательного изучения невалентных взаимодействий в конкретном ассоциате и анализа устойчивости взаимодействий фрагментов этого ассоциата на основании обработки структур в Кембриджском Банке Структурных Данных. В частности, для ряда функциональных групп и сольватных молекул при помощи анализа Кембриджского Банка Структурных Данных и разработанного ранее алгоритма усреднения графа связности было обнаружено хорошее согласие плотности распределения критических точек и степени их вырождения. Тем не менее, обнаружено что результативность используемого алгоритма может ограничиваться качеством структурных данных и спецификой связывания (отсутствием у взаимодействий явных геометрических предпочтений). Важно отметить, что использование модели «инвариомов» для построения функции электронной плотности не дает качественно новых результатов применения алгоритма по сравнению с моделью промолекулы. По-видимому, это связано с недостаточным объемом выборки, содержащей только экспериментальные структурные данные. Также показано, что другие интегральные характеристики – поверхностные интегралы электронной плотности – могут быть использованы для оценки прочности невалентного межмолекулярного взаимодействия не только в терминах энергии связывания, но и в терминах разложения этой величины в рамках подхода Взаимодействующих Квантовых Атомов через аппроксимацию обменно-корреляционного вклада в энергию взаимодействия атомов в «связанных» состояниях. Разрабатываемое программное обеспечение было доработана для оценок этих вкладов из поверхностных интегралов. С учетом обнаруженной зависимости кривизны поверхности потенциальной энергии от вторых производных обменно-корреляционных вкладов, был сделан вывод о взаимосвязи характеристик межатомной поверхности как меры прочности топологического связывания с устойчивостью межатомного взаимодействия относительно сдвигов атомных ядер. Наконец, проведены исследования кристаллических структур ряда сокристаллов комплексов переходных металлов. Обнаружено, что невалентные взаимодействия в таких системах, в частности взаимодействия с атомами металлов, могут влиять как на структуру комплексного соединения (соотношение изомеров), так и на характер кристаллической упаковки. Интересно, что подобные взаимодействия могут не приводить к топологическому связыванию двух атомов, оставаясь при этом стабилизирующими с энергетической точки зрения. Это демонстрирует необходимость более детального рассмотрения интегральных характеристик, не описывающих только конкретное двухатомное связывание, при изучении невалентных взаимодействий в подобных системах.

 

Публикации

1. Ананьев И.В., Бокач Н.А., Кукушкин В.Ю. Structure-directing sulfur center dot center dot center dot metal noncovalent semicoordination bonding ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION B-STRUCTURAL SCIENCE CRYSTAL ENGINEERING AND MATERIALS, 76, 436-449 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1107/S2052520620005685

2. Анисимов А.А., Ананьев И.В. Interatomic exchange-correlation interaction energy from a measure ofquantum theory of atoms in moleculestopological bonding: A diatomic case Journal of Computational Chemistry, 41, 25, 2213-2222 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1002/jcc.26390

3. Чаплыгин Д.А., Ананьев И.В., Ферштат Л.Л., Махова Н.Н. Divergent Synthesis of Five-Membered Nitrogen Heterocycles via Cascade Reactions of 4-Arylfuroxans Synthesis, 52, 18, 2667-2678 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1055/s-0040-1707393


Возможность практического использования результатов
Результаты проекта могут быть использованы для создания новых и усовершенствования имеющихся методов изучения соединений включения и, шире, - любых фаз с невалентными взаимодействиями. В частности, можно предположить, что методики оценки прочности невалентных взаимодействий и их устойчивости/распространенности могут найти свое применение в кристаллохимических исследованиях, направленных на дизайн новых материалов с заданной структурой и свойствами.