КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 17-14-01314

НазваниеНовые витальные флуоресцентные зонды для изучения перекисного окисления кардиолипина во внутренней мембране митохондрий: от модельных мембран до живых клеток.

РуководительМулкиджанян Армен Яковлевич, Доктор биологических наук

Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Московский государственный университет имени M.В.Ломоносова», г Москва

Период выполнения при поддержке РНФ 2017 г. - 2019 г.  , продлен на 2020 - 2021. Карточка проекта продления (ссылка)

Конкурс№18 - Конкурс 2017 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами».

Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни, 04-205 - Клеточная биология, цитология, гистология

Ключевые словакардиолипин, митохондриально-направленные зонды, активные формы кислорода, перекисное окисление липидов, митохондрии, липосомы

Код ГРНТИ34.17.19


СтатусУспешно завершен


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
За последние годы было показано, что окислительный стресс, вызываемый нарушением окислительно-восстановительного баланса и повышенным образованием активных форм кислорода (АФК), коррелирует с развитием различных патологий и старением организма. Перекисное окисление липидов во внутренней мембране митохондрий играет важную роль в развитии окислительного стресса. Первой мишенью АФК служат молекулы специфичного для митохондриальных мембран фосфолипида кардиолипина, окисление которого запускает каскад реакций, приводящих к апоптозу (программируемой клеточной смерти). Показано, что предотвращение окисления кардиолипина в клетках предотвращает и патологические последствия окислительного стресса. При этом в настоящее время отсутствуют методы, позволяющие вести прижизненные наблюдения за окислением кардиолипина в клетке. Цель данного проекта —разработка и испытание новых митохондриально-направленных флуоресцентных зондов для наблюдения за окислением кардиолипина и других липидов в митохондриях живых клеток. В рамках проекта планируется синтезировать ряд митохондриально-направленных флуоресцентных зондов с избирательным сродством к кардиолипину на основе уже полученного нами митохондриально-направленного флуорофора BODIPY581/591-N2С12-ТРР, в котором флуоресцентная группа BODIPY581/591 соединена с проникающим в митохондрии катионом трифенилфосфонием (ТРР) посредством линкера N2С12, содержащего две пептидные связи. Избирательное сродство к кардиолипину будет достигаться введением в линкер функциональных групп, способных связываться с молекулами кардиолипина. Специфическое сродство новых зондов к кардиолипину будет количественно оцениваться с использованием липидных везикул (липосом), содержащих различные количества, как восстановленного, так и окисленного кардиолипина. С использованием зондов, показавших специфическое сродство к кардиолипину, на клеточных культурах будет определена локализация зондов и проведены измерения уровня окисления липидов внутренней мембраны митохондрий при различных видах окислительного стресса. Будет проверено, способны ли клетки избирательно элиминировать митохондрии с высоким уровнем окисленности липидов. Новые зонды будут применяться для оценки эффективности антиоксидантов различной структуры и специфичности в различных клеточных моделях окислительного стресса.

Ожидаемые результаты
Будут синтезированы новые флуоресцентные зонды (на основе уже полученного нами митохондриально-направленного флуорофора BODIPY581/591-N2С12-ТРР, в котором флуоресцентная группа BODIPY581/591 соединена с проникающим в митохондрии катионом ТРР посредством N2С12 линкера, содержащего две пептидные связи) с избирательным сродством к кардиолипину для регистрации перекисного окисления липидов во внутренней мембране митохондрий в клеточных культурах. Cвойства этих зондов будут исследованы в модельных мембранных везикулах (липосомах), содержащих различные формы кардиолипина, что позволит оптимизировать структуру зондов и методики измерения уровня окисленности липидов. Испытания новых зондов будут проводиться на культурах клеток, где будет определена локализация зондов (колокализация с митохондриальными красителями) и их чувствительность к окислению кардиолипина и других липидов в митохондриях. С использованием полученных зондов, специфически реагирующих на окисление кардиолипина, будут проведены измерения уровня окисления липидов внутренней мембраны митохондрий при различных видах окислительного стресса. Будет исследована гетерогенность популяции митохондрий в одной клетке по уровню окисленности кардиолипина и других липидов, а также связь между степенью окисленности липидов и величиной митохондриального мембранного потенциала. С помощью новых митохондриально-направленных зондов и антиоксидантов будет выяснена возможная роль окисления липидов митохондрий в гибели клеток, а также роль митофагии в защите клеток от гибели при окислительном стрессе. С помощью новых митохондриально-направленных флуоресцентных зондов будет разработана методика оценки способности различных антиоксидантов (в первую очередь, митохондриально-направленных) защищать кардиолипин от окисления в культурах клеток. Полученные результаты будут использованы в разработке новых митохондриально-направленных антиоксидантов, дополняющих уже полученную в нашем институте линейку соединений семейства SkQ, одно из которых - SkQ1 - является первым в истории фармакологии официально одобренным и уже применяемым митохондриально-адресованным лекарственным препаратом.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2017 году
Отработан синтез флуоресцентного зонда, представляющего собой конъюгат катиона трифенилфосфония с флуоресцентной меткой BODIPY581/591 (BODIPY581-TPP), предназначенного для количественной и селективной оценки перекисного окисления кардиолипина во внутренней мембране митохондрий in vivo. Окисление диенового фрагмента этого зонда происходит при взаимодействии с перекисными липидными радикалами и сопряжено с повышением флуоресценции в зеленой области и с уменьшением флуоресценции в красной области. Наличие положительно заряженной группы и амидных групп в линкере обеспечивает сродство зонда к отрицительно заряженным группам на поверхности мембраны, в первую очередь к кардиолипиновыми доменами. 2. Методами молекулярного моделирования и квантово-химических расчетов было определено положение диена в молекуле BODIPY581-TPP относительно окисленного диена в жирнокислотных остатках кардиолипина. Сделан вывод, что способный окисляться остаток в молекуле BODIPY581-ТРР должен располагаться вблизи от перокси-групп жирных кислот кардиолипина. Молекулярно-динамическое моделирование указывает на то, что линкерная часть зонда BODIPY581-ТРР расположена вдоль мембраны, так что ее длина и состав мало влияют на глубину расположения диенового остатка. Предполагается, что внесение модификаций в линкерную часть может повысить сродство зонда к кардиолипину, не изменив его чувствительности к окислению жирнокислотных остатков. Молекулярно-динамическое моделирование указывает на высокую эффективность и селективность нового зонда BODIPY581-ТРР по отношению к окисленной форме кардиолипина. 3. Исследовано влияние низкомолекулярных миметиков BODIPY581-TPP на окисление кардилипиновых липосом, которое запускалось двумя разными методами. В первом случае для инициации цепной перекисной реакции использовали гидрофобный азоинициатор 2,2′-азобис-(4-метокси-2,4-диметилвалеронитрил) (MeO-AMVN). При этом оценивалась способность миметиков тушить пероксильные радикалы. Во втором случае для инициации цепной перекисной реакции использовали цитохром c, который при взаимодействии с липидными перекисями, всегда присутствующими в мембране, способен превращаться в пероксидазу и окислять молекулы кардиолипина. Этом случае исследовалась еще и способность миметиков связыватся с кардиолипином и препятствовать его взаимодействию с цитохромом с. В качестве миметиков использовались креатин, карнозин и L-карнитин, низкомолекулярные соединения, присутствующие в клетках в больших количествах. Креатин и карнозин имеют амидо- и аминогруппы, а L-карнитин имеет положиельно заряженную холиновую группу и обладает способностью связываться с жирными кислотами. Исследование этих соединений представляло интерес не только с методической точки зрения, но и одновременно позволяло прояснить антиокислительные свойства этих соединений, функция которых в клетке остается неясной уже около ста лет. Нельзя было исключить, что многочисленные сообщения о способности этих соединений предотвращать апоптоз могут отражать их способность связываться с кардиолипином и препятствовать его окислению цитохромом с. Ни одно из испытанных соединений не оказалось истинным антиоксидантом по отношению к кардиолипину. Карнозин, однако, обладал слабым прооксидантным действием. Испытанные соединения в высокой концентрации 1 мМ не оказывали влияния на индуцированное цитохромом c окисление кардиолипина, что говорит об их неспособности препятствовать взаимодействию кардиолинина с цитохромом с. 4. Исследовалась способность BODIPY581-TPP отслеживать окисление липидов в клетках в разных моделях окислительного стресса. BODIPY581-TPP оказался способен детектировать митохондриальный стресс в клетках, обработанных перекисью водорода или гидроперекисью кумола, добавление митохондриально-направленного антиоксиданта SkQ1, способного в концентрации 20 нМ эффективно предотвращать окислительный стресс, предотвращало и ответ BODIPY581-TPP во всех вариантах индукции. Для индукции митохондриального окислительного стресса были также использованы ингибиторы дыхательной цепи пьерицидин и антимицин, а также редокс медиаторы менадион и бриллиантовый зеленый, которые восстанавливаются в митохондриях и образуют АФК, реагируя с кислородом. Было показано, что редокс медиаторы вызывали значительную дозо-зависимую генерациию АФК, тогда как ингибиторы дыхания не вызывали существенного окислительного стресса. Соответственно, и флуоресценция BODIPY581-TPP не менялась существенно в ответ на добавление ингибиторов, но заметно менялась в присуствии медиаторов. 5. BODIPY581-TPP был также применен для исследования особенностей развития окислительного стресса при наследственной оптической нейропатии Лебера (LHON). Было показано, что BODIPY581-TPP отслеживал как окисление липидов, так и его предотвращение антиоксидантами. Таким образом, нами было показана возможность применения BODIPY581-TPP для изучения окислительного повреждения митохондриальной мембраны в ответ на окислительный стресс различной природы и на различных объектах. Поскольку ранее было показано, что в ответ на окислительный стресс окисляется почти исключительно кардиолипин, использовавшийся нами флуоресцентый зонд BODIPY581-TPP сообщал именно о его окислении. 6. Разработана модель, в соответствии с которой конечная судьба клетки определяется балансом между запускающимися в ответ на окисление кардиолипина проапоптотическими и антиапоптотическими реакциями. Идентифицирована цепь антиапоптозных реакций. Благодаря наличию двух противоположно направленных регуляторных путей, митохондриально направленные антиоксиданты, уменьшая количество окисляющегося кардиолипина, могут смещать баланс в сторону выживания как клеток, так и организмов в случае многих патологий.

 

Публикации

1. Мулкиджанян А.Я., Шалаева Д.Н., Лямзаев К.Г., Черняк Б.В. Could the fission of mitochondria in response to oxidative stress prevent apoptosis? / Дробление митохондрий в ответ на окислительный стресс предотвращает апоптоз? Биохимия, т.83, №5 (год публикации - 2018)


Аннотация результатов, полученных в 2018 году
В 2018г оптимизирована схема синтеза нового флуоресцентного митохондриально-направленного зонда MitoCLox, чувствительного к окислению кардиолипина. Предложенная схема будет использована для синтеза новых вариантов зонда. Уже синтезирован новый вариант зонда в который введен положительно заряженный остаток аминокислоты аргинина. Предполагается, что наличие двух положительных зарядов позволит увеличить селективность зонда по отношению к кардиолипину. С помощью молекулярного моделирования и квантово-химических расчетов детально исследовано взаимодействие MitoCLox с окисленным кардиолипином в бислойной мембране. Проведено сравнение с разработанным ранее зондом MitoPerox. Показано, что в обоих зондах глубина погружения диен-содержащего фрагмента, чувствительного к окислению, соответствует положению двойных связей в остатках жирных кислот в молекуле кардиолипинат.е. оптимальна для защиты кардиолипина от окисления. Анализ распределения зондов в плоскости мембраны показал возможность тесного взаимодействия зонда как с восстановленным, так и с окисленным кардиолипином. Исследования связывания MitoCLox с липосомами показали, что зонд одинаково хорошо связывается с липосомами, содержащими кардиолипин в различных пропорциях с иными фосфолипидами. Наличие одного положительного заряда не дает измеряемого преимущества на фоне термодинамически очень выгодного взаимодействия между гидрофобными частями зонда и липидной мембраной. Исследована возможность использования MitoCLox для отслеживания окисления кардиолипина в липосомах. В качестве индуктора окисления был использован цитохром с, который приобретает пероксидазную активность при связывании с кардиолипином. Проведено одновременное измерение кинетики образования диеновых конъюгатов (продуктов окисления кардиолипина) и окисления MitoCLox. Было показано, что как накопление диенов, так и окисление MitoCLox инициированное цитохромом с во времени развиваются линейно. MitoClox не влиял на окисление кардиолипина цитохромом с, что делает возможным его использование в качестве флуоресцентного зонда in vivo. Антиоксидант трет-бутилгидрохинон (TBHQ) блокировал как окисление кардиолипина, так и окисление MitoCLox. Митохондриально-направленный антиоксидант SkQ1 в восстановленной форме эффективно подавлял окисление кардиолипина и MitoCLox. Окисленная форма SkQ1 не влияла на окисление, что позволило исключить возможные взаимодействия SkQ1 с цитохромом с и с зондом. Показано, что при понижении доли кардиолипина в липосомах до 50% его окисление цитохромом с практически прекращается. Видимо, способность цитохрома с окислять кардиолипин обусловлена его связыванием с кардиолипиновыми доменами. Это может служить одной из причин селективного окисления кардиолипина в ответ на окислительный стресс in vivo. Исследована кинетика накопления MitoCLox в клетках и подтверждена селективность его связывания с митохондриями. С помощью проточной цитофлуориметрии проведены измерения ответа MitoCLox на окислительный стресс, вызванный различными агентами. Показано, что эффективность окисления зонда органической гидроперекисью существенно выше, чем у перекиси водорода. Это согласуется с данным о более высокой эффективности органических гидроперекисей в индукции перекисного окисления липидов в мембране митохондрий. Интересно, что в клетках карциномы RKO, различия в эффекте перекиси водорода и органической гидроперекиси оказались значительно более выраженными чем в фибробластах. Эти результаты согласуются с данными о том, что клетки RKO обладают высокой резистентностью к цитотоксическому действию перекиси водорода. Исследовано действие митохондриально-направленных и традиционных антиоксидантов на окисление липидов в мембране митохондрий. Показано, что митохондриально-направленные антиоксиданты семейства SkQ предотвращают окисление MitoCLox в значительно более низких концентрациях, чем традиционные антиоксиданты. Эти результаты согласуются с данными о высокой эффективности митохондриально-направленных антиоксидантов в защите клеток от гибели при окислительном стрессе. Полученные результаты позволяют предполагать, что окисление кардиолипина играет основную роль в индукции гибели клеток при окислительном стрессе.

 

Публикации

1. Лямзаев КГ, Токарчук АВ, Пантелеева АА, Мулкиджанян АЯ, Скулачев ВП, Черняк БВ Induction of autophagy by depolarization of mitochondria Autophagy, Volume 14, Issue 5, 4 May 2018, Pages 921-924 (год публикации - 2018) https://doi.org/10.1080/15548627.2018.1436937

2. Нестеренко А.М., Холина Е.Г., Лямзаев К.Г., Мулкиджанян А.Я., Черняк Б.В. Молекулярно-динамическое моделирование взаимодействия катионных флуоресцентных зондов чувствительных к перекисному окислению липидов с митохондриальной мембраной Доклады Академии Наук (Doklady Biochemistry and Biophysic), - (год публикации - 2019)


Аннотация результатов, полученных в 2019 году
В рамках проекта в течение 2017-2019 гг нами были впервые разработаны, синтезированы и изучены новые митохондриально-направленные флуоресцентных зонды для регистрации окисления кардиолипина in vivo, в митохондриях живых клеток. Первым был изучен зонд MitoCLox, было показано, что этот зонд селективно накапливается в митохондриях и служит чрезвычайно удобным индикатором окисления митохондриальных липидов. Мы использовали MitoCLox как платформу для получения новых зондов с еще большей избирательностью по отношению к кардиолипину. Один из возможных подходов, основанный на увеличении положительного заряда зонда, был испытан при создании зонда, несущего остаток аргинина в составе линкера (MitoCLox-Arg). Эксперименты на липосомах позволили измерить количественные различия в сродстве синтезированных нами флуоресцентных зондов к кардиолипину и к нейтральным фосфолипидам. Проведенные измерения показали, что как MitoCLox, так и MitoCLox-Arg значительно лучше связываются с кардиолипиновыми липосомами, чем с липосомами из нейтрального фосфолипида. Разница в сродстве оказалась выше в случае MitoCLox-Arg, который оказался специфичным по кардиолипину и очень плохо связывался с нейтральными липидами, такими как фосфатидилхолин. Эксперименты с изолированными митохондриями показали, что MitoCLox-Arg обладает высокой чувствительностью к окислению липидов, которая мало отличалась от чувствительности MitoCLox. Эксперименты с клетками, однако, показали, что введение дополнительного заряда в молекулу MitoCLox-Arg несколько снизило способность зонда проникать через внешнюю мембрану клетки, так что часть зонда попадала в клетку путем эндоцитоза. Дальнейшее использование MitoCLox-Arg возможно с использованием липофильных анионных соединений, которые могут способствовать его проникновению через мембрану и предотвращать эндоцитоз. Экранирование остатка аргинина ароматическими остатками в составе линкера так же может повысить способность молекулы зонда проникать через мембрану. В настоящее время разрабатывается схема синтеза подобной молекулы. С помощью MitoCLox мы исследовали роль перекисного окисления митохондриальных липидов в падении мембранного потенциала при окислительном стрессе. Было показано, что окисление MitoCLox начинается сразу после индукции окислительного стресса перекисью водорода, а снижение мембранного потенциала происходит лишь через 40 минут после добавки перекиси водорода. Можно предполагать, что мембранный потенциал может поддерживаться столь продолжительное время за счет гидролиза запасов внутриклеточного АТФ, образуемого за счет гликолиза, с помощью АТФ-синтазы, что может компенсировать утечку протонов через частично окисленную мембрану. Интересно, что массовая фрагментация митохондрий наблюдалась лишь при падении мембранного потенциала, т.е. начиналась одновременно с достижением высокой степени окисленности митохондриальной мембраны. С помощью MitoCLox была исследована гетерогенность популяции митохондрий в составе одной клетки. В эндотелиальных клетках была выявлена фракция митохондрий с повышенным уровнем окисленности фосфолипидов. Эти митохондрии были небольшими, округлыми и располагались вблизи ядра. Эти же митохондрии имели пониженный уровень мембранного потенциала. Можно полагать, что перекисное окисление липидов митохондрий (прежде всего кардиолипина) может быть причиной снижения мембранного потенциала в части митохондриальной популяции. Возможно, эти митохондрии служат своеобразными датчиками клеточного окислительного стресса, и при превышении допустимого предела быстро запускать механизм клеточной гибели. Мы показали, что эти митохондрии могут служить мишенью для избирательной аутофагии (митофагии). Элиминация этих митохондрий может служить одной из причин защитного действия аутофагии при различных стрессах.

 

Публикации

1. Боздагонян М.Е., Лохматиков А.В., Воскобойникова Н, Черепанов Д.А., Стейнхофф Х, Шайтан К.В., Мулкиджанян А.Я. Proton leakage across lipid bilayers: Oxygen atoms of phospholipid ester linkers align water molecules into transmembrane water wires BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOENERGETICS, Том: 1860 Выпуск: 6 Стр.: 439-451 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1016/j.bbabio.2019.03.001

2. Крылова Т.Д., Шеремет Н.Л., Табаков В.Ю., Лямзаев К.Г., Иткис Ю.С., Цыганкова П.Г., Андреева Н.А., Шелкова М.С., Невиницина Т.А., Кадышев В.В. Захарова Е.Ю. Three rare pathogenic mtDNA substitutions in LHON patients with low heteroplasmy Mitochondrion, - (год публикации - 2020) https://doi.org/10.1016/j.mito.2019.10.002

3. Лямзаев К.Г., Пантелеева А., Карпухина А., Галкин И., Плетюшкина О., Попова Е., Ригер Б., Буш К., Мулкиджанян А., Черняк Б. Novel fluorescent mitochondria-targeted probe MitoCLox reports lipid peroxidation in response to oxidative stress in vivo OXIDATIVE MEDICINE AND CELLULAR LONGEVITY, - (год публикации - 2019)

4. Лямзаев К.Г., Сумбатян Н.В., Нестеренко А.М., Холина Е.Г., Воскобойникова Н, Штейнхофф Х, Мулкиджанян А.Я., Черняк Б.В. MitoClox, a novel mitochondria-targeted fluorescent probe for tracing lipid peroxidation Oxidative Medicine and Cellular Longevity, Volume 2019, Article ID 9710208 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1155/2019/9710208

5. Нестеренко А.М., Холина Е.Г., Лямзаев К.Г., Мулкиджанян А.Я., Черняк Б.В. Molecular Dynamics Modeling of the Interaction of Cationic Fluorescent Lipid Peroxidation-Sensitive Probes with the Mitochondrial Membrane DOKLADY BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, Том: 486 Выпуск: 1 Стр.: 220-223 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1134/S1607672919030153

6. Фетисова Е.К., Мунтян М.С., Лямзаев К.Г., Черняк Б.В. Therapeutic Effect of the Mitochondria-Targeted Antioxidant SkQ1 on the Culture Model of Multiple Sclerosis OXIDATIVE MEDICINE AND CELLULAR LONGEVITY, Том: 2019 Номер статьи: 2082561 (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1155/2019/2082561


Возможность практического использования результатов
Созданные зонды для прижизненного наблюдения за перекисным окислением молекул кардиолипина митохондриальной мембраны возможно использовать в научных и медицинских исследованиях. В силу возможности использования этих зондов в медицинской диагностике, мы предполагаем их патентование. За время работы над проектом и после публикации статей было несколько запросов с просьбой прислать наши зонды с целью научных изысканий.