Исследование выполнено при поддержке Российского научного фонда. Результаты опубликованы в журнале Nucleic Acids Research (прим. - Пресс-служба РНФ).
Ученые объединили результаты многочисленных экспериментов, создав первую полную классификацию хроматома - совокупности белков хроматина. Они также проанализировали 3 тыс. белков с помощью суперкомпьютера «МГУ-270». Систематизированные данные были опубликованы на интерактивном веб-ресурсе SimChrom.
«Платформа позволяет изучать локализацию белков внутри ядра, их доменную организацию и функциональную классификацию. Созданная база данных и предложенная система анализа помогают сформировать целостное представление о <…> совокупности всех белков, взаимодействующих с хроматином», - сообщили ТАСС в университете.
Понимание того, как эти белки организуют геном и регулируют активность генов, важно не только для фундаментальной биологии. Нарушения в работе белков хроматина могут приводить к различным заболеваниям, включая онкологические. Поэтому такие исследования могут помочь в поиске молекулярных механизмов болезней и разработке новых подходов к их диагностике и профилактике, считают авторы.
Ученые МГУ также выявили новые свойства белков. Долгое время в биологии считалось, что ключ к пониманию их функций - это четкая трехмерная структура белка. Однако оказалось, что многие из изученных белков, особенно связанные с регуляцией генов, содержат участки без фиксированной формы.
«Такие гибкие фрагменты могут взаимодействовать сразу с несколькими партнерами и образовывать временные молекулярные объединения. Иногда они формируют внутри клетки особые структуры - биомолекулярные конденсаты, напоминающие крошечные "капли", которые помогают организовывать сложные процессы, например, регуляцию транскрипции. Исследование показало, что белки хроматина особенно богаты такими неупорядоченными регионами, что может объяснять их способность участвовать во множестве взаимодействий и тонко настраивать работу генов», - уточнили в вузе.
