КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 18-15-00106

НазваниеМеханобиология стволовых клеток: роль ионных каналов

РуководительНегуляев Юрий Алексеевич, Доктор биологических наук

Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт цитологии Российской академии наук, г Санкт-Петербург

Период выполнения при поддержке РНФ 2018 г. - 2020 г.  , продлен на 2021 - 2022. Карточка проекта продления (ссылка)

Конкурс№28 - Конкурс 2018 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами».

Область знания, основной код классификатора 05 - Фундаментальные исследования для медицины, 05-401 - Молекулярная и клеточная медицина

Ключевые словамеханобиология, стволовые клетки, ионные каналы, клеточная мембрана, механотрансдукция, кальциевая сигнализация, эндометриальные мезенхимные стволовые клетки, клеточная подвижность, ENaC, TRP, Piezo, цитоскелет, внеклеточный матрикс

Код ГРНТИ34.19.19


СтатусУспешно завершен


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
В последние десятилетия исследования на клеточном и молекулярном уровнях постепенно сформировали новое исследовательское поле - "механобиология", которое становится важной и перспективной дисциплиной. Механические свойства клеточного окружения являются мощными модуляторами поведения клеток. Например, локальные физические параметры, такие как упругость внеклеточной матрицы и нанотопология, вызывают клеточный ответ в том числе и в стволовых клеточных линиях. Механическое воздействие на основные клеточные программы, такие как пролиферация, дифференцировка, старение и апоптоз, особенно важно для трансплантационной терапии стволовыми клетками, так как стволовые клетки сталкиваются с различными механическими сигналами во время миграции и приживления. Кроме того, перед трансплантацией стволовые клетки выращивают в условиях in vitro, и механические свойства условий культивирования могут повлиять на их поведение. В связи с этим понимание того, каким образом стволовые клетки могут воспринимать механические сигналы и как эта обработка может привести к последующим сигнальным событиям и в конечном счете к окончательному выбору развития, необходимо для точного контроля за судьбой трансплантированных клеток. Хорошо известно, что все типы клеток способны обнаруживать и реагировать на внеклеточные и внутриклеточные химические сигналы. Недавние исследования дают основания полагать, что многие клетки обладают также возможностью детектировать механические сигналы из своего микроокружения, такие как жесткость или эластичность внеклеточного матрикса или внеклеточных субстратов, в результате которой могут происходить глубокие преобразования их морфологии и функции. Стволовые клетки делают специфический выбор развития в том или ином направлении, основанный на сочетании внутренних и внешних сигналов, включая в том числе механические стимулы из окружающей среды. В то же время хорошо известно, что ионные каналы прямо или косвенно участвуют в передаче всех форм физического раздражения, включая звук, свет, температуру, механическую силу и даже силы тяжести, во внутриклеточные сигнальные пути. Опубликованные результаты экспериментов, в том числе выполненных в нашей лаборатории, показали, что различные ионные каналы могут присутствовать в стволовых клетках, однако характер их активности и экспрессии не всегда понятны. В предложенном проекте мы предполагаем ответить на вопрос о том, в какой степени ионные каналы, обнаруженные в стволовых клетках, могут быть вовлечены в передачу механических сигналов клеточного окружения к внутриклеточным сигнальным путям, связанным со специализацией стволовых клеточных линий. Такая информация крайне важна для разработок в области заместительной, восстановительной клеточной терапии и регенеративной медицины.

Ожидаемые результаты
В результате проделанной работы будет выявлен профиль ионных каналов в эмбриональных и мезенхимных стволовых клетках человека, вовлеченных в детектирование механических стимулов. Будет достигнуто молекулярное и механистическое понимание того, каким образом стволовые клетки могут анализировать механические сигналы, в том числе с использованием ионных каналов, и как этот анализ может привести к последующим сигнальным событиям, а в конечном счете к окончательному выбору развития клеток. Мы ожидаем, что результаты будут приоритетными, так как практически нет опубликованных работ по систематическому анализу участия ионных каналов в реакции стволовых клеток на механические воздействия окружающей среды. Мы полагаем, что научная и общественная значимость планируемой работы заключается в восполнении пробела в изучении стволовых клеток человека, роль которых в заместительной и восстановительной клеточной терапии имеет широкие перспективы в лечении многих заболеваний и травм. В случае поддержки нашей работы, полученные результаты будут опубликованы в международных журналах, индексируемых в базе данных «Сеть науки» (Web of Science), Scopus и в отечественных журналах, индексируемых в базе данных «РИНЦ».


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2018 году
В отчетном году в качестве основных экспериментальных моделей использованы эндометриальные мезенхимные стволовые клетки (эМСК) человека и мезенхимные стволовые клетки (МСК), полученные из периренального жира крыс. С помощью метода патч-кламп изучена активность ионных каналов в составе механочувствительных сигнальных комплексов в мембране эМСК человека. С использованием методов иммуноцитохимии и проточной цитометрии выявлена связь функциональной экспрессии кальций-зависимых калиевых BK-каналов в мембране эМСК с фазами клеточного цикла. Обнаружено, что уровень экспрессии ВК каналов минимален в G2M-фазе, что соответствует ожидаемым изменениям калиевой проницаемости и мембранного потенциала. Оказалось, однако, что селективные ингибиторы BK-каналов ибериотоксин и харибдотоксин не влияют на динамику прохождения цикла эМСК. С помощью методов ПЦР и иммунофлуоресценции впервые показана экспрессия каналов Piezo1 в эМСК. Экспрессия Piezo2 показана только на уровне мРНК. Совокупность полученных данных позволяет считать Piezo1/2 наиболее вероятными молекулярными коррелятами стретч-активируемых катионных каналов в мембране стволовых клеток. Локальный вход кальция через исследуемые каналы обеспечивает сопряженную активацию колокализованных калиевых ВК каналов в эМСК. В экспериментах по измерению уровня внутриклеточного кальция впервые показано, что селективный активатор каналов Piezo1 Yoda1 вызывает вход кальция, включающий, по крайней мере, две фазы – быструю и медленную. Быстрая фаза может быть обусловлена синергетическим действием Yoda1 и протока (shear stress) при смене раствора; медленная фаза отражает вход кальция при действии Yoda1. Таким образом, продемонстрировано, что один из основных механосенсорных путей в эМСК формируется при участии белка Piezo1. Разработаны и апробированы оптимальные подходы к прижизненному наблюдению и количественной оценке подвижности и миграции стволовых клеток. На модели «зарастания раны» (wound healing assay) с использованием цейтраферной сьемки впервые показано снижение скорости миграции эМСК человека после экстракции мембранного холестерина. Проанализированы возможности ингибиторного анализа роли ионных каналов в подвижности мезенхимных стволовых клеток (МСК) различного происхождения. Специального внимания заслуживает поиск путей повышения миграционного потенциала МСК с помощью эндогенных биологически активных веществ. В ходе работы по проекту были выделены и охарактеризованы МСК из периренального жира крысы. Мультипотентный статус полученных МСК был подтвержден при индукции адипогенной и остеогенной дифференцировки клеток in vitro. Обнаружено, что добавление в питательную среду предсердного натрийуретического пептида (ПНП, 10 нМ) существенно ускоряло зарастание экспериментальной раны. Результаты свидетельствуют, что ПНП повышает подвижность исследуемых МСК и таким образом может усиливать их миграционный потенциал. Повышение клеточной подвижности при действии ПНП сопровождалось частичной разборкой (disassembly) актинового цитоскелета. В рамках задач по идентификации нативных каналов, связанных с механотрансдукцией, проведены эксперименты по выявлению электровозбудимых натриевых каналов в эМСК человека. В ПЦР экспериментах обнаружена экспрессия генов SCN1B, SCN3B и SCN4B, кодирующих ß1-, ß3- и ß4-субъединицы электровозбудимых натриевых каналов. Методом патч-кламп в клетках эМСК зарегистрированы тетродотоксин-чувствительные ионные токи, обладающие кинетикой, характерной для электровозбудимых натриевых каналов. Полученные приоритетные данные дают стимул к развитию исследований, направленных на выявление неканонической роли электроуправляемых натриевых каналов в том числе, участия в передаче механических сигналов в стволовых клетках. Сообщается, что АТФ-индуцированная пуринергическая передача сигналов влияет на пролиферацию стволовых клеток, миграцию и дифференцировку в условиях in vitro и in vivo. В эМСК человека нами впервые показана, на уровне мРНК, экспрессия генов, кодирующих пуринэргические рецепторы Р2Х7 и Р2Х4 типа. С использованием кальций-связывающего зонда FURA-2АM показан вход кальция в эМСК при действии АТФ. Кроме того, вход Са2+ в эМСК зарегистрирован при активации рецептора Р2Х7. Полученные данные вкупе с литературными источниками обусловили наш интерес к дальнейшему поисковому исследованию в рамках проекта функциональной роли пуриноцепторов в мезенхимных стволовых клетках человека на модели эМСК.

 

Публикации

1. Ревитцер А.В., Негуляев Ю.А. Влияние предсердного натрийуретического пептида на миграцию мезенхимных стволовых клеток, выделенных из периренального жира крысы. ЦИТОЛОГИЯ, №12, Том 60, стр. 983 – 986 (год публикации - 2018) https://doi.org/10.7868/S0041377118120044

2. Ревитцер А.В., Негуляев Ю.А. Характеристика актинового цитоскелета стволовых клеток крысы, выделенных из периренального жира, с помощью фрактальной размерности. Неделя науки СПбПУ: материалы научной конференции с международным участием. – СПб.: ПОЛИТЕХ-ПРЕСС, 2018, стр. 173 – 175 (год публикации - 2018)


Аннотация результатов, полученных в 2019 году
1. В соответствии с планом работы в отчетном году был расширен круг экспериментальных объектов: в исследованиях использованы мезенхимные стволовые клетки различного происхождения, а также культивируемые клетки линии К562, имеющие свойства мультипотентного предшественника клеток крови. Одним из основных объектов изучения механозависимых катионных каналов и их комплексов оставались мезенхимные стволовые клетки эндометрия человека (эМСК). Проведены сравнительные исследования механотрансдукции и клеточной подвижности на культурах эМСК, полученных от здоровых доноров и от пациентов с аденомиозом. Новым объектом исследования были мезенхимные стволовые клетки линии FetMSC, полученные из костного мозга 5-6 недельного эмбриона человека (Коллекция клеточных культур ИНЦ РАН). 2. С использованием метода патч-кламп исследовали механизмы, обеспечивающие согласованное функционирование ионных каналов в составе механочувствительных сигнальных комплексов, выявленных нами ранее в плазматической мембране эМСК. В опытах на клетках, инкубированных с акцептором стеролов метил-бета-циклодекстрином, проверена гипотеза относительно роли мембранного холестерина и рафтов в работе механозависимых кластеров каналов в эМСК. 3. В клетках линии К562 выявлена сопряженная механозависимая активация кальций-проводящих каналов и кальций-зависимых каналов. Впервые показано, что поступление кальция из внеклеточной среды в цитоплазму через механо-управляемые каналы в мембране клеток К562 активирует колокализованные с ними калиевые каналы малой проводимости (SK), которые не имеют собственной механочувствительности. Показано сохранение функционального сопряжения каналов в процессе механозависимой активации после инкубации клеток с деструктором актинового цитоскелета цитохалазином Д. Результаты позволяют полагать, что в плазматической мембране клеток К562 функционируют кластеры, включающие калиевые SK-каналы и белки Piezo1/2, формирующие стретч-активируемые катионные каналы (Чубинский-Надеждин и др., 2019, Цитология 61(7): 580-588). 4. С использованием селективного химического активатора катионных каналов Piezo1 продемонстрировано их участие в механозависимом кальциевом ответе и подвижности эМСК. В опытах, базирующихся на использовании методов прижизненной микроскопии, впервые показано, что повышение активности каналов Piezo1 приводит к снижению скорости миграции эМСК. (Chubinskiy-Nadezhdin et al, 2019, Eur.Biophys.J. 48: S98). 5. В ходе проведенного сравнительного исследования установлено, что при аденомиозе эМСК обладают повышенным миграционным потенциалом по сравнению с клеточными линиями, полученными от здоровых доноров. Однако при переводе клеток на среду без сыворотки клетки от донора с аденомиозом мигрировали медленнее нормальных клеток. Полученные данные важны в нескольких аспектах, в частности, позволяют использовать культуры эМСК как модель для выяснения механизмов, лежащих в основе изменений клеточной механики и подвижности при различных патологиях, включая аденомиоз (Сударикова и др., 2019, Цитология 61(12): 964-970). 6. На мезенхимных стволовых клетках линии FetMSC показаны новые возможности направленного изменения клеточной механики, подвижности и структур цитоскелета при действии эндогенного модулятора - предсердного натрийуретического пептида (ПНП). В клетках FetMSC обнаружена экспрессия рецепторов ПНП (тип А и С). На модели «зарастания раны» (wound healing assay) оценены изменения миграционных характеристик клеток при действии ПНП в широком диапазоне концентраций; с помощью окрашивания родамин-фаллоидином визуализированы сопутствующие изменения актиновых структур. Обнаруженные эффекты могут быть связаны с ранее неизвестными функциями каналов семейства ENaC в стволовых клетках (Ревитцер и др., 2019, Гены и Клетки 11(3):46; Ревитцер и др., 2019, Цитология 10(61):817-822). 7. Недавно возникли предположения о том, что механический стимул и активация каналов Piezo в мезенхимных стволовых клетках может индуцировать выброс АТФ во внеклеточную среду (ATP release). В наших исследованиях получены новые данные о влиянии внеклеточного АТФ на миграционную способность и пролиферативную активность эМСК, показана функциональная экспрессия рецептора P2X7 и проанализирована степень его участия в обнаруженных эффектах (статья на рецензии, J.Cell.Mol.Med). 8. Выявлена и изучена связь активности механочувствительных кальций-проницаемых каналов Piezo и калиевых ВК-каналов с пролиферацией и клеточным циклом эМСК (Chubinskiy-Nadezhdin et al, 2019, Acta Naturae, Спецвыпуск т.1,с.113). Полученные данные позволяют рассматривать динамику функциональной экспрессии BK-каналов на плазматической мембране эМСК как новый маркер клеточной пролиферации. BK-каналы, входящие в состав механозависимых сигнальных кластеров, могут оказывать существенное влияние на сигнальные процессы в эМСК путем модуляции мембранного потенциала, который динамически меняется в ходе клеточного цикла. Однако введение в среду селективных поровых блокаторов BK-каналов не влияло на скорость пролиферации и распределение эМСК по фазам цикла. Полученные данные указывают, что BK-опосредованный транспорт калия не является критическим регулятором прохождения клеток по клеточному циклу (Chubinskiy-Nadezhdin et al, 2019, Scientific Reports 9: 4595).

 

Публикации

1. Ревитцер А.В., Чубинский-Надеждин В. И., Негуляев Ю. А. Влияние предсердного натрийуретического пептида на реорганизацию актинового цитоскелета и миграцию мезенхимных стволовых клеток человека Цитология, 61 (10) : 817 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1134/S0041377119100079

2. Сударикова А. В., Шилина М. А., Чубинский-Надеждин В. И., Гринчук Т. М., Морачевская Е. А., Негуляев Ю. А. Повышенная миграционная способность эндометриальных мезенхимных стволовых клеток при аденомиозе Цитология, 61(12): 964-970 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1134/S0041377119120058

3. Чубинский-Надеждин В. И., Негуляев Ю. А., Морачевская Е. А. Функциональное сопряжение ионных каналов в процессе механозависимой активации в мембране клеток К562. Цитология, 61(7): 580-588 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1134/S0041377119070113

4. Чубинский-Надеждин В.И., Сударикова А.В., Шилина М.А., Васильева В.Ю., Гринчук Т. М., Люблинская О. Г., Никольский Н.Н., Негуляев Ю. А. Cell Cycle-Dependent Expression of Bk Channels in Human Mesenchymal Endometrial Stem Cells Scientific Reports, 9:4595 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1038/s41598-019-41096-2

5. Ревитцер А. В., Чубинский-Надеждин В. И., Негуляев Ю. А. Реорганизация фибриллярного актина в мезенхимных стволовых клетках после культивирования в присутствии предсердного натрийуретического пептида Гены и Клетки, 11(3):46 (год публикации - 2019)

6. Чубинский-Надеждин В., Васильева И., Васильева В., Сударикова А, Шуйский Л., Шилина М., Негуляев Ю. Piezo proteins as molecular correlates of mechanosensitive ion channels in human endometrial-derived mesenchymal stem cells EUROPEAN BIOPHYSICS JOURNAL WITH BIOPHYSICS LETTERS, 48:S98 (год публикации - 2019)


Аннотация результатов, полученных в 2020 году
1. В результате выполнения проекта установлено, что внеклеточный АТФ подавляет пролиферативный и миграционный потенциал мезенхимных стволовых клеток эндометрия человека (эМСК); эффект не связан с активацией P2X7R. Известно, что внутриклеточный АТФ попадает во внеклеточную среду в ответ на воспалительный стимул или после гибели клеток. Внеклеточный АТФ действует как воспалительный медиатор и через активацию пуринергических рецепторов (P2X и P2Y) влияет на миграцию, пролиферацию и дифференцировку различных типов клеток, в том числе, стволовых клеток человека. эМСК обладают высокой пластичностью, низкой иммуногенностью и способностью к направленной миграции, что позволяют считать их важным инструментом регенеративной медицины. В работе исследовали роль внеклеточного АТФ в пролиферации и миграции эМСК. Обнаружено, что АТФ-индуцированная активация пуринергических рецепторов подавляет миграционную способность эМСК. В ходе поиска мишени действия АТФ в эМСК была обнаружена экспрессия одного из наиболее распространенных пуринорецепторов, P2X7R. Тем не менее, действие специфического агониста P2X7R, 2′,3′-O-(4-benzoylbenzoyl)-ATP (BzATP) не влияло на скорость миграции клеток. Присутствие в среде ингибитора рецептора P2X7, реагента AZ10606120, также не предотвращало индуцированное АТФ подавление миграции эМСК, что доказывало непричастность рецептора P2X7 к регуляции подвижности этих клеток. Было обнаружено, что, не являясь токсичным для клеток, внеклеточный АТФ индуцировал остановку клеточного цикла, подавляя пролиферацию, миграционный и соответственно регенеративный потенциал стволовых клеток эндометрия (Semenova et al., 2020. J. Cell. Mol. Med.). 2. Получены новые данные о сопряженной механозависимой активации Са-переносящих и Са-управляемых катионных каналов в мезенхимных стволовых клетках человека. C использованием метода патч-кламп в режиме регистрации одиночных каналов от участка клеточной мембраны (cell-attached) показано сохранение функционального сопряжения механочувствительных каналов (МЧК/Piezo) и кальций-активируемых калиевых каналов высокой проводимости (BK) после разрушения богатых холестерином липидных микродоменов (рафтов). В ходе работы были выявлены ограничения традиционного подхода для оценки целостности рафтов в плазматической мембране путем визуализации маркерного ганглиозида GM1. Впервые показана зависимость содержания кластеризованных молекул GM1 в мембране эМСК от фазы клеточного цикла. Результаты свидетельствуют о функциональной связи GM1-содержащих рафтов с клеточным циклом эМСК, а также о вероятных изменениях механических свойств мембраны при подготовке клеток к делению (Чубинский-Надеждин и др, 2020, Цитология). 3. В рамках развития новых численных методов оценки изменений внутриклеточных структур, лежащих в основе клеточной подвижности и механотрансдукции, описаны изменения организации фибриллярного актина в мезенхимных стволовых клетках линий FRSN и FetMSC в терминах фрактальной размерности Минковского в контроле и после действия ингибитора полимеризации актина латрункулина Б (Ревитцер и др., Гены и Клетки, 2020). 4. С помощью комплексного подхода, включающего электрофизиологический анализ ионных токов, показана экспрессия потенциал-зависимых натриевых каналов Nav в невозбудимых клетках, в том числе, линии эМСК. В ряде опытов с применением прижизненной микроскопии получены интересные данные, свидетельствующие о возможном ускорении миграции клеток при действии TTX (Шаматова и др., Гены и Клетки, 2020).

 

Публикации

1. Ревитцер А.В., Чубинский-Надеждин В.И., Негуляев Ю.А. The Effect of Atrial Natriuretic Peptide on Reorganization of Actin Cytoskeleton and Migration of Human Mesenchymal Stem Cells Cell and Tissue Biology, 14(2):154-159 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1134/S1990519X20020091

2. Семенова С., Шатрова А., Васильева И., Шаматова М., Пуговкина Н., Негуляев Ю. Adenosine-5′-triphosphate suppresses proliferation and migration capacity of human endometrial stem cells Journal of Cellular and Molecular Medicine, Volume 24, Issue 8, 1 April 2020, Pages 4580-4588 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1111/jcmm.15115

3. Сударикова А.В., Шилина М.А., Чубинский-Надеждин В.И., Гринчук Т.М., Морачевская Е.А., Негуляев Ю.А. Increased Migration Ability of Adenomyosis-Derived Endometrial Mesenchymal Stem Cells Cell and Tissue Biology, 14(3):190-195 (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1134/S1990519X20030062

4. Чубинский-Надеждин В. И., Шилина М. А., Сударикова А. В., Люблинская О. Г., Негуляев Ю. А., Морачевская Е. А. Зависимость присутствия кластеризованного ганглиозида GM1 в мембране эндометриальных мезенхимных стволовых клеток от фазы клеточного цикла Цитология, 62(10): 753-760. (год публикации - 2020) https://doi.org/10.31857/S0041377120100028

5. Ревитцер А.В., Негуляев Ю.А. Исследование перестроек фибриллярного актина в мезенхимных стволовых клетках с помощью фрактальной размерности Минковского Гены и Клетки, 15(3):28 (год публикации - 2020)

6. Шаматова М.М., Сударикова А.В., Негуляев Ю.А.. Функциональная активность электровозбудимых натриевых каналов в клетках линии К562 и мезенхимных стволовых клетках человека Гены и Клетки, 15(3):38-39 (год публикации - 2020)

7. - Adenosine-5′-triphosphate suppresses proliferation and migration capacity of human endometrial stem cells Medicine Innovates, November 7, 2020; Regenerative Medicine (год публикации - )

8. - Последние новости База данных, содержащая сведения об оценке и о мониторинге результативности деятельности научных организаций, выполняющих научно-исследовательские, опытно-конструкторские и технологические работы гражданского назначения, Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт цитологии РАН, 24 ноября 2020 г. 13:01 (год публикации - )


Возможность практического использования результатов
не очевидно