КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер проекта 24-74-10020

НазваниеСтруктурно-функциональный базис полифармакологии и онкодрайверной конститутивной активности лейкотриеновых рецепторов

Руководитель Лугинина Александра Павловна, Кандидат физико-математических наук

Организация финансирования, регион федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Московский физико-технический институт (национальный исследовательский университет)" , г Москва

Конкурс №98 - Конкурс 2024 года «Проведение исследований научными группами под руководством молодых ученых» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными

Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни; 04-202 - Протеомика; структура и функции белков

Ключевые слова Структурная биология; GPCR рецепторы; фармакология; рентгеновская кристаллография; селективность лигандов; онкогенный однонуклеотидный полиморфизм; биофизические исследования

Код ГРНТИ34.15.15


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Цистеинил-лейкотриеновые рецепторы CysLT1R и CysLT2R относятся к суперсемейству рецепторов, сопряженных с G-белком (GPCR), и являются активными участниками воспалительных процессов. Селективные антагонисты CysLT1R - зафирлукаст, монтелукаст и пранлукаст - активно рекомендуются медиками при лечении таких заболеваний, как астма, аллергический ринит и крапивница. Однако данные препараты обладают рядом психоневрологических и гастроэнтерологических побочных эффектов, а также в ряде случаев показали свою неэффективность. Рецептор второго подтипа (CysLT2R) является менее изученным и на современном фармакологическом рынке не существует препаратов, действующих на данный белок. CysLT2R участвует в развитии сердечно-сосудистых и нейродегенеративных заболеваний, а также было показано, что в различных видах рака повышенная экспрессия CysLT1R и CysLT2R оказывает противоположный эффект. Таким образом, исследования селективности ортостерических карманов связывания с лигандами являются актуальной задачей для современной биомедицины. Однонуклеотидный полиморфизм (мутация L129Q, приводящая к конституитивной активации CysLT2R), является редким генетическим заболеванием и вызывает неизлечимую в настоящее время увеальную меланому. Таким образом, разработка обратных агонистов, активных в отношении данной мутантной формы GPCR, позволит справиться с данным орфанным заболеванием с использованием подхода персонализованной медицины. Поэтому целью данного проекта является получение методом рентгеновской кристаллографии пространственных структур CysLT1R и CysLT2R с дуальным неселективным антагонистом, что позволит выявить участки сайта связывания лиганда, отвечающие за селективность к подтипам рецепторов. Кроме того, планируется получение пространственной структуры CysLT2R L129Q формы для изучения влияния данной мутации на механизм активации рецептора и, в частности, на лиганд-связывающий карман. Рецепторы, сопряженные с G-белком, являются крайне сложными объектами исследования, в силу своей амфифильной природы, низкой стабильности и природного уровня экспрессии, и в то же время - важнейшими мишенями для фармакологической промышленности (около 40% препаратов нацелены на эту группу белков), а структурная биология - важнейшим инструментом для современной и рациональной разработки лекарств. Таким образом, структурные исследования подтип-специфичной селективности и влияния онкогенной мутации для цистеинил-лейкотриеновых рецепторов являются важной и актуальной биомедицинской задачей, а также развитием высокотехнологичной персонализованной медицины в Российской Федерации и относятся к передовым проектам мирового уровня, что планируется продемонстрировать в итоговых публикациях. Для выполнения проекта командой из молодых и опытных сотрудников МФТИ, обладающей богатым научным заделом по проекту, планируется использование подходов рациональной разработки стабилизирующих мутаций и генной инженерии, бакуловирусной экспрессии, очистки белков и биофизической охарактеризации белков и их комплексов, а также структурных методов, таких как рентгеновская кристаллография и крио-электронная микроскопия.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2025 году
В результате реализации проекта за отчетный период (первый год выполнения) был проведён анализ литературных данных, что позволило уточнить стратегию продвижения в экспериментальной работе, а также сформирована материальная база для старта проекта. Кроме того, была получена биомасса цистеинил-лейкотриеновых рецепторов первого и второго типа (кристаллизационные конструкции с внесенными стабилизирующими модификациями, известные из ранее опубликованных работ), очищены и охарактеризованы белковые препараты: белки в комплексе с дуальным лигандом показали достаточную стабильность и монодисперсность. Для комплексов CysLT1R-ONO2580366 и CysLT2R-ONO2580366 получены пробные кристаллы, определены стартовые условия преципитантов-осадителей. Для онкогенного варианта L129Q CysLR2R был успешно проведён скрининг стабилизирующих мутаций, не затрагивающих область, сопряжённую со 129 аминокислотой, и предсказанных при помощи программного обеспечения CompoMug. Обнаружены мутации и их комбинации, способствующие продуктивной экспрессии и очистке стабильного и монодисперсного белкового препарата. Наилучшие результаты показали комбинации из трёх мутаций. Таким образом, проект реализуется, согласно плану-графику, указанному в заявке.

 

Публикации

1. Сафронова Н.А., Лугинина А.П., Садова А.А., Шевцов М.Б., Моисеева О.В., Борщевский В.И., Мишин А.В. Дизайн генно-инженерных конструкций, выделение и очистка мономерной формы рецептора GPR17 класса GPCR для структурно-функциональных исследований Биоорганическая химия, Том 51, выпуск № 1 (2025), стр. 82-93 (год публикации - 2025)
https://doi.org/10.31857/S0132342325010086

2. Дашевский Д.Е., Лугинина А.П., Маслов И., Шевелёва М., Хорн П.А., Дмитриева Д., Капранов И., Белоусов А., Пермяков С., Черезов В.Г., Борщевский В.И., Мишин А.В. Unlocking GPCR-ligand interactions: Measuring binding affinities with thermal shift assay Protein Science, Том 35, выпуск 5, e70120 (год публикации - 2025)
https://doi.org/10.1002/pro.70120