КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ

Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.

 

ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ


Номер 18-74-00094

НазваниеНовые производные 8-гидроксихинолина в качестве ингибиторов различных этапов репликации вируса иммунодефицита человека

РуководительСольев Павел Николаевич, Кандидат химических наук

Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук, г Москва

Период выполнения при поддержке РНФ 07.2018 - 06.2020 

Конкурс№29 - Конкурс 2018 года по мероприятию «Проведение инициативных исследований молодыми учеными» Президентской программы исследовательских проектов, реализуемых ведущими учеными, в том числе молодыми учеными.

Область знания, основной код классификатора 04 - Биология и науки о жизни, 04-110 - Общая и молекулярная микробиология; вирусология

Ключевые словавирус иммунодефицита человека, интеграза, сплайсинг, хинолины, клик-реакции

Код ГРНТИ34.25.37


СтатусУспешно завершен


 

ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ


Аннотация
Проект является комплексным фундаментальным исследованием, в качестве объекта исследования которого выбраны новые ингибиторы белка Rev и интегразы вируса иммунодефицита человека (ВИЧ). Возможное наличие сразу нескольких белков-мишеней одного вируса объясняется общим для этих мишеней фармакафором (8-гидроксихинолин) у запланированных соединений. Проект направлен на разработку методов получения и на изучение механизмов действия новых, ранее не синтезированных производных гидроксихинолина – ключевого компонента многих антибиотиков и антивирусных агентов. В отличие от слепого скрининга коммерческих баз данных, направленный синтез позволит выявить возможные пути модификации соединений, изучить взаимодействие с вирусными ферментами-мишенями и предложить новые модификации. В качестве перспективной мишени мы выбрали регуляторный вирусный белок Rev. Производные 8-гидроксихинолина с запланированными в проекте заместителями потенциально могут препятствовать образованию комплекса Rev–пре-мРНК. Такая анти-ВИЧ активность ещё мало изучена, в литературе описано не более десяти структурных примеров ингибиторов данного комплекса. С 2015-го года на клинических испытания находится пока лишь один из этих ингибиторов (ABX464, Франция). В качестве второй мишени предлагается использовать интегразу вируса иммунодефицита, которая является второй по распространенности и эффективности после обратной транскриптазы вируса и необходимой мишенью для коктейля препаратов в составе высокоэффективной антиретровирусной терапии. Кроме того, будет произведена верификация мишени и с помощью других ферментов вируса иммунодефицита человека, в частности, на полимеразной и рибонуклеазной активностях обратной транскриптазы ВИЧ. Новизной в предложенном подходе является функционально-ориентированный синтез хинолиновых производных. Хинолины и гидроксихинолины признаны «привилегированными структурами» в медицинской химии, то есть такими химическими фрагментами, которые могут служить специфическими лигандами для широкого круга биологических мишеней при определённой модификации функциональных групп в молекуле. Помимо этого, «привилегированные структуры» проявляют свойства, необходимые для кандидатов в препараты (абсорбция, растворимость, распределение в тканях организма, выведение, высокое координационное сродство). Скрининговые библиотеки с подобными фрагментами несут потенциал для фармакологических тестирований, сокращая время поиска новых активных соединений. Выявлено, что для оптимального связывания с металлами активных центров белков необходимо замещение по 5 или 7-ому положению 8-гидроксихинолина, при этом 7-ое положение оказывается менее токсичным в отношении неинфицированных клеток человека. В данной работе мы предлагаем использовать современные тенденции зелёной химии, то есть минимального расхода токсичных растворителей и применения «клик»-реакций органического синтеза. «Клик»-реакции обычно проходят с высокими выходами и в мягких условиях, что облегчает создание библиотек субстратов для скрининга активности. Одним из возможных вариантов «клик»-реакций является синтез гидразонов и оксимов. Фрагменты гидразонов и оксимов редко применяются в дизайне фармакологических препаратов, и в то же время они привносят необходимую конформационную жесткость в структуры и обладают достаточной стабильностью к гидролизу при сопряжении с ароматическим кольцом [J. Kalia, R.T. Raines. Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 2008, 47 (39): 7523-7526; M.A. Abdelrahman et al. / European Journal of Medicinal Chemistry, 2017, 138: 698-714]. Описано, что гидразоны проявляют удачные хелаторные свойства по отношению к металл-зависимым вирусным ферментам [Carcelli et al. / Front. Microbiol., 2017, 8: 440]. В данном проекте мы предлагаем модель связывания производных 8-гидроксихинолина с белками ВИЧ. Хелаторные свойства соединения обеспечивают координацию с двумя ионами металлов, что особенно актуально для ферментов обратной транскриптазы (как полимеразного домена, так и РНКазы-Н) и интегразы вируса иммунодефицита, содержащими по два иона магния в активном центре (Рис. 1). Рис. 1. Модель связывания гидразонового производного 8-гидроксихинолина в активном центре белка-мишени (интегразы ВИЧ). Проект предлагает направленный синтез такого типа производных и проверку их биологической активности в отношении ингибирования сплайсинга мРНК вируса иммунодефицита (впервые в России) и ингибирования фермента интегразы вируса иммунодефицита на основе клеточной системы, а также проверку этих соединений и на других мишенях.

Ожидаемые результаты
В ходе выполнения проекта будут получены новые данные в области медицинской химии, а также будут исследованы новые возможности специфического воздействия на ферменты ВИЧ. Запланированный химический синтез включает в себя новую, ранее не опубликованную органическую реакцию, а именно, присоединение эфиров азодикарбоксилатов к 8-гидроксихинолину и некоторым другим соединениям с фенольным фрагментом в ароматическом кольце. Этот метод будет иметь практическое значение, выходящее за рамки данного проекта, для стереоселективного синтеза гидразин-производных 8-гидроксихинолина или фенола (синтетические блоки в медицинской химии и химии красителей и индикаторов); метод является безопасным (в отличие от аминирования гидразином ароматических галогенпроизводных) и соответствующим требованиям «зелёной химии». Предложенное исследование отличается в синтетическом смысле не только новым подходом, но и структурным аспектом. В отличие от наиболее часто синтезируемых 2-замещенных 8-гидроксихинолинов, предлагается синтезировать 7-замещенные 8-гидроксихинолины, которые по расчётам и данным из литературных источников обладают сравнимой комплексообразующей способностью с атомами двухвалентных металлов в активном центре белка [M.A. Abdelrahman et al. / European Journal of Medicinal Chemistry, 2017, 138: 698-714], однако ранее в качестве ингибиторов интегразы тестировались лишь немногие представители этого класса соединений [R. Musiol, Curr. Pharm. Des., 2013, 19 (10): 1835-1849; E.J. Velthuisen et al. / Eur. J. Med. Chem., 2016, 117: 99-112]. Впервые в России будет проведено исследование влияния потенциальных антивирусных агентов на сплайсинг вируса иммунодефицита, а именно, будет проведена количественная оценка экспорта мРНК вируса из клеточного ядра в поздней фазе репликации. Это позволит выявить, является ли какой-либо из белков вируса (ожидается, что таким выступит белок Rev), мишенью для данных структур, или ингибирование затрагивает исключительно консервативную мишень – интегразу. Влияние на сплайсинг является одной из самых горячих тем и новых мишеней в современной медицинской вирусологии. Выявление селективного ингибитора или энхансера этого процесса у ВИЧ позволит нарушить весь каскад созревания вируса, прервать распространение вируса по организму в стадии, когда такой потенциальный препарат был бы назначен пациенту, так как выход новых вирусных частиц из инфицированной клетки для дальнейшего заражения становится невозможным. Таким образом, всё чаще постулируется, что ингибирование сплайсинга пре-мРНК является новым необходимым этапом развития антиретровирусной терапии, позволяющим в будущем существенно снизить частоту возникновения резистентных к препаратам штаммов вируса. Полученные в ходе проекта данные будут отличаться оригинальностью и представлять значение для данной области молекулярной вирусологии и медицинской химии. Следовательно, не только цели и задачи проекта, но и подходы к их решению обладают необходимой научной новизной и актуальностью. Планируется публикация результатов исследований в ведущих международных журналах, относящихся к 1 квартилю в соответствующих областях науки, а также планируется представление результатов на международных и/или всероссийских конференциях.


 

ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ


Аннотация результатов, полученных в 2018 году
Проект является комплексным фундаментальным исследованием, в качестве объекта исследования которого выбраны новые производные 8-гидроксихинолина с потенциальной анти-ВИЧ активностью. Предполагаемыми мишенями соединений являются регуляторный белок Rev и интеграза вируса иммунодефицита. Работа в первый год проекта следовала принципам «зелёной химии», то есть минимального расхода токсичных растворителей и применения «клик»-реакций органического синтеза (проходящих с высокими выходами и в мягких условиях, что облегчает создание библиотек субстратов для скрининга активности). Одним из возможных вариантов «клик»-реакций стал синтез гидразонов на основе 7-гидразино-8-гидроксихинолина. В работе использована новая реакция сочетания эфиров азодикарбоксилатов с фенол-содержащими соединениями. Для получения гидразонов на основе 7-гидразино-8-гидроксихинолина была разработана методика эффективного синтеза их предшественника – ди-трет-бутил 1-(8-гидроксихинолин-7-ил)гидразинил-1,2-дикарбоксилата. На его основе нами были синтезированы запланированные в проекте соединения, параллельно происходило изучение самого процесса образования таких производных и оптимизация условий для повышения выхода. Нами проварьированы температура проведения, растворители, катализаторы, позволяющие увеличить конверсию до 99% на граммовых загрузках. Используемые растворители и катализатор являются общедоступными, а также концепциям «зелёной химии» и исключает примеси соединений переходных металлов. На основе данных 1H и 2H ЯМР спектрометрии нами был предложен механизм превращения и выявлена роль каждого из реагентов. Из ди-трет-бутил 1-(8-гидроксихинолин-7-ил)гидразинил-1,2-дикарбоксилата далее были синтезированы гидразоны. Разработана методика их “one-pot” синтеза, включающая в себя одновременное удаление Boc-зищиты с помощью эфирата трифтористого бора и реакцию in situ образующегося 7-гидразино-8-гидрокисхинолина с ароматическими альдегидами. Со-продукты, образующиеся в ходе реакции, упариваются на вакууме, упрощая трудоемкое выделение целевого продукта хроматографией. Соединения наработаны в количествах, необходимых для биологических испытаний. В результате проведенных исследований был предложен метод синтеза целевых соединений в несколько простых стадий. При этом необходимые заместители в ароматической кольцо гидразона вводятся в соединения в последней стадии синтеза. Вещества были стабильными к химическому гидролизу (моделирующему физиологические условия в организме) на pH от 2 до 8, и в условиях гидролиза в сыворотке крови человека. Синтезированные производные 8-гидроксихинолина не проявляют выраженной токсичности в клетках человека МТ4 и Huh7 (CC50 > 500 мкМ). Существенным ответвлением от плана исследований стал скрининг субстратов для реакции сочетания с азодикарбоксилатами, помимо 8-гидроксихинолина. Была показана возможность проведения гидразосочетания с замещенными 8-гидроксихинолинами, 1-нафтолами и непосредственно с фенолом. На основе последнего, мы предложили и осуществили новую методику получения 4-гидроксифенилгидразина – важного прекурсора в медицинской химии таких популярных препаратов как Индометацин и Базедоксифен. В отличие от промышленно применяемых методов, где выход не превышает 48% при синтезе из фенола и включает в себя минимум 4 стадии, при использовании предложенной нами методики с участием новой реакции удаётся практически удвоить выход до 90% и сократить две стадии синтеза. По совокупности результатов подготовлена заявка на патент РФ и статья.

 

Публикации


Аннотация результатов, полученных в 2019 году
За отчетный год были наработаны производные 7-гидразино-8-гидроксихинолина для биологических испытаний, в том числе ряд был пополнен новыми вещеставми (2,3-диметоксибензилиден-, 4-фторбензилиден-, 2-нитробензилиден-производные и некоторые другие). Выявлены новые данные по возможным побочным процессам, связанные с образованием соединений формазонового типа при избытке замещенных бензальдегидов, в синтезе гидразонов. Изучена стабильность всех новых продуктов в химических средах. Выявлено, что вещества стабильны в условиях pH 2 в течение 6 часов (деградация менее 5%) и в растворах вода-ДМСО более 3 дней (деградация менее 5%). Вещества показали себя стабильными в условиях химического гидролиза на pH от 2 до 8, и в условиях гидролиза в сыворотке крови человека в течение нескольких часов. Проведены цитотоксические испытания на клетках МТ4 и Huh7, показавшие, что синтезированные производные 8-гидроксихинолина не проявляют выраженной токсичности в клетках человека (CC50 > 500 мкМ). Продолжено исследование физико-химических свойств и сольватохромизма соединений. В течение допустимых сроков подготовлена заявка на патент по химическому синтезу производных 7-гидразино-8-гидроксихинолина, заявка подана в ФИПС для рассмотрения и регистрации. Синтезированные вещества были исследованы на предмет биологической активности в отношении интегразы вируса иммунодефицита человека и Ku70 белка человека, как перспективных мишеней для анти-ВИЧ терапии. Среди всех соединений наиболее успешным оказался 7-(4-фторбензилиден)гидразино-8-гидроксихинолин, проявивший активность на обоих белках (IC=20-40 мкМ). В виду того, что описано крайне мало ингибиторов белка Ku, полученные данные представляют большой интерес, а соединения на основе 7-гидразино-8-гидроксихинолина нуждаются в дальнейшем совершенствовании и поиске соединений-лидеров. В ходе диск-агарозной проверки синтезированных в проекте соедиений против отдельных бактерий и грибков 7-(4-фторбензилиден)гидразино-8-гидроксихиноли так же показал наибольший потенциал активности и наибольшую площадь ингибирования роста патогенов на агарозном диске.

 

Публикации

1. Сольев П.Н., Шерман Д.К., Новиков Р.А., Левина Е.А., Кочетков С.Н. Hydrazo coupling: the efficient transition-metal-free C–H functionalization of 8-hydroxyquinoline and phenol through base catalysis Green Chemistry, Green Chemistry, 2019, volume 21 (issue 23): pp. 6381-6389. (год публикации - 2019) https://doi.org/10.1039/C9GC02824B

2. Сольев Павел Николаевич, Шерман Дарья Константиновна, Закирова Наталья Фанисовна, Кочетков Сергей Николаевич Эффективный способ получения производных гидразинофенола -, - (год публикации - )

3. - Открыта новая реакция для получения медицински значимых соединений Газета.Ru (Gazeta.Ru), Интернет-издание "Газета.ru" (Учредитель: АО «Газета.Ру», Свидетельство о регистрации СМИ Эл № ФС77-67642 от 10.11.2016), раздел наука, дата: 21.11.2019, время: 16:37 (год публикации - )

4. - Открыта новая реакция для получения медицински значимых соединений Indicator (Индикатор), Интернет-издание "Indicator" (Учредитель: ООО "Лента.Ру", Свидетельство о регистрации СМИ ЭЛ № ФС 77-68389 от 30.12.2016), раздел "Химия и науки о материалах", дата: 23 ноября, время: 23:57 (год публикации - )

5. - Открыта новая реакция для получения медицински значимых соединений Издательство «ТЕХНОСФЕРА», Рекламно-издательский центр «ТЕХНОСФЕРА» (Учредитель: Издательство "Техносфера", раздел "Новости", дата 26.11.2019) (год публикации - )


Возможность практического использования результатов
Разработанный в ходе выполнения проекта новый метод для получения биологически активных соединений имеет перспективы для синтеза известных препаратов, в полном синтезе которых пристутсвует структура 4-гидроксифенилгидразина. Такими препаратами могут являться, например, Индометацин и Базидоксифен. Разработанный метод повышает выход 4-гидразинофенола почти в два раза по сравнению с текущими применяемыми методами. Способ удобно применим для лабораторий органического синтеза и в медицинской химии. Синтезированные в проекте соединения представляют интерес как ингибиторы ферментов социально-значимых заболеваний, проявляют выраженную активность против возбудителей социально-значимых заболеваний и нуждаются в дальнейшем изучении.