Роль вторичной структуры РНК геномного сегмента NS вируса гриппа А в его жизнеспособности и патогенности

КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ

Номер проекта 18-74-00130

НазваниеРоль вторичной структуры РНК геномного сегмента NS вируса гриппа А в его жизнеспособности и патогенности

Руководитель Сергеева Мария Валерьевна, Кандидат биологических наук

Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное учреждение "Научно-исследовательский институт гриппа имени А.А. Смородинцева" Министерства здравоохранения Российской Федерации , г Санкт-Петербург

Конкурс №29 - Конкурс 2018 года по мероприятию «Проведение инициативных исследований молодыми учеными» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными

Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни; 04-110 - Общая и молекулярная микробиология; вирусология

Ключевые слова вирус гриппа А, ген NS, вторичная структура РНК, метод обратной генетики, патогенность

Код ГРНТИ34.15.31

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ

Аннотация
Вирус гриппа представляет собой серьезную угрозу для здоровья человека. Несмотря на значительный прогресс, достигнутый в разработке противовирусных препаратов, вакцин, диагностике и надзоре, вирус гриппа продолжает эволюционировать и вызывать эпидемии. В настоящее время основными мишенями при разработке противовирусных препаратов являются белки, входящие в состав вирусной частицы. Как правило, через некоторое время у вируса вырабатывается резистентность, и препарат становится не эффективен. В настоящее время известно, что элементы вторичной структуры РНК критически важны для жизненного цикла РНК-содержащих вирусов. Структура типа шпильки, расположенная на концевых областях вирионной (-) РНК вируса гриппа играет ключевую роль в успешном узнавании геномных сегментов вирусными белками для их дальнейшей упаковки в капсид. Стабильная шпилька в регионе (497-564) (+) РНК геномного сегмента NS характерна для высокопатогенных вирусов гриппа птиц А(H5N1), в отличии от других менее патогенных вирусов. Таким образом, вторичная структура вирусной РНК не только является актуальным объектом фундаментального исследования, но и в дальнейшем может стать перспективной мишенью противовирусных препаратов нового поколения. Целью данного проекта является исследование роли консервативных вторичных структур в регионах (82-148) и (497-564) (+) РНК геномного сегмента NS в жизненном цикле и патогенности вирусов гриппа А.

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ

Публикации

1. Барановская И.Л., Сергеева М.В., Васин А.В. Influenza A virus NS1 protein expression level depends on NS gene RNA secondary structure FEBS Open Bio. The 44th FEBS Congress (год публикации - 2019)

2. Барановская И.Л., Сергеева М.B., Васин А.В. Вторичная структура РНК генного сегмента NS вируса гриппа А влияет на экспрессию рамок считывания NS1/NEP на ранней стадии вирусной инфекции Материалы XX Зимней молодежной школы ПИЯФ по биофизике и молекулярной биологии, 25 февраля – 2 марта 2019 г., НИЦ «Курчатовский институт» – ПИЯФ, 2019: С. 83-84 (год публикации - 2019)

3. Барановская И.Л., Сергеева М.В., Васин А.В. Influenza A virus NS1 protein expression level depends on NS gene RNA secondary structure FEBS Open Bio, 44th FEBS Congress, From Molecules to Living Systems, Krakow, Poland, July 6‐11, 2019. Vol. 9, N S1, P.162 (год публикации - 2019)
10.1002/2211-5463.12675

4. Барановская И.Л., Сергеева М.В., Васин А.В. Stable hairpin secondary structure in NS gene RNA enhances expression of NS1 in influenza infected cells OPTIONS X for the Control of Influenza. Abstracts, International Society for Influenza and Other Respiratory Virus Diseases. OPTIONS X for the Control of Influenza abstracts. P 284. (год публикации - 2019)

5. Барановская И., Сергеева М., Фадеев А., Кадырова Р., Иванова А., Рэмзи Э., Васин А. Changes in RNA secondary structure affect NS1 protein expression during early stage influenza virus infection Virology Journal, Vol. 16, Article number: 162 (год публикации - 2020)
10.1186/s12985-019-1271-0

6. Барановская И.Л., Сергеева М.B., Васин А.В. Репродуктивные свойства вирусов гриппа А с различной вторичной структурой РНК гена NS в живых системах Материалы ХХI Зимней молодежной школы ПИЯФ по биофизике и молекулярной биологии, Том 2. Тезисы докладов молодежной конференции. - Гатчина.: Изд-во НИЦ «Курчатовский институт» – ПИЯФ, 2020. - С. 16-17. (год публикации - 2020)

Публикации