Многогранная адаптация микобактерий туберкулеза к антибиотикам нового поколения на популяционном и индивидуальном уровнях и влияние на трансмиссию

КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ

Номер проекта 24-44-00004

НазваниеМногогранная адаптация микобактерий туберкулеза к антибиотикам нового поколения на популяционном и индивидуальном уровнях и влияние на трансмиссию

Руководитель Мокроусов Игорь Владиславович, Доктор биологических наук

Организация финансирования, регион Федеральное бюджетное учреждение науки "Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии им. Пастера" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека , г Санкт-Петербург

Конкурс №86 - Конкурс 2023 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований международными научными коллективами» (NSFC)

Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни; 04-201 - Структурная, функциональная и эволюционная геномика

Ключевые слова Mycobacterium tuberculosis; лекарственная устойчивость; эволюция; молекулярная эпидемиология; филогеномика; филогеография; мутагенез; вирулентность; мышиная модель

Код ГРНТИ34.27.00

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ

Аннотация
Китай и Россия являются странами с высоким бременем лекарственно-устойчивого туберкулеза (ТБ) и большим разнообразием штаммов Mycobacterium tuberculosis. Обе страны оказывают значительное влияние на глобальное здравоохранение и экономику, и обе характеризуются тревожным появлением штаммов M.tuberculosis, устойчивых к препаратам нового поколения, и их активной циркуляцией. Основной целью данного проекта является изучение механизмов адаптации M. tuberculosis к противотуберкулезным препаратам нового поколения на популяционном и индивидуальном уровнях в России и Китае, получение новых знаний об эпистатической компенсаторной эволюции лекарственной устойчивости, приводящей к усилению распространения наиболее опасных эпидемически и активно передающихся штаммов M. tuberculosis, несущих мутации с минимальным или нулевым влиянием на жизнеспособность. Мы используем популяционные коллекции M. tuberculosis и серийные изоляты, выделенные от пациентов во время лечения. Полногеномное секвенирование штаммов, включая in vitro мутагенез, метагеномный анализ, и эксперимент на мышиных моделях in vivo позволят получить глубокие фундаментальные знания о молекулярных механизмах устойчивости к противотуберкулезным препаратам нового поколения (новым фторхинолонам, бедаквилину, линезолиду и другим). Мы исследуем, существует ли разница в способности к передаче между штаммами с различными мутациями, связанными с устойчивостью, и принадлежностью штамма к филогенетической линии/сублинии. Будет исследована роль как основных, так и потенциально недооцененных менее частых мутаций в фенотипе резистентности, включая сниженную резистентность. Также будет оцениваться явление побочной лекарственной чувствительности, т. е. корреляция между повышением устойчивости к одним антибиотикам и в то же время повышением чувствительности к другим. Эта информация будет применена для разработки новых схем противотуберкулезного лечения. Выделение клинически значимых и активно трансмиссивных кластеров резистентных штаммов и разработка методов их выявления будут рекомендованы для внедрения в местные и национальные программы борьбы с туберкулезом и эпидемиологического надзора. Это исследование внесет важный вклад в одобренное ВОЗ внедрение геномной тестирования резистентности M. tuberculosis в клиническую практику, включая признание роли эпистатического взаимодействия мутаций резистентности и компенсаторных мутаций и их влияния на жизнеспособность штаммов и их трансмиссию в России и Китае. В заключение, этот проект на пересечении взаимосвязанных областей медицинской микробиологии, молекулярной генетики, молекулярной эпидемиологии и эволюционной генетики в двух странах с высоким бременем туберкулеза будет иметь результаты имеющие международный приоритет и новизну которые приблизят к пониманию эволюции M. tuberculosis и его ко-адаптации с человеческой популяцией, позволят адекватно понять молекулярную основу устойчивости к противотуберкулезным препаратам нового поколения, оценить риск резистентности M.tuberculosis, обеспечить информированный выборе адекватной схемы комплексной химиотерапии на уровне пациента, разработать и внедрить современные меры эпидемиологического надзора.

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ

Аннотация результатов, полученных в 2024 году
В 2024 году проводились исследования по нескольким взаимосвязанным направлениям согласно целям проекта, кратко описанным ниже. МОЛЕКУЛЯРНО-ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ПОПУЛЯЦИИ MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS В ОМСКОЙ ОБЛАСТИ ЗАПАДНОЙ СИБИРИ Выполнен анализ данных молекулярно-генетического мониторинга за два периода наблюдения в Омской области (2021-2022) для понимания разнообразия и распространения штаммов, а также для подготовки к анализу новых штаммов, полученных в 2024 году. Изучено 219 штаммов от впервые выявленных больных туберкулезом легких. В структуре популяции M. tuberculosis 2021-2022 гг. преобладали штаммы генетического семейства Beijing 66% (144/219) и были преимущественно представлены двумя основными субтипами: B0/W148 - 27,8% (40/144) и Central Asian/Russian - 61,8% (89/144). В структуре Central Asian/Russian выявлено 9 (4,1% во всей коллекции) штаммов субтипа Central Asian Outbreak (CAO). 11 (4,8%) штаммов было отнесено к древней сублинии генотипа Beijing. Остальные штаммы M. tuberculosis принадлежали к различным генетическим семействам Евро-Американской линии (L4). За пятилетний период в структуре популяции M. tuberculosis в Омской области уменьшилась в 2 раза доля штаммов древней сублинии Beijing. Таким образом, в Омской области преобладают штаммы субтипов Central Asian/Russian (МЛУ 30,3%) и B0/W148 (МЛУ 82,5%) генотипа Beijing (L2). Доля штаммов Central Asia Outbreak Beijing в Омской области остается незначительной (4%), несмотря на доминирование штаммов данного субтипа в Северном Казахстане (64%). Штаммы генотипа Beijing B0/W148 продолжают играть ключевую роль в распространении туберкулеза с множественной лекарственной устойчивостью в Омской области, как и в России в целом. ФОРМИРОВАНИЕ НОВОЙ КОЛЛЕКЦИИ ШТАММОВ И ДНК M. TUBERCULOSIS В ОМСКОЙ ОБЛАСТИ в 2024 г. В 2024 Отобрано 239 культур от впервые выявленных больных, которые были идентифицированы как M. tuberculosis. Для всех культур была определена чувствительность к противотуберкулезным препаратам. Из 239 человек 109 пациентов получали новые ПТП препараты (Lfx, Mfx, Lzd, Bq) в различных комбинациях. От этих пациентов в дальнейшем отбирали культуры для коллекции серийных изолятов. Описание коллекции серийных изолятов. В настоящее время было отобрано 25 вторичных 6 третьих 2 четвертых 1 пятая культур M. tuberculosis от пациентов, которые получали новые ПТП препараты (Lfx, Mfx, Lzd, Bq) в различных комбинациях. Проведено полногеномное секвенирование 96 лекарственно-устойчивых и чувствительных штаммов M. tuberculosis из Омской области. В настоящее время проведится биоинформатический анализ геномов данных штаммов. ХАРАКТЕРИСТИКА ГЕНЕТИКИ УСТОЙЧИВОСТИ К ФТОРХИНОЛОНАМ M. TUBERCULOSIS В ЗАПАДНОЙ СИБИРИ И НА СЕВЕРО-ЗАПАДЕ РОССИИ Изучено 80 (13,1%) (фенотипически пре-ШЛУ) из 613 штаммов M. tuberculosis, выделенных с января 2019 г. по декабрь 2022 г. от впервые выявленных больных туберкулезом легких, проживающих в Омске и Омской области. Коллекция для сравнения включала 40 устойчивых к офлоксацину из 599 штаммов M. tuberculosis, выделенных в 2015-2019 гг. от впервые выявленных больных туберкулезом в регионах Северо-Запада России. Из 613 изолятов одновременную фенотипическую устойчивость к рифампицину, изониазиду и фторхинолонам, т.е. пре-ШЛУ, выявили у 80 (13,1%) штаммов. Все пре-ШЛУ штаммы имели мутации в генах katG, rpoB и gyrA. У 98,8% (79/80) пре-ШЛУ штаммов устойчивость к рифампицину была обусловлена заменой rpoB Ser531Leu, устойчивость к изониазиду – заменой katG Ser315Thr, причем у 20% (16/80) штаммов обнаружена дополнительная мутация в гене inhA(-15)T; один штамм характеризовался мутациями katG Ser315Thr, rpoB His526Asn. Наиболее часто среди мутаций, ассоциированных с устойчивостью к фторхинолонам, выявляли gyrA Asp94Gly (54; 67.5%) и Ala90Val (13; 16.3%). Сравнение полученных результатов по Западной Сибири и Северо-Западу России показало, что у штаммов M. tuberculosis двух изученных регионах наиболее частыми мутации были gyrA Asp94Gly и Ala90Val. В Западной Сибири большинство пре-ШЛУ штаммов относились к семейству Beijing (74; 92,5%). Основными подтипами Beijing были Central Asian/Russian (23; 28,8%) и российский эпидемический субтип B0/W148 (42; 52,5%). Сравнение структуры генотипов офлоксацин-устойчивых штаммов M. tuberculosis с ранее полученными аналогичными данными по Северо-Западу России (2015-2019 гг.) не выявило значимых различий между регионами (p>0,05). Доля пре-ШЛУ штаммов устойчивых к канамицину и амикацину субтипа Beijing B0/W148 была незначительно больше, чем субтипа Central Asian/Russian (52,3% против 34,8%, p>0,05). Более половины офлоксацин-устойчивых штаммов Beijing B0/W148 (31/42) и Central Asian/Russian (17/23) имели мутацию Asp94Gly. Таким образом, в изученной выборке штаммов M. tuberculosis из различных регионов России первичная резистентность к фторхинолонам составляла 6,7% - 13,1% в общей популяции, и была обусловлена преимущественно мутациями Asp94Gly и Ala90Val в гене gyrA. Наибольшая доля резистентных к фторхинолонам штаммов M. tuberculosis представлена генотипом Beijing B0/W148, который также характеризуется высоким уровнем устойчивости к другим препаратам второго ряда. АДАПТАЦИЯ M. TUBERCULOSIS К ПРОИЗВОДНОМУ АРОИЛГИДРАЗОНА IN VITRO И ВОЗМОЖНАЯ РОЛЬ ГЕНА Rv3755c В последние годы было разработано много производных гидразида-гидразона с антимикобактериальной активностью, и было показано, что они в три-четыре раза эффективнее изониазида (Angelova 2022 и приведенные там ссылки). Целью работы была оценка ответа M. tuberculosis на действие нового производного ароилгидразона с использованием метода мутагенеза ин витро. Ранее было описано соединение – производное ароилгидразона N’-[(E)-(5-methoxy-1H-indol-3-yl)methylidene]furan-2- carbohydrazide (Angelova et al., 2019). В MLT_FUR-устойчивом клоне 3bgm/MLT была обнаружена 1 мутация – несинонимичный SNP в геномной позиции 4201587 T>C гене Rv3755c в позиции 302 A>G (кодон 101H>R CAC-CGC). Rv3755c расположен в сети генов, включающей и несколько генов ABC-транспортеров. Ранее был описан штамм с мутацией в Rv3755 который характеризовался медленным ростом при исследовании с помощью мутагенеза транспозона на основе Himar1 в штамме H37Rv (Sassetti et al., 2003). В этой связи можно отметить, что одной из ключевых реакций M. tuberculosis на давление препарата является именно снижение скорости роста (Safi et al., 2019). Таким образом, мутация в гене Rv3755c, обнаруженная в клоне M. tuberculosis устойчивом к повышенной концентрации соединения - производного ароилгидразона может быть связана с бактериальной адаптацией к селективному давлению данного соединения и отражать проявление неспецифического механизма толерантности. Консервативный белок Rv3755c, функция которого в настоящее время неизвестна, может быть связан с системой активного выброса белков ABC-транспортеров.

Публикации

1. Сергеев Г.М., Вязовая А.А., Полев Д.Е., Мокроусов И.В. Comparison of Bioinformatics Programs for Solving a Number of Current Tasks in Mycobacterium tuberculosis Genomic Epidemiology IV МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ ГЕНОМИКА, МЕТАГЕНОМИКА И МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОЛОГИЯ МИКРООРГАНИЗМОВ. Сколково, Москва 25-27 октября 2025 года, С.51-53 (год публикации - 2025)

2. Мокроусов И. Genetics of Mycobacterium tuberculosis adaptation to selective pressure of antibiotics and potential anti-TB compounds Abstract book, XII Meeting of the Latin American Society of Tuberculosis and Other Mycobacteriosis, November 19 to 21, 2025, Montevideo, Uruguay, P. 15 (год публикации - 2025)

3. Вязовая А.А., Соловьева Н.С., Герасимова А.А., Журавлев В.Ю., Мокроусов И.В. Молекулярная характеристика фторхинолон-устойчивых штаммов Mycobacterium tuberculosis от впервые выявленных больных туберкулезом на Северо-Западе России Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии, 101(3):342–350. (год публикации - 2024)
10.36233/0372-9311-510

4. Костюкова И.В., Вязовая А.А., Пасечник О.А., Мокроусов И.В. Молекулярно-генетическая характеристика мультирезистентных штаммов M. tuberculosis в Омской области Журнал инфектологии, Т. 16, № 2, Приложение 2, С. 59 (год публикации - 2024)

5. Вязовая А., Костюкова И., Терентьева Д., Герасимова А., Пасечник О., Мокроусов И. Molecular epidemiology of TB in area with high burden of HIV in West Siberia, Russia International Journal of Tuberculosis and Lung Disease, 28 (11), S654 (год публикации - 2024)

6. Вязовая А.А., Костюкова И.В., Терентьева Д.Р., Найзабаева Д.А., Мальцева Э.Р., Пасечник О.А., Скиба Ю.А., Мокроусов И.В. Структура генотипов микобактерий туберкулеза в Омской области - регионе приграничным с Казахстаном Eurasian Journal of Applied Biotechnology, № 3S, С. 23 (год публикации - 2024)

7. Мокроусов И., Виноградова Т., Вязовая А., Догонадзе М., Герасимова А., Журавлев В. Epidemic and endemic M. tuberculosis strains: How pathobiology is shaping their spread International Journal of Tuberculosis and Lung Disease, 28 (11), S173-S174 (год публикации - 2024)

8. Мокроусов И., Ангелова В.Т., Славчев И., Безручко М.В., Димитров С., Полев Д.Е., Добриков Г.М., Вылчева В. Genomic Insight into Primary Adaptation of Mycobacterium tuberculosis to Aroylhydrazones and Nitrofuroylamides In Vitro Antibiotics (Basel), 14(3):225 (год публикации - 2025)
10.3390/antibiotics14030225

9. Мокроусов И.В., Ангелова В.Т., Полев Д.Е., Вылчева В. Первичная адаптация Mycobacterium tuberculosis in vitro к действию ароилгидразонов 5-й Российский микробиологический конгресс : сборник тезисов докладов ; Волгоград, 29 сентября – 3 октября 2025 г. / под ред. Д. А. Бабкова. – Волгоград : Библиотечно-издательский центр ВолгГМУ, 2025, С. 248-249 (год публикации - 2025)

10. Герасимова А.А., Вязовая А.А., Майская М.Ю. Структура сопутствующих инфекционных заболеваний у больных ВИЧ-ассоциированным туберкулезом Бюллетень Северного Государственного Медицинского Университета, Т. 52, Номер 1, С. 296-298 (год публикации - 2025)

11. Сергеев Г.М., Костюкова И.В., Безручко М.В., Пасечник О.А., Мокроусов И.В., Вязовая А.А. Геномный анализ штаммов Mycobacterium tuberculosis с пред-широкой и широкой лекарственной устойчивостью в Омской области Фундаментальные и прикладные аспекты современной эпидемиологии и инфекционных болезней: Сборник тезисов Межрегиональной научно-практической конференции, посвящённой 125-летию создания ФБУН «Казанский научно-исследовательский институт эпидемиологии и микробиологии» Роспотребнадзора (5–6 июня 2025 года) / под ред. академика РАН, профессора, д.м.н. В.Г. Акимкина и к.м.н. И.Д. Решетниковой. Казань: ФБУН КНИИЭМ Роспотребнадзора, ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, 2025, С. 127-128 (год публикации - 2025)

12. Вязовая А.А., Сергеев Г.М., Васильева Н.Р., Безручко М.В., Соловьева Н.С., Журавлев В.Ю., Мокроусов И.В. Спектр мутаций, ассоциированных с устойчивостью к бедаквилину и линезолиду Mycobacterium tuberculosis в России Журнал инфектологии, Приложение 1, Т. 17, № 3, С. 42 (год публикации - 2025)

13. Костюкова И.В., Вязовая А.А., Пасечник О.А., Мокроусов И.В. Оценка эпидемиологических проявлений туберкулеза и генетического разнообразия штаммов Мycobacterium tuberculosis с множественной лекарственной устойчивостью в Омской области Эпидемиология и вакцинопрофилактика, 24(2):66-73 (год публикации - 2025)
10.31631/2073-3046-2025-24-2-66-73

14. Вылчева В., Милева М., Догонадзе М., Добрева А., Мокроусов И. Antimycobacterial Activity of Essential Oils from Bulgarian Rosa Species Against Phylogenomically Different Mycobacterium tuberculosis Strains Pharmaceutics, 16(11):1393 (год публикации - 2024)
10.3390/pharmaceutics16111393

15. Виноградова Т., Заболотных Н., Догонадзе М., Дьякова М., Эсмедляева Д., Витовская М., Рубцова О., Вязовая А., Герасимова А., Ариэль Б., Мокроусов И. Long-term chemotherapy of C57BL/6 mice infected with epidemiologically important Mycobacterium tuberculosis strains and molecular insight into host-pathogen interplay Microbial Pathogenesis, 207:107919 (год публикации - 2025)
10.1016/j.micpath.2025.107919

16. Костюкова И.В., Вязовая А.А., Пасечник О.А., Мокроусов И.В. Характеристика лекарственной устойчивости штаммов M.tuberculosis non-Beijing генотипов в Омской области Журнал инфектологии, Т. 17, №2, ПРИЛОЖЕНИЕ 1, С. 49-50. (год публикации - 2025)

Аннотация результатов, полученных в 2025 году
В 2025 году проводились исследования по нескольким взаимосвязанным направлениям согласно целям проекта, кратко описанным ниже. См также Новости РНФ: https://www.rscf.ru/news/biology/gipervirulentnomu-shtammu-m-tuberculosis-pomogaet-adaptirovatsya-k-antibiotikoterapii-otklyuchenie-f/ https://www.rscf.ru/en/news/biology/eksperimentalnaya-evolyutsiya-vozbuditelya-tuberkuleza-otkryvaet-potentsialnye-mekhanizmy-ustoychivo/ Адаптация M. tuberculosis к новым антибиотикам на популяционном уровне и динамические изменения в распространении эпидемических и эндемических кластеров штаммов. Молекулярно-генетический мониторинг возбудителя туберкулеза в Омской области за 2023–2025 гг. показал, что популяции M. tuberculosis представлена штаммами Восточно-Азиатской (L2) и Евро-Американской (L4) филогенетических линий. Филогенетическое (WGS) древо построено для 178 штаммов M. tuberculosis. Среди штаммов L2 выявлено 6 сублиний, наиболее многочисленными были L2.2.M4.9 – 35,4%, L2.2.M4.5 – 22,5% и L4.3.3 – 15,7%. Мутации в гене rpoC (компенсаторные) выявлены исключительно у МЛУ/пре-ШЛУ штаммов сублиний L2.2.М4.5 (20 из 40; 50%) и L2.2.AA2 (4 из 4; 100%), при этом во всех случаях у этих штаммов присутствовала замена Ser450Leu в гене rpoB. У всех штаммов L2.2.AA2 и у 16 штаммов L2.2.М4.5 в гене rpoC преобладала замена Asp485Asn, у 4 штаммов L2.2.М4.5 обнаружена мутация Leu527Val. Адаптация M. tuberculosis к новым антибиотикам на индивидуальном уровне: геномный анализ серийных изолятов от больных в процессе лечения. В Калининградской области больные МЛУ/пре-ШЛУ/ ШЛУ -ТБ, проходившие лечение с включением в терапию бедаквалина, были инфицированы преимущественно штаммами M. tuberculosis генотипа Beijing (L2.2.1): 66,7% (10/15) - субтип B0/W148 (L2.2.М4.5), 13,3% (2) - субтип Central Asian Russian (CAR) и 10,0% САО (Central Asia Outbreak). Проведен поиск мутаций в генах, ассоциированных с устойчивостью к бедаквилину: mmpR5 (Rv0678), atpE (Rv1305), pepQ (Rv2535c) и Rv1979c. У 22 изолятов M. tuberculosis шести пациентов обнаружены 9 мутаций (несинонимические однонуклеотидные замены, вставки, делеции, дупликация) в генах mmpR5 и atpE. В большинстве случаев имела место гетерорезистентность. У двух пациентов установлено, что мутации устойчивости к бедаквилину возникли в процессе лечения. Предварительное сравнение с нашим данными по 2018-2019 гг по развитию лекарственной устойчивости к бедаквилину [Mokrousov et al., 2021] увеличение доли штаммов с уже приобретенной устойчивостью к бедаквилину то есть активное распространение таких штаммов в популяции. Изучение взаимодействия M. tuberculosis и организма хозяина в модели леченых зараженных мышей: генетические изменения вне мутаций устойчивости. Мутации устойчивости к применявшимся антибиотикам нового поколения не возникли т.к. лечение было непрерывным и адекватным. Анализ всего массива геномных данных в штаммах, выделенных из легких мышей C57BL/6 после 2 и 5,5 месяцев терапии, выявил мутации в двух группах. Гипервирулентному штамму M. tuberculosis Beijing 14717-15 (бурятский субтип) помогает адаптироваться к антибиотикотерапии отключение фермента Tgs3, синтезирующего триацилглицериды: мутация tgs3 138 Q>Stop может способствовать усилению роста этого штамма в легких инфицированных животных в условиях химиотерапии. В одном легочном изоляте низковирулентного штамма LAM 7074 после 6 месяцев химиотерапии была обнаружена значимая мутация в гене оксидоредуктазы Rv1856c. Этот ген необходим для роста на холестерине на этапе персистенции когда штамм начинает использовать холестерин организма хозяина как источник энергии и углерода. В условиях иммунного ответа организма-хозяина разные штаммы используют различные стратегии адаптации, что может привести к отбору полезных мутаций в генах, не имеющих прямого отношения к резистентности. Изучение генетики возможных механизмов устойчивости M. tuberculosis к новым кандидатным противотуберкулезным соединениям ароилгидразонам и нитрофуроиламидам в модели экспериментальной эволюции и отбора спонтанных мутантов. Геномный и биоинформатический анализ, а также сравнение с данными по исходному штамму дикого типа, позволили выявить резистентные клоны M. tuberculosis с мутациями, возникшими при культивировании на средах с повышенными концентрациями ароилгидразонов MLT_FUR, VAL_SNN и нитрофуроиламида DO-209. В одном клоне, устойчивом к MLT_FUR, были обнаружены две мутации: мутация со сдвигом рамки считывания в гене ppgK и несинонимичная мутация в mmpS2. Сдвиг рамки считывания в ppgK привел к инактивации гена. ppgK кодирует полифосфат-глюкокиназу. Это существенный ген, нужен для размножения M. tuberculosis в селезенке мышей C57BL/6J и вероятно, связан с лекарственной толерантностью, вызванной голоданием, и с персистенцией M. tuberculosis у мышей (Block 2023). Несинонимичная замена была обнаружена в гене MmpS2, который может иметь отношение к толерантности. Две мутации в клоне, устойчивом к DO-209, были выявлены в infB и nrdH (категория генов - информационные пути). Ген infB кодирует вероятный фактор инициации трансляции IF-2 (InfB), один из основных компонентов, необходимых для инициации трансляции. Примеры других бактерий (M. smegmatis, E. сoli) показывают его значимость для толерантности к рифампину и повышению толерантности к стрессу. Белок NrdH играет роль в противодействии окислительному стрессу, а нитрофураны входят в число соединений, которые могут вызывать такой стресс у M. tuberculosis и данная мутация может оказывать некоторое влияние на противодействие окислительному стрессу, вызванному действием нитрофуроиламида. Таким образом, кратковременное действие изученных соединений in vitro на медленно растущие M. tuberculosis в основном ведет к появлению и отбору мутаций в разных несвязанных генах, которые создают условия для выживания в условиях внешнего стресса. Первичный ответ M. tuberculosis включает: (1) неспецифические механизмы толерантности (ароилгидразоны и нитрофуроиламиды): системы активного выброса, замедление скорости роста и мелкие колонии, (2) механизмы борьбы с окислительным и нитрозативным стрессом (нитрофураниламиды).

Публикации