КАРТОЧКА
ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ
Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.
ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ
Номер 15-15-10022
НазваниеИзучение вариабельности митохондриальной ДНК на основе анализа митохондриального генома при атеросклерозе и ассоциированными с ним заболеваниями и состояниями
РуководительШкурат Татьяна Павловна, Доктор биологических наук
Организация финансирования, регион федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Южный федеральный университет", Ростовская обл
| Период выполнения при поддержке РНФ | 2015 г. - 2017 г. |
Конкурс№7 - Конкурс 2015 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований с привлечением молодых исследователей».
Область знания, основной код классификатора 05 - Фундаментальные исследования для медицины, 05-202 - Сердечно-сосудистая система
Ключевые словаАТЕРОСКЛЕРОЗ, ИШЕМИЧЕСКАЯ БОЛЕЗНЬ СЕРДЦА, ИНФАРКТ МИОКАРДА, ДИАБЕТ, ГИПЕРТОНИЯ, ОЖИРЕНИЕ, ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ПРЕДРАСПОЛОЖЕННОСТЬ, ДИАГНОСТИКА, МЕТАБОЛИЗМ, МУТАЦИИ МИТХОНДРИАЛЬНОГО ГЕНОМА, ПОЛНОГЕНОМНОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ, ФАКТОРЫ РИСКА
Код ГРНТИ76.03.39
СтатусУспешно завершен
ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ
Аннотация
Фундаментальная научная проблема, на решение которой направлен проект, заключается в выявлении повреждений митохондриальной ДНК на основе анализа вариабельности митохондриального генома при атеросклерозе и ассоциированными с ним заболеваниями и состояниями. Раскрытие этих связей даст новые знания об атерогенезе как возрастном дегенеративном патологическом процессе и создаст основу для разработки новых способов генетической диагностики, а также генетической, биологической и лекарственной терапии. В данном исследовательском проекте будет изучена роль вариабельности митохондриальной ДНК (мтДНК) при ключевых сердечно-сосудистых заболеваниях и связанных с ними патологиях. Проект направлен на создание новых эффективных методов для скрининга, диагностики, контроля и лечения основных сердечно-сосудистых заболеваний и таким образом, предоставляет новые и более эффективные средства по борьбе с эпидемией сердечно-сосудистых заболеваний, сахарного диабета 2 типа и ожирением в России. Полногеномное секвенирование мтДНК будет выполнено на выборке из 150 релевантных образцов от лиц, прошедших комплексное обследование для выявления соответствующих фенотипических характеристик. Это позволит выявить варианты мтДНК, которые ассоциированы с атеросклерозом и ассоциированными с ним заболеваниями и состояниями (например, его основными клиническими проявления в форме ИБС, а также артериальной гипертонией, сахарным диабетом 2 типа и ожирением). Обнаруженные значимые варианты мтДНК, включающие также существующие результаты экспериментальных исследований, будут оценены в расширенной выборке из популяции с использованием технологии ПЦР-РВ. Параллельно будет проведен анализ возможной экспрессии псевдогенов для исключения ложнополжительных результатов. Будет генотипировано, по крайней мере, 500 образцов мтДНК. Получение банка мтДНК гарантирует фундаментальную и клиническую актуальность результатов и выводов. Кроме подходов молекулярной и генетической эпидемиологии, команда исследователей будет использовать передовую экспертизу в области биоинформатики и молекулярной биологии. Предлагаемые подходы позволят представить список генов-кандидатов и ключевых мутаций, ответственных за клеточные и молекулярные механизмы развития патологии; кроме того, это откроет поле для развития клеточных моделей с целью изучения механизмов и метаболических путей развития патологии, обусловленных повреждениями мтДНК, и дальнейшего развития новых методов генетической диагностики, а также генетической, биологической и лекарственной терапии. Впервые будет масштабно изучена связь вариантов мтДНК с такими заболеваниями, как атеросклероз, ишемическая болезнь сердца, артериальная гипертония, сахарный диабет 2 типа и ожирение. Впервые будет изучена внутрипопуляционная вариабельность митохондриального генома. Таким образом, предложенный проект способен обеспечить инновационные научные результаты.
Ожидаемые результаты
В результате полногеномного секвенирования митохондриальной ДНК и последующего исследования на расширенной выборке из популяции будет определен практически исчерпывающий список митохондриальных мутаций и полиморфизмов, определяющих индивидуальную предрасположенность к атеросклерозу, ишемической болезни сердца, артериальной гипертонии, сахарному диабету 2 типа и ожирению. Будет выполнена интегральная оценка взаимодействий гетероплазмий и однонуклеотидных полиморфизмов митохондриального генома в предсказании атеросклероза, ИБС, артериальной гипертонии, сахарного диабета 2 типа и ожирения. Будут разработаны принципы создания клеточных моделей для изучения механизмов и метаболических путей развития патологии, обусловленных повреждениями мтДНК, и развития новых методов генетической диагностики, а также генетической, биологической и лекарственной терапии. Накопленные молекулярно-биологические и клинические данные дадут возможность для улучшения здоровья человека и для стимулирования научной и производственной активности. Предложенный проект представляет собой исследовательскую программу, направленную на использование новых молекулярных маркеров для улучшения диагностики и генерирования основы для развития инновационных терапевтических подходов. Проект имеет потенциал, чтобы достичь больших успехов в науке и создать значительную научную активность в России.
ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ
Аннотация результатов, полученных в 2015 году
Фундаментальная научная проблема, на решение которой направлен проект, заключается в выявлении повреждений митохондриальной ДНК на основе анализа вариабельности митохондриального генома при атеросклерозе и ассоциированными с ним заболеваниях и состояниях. Наиболее частые хронические возрастные дегенеративные заболевания (атеросклероз, его основное клиническое проявление – ишемическая болезнь сердца, артериальная гипертония, сахарный диабет 2 типа и ожирение) имеют чрезвычайно высокую распространенность, которая у лиц пожилого возраста в совокупности составляет 100%. Считается, что все они связаны с биологическим старением клеток, одним из индикаторов и механистических факторов которого является повреждение митохондриального генома. В данном исследовательском проекте изучается роль вариабельности митохондриальной ДНК (мтДНК) при ключевых сердечно-сосудистых заболеваниях и связанных с ними патологиях.
На первом этапе исследования в 2015 году (Наладка и проведение секвенирования мтДНК) проводились исследовательские работы, входящие в состав «исследования для открытия», целью которого является получение информативных генетических маркеров для последующего репликационного/верификационного исследования. Было обследовано 399 человек в возрасте от 51 до 83 лет, которые были охарактеризованы с использованием УЗИ бассейна сонных артерий по толщине интимо-медиального слоя сонных артерий, суррогатной мере оценки степени развития атеросклероза. На основании оценки атеросклеротического статуса была сформирована группа из 70 участников исследования, включающая как условно здоровых лиц с минимальными признаками каротидного атеросклероза или с отсутствием таковых, а также пациентов с выраженным каротидным атеросклерозом, у которых толщина интимо-медиального слоя общих сонных артерий значительно превышала нормальные показатели. Была сформирована коллекция образцов ДНК участников исследования.
Для генотипирования мтДНК был налажен и использован метод полногеномного секвенирования, основанный на технологии NGS на платформе Roche 454. В результате секвенирования образцов ДНК от 70 участников исследования был выявлен спектр мутаций митохондриальной ДНК, который включал однонуклеотидные замены, делеции и инсерции. Анализ вариабельности митохондриального генома показал, что частота гомоплазмичных мутаций мтДНК у участников исследования составила 15-27 нуклеотидных вариантов на 1 митохондриальный геном. Однонуклеотидные варианты, ассоциированные с атеросклерозом, в большинстве своем были идентичны таковым в Кембриджской (референсной) последовательности мтДНК. Общая частота гомоплазмичных мутаций была достоверно выше у условно здоровых лиц по сравнению с пациентами с каротидным атеросклерозом, то есть здоровые лица характеризовались более высокой вариабельностью митохондриального генома. Были выявлены в общей сложности 270 гетероплазмичных вариантов мтДНК, большинство из которых были редкими вариантами, обнаруженными только у одного участника исследования. 115 вариантов мтДНК имели частоту встречаемости выше 5%; из них были исключены из рассмотрения те варианты мтДНК, которые имели одинаковую частоту встречаемости как у условно здоровых лиц, так и у пациентов с атеросклерозом. В результате был сформирован предварительный список информативных генетических маркеров для дальнейшего репликационного/верификационного исследования, включающий следующие 15 вариантов мтДНК: 576insC, A750G, A1811G, 8516insA/C/AC, 8528insA, 8930insG, G9477A, 10958insC, A11467G, A12308G, G12372A, 13047insC, 13050insC, C14766T, A15326G. Таким образом, на основании результатов полногеномного секвенирования была определена вариабельность митохондриального генома клеток крови, а также идентифицирован спектр точечных мутаций (вариантов) митохондриального генома клеток крови, ассоциированных с атеросклерозом, которые были признаны кандидатами на роль генетических маркеров предрасположенности к атеросклерозу.
Cсылки на информационные ресурсы в сети Интернет, посвященные проекту:
1) Neskubina OM, Derevyanchuk EG, Demakova NA, Shkurat TP. The usefulness of high-resolution carotid ultrasonography for the detection of subclinical atherosclerosis. Online J Health Allied Scs. 2015;14(3):8. Available at URL: http://www.ojhas.org/issue55/2015-3-8.html
2) Sazonova M.A Mitochondrial Genome Sequencing in Atherosclerosis: What's Next? / Sazonova M.A, Shkurat T.P., Demakova N.A, Zhelankin A.V., Barinova V.A., Sobenin I.A., Orekhov A.N. // . — 2016. — T. 22, № 00. Available at URL: http://niib.sfedu.ru/assets/files/publications/Sazonova-MS.doc.pdf
Публикации
1. Neskubina OM, Derevyanchuk EG, Demakova NA, Shkurat TP The Usefulness of High-Resolution Carotid Ultrasonography for the Detection of Subclinical Atherosclerosis Online Journal of Health and Allied Sciences, Vol. 14, Issue 3:8 (год публикации - 2015)
2. Sazonova MA, Shkurat TP, Demakova NA, Zhelankin AV, Barinova VA, Sobenin IA, Orekhov AN. Mitochondrial Genome Sequencing in Atherosclerosis: What's Next? Current Pharmaceutical Design, 2015 Nov 12. [Epub ahead of print] (год публикации - 2016) https://doi.org/10.2174/1381612822666151112152335
3. Е.Г. Деревянчук Изучение распределения мотивов зрелой микроРНК вокруг и внутри генов, ассоциированных с развитием атеросклероза Актуальные проблемы биологии, нанотехнологий и медицины, Материалы VI Международной научно-практической конференции «Актуальные проблемы биологии, нанотехнологий и медицины» - Ростов-на-Дону, 2015. – С. 52. (год публикации - 2015)
Аннотация результатов, полученных в 2016 году
В «исследование для открытия» включено 80 лиц с проведением количественной диагностики атеросклероза методом ультрасонографии сонных артерий. Коллекция образцов ДНК для полногеномного секвенирования в рамках «исследования для открытия» расширена до 150 образцов. Проведено полногеномное секвенирование 80 образцов мтДНК от дополнительно включенных пациентов.
Создан окончательный список информативных генетических маркеров для репликационного/верификационного исследования, включающего также известные ранее маркеры повреждения генов мтДНК, ассоциированные с ИБС и сахарным диабетом 2 типа и используемые в качестве положительного контроля и для доказательства правильности концепции.
Разработаны праймеры и зонды для количественной ПЦР в режиме реального времени с целью анализа гетероплазмии мтДНК по выбранным информативным генетическим маркерам.
Проведен рестрикционный анализ продуктов амплификации с использованием сайт-специфичных рестриктаз для исключения ложноположительных результатов ПЦР-РВ в случае амплификации с псевдогенов.
Для проведения верификационного/репликационного исследования осуществлено увеличение выборки участников исследования и коллекции ДНК за счет включения и обследования 200 лиц с проведением количественной диагностики атеросклероза методом ультрасонографии сонных артерий.
По текущим результатам проекта опубликованы следующие статьи:
1) Galitsyna E.V., Sazonova M.A., Shkurat T.P., Demakova N.A., Melnichenko A.A., Sinyov V.V., Ryzhkova A.I., Mitrofanov K.Y., Zhelankin A.V., Sobenin I.A., Orekhov A.N. Mutations of mitochondrial DNA in chronic non-inflammatory diseases: target candidates for treatment. Current Pharmaceutical Design. 2016.
http://www.eurekaselect.com/146473/article
2) Sazonova M., Sinyov V., Ryzhkova A., Shkurat T, Demakova N, Nikitina N., Sobenin I., Orekhov A. Creation of hybrid lines of monocyte origin with high heteroplasty level for mitochondrial genome mutation m.1555G>A. Atherosclerosis. 2016.
http://www.atherosclerosis-journal.com/article/S0021-9150(16)30797-3/fulltext
3) Sazonova V.A., Sinyov V.V., Ryzhkova A.I., Galitsyna E.V., Shkurat T.P., Melnichenko A.A., Demakova N.A., Postnov A.Y., Sobenin I.A., Orekhov A.N. Cybrid models of pathological cell processes in different diseases. Current Pharmaceutical Design. 2016.
http://www.eurekaselect.com/147500/article
4) Shkurat T.P., Timofeeva S.V., Demakova N.A., Romanov D.E., Butenko E.V. MicroRNA Binding Sites in Mitochondrial Genes are Associated with the Progression of Atherosclerosis. Annals Academy of Medicine Singapore. 2016.
http://www.annals.edu.sg/pdf/45VolNo9Sep2016/SHBC2016.pdf
Публикации
1. Сазонова М.А., Галицына Е.В., Синев В.В., Рыжкова А.И., Мельниченко А.А., Демакова Н.А., Собенин И.А., Шкурат Т.П., Орехов А.Н. Threshold level of heteroplasmy of mtDNA mutations associated with atherosclerotic lesions Vessel Plus, - (год публикации - 2016)
2. Галицына Е.В., Сазонова М.А., Шкурат Т.П., Демакова Н.А., Мельниченко А.А., Синев В.В., Рыжкова А.И., Митрофанов К.Ю., Желанкин А.В., Собенин И.А., Орехов А.Н. Mutations of mitochondrial DNA in chronic non-inflammatory diseases: target candidates for treatment Current Pharmaceutical Design, Oct 18. [Epub ahead of print] (год публикации - 2016) https://doi.org/10.2174/1381612822666161018162022
3. Сазонова М.А., Синев В.В., Рыжкова А.И., Галицына Е.В., Шкурат Т.П., Мельниченко А.А., Демакова Н.А., Постнов А.Ю., Собенин И.А., Орехов А.Н. Cybrid models of pathological cell processes in different diseases Current Pharmaceutical Design, 2016 Nov 18. [Epub ahead of print] (год публикации - 2016) https://doi.org/10.2174/1381612823666161118144216
4. Бутенко Е.В., Тимофеева С.В., Нескубина О.М., Шкурат Т.П. Lipid metabolism genes polymorphisms are assosiated with atherosclerotic status Abstracts of International Young Scientists Conference "New trends in life science", P. 40-41 (год публикации - 2016)
5. Деревянчук Е.Г., Нескубина О.М., Демакова Н.А., Шкурат Т.П. Investigation of the lipid metabolism and cytokines genes polymorphisms role in the development of atherosclerosis Abstracts of International Young Scientists Conference "New trends in life science", P. 42 (год публикации - 2016)
6. Сазонова М., Синев В., Рыжкова А., Шкурат Т., Демакова Н., Никитина Н., Собенин И., Орехов А. Creation of hybrid lines of monocyte origin with high heteroplasty level for mitochondrial genome mutation m.1555G>A Atherosclerosis, 252; e79-e80 (год публикации - 2016)
7. Тимофеева С.В., Бутенко Е.В., Нескубина О.М., Потёмкин Д.С., Машкина Е.В. Inflammatory response and oxidative stress genes polymorphisms are assosiated with atherosclerotic status Abstracts of International Young Scientists Conference "New trends in life science", P. 69 (год публикации - 2016)
8. Шкурат Т.П., Тимофеева С.В., Демакова Н.А., Романов Д.Е., Бутенко Е.В. MicroRNA Binding Sites in Mitochondrial Genes are Associated with the Progression of Atherosclerosis Annals Academy of Medicine Singapore, Vol. 45 (Suppl), No. 9, P. S174 (год публикации - 2016)
Аннотация результатов, полученных в 2017 году
В 2017 году было завершено формирование выборки для проведения исследования. Общий размер выборки составил 512 человек. По результатам ультрасонографическго обследования сонных артерий 318 человек были отнесены к группе условно здоровых лиц, 194 человек – к группе пациентов с каротидным атеросклерозом. Имелись достоверные различия между пациентами с каротидным атеросклерозом по средней толщине интимо-медиального комплекса общих сонных артерий, наблюдаемые во всех возрастных группах как у мужчин, так и у женщин. Из показателей клинического обследования достоверные различия были только по возрасту и уровню холестерина ЛНП.
Был создан банк образцов ДНК в общей сложности от 512 участников исследования; 4 образца оказались непригодными для генотипирования, и окончательный размер банка составил 508 образцов.
Было проведено генотипирование образцов мтДНК участников исследования с использованием ПЦР-РВ. Генотипирование мтДНК проводили по позициям m.497C>T, m.576insC, m.709G>A, m.750A>G, m.1189T>C, m.1555A>G, m.1719G>A, m.1811A>G, m.3480A>G, m.8930insG, m.8967G>A, m.9477G>A, m.10550A>G, m.10958insC, m.11299T>C, m.11467A>G, m.12308A>G, m.12372G>A, m.13617T>C, m.13708G>A, m.14766C>T, m.14798C>T, m.15326A>G, m.16192C>T, m.16223C>T, m.16270C>T, m.3336C>T, m.5178C>A, m.12315G>A, m.14459G>A, и m.15059G>A (всего 31 позиция).
Проведен анализ результатов генотирипования; выявлено и охарактеризовано взаимодействие гетероплазмий, однонуклеотидных полиморфизмов и их сочетаний, предсказывающих атеросклероз, ИБС, артериальную гипертонию, сахарный диабет 2 типа и ожирение, с использованием многомерных вычислительных методов.
При сравнении групп участников исследования по степени гетероплазмии высокоуровневых мутаций мтДНК (c частотой встречаемости в выборке более 20% и с уровнем гетероплазмии не менее 8% в не менее, чем в 10% случаев выявленных вариантов) были получены достоверные различия между условно здоровыми лицами и пациентами с каротидным атеросклерозом по мутациям m.1555A>G (p=0,022), m.5178C>A (p=0,022), m.12315G>A (p=0,004) и m.15059G>A (p=0,015). Была отмечена тенденция к существованию различий между группами при p<0,1 (то есть не достигшая заданного порога статистической значимости) по гетероплазмии мутаций m.576insC (p=0,065), m.3480A>G (p=0,097), m.13708G>A (p=0,091) и m.14798C>T (p=0,082). Был проведен анализ линейной регрессии, где в качестве зависимой переменной были использованы средняя толщина интимо-медиального комплекса сонных артерий или размер атеросклеротической бляшки, а в качестве независимых переменных – показатели гетероплазмии по мутациям мтДНК, была получена модель, объясняющая 55% вариабельности зависимой переменной – толщины интимо-медиального комплекса сонных артерий (R=0,746; R2=0,557). Также был проведен корреляционный анализ. В результате был изменен и уточнен список митохондриальных генетических маркеров атеросклероза:
I. Маркеры группы А (есть различия между здоровыми лицами и пациентами с каротидным атеросклерозом, или сильная тенденция к существованию таких различий; связь с атеросклерозом подтверждена методами линейного и корреляционного анализа).
1. m.1555A>G
2. m.5178C>A
3. m.12315G>A
4. m.15059G>A
5. m.576insC
6. m.3480A>G
II. Маркеры группы Б (может иметься тенденция к существованию различий между здоровыми лицами и пациентами с каротидным атеросклерозом; связь с атеросклерозом подтверждена методами линейного и/или корреляционного анализа).
1. m.14798C>T
2. m.13708G>A
III. Маркеры группы В (связь с атеросклерозом подтверждена только методами корреляционного анализа).
1. m.3336C>T
2. m.12372G>A
3. m.14459G>A
4. m.15326A>G
Эти 12 мутаций локализованы в 6 генах: MT-RNR1, MT-ND1, MT-ND2, MT-ND5, MT-CYB и MT-TL2. Таким образом, эти мутации могут вызывать нарушения в сборка белка в митохондриальных рибосомах, изменять активность NADH дегидрогеназы и цитохрома В, а в итоге - приводить к развитию митохондриальной дисфункции.
В отношении артериальной гипертензии исследованные мутации мтДНК объясняли только 10-11% вариабельности артериального давления, а при корреляционном анализе ни один из маркеров не показал достоверной корреляции ни с систолическим АД, ни с диастолическим АД, ни с наличием установленного диагноза артериальной гипертензии. Таким образом, мутации митохондриального генома, ассоциированные с атеросклерозом, не имеют отношения к формированию фенотипа артериальной гипертензии.
Для изучения связи митохондриальных мутаций с метаболическими заболеваниями была выбрана модель метаболического синдрома (МС), поскольку концепция МС подразумевает совокупность нескольких факторов риска, которые приводят к повышенному риску кардиометаболических нарушений и атеросклеротической болезни. По данным генотипирования мтДНК, только уровни гетероплазмии для мутаций m.3336T>C и m.14846G>A достоверно различались между группами. Были выявлены достоверные корреляции между выраженностью МС, оцененной по интегральному индексу и гетероплазмией по m.652insG и m.3336T>C (r=0,323, p<0,001; были обнаружены некоторые корреляции между некоторыми показателями гетероплазмии мтДНК и автономными компонентами МС. Модель линейной регрессии объяснила 14% вариабельности интегрального показателя МС наличием мутаций мтДНК.
В результате биоинформационного поиска возможных взаимосвязей между распределением последовательностей, гомологичных митохондриальным микро-РНК, внутри и в окрестностях генов, ассоциированных с развитием атеросклероза, были выявлены 4 микро-РНК из списка ассоциированных с митохондриями, мотивы которых картированы в интронах гена PPARGC1A, который имеет непосредственное отношение к митохондриям, так как координирует регуляцию экспрессии комплекса генов, вовлеченных в сигнальные пути митохондрий, например, окисление жирных кислот.
Были разработаны принципы создания клеточных моделей для изучения механизмов и метаболических путей развития патологии, обусловленных повреждениями мтДНК. Из трех испытанных подходов к созданию клеточных моделей, воспроизводящих заданный условиями эксперимента митохондриальный генотип, только получение цитоплазматических гибридов оказалось эффективным решением в плане получения жизнеспособных клеток, несущих определенный генотип. С другой стороны, свойства клеточных линий, полученных путем цибридизации, могут быть непредсказуемыми в связи с вариабельностью донорской мтДНК.
http://www.abstractsonline.com/Plan/ViewAbstract.aspx?sKey=93d402d3-cf3b-4df4-9e30-3de4ac5a135f&cKey=685ed1cf-1519-482a-bfdd-8bd4b3088590&mKey=15a3630e-7769-4d64-a80a-47f190ac2f4f
http://www.atherosclerosis-journal.com/article/S0021-9150(17)31134-6/fulltext
https://bionanomed.sfedu.ru/ru/sbornik
http://www.abstractsonline.com/Plan/ViewAbstract.aspx?sKey=93d402d3-cf3b-4df4-9e30-3de4ac5a135f&cKey=f67544de-f92e-4286-83dc-09f973ed6244&mKey=15a3630e-7769-4d64-a80a-47f190ac2f4f
https://elibrary.ru/download/elibrary_26371901_10013406.pdf
http://www.atherosclerosis-journal.com/article/S0021-9150(17)31153-X/fulltext
http://www.atherosclerosis-journal.com/article/S0021-9150(17)31155-3/fulltext
https://www.hindawi.com/journals/omcl/2017/6934394/
http://www.atherosclerosis-journal.com/article/S0021-9150(17)30902-4/fulltext
https://lomonosov-msu.ru/archive/Lomonosov_2017/data/10738/uid84345_report.pdf
http://www.abstractsonline.com/Plan/ViewAbstract.aspx?sKey=93d402d3-cf3b-4df4-9e30-3de4ac5a135f&cKey=90af8bb0-18c4-42c6-90d0-d3eb94a44155&mKey=15a3630e-7769-4d64-a80a-47f190ac2f4f
Публикации
1. Нескубина О.М. Исследование носительства полиморфизма GLY 482 SER гена PPARGC1A у жителей Ростовской области, страдающих поздним атеросклерозом Cборник статей Международной научно-практической конференции "Достижения и инновации в науке, технологиях и медицине", сборник статей Международной научно-практической конференции. Под общей редакцией Г.Ю. Гуляева. 2016 Издательство: МЦНС «Наука и Просвещение». - стр. 80-83 (год публикации - 2016)
2. Нескубина О.М., Машкина Е.В., Шкурат Т.П. Исследование генетического полиморфизма G-250A гена LIPC при раннем и позднем атеросклерозе Валеология, - (год публикации - 2017)
3. Сазонова М.А., Синев В.В., Рыжкова А.И., Галицына Е.В., Хасанова З.Б., Постнов А.Ю., Ярыгина Е.И., Орехов А.Н., Собенин И.А. Role of mitochondrial genome mutations in pathogenesis of carotid atherosclerosis. Oxidative Medicine and Cellular Longevity., Vol. 2017, Article ID 6934394 (год публикации - 2017) https://doi.org/10.1155/2017/6934394
4. Собенин И.А., Мельниченко А.А., Демакова Н.А., Галицына Е.В., Шкурат Т.П. Вариабельность митохондриального генома клеток крови при сердечно-сосудистых и метаболических заболеваниях. Генетика – фундаментальная основа инноваций в медицине и селекции. Издательство Южного федерального университета, Ростов-на-Дону, Таганрог., Генетика – фундаментальная основа инноваций в медицине и селекции. Материалы Научно-практической конференции с международным участием, Ростов-на-Дону, 2–4 ноября 2017 г. Издательство Южного федерального университета, 2017, стр. 7. (год публикации - 2017)
5. Тимофеева С.В., Бутенко Е.В., Деревянчук Е.Г., Нескубина О.М., Потемкин Д.С., Шкурат Т.П. Data on SNP of lipid metabolism genes related with atherosclerosis progression. Data in brief, - (год публикации - 2017)
6. Волобуева А.С., Мельниченко А.А., Гречко А.В., Орехов А.Н. Mitochondrial genome variability: the effect on cellular functional activity. Therapeutics and Clinical Risk Management, - (год публикации - 2017)
7. Чистяков Д.А., Шкурат Т.П., Мельниченко А.А., Гречко А.В., Орехов А.Н. The role of mitochondrial dysfunction in cardiovascular disease: A brief review. Annals of Medicine, - (год публикации - 2017)
8. Бутенко Е.В., Тимофеева С.В., Деревянчук Е.Г., Шкурат Т.П. The contribution of genetic variants to plasma lipid composition related to the atherosclerotic status European Journal of Human Genetics, - (год публикации - 2017)
9. Галицына Е., Сазонова М., Синев В., Рыжкова А., Мельниченко А., Демакова Н., Собенин И., Шкурат Т., Орехов А. Association of mitochondrial genome mutations with chronic diseases of non-inflammatory genesis. Atherosclerosis, 263(8):e274-e275. (год публикации - 2017) https://doi.org/10.1016/j.atherosclerosis.2017.06.885
10. Деревянчук Е.Г., Бутенко Е.В., Машкина Е.В., Нескубина О.М. Исследование ассоциации полиморфизмов генов с развитием атеросклероза в Ростовской популяции. Генетика – фундаментальная основа инноваций в медицине и селекции, Материалы научно-практической конференции с международным участием «Генетика – фундаментальная основа инноваций в медицине и селекции», Ростов-на-Дону, 2-4 ноября 2017 г. - с.133-134 (год публикации - 2017)
11. Деревянчук Е.Г., Бутенко Е.В., Шкурат Т.П. SERPINE1 gene polymorphic variant in the predisposition to cardiovascular diseases European Journal of Human Genetics, - (год публикации - 2017)
12. Рыжкова А., Сазонова М., Синев В., Галицына Е., Мельниченко А., Демакова Н., Собенин И., Шкурат Т., Орехов А. Mito-SNP in mitochondrial cytopathies. Atherosclerosis, 263(8):e280. (год публикации - 2017) https://doi.org/10.1016/j.atherosclerosis.2017.06.904
13. Сазонова М.А., Синев В.В., Рыжкова А.И., Галицына Е.В., Мельниченко А.А., Демакова Н.А., Бобрышев Ю.В., Шкурат Т.П., Орехов А.Н. Ultrastructural analysis of mitochondrial cristae in leukocytes of patients with atherosclerosis. Atherosclerosis, 263(8):e280-e282. (год публикации - 2017) https://doi.org/10.1016/j.atherosclerosis.2017.06.906
14. Тимофеева С., Бутенко Е., Романов Д., Шкурат Т. Oxidative stress and inflammation response genes in miRNA-mediated mitochondrial and nuclear genome crosstalk associated with cardio-vascular diseases. Atherosclerosis, 263(8):e202. (год публикации - 2017) https://doi.org/10.1016/j.atherosclerosis.2017.06.653
15. Тимофеева С.В., Бутенко Е.В. Оценка вклада полиморфных вариантов генов PON1 и EDN1 в развитие сердечно-сосудистых заболеваний Сборник тезисов XXIV Международной научной конференции студентов, аспирантов и молодых ученых "Ломоносов - 2017", Материалы Международного молодежного научного форума «ЛОМОНОСОВ-2017» / Отв. ред. И.А. Алешковский, А.В. Андриянов, Е.А. Антипов. [Электронный ресурс] — М.: МАКС Пресс, 2017. — 1 электрон. опт. диск (год публикации - 2017)
16. Тимофеева С.В., Бутенко Е.В., Деревянчук Е.Г., Нескубина О.М., Шкурат Т.П. Genetic effects of PPARG1C and TNF1 gene variants related to cardiovascular disorders European Journal of Human Genetics, - (год публикации - 2017)
17. Тимофеева С.В., Бутенко Е.В., Деревянчук Е.Г., Ребров Ю.А., Шкурат Т.П. Изучение ассоциации гетероплазмии по мутации M13513G>A митохондриального гена MT-ND5 с развитием атеросклероза. Генетика – фундаментальная основа инноваций в медицине и селекции, Мат. научно-практической конференции с международным участием «Генетика – фундаментальная основа инноваций в медицине и селекции», Ростов-на-Дону, 2-4 ноября 2017 г. - с.148-149. (год публикации - 2017)
18. - Естественнонаучное и математическое направление науки и образования сайт Южного федерального университета, - (год публикации - )
Возможность практического использования результатов
Социальная значимость проекта определяется темой исследования и полученными результатами в ходе проекта. Так атеросклеротические поражения артерий представляют собой одну из ведущих патологий системы кровообращения, которая является основной причиной заболеваемости и смертности населения во многих странах мира.
Открытые новые митохондриальные молекулярно-генетические маркеры позволят улучшить диагностику и стать основой для развития инновационных терапевтических подходов. На основе полученных данных будет в дальнейшем подготовлен патент «Способ диагностики развития атеросклероза на основе индивидуальных особенностей мтДНК». Полученные данные могут быть использованы для разработки новых принципов создания клеточных моделей для изучения механизмов и метаболических путей развития патологий, обусловленных повреждениями мтДНК, и развития новых методов генетической диагностики, а также генетической, биологической и лекарственной терапии. Полученные данные имеют высокий потенциал, чтобы достичь успехов в практической медицине для обеспечения экономического роста и социального развития Российской Федерации.