КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ
Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.
ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ
Номер проекта 19-15-00055
НазваниеВозникающие вирусы: экология и эволюция
Руководитель Лукашев Александр Николаевич, Доктор медицинских наук
Организация финансирования, регион федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования Первый Московский государственный медицинский университет имени И.М. Сеченова Министерства здравоохранения Российской Федерации (Сеченовский Университет) , г Москва
Конкурс №35 - Конкурс 2019 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами»
Область знания, основной код классификатора 05 - Фундаментальные исследования для медицины; 05-403 - Медицинская микробиология и вирусология
Ключевые слова вирус, арбовирусы, возникающие инфекции, энтеровирус, пикорнавирус, флебовирус
Код ГРНТИ76.03.41
ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ
Аннотация
Проект направлен на изучение различных аспектов появления новых вирусных инфекций. Проблема возникающих заболеваний имеет как фундаментальное, так и важное прикладное значение для профилактической медицины. В последние годы формируется понимание того, что возникающие инфекции - не случайные события, а способ существования вирусов в биосфере. Способность менять хозяев, быстро и эффективно осваивать новые экологические ниши, по всей видимости, практически всегда была одной из важнейших фенотипических характеристик вирусов. Интересно отметить, что этот условный «emergence phenotype» проявляется на самых разных уровнях, от сезонных вспышек конкретных инфекций до возникновения всего многообразия вирусов. В то же время наше понимание динамики популяций вирусов на средне- и долгосрочной временной шкале ограничено из-за того, что практически отсутствуют образцы вирусов старше 50 лет, а 95% вирусов, изученных в 20 веке, были выделены от человека и домашних животных. Более того, почти все изоляты для ряда вирусов были выделены исключительно на территории развитых стран в то время, как, например, Африка и Центральная Азия остаются практически неисследованными. При этом существуют свидетельства того, что популяция вирусов как в пределах одного носителя, так и в пределах всей занимаемой экологической ниши в биосфере является намного более динамичной, чем считалось ранее. Данный проект направлен на изучение экологических, популяционных и генетических закономерностей, связанных с возникновением новых вирусов на разных уровнях, от сезонных изменений в популяции вирусов человека до передачи вирусов между млекопитающими, насекомыми и растениями. В настоящее время в мире ведется достаточно много подобных работ. Научная новизна данного проекта будет обеспечена комплексностью подхода (биоинформатический, эпидемиологический, экспериментальный, экологический), использованием высокопроизводительных биоинформатических инструментов собственной разработки для автоматизации анализа, опытом публикации многочисленных статей в журналах первого квартиля по тематике проекта, сотрудничеством с одной из ведущих групп в мире (Институт Вирусологии, университет Шарите, Берлин).
ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ
Публикации
1.
Вакуленко Ю.А., Девяткин А.А., Лукашев А.Н.
The Effect of Sample Bias and Experimental Artefacts on the Statistical Phylogenetic Analysis of Picornaviruses.
Viruses, 6;11(11). pii: E1032 (год публикации - 2019)
10.3390/v11111032
2.
Вакуленко Ю.А., Девяткин А.А., Лукашев А.Н.
Using Statistical Phylogenetics for Investigation of Enterovirus 71 Genotype A Reintroduction into Circulation
Viruses, 25;11(10). pii: E895 (год публикации - 2019)
10.3390/v11100895
3.
Климентов А.С., Белова О.А., ..., Пиликова О.М., Полиенко А.Е., Пурмак К.А., Романенко Е.Н., Романова Л.И., Сарыглар А.А., Соломащенко Н.И., Шамсутдинов А.Ф., Вакалова Е.В., Лукашев А.Н., Карганова Г. Г., Гмыль А.П.
Phlebovirus sequences detected in ticks collected in Russia: Novel phleboviruses, distinguishing criteria and high tick specificity
Infection, Genetics and Evolution, 3:104524 (год публикации - 2020)
10.1016/j.meegid.2020.104524
4. Серен Симсек, Виктор Корман, Герман Эверлинг, Александр Лукашев.. Кристиан Дростен, Ян Дрекслер, Джелле Матейнссенс At least seven distinct rotavirus genotype constellations in bats with evidence of reassortment and zoonotic transmissions MBio (год публикации - 2021)
5.
Девяткин АА, Вакуленко ЮА, Дашьян МА, Лукашев АН.
Evaluating the Impact of Anthropogenic Factors on the Dissemination of Contemporary Cosmopolitan, Arctic, and Arctic-like Rabies Viruses
Viruses, 14(1):66 (год публикации - 2021)
10.3390/v14010066
Публикации
1.
Вакуленко Ю.А., Девяткин А.А., Лукашев А.Н.
The Effect of Sample Bias and Experimental Artefacts on the Statistical Phylogenetic Analysis of Picornaviruses.
Viruses, 6;11(11). pii: E1032 (год публикации - 2019)
10.3390/v11111032
2.
Вакуленко Ю.А., Девяткин А.А., Лукашев А.Н.
Using Statistical Phylogenetics for Investigation of Enterovirus 71 Genotype A Reintroduction into Circulation
Viruses, 25;11(10). pii: E895 (год публикации - 2019)
10.3390/v11100895
3.
Климентов А.С., Белова О.А., ..., Пиликова О.М., Полиенко А.Е., Пурмак К.А., Романенко Е.Н., Романова Л.И., Сарыглар А.А., Соломащенко Н.И., Шамсутдинов А.Ф., Вакалова Е.В., Лукашев А.Н., Карганова Г. Г., Гмыль А.П.
Phlebovirus sequences detected in ticks collected in Russia: Novel phleboviruses, distinguishing criteria and high tick specificity
Infection, Genetics and Evolution, 3:104524 (год публикации - 2020)
10.1016/j.meegid.2020.104524
4. Серен Симсек, Виктор Корман, Герман Эверлинг, Александр Лукашев.. Кристиан Дростен, Ян Дрекслер, Джелле Матейнссенс At least seven distinct rotavirus genotype constellations in bats with evidence of reassortment and zoonotic transmissions MBio (год публикации - 2021)
5.
Девяткин АА, Вакуленко ЮА, Дашьян МА, Лукашев АН.
Evaluating the Impact of Anthropogenic Factors on the Dissemination of Contemporary Cosmopolitan, Arctic, and Arctic-like Rabies Viruses
Viruses, 14(1):66 (год публикации - 2021)
10.3390/v14010066
Публикации
1.
Вакуленко Ю.А., Девяткин А.А., Лукашев А.Н.
The Effect of Sample Bias and Experimental Artefacts on the Statistical Phylogenetic Analysis of Picornaviruses.
Viruses, 6;11(11). pii: E1032 (год публикации - 2019)
10.3390/v11111032
2.
Вакуленко Ю.А., Девяткин А.А., Лукашев А.Н.
Using Statistical Phylogenetics for Investigation of Enterovirus 71 Genotype A Reintroduction into Circulation
Viruses, 25;11(10). pii: E895 (год публикации - 2019)
10.3390/v11100895
3.
Климентов А.С., Белова О.А., ..., Пиликова О.М., Полиенко А.Е., Пурмак К.А., Романенко Е.Н., Романова Л.И., Сарыглар А.А., Соломащенко Н.И., Шамсутдинов А.Ф., Вакалова Е.В., Лукашев А.Н., Карганова Г. Г., Гмыль А.П.
Phlebovirus sequences detected in ticks collected in Russia: Novel phleboviruses, distinguishing criteria and high tick specificity
Infection, Genetics and Evolution, 3:104524 (год публикации - 2020)
10.1016/j.meegid.2020.104524
4. Серен Симсек, Виктор Корман, Герман Эверлинг, Александр Лукашев.. Кристиан Дростен, Ян Дрекслер, Джелле Матейнссенс At least seven distinct rotavirus genotype constellations in bats with evidence of reassortment and zoonotic transmissions MBio (год публикации - 2021)
5.
Девяткин АА, Вакуленко ЮА, Дашьян МА, Лукашев АН.
Evaluating the Impact of Anthropogenic Factors on the Dissemination of Contemporary Cosmopolitan, Arctic, and Arctic-like Rabies Viruses
Viruses, 14(1):66 (год публикации - 2021)
10.3390/v14010066