КАРТОЧКА ПРОЕКТА ФУНДАМЕНТАЛЬНЫХ И ПОИСКОВЫХ НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ,
ПОДДЕРЖАННОГО РОССИЙСКИМ НАУЧНЫМ ФОНДОМ
Информация подготовлена на основании данных из Информационно-аналитической системы РНФ, содержательная часть представлена в авторской редакции. Все права принадлежат авторам, использование или перепечатка материалов допустима только с предварительного согласия авторов.
ОБЩИЕ СВЕДЕНИЯ
Номер проекта 17-13-01276
НазваниеМеханизмы избирательного отклика фотоактивных белков и гибридных бионаносистем на их основе
Руководитель Боченкова Анастасия Владимировна, Кандидат физико-математических наук
Организация финансирования, регион Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Московский государственный университет имени M.В.Ломоносова» , г Москва
Конкурс №18 - Конкурс 2017 года «Проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований отдельными научными группами»
Область знания, основной код классификатора 03 - Химия и науки о материалах; 03-504 - Электронно-возбужденные системы, фотохимия, радиационная химия, спиновая химия
Ключевые слова фотохимия, фемтохимия, электронно-возбужденные молекулярные системы, спектроскопия, динамика излучательной и безызлучательной релаксации, квантовая химия, фотоактивные белки, флуоресцентные белки, плазмоника, наноматериалы, нанофотоника, гибридные бионаносистемы, фемтосекундная спектроскопия
Код ГРНТИ31.15.29
ИНФОРМАЦИЯ ИЗ ЗАЯВКИ
Аннотация
Проект направлен на разработку новых подходов к управлению процессами поглощения, преобразования и передачи энергии в фотоактивных белках, в том числе на создание новых гибридных бионаноматериалов на их основе с контролируемым фотооткликом. Актуальность исследования фотохимических и фотофизических процессов, протекающих при электронно-колебательном возбуждении биологических хромофоров и фотоактивных белков, таких как белки зрительной рецепции и флуоресцентные белки, обусловлена их высокой эффективностью и сверхбыстрыми фемтосекундными временами протекания первичных фотоинициируемых реакций. Установление механизмов действия, прогнозирование и оптимизация свойств фотоактивных биосистем с помощью новейших экспериментальных методов фемтосекундной лазерной спектроскопии и современных методов квантовой химии является необходимым для создания на их основе перспективных материалов для нелинейной оптики, оптической микроскопии сверхвысокого разрешения, биосенсорных технологий.
В основе данного проекта лежит тесное сотрудничество экспериментальных и теоретических групп. Результаты междисциплинарного проекта, полученные на стыке физики, химии и биологии, внесут существенный вклад в понимание механизмов действия фотоактивных биосистем. Достижимость решения поставленных задач определяется наличием большого опыта работы коллектива исполнителей в областях фотохимии, биофизики, квантовой химии, фемтосекундной лазерной спектроскопии и наноплазмоники. Впервые будут проведены совместные теоретические и экспериментальные работы по оптимизации условий для избирательного отклика фотоактивных белков при селективном возбуждении определенных колебательных мод. Впервые будут разработаны подходы к управлению откликом фотоактивных белков путем воздействия на них электромагнитными полями резонансно-возбужденных плазмонных наноструктур в гибридных бионаносистемах.
В рамках проекта предполагается дальнейшее развитие неэмпирических методов квантовой химии, таких как инвариантная многоконфигурационная квазивырожденная теория возмущений в варианте RI-XMCQDPT2, для эффективного построения и анализа многомерных поверхностей потенциальной энергии фотоактивных биосистем, в том числе, в областях их квазипересечения. С использованием разрабатываемых квантовохимических методов будет проведено моделирование вибронной структуры оптических спектров и исследованы механизмы электронно-колебательного взаимодействия при фотовозбуждении и дезактивации фотоактивных биосистем. В проекте планируется развитие кинетических и динамических подходов для исследования характеристических времен колебательной релаксации и внутренней конверсии хромофорных групп ретиналь-содержащих (зрительные фоторецепторы и бактериальные родопсины) и флуоресцентных белков в изолированном состоянии и в белковом окружении. В частности, планируется исследование полного фотоцикла нового бактериального родопсина, выполняющего функцию светочувствительного натриевого канала. В случае флуоресцентных белков будет разработана квантовая теория фотоиндуцированного переноса электрона на молекулы окислителя при селективном возбуждении высокочастотных колебательных мод их хромофоров. Совместные теоретические и экспериментальные работы в области молекулярной физики, молекулярной биологии и биофотоники позволят сделать вывод о роли белкового окружения в механизмах действия этих фотоактивных биосистем и определить пути управления их избирательным фотооткликом.
Помимо оптимизации фотофизических и фотохимических свойств самих хромофорных групп и их ближайшего окружения в фотоактивных белках, например, путем посттрансляционных химических модификаций их структуры, в проекте планируется поиск путей оптимизации фотоотклика биомолекулярных систем при внешнем воздействии на них. В проекте планируется создание новых гибридных бионаносистем на основе фотоактивных белков и плазмонных наночастиц с заданными свойствами. Многократное увеличение эффективности нелинейного двухфотонного поглощения и интенсивности флуоресценции белков семейства зеленого флуоресцентного белка будет достигаться за счет воздействия на них ближними полями возбужденных плазмонных резонансов. Это позволит использовать нелинейные двухфотонные процессы возбуждения фотоактивных частиц в области терапевтического окна прозрачности биологических тканей (700-1200 нм), что важно в различных биомедицинских приложениях.
ОТЧЁТНЫЕ МАТЕРИАЛЫ
Публикации
1. Боченков В.Е. Large Area Fabrication of 2D Chiral Plasmonic Nanoparticles Proceedings of META'18, The 9th International Conference on Metamaterials, Photonic Crystals and Plasmonics, Marseille, France, стр. 629-630 (год публикации - 2018)
2.
Боченков В.Е., Сазерленд Д.С.
Chiral plasmonic nanocrescents: large-area fabrication and optical properties
Optics Express, том 26, № 21, с. 27101-27108 (год публикации - 2018)
10.1364/OE.26.027101
3.
Кнудсен Й.Л., Клуге А., Боченкова А.В., Кифер Х.В., Андерсен Л.Х.
The UV-visible action-absorption spectrum of all-trans and 11-cis protonated Schiff base retinal in the gas phase
Physical Chemistry Chemical Physics, Том: 20 Выпуск: 10 Стр.: 7190-7194 (год публикации - 2018)
10.1039/c7cp07512j
4.
Боченков В.Е.
Chiral comma-shaped gold nanoparticles: fabrication and refractive index sensitivity
Journal of Physics: Conference Series, том 1092, с. 012011 (год публикации - 2018)
10.1088/1742-6596/1092/1/012011
5. Аференок А.С., Боченков В.Е. Моделирование оптических свойств наночастиц золота, имеющих форму диска с двумя отверстиями XXXV Всероссийский симпозиум молодых ученых по химической кинетике Сб. трудов, Москва, 2018.-162 с., стр. 76 (год публикации - 2018)
6.
Боченков В.Е., Шабатина Т.И.
Chiral Plasmonic Biosensors
Biosensors, том 8, № 4, 120 (год публикации - 2018)
10.3390/bios8040120
7. Авдонин И.С., Боченкова А.В. Долгоживущее электронно-возбуждённое состояние анионной формы мета-хромофора зелёного флуоресцентного белка Сборник тезисов докладов VI научной молодежной школы-конференции «Химия, физика, биология: пути интеграции», стр.11 (год публикации - 2018)
8. Авдонин И.С. Механизм безызлучательной электронной релаксации мета хромофора зелёного флуоресцентного белка Материалы IX научной конференции молодых ученых "Инновации в химии: достижения и перспективы - 2018", стр. 811 (год публикации - 2018)
9. Каморзин Б.Б. Моделирование электронно-колебательных спектров нежёстких биологических хромофоров Материалы IX научной конференции молодых ученых "Инновации в химии: достижения и перспективы - 2018", стр.847 (год публикации - 2018)
10. Петрусевич Е.Ф. Моделирование электронно-колебательных спектров ретиналь-содержащих фотоактивных белков Материалы IX научной конференции молодых ученых "Инновации в химии: достижения и перспективы - 2018" (год публикации - 2018)
11. Кусочек П.А. Механизм фотоиндуцированной изомеризации хромофорных групп ретиналь-содержащих фотоактивных белков Материалы IX научной конференции молодых ученых "Инновации в химии: достижения и перспективы - 2018", стр. 862 (год публикации - 2018)
12.
И.А. Колмычек,Е.А. Мамонов, В.Е. Боченков,Т.В. Мурзина
Second-harmonic generation in gold crescent and comma-like nanostructures
Optics Letters, vol. 44, no. 22,5473-5476 (год публикации - 2019)
10.1364/OL.44.005473
13. Боченкова А.В. МОЛЕКУЛЯРНЫЙ МЕХАНИЗМ ЗРЕНИЯ Сборник трудов конференции "Ломоносовские чтения 2.0", 15-16 апреля, Московский государственный университет, с.12 (год публикации - 2019)
14.
Е.М. Лобанова, Т.И. Шабатина, В.Е. Боченков
Computer Simulations of the Optical Properties of Triangular Gold Nanoparticle Dimers
Moscow University Chemistry Bulletin, Volume 74, Issue 5, 1 September 2019, Pages 229-231 (год публикации - 2019)
10.3103/S0027131419050080
15.
Кифер Й.В., Грубер Е., Лангеланд Й., Кусочек П.А., Боченкова А.В., Андерсен Л.Х.
Intrinsic photoisomerization dynamics of protonated Schiff-base retinal
Nature Communications, V. 10, article number 1210 (год публикации - 2019)
10.1038/s41467-019-09225-7
16. Кусочек П.А., Боченкова А.В. МЕХАНИЗМ И КИНЕТИКА ФОТОИЗОМЕРИЗАЦИИ ХРОМОФОРНЫХ ГРУПП РЕТИНАЛЬ-СОДЕРЖАЩИХ ФОТОРЕЦЕПТОРНЫХ БЕЛКОВ В ГАЗОВОЙ ФАЗЕ: ТЕОРИЯ И ЭКСПЕРИМЕНТ XXXVI ВСЕРОССИЙСКИЙ СИМПОЗИУМ МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ ПО ХИМИЧЕСКОЙ КИНЕТИКЕ Сборник трудов. Под редакцией Мельникова М.Я., Верной О.И.. 2019 Издательство: Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова (Москва), c. 56 (год публикации - 2019)
17. Кусочек П.А., Боченкова А.В. МОДЕЛИРОВАНИЕ СТРУКТУРЫ И ЭЛЕКТРОННО-КОЛЕБАТЕЛЬНЫХ СПЕКТРОВ ПРОТОНИРОВАННОГО ОСНОВАНИЯ ШИФФА РЕТИНАЛЯ В ФОТОЦИКЛЕ БАКТЕРИАЛЬНОГО РОДОПСИНА KR2 СБОРНИК ТЕЗИСОВ ДОКЛАДОВ VII НАУЧНОЙ МОЛОДЕЖНОЙ ШКОЛЫ-КОНФЕРЕНЦИИ "ХИМИЯ, ФИЗИКА, БИОЛОГИЯ: ПУТИ ИНТЕГРАЦИИ" Москва, 2019, Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт химической физики им. Н.Н. Семенова Российской академии наук, Москва, c. 44 (год публикации - 2019)
18. Аференок А.С., Боченков В.Е., Шабатина Т.И. НАНОЧАСТИЦЫ ЗОЛОТА, ИМЕЮЩИХ ФОРМУ ДИСКА С ДВУМЯ СОПРИКАСАЮЩИМИСЯ ОТВЕРСТИЯМИ: МОДЕЛИРОВАНИЕ ОПТИЧЕСКИХ СВОЙСТВ XXXVI ВСЕРОССИЙСКИЙ СИМПОЗИУМ МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ ПО ХИМИЧЕСКОЙ КИНЕТИКЕ Сборник трудов. Под редакцией Мельникова М.Я., Верной О.И.. 2019 Издательство: Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова (Москва), c.106 (год публикации - 2019)
19. Кабылда А., Петрусевич Е.Ф. Моделирование механизма необратимой окислительно-восстановительной фотоконверсии двухцветного флуоресцентного белка Материалы XXVI Международной научной конференции студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов-2019», секция «Химия». – М.: Издательство «Перо», 2019., с.799 (год публикации - 2019)
20. Петрусевич Е.Ф. Молекулярный механизм окисления зеленого флуоресцентного белка Материалы XXVI Международной научной конференции студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов-2019», секция «Химия». –М.: Издательство «Перо», 2019, с.822 (год публикации - 2019)
21. Кусочек П.А. Моделирование электронно-колебательных спектров хромофорных групп фотоактивных белков в белковом окружении Материалы XXVI Международной научной конференции студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов-2019», секция «Химия». –М.: Издательство «Перо», 2019, с.807 (год публикации - 2019)
22.
А.С. Аференок, Т.И. Шабатина, В.Е. Боченков
Modeling the optical properties of gold nanodisks with two holes
Journal of Physics: Conference Series, 1348, 012088 (год публикации - 2019)
10.1088/1742-6596/1348/1/012088
23. В.Е. Боченков, А.М. Шахов, А.А. Астафьев,В.А. Тимошенко Immobilization and plasmon-enhanced fluorescence of EGFP on Al nanohole arrays Journal of Physics: Conference Series (год публикации - 2019)
24.
Свендсен, А; Кифер, ХВ; Педерсен, ХБ; Боченкова, АВ; Андерсен, ЛХ
Origin of the Intrinsic Fluorescence of the Green Fluorescent Protein
JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, Том: 139 Выпуск: 25 Стр.: 8766-8771 (год публикации - 2017)
10.1021/jacs.7b04987
25.
Боченков ВЕ
In-situ resist colloidal lithography for affordable plasmonics
AIP Conference Proceedings, Том 1874, Номер статьи 030004 (год публикации - 2017)
10.1063/1.4998033
26.
Иоффе ИН; Квик, М; Квик, МТ; Добряков, АЛ; Рихтер, С; Грановский, АА; Берндт, Ф; Марвальд, Р; Эрнстинг, НП; Коваленко, СА
Tuning Stilbene Photochemistry by Fluorination: State Reordering Leads to Sudden Polarization near the Franck−Condon Region
JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, Том: 139 Выпуск: 42 Стр.: 15265-15274 (год публикации - 2017)
10.1021/jacs.7b09611
Публикации
1. Боченков В.Е. Large Area Fabrication of 2D Chiral Plasmonic Nanoparticles Proceedings of META'18, The 9th International Conference on Metamaterials, Photonic Crystals and Plasmonics, Marseille, France, стр. 629-630 (год публикации - 2018)
2.
Боченков В.Е., Сазерленд Д.С.
Chiral plasmonic nanocrescents: large-area fabrication and optical properties
Optics Express, том 26, № 21, с. 27101-27108 (год публикации - 2018)
10.1364/OE.26.027101
3.
Кнудсен Й.Л., Клуге А., Боченкова А.В., Кифер Х.В., Андерсен Л.Х.
The UV-visible action-absorption spectrum of all-trans and 11-cis protonated Schiff base retinal in the gas phase
Physical Chemistry Chemical Physics, Том: 20 Выпуск: 10 Стр.: 7190-7194 (год публикации - 2018)
10.1039/c7cp07512j
4.
Боченков В.Е.
Chiral comma-shaped gold nanoparticles: fabrication and refractive index sensitivity
Journal of Physics: Conference Series, том 1092, с. 012011 (год публикации - 2018)
10.1088/1742-6596/1092/1/012011
5. Аференок А.С., Боченков В.Е. Моделирование оптических свойств наночастиц золота, имеющих форму диска с двумя отверстиями XXXV Всероссийский симпозиум молодых ученых по химической кинетике Сб. трудов, Москва, 2018.-162 с., стр. 76 (год публикации - 2018)
6.
Боченков В.Е., Шабатина Т.И.
Chiral Plasmonic Biosensors
Biosensors, том 8, № 4, 120 (год публикации - 2018)
10.3390/bios8040120
7. Авдонин И.С., Боченкова А.В. Долгоживущее электронно-возбуждённое состояние анионной формы мета-хромофора зелёного флуоресцентного белка Сборник тезисов докладов VI научной молодежной школы-конференции «Химия, физика, биология: пути интеграции», стр.11 (год публикации - 2018)
8. Авдонин И.С. Механизм безызлучательной электронной релаксации мета хромофора зелёного флуоресцентного белка Материалы IX научной конференции молодых ученых "Инновации в химии: достижения и перспективы - 2018", стр. 811 (год публикации - 2018)
9. Каморзин Б.Б. Моделирование электронно-колебательных спектров нежёстких биологических хромофоров Материалы IX научной конференции молодых ученых "Инновации в химии: достижения и перспективы - 2018", стр.847 (год публикации - 2018)
10. Петрусевич Е.Ф. Моделирование электронно-колебательных спектров ретиналь-содержащих фотоактивных белков Материалы IX научной конференции молодых ученых "Инновации в химии: достижения и перспективы - 2018" (год публикации - 2018)
11. Кусочек П.А. Механизм фотоиндуцированной изомеризации хромофорных групп ретиналь-содержащих фотоактивных белков Материалы IX научной конференции молодых ученых "Инновации в химии: достижения и перспективы - 2018", стр. 862 (год публикации - 2018)
12.
И.А. Колмычек,Е.А. Мамонов, В.Е. Боченков,Т.В. Мурзина
Second-harmonic generation in gold crescent and comma-like nanostructures
Optics Letters, vol. 44, no. 22,5473-5476 (год публикации - 2019)
10.1364/OL.44.005473
13. Боченкова А.В. МОЛЕКУЛЯРНЫЙ МЕХАНИЗМ ЗРЕНИЯ Сборник трудов конференции "Ломоносовские чтения 2.0", 15-16 апреля, Московский государственный университет, с.12 (год публикации - 2019)
14.
Е.М. Лобанова, Т.И. Шабатина, В.Е. Боченков
Computer Simulations of the Optical Properties of Triangular Gold Nanoparticle Dimers
Moscow University Chemistry Bulletin, Volume 74, Issue 5, 1 September 2019, Pages 229-231 (год публикации - 2019)
10.3103/S0027131419050080
15.
Кифер Й.В., Грубер Е., Лангеланд Й., Кусочек П.А., Боченкова А.В., Андерсен Л.Х.
Intrinsic photoisomerization dynamics of protonated Schiff-base retinal
Nature Communications, V. 10, article number 1210 (год публикации - 2019)
10.1038/s41467-019-09225-7
16. Кусочек П.А., Боченкова А.В. МЕХАНИЗМ И КИНЕТИКА ФОТОИЗОМЕРИЗАЦИИ ХРОМОФОРНЫХ ГРУПП РЕТИНАЛЬ-СОДЕРЖАЩИХ ФОТОРЕЦЕПТОРНЫХ БЕЛКОВ В ГАЗОВОЙ ФАЗЕ: ТЕОРИЯ И ЭКСПЕРИМЕНТ XXXVI ВСЕРОССИЙСКИЙ СИМПОЗИУМ МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ ПО ХИМИЧЕСКОЙ КИНЕТИКЕ Сборник трудов. Под редакцией Мельникова М.Я., Верной О.И.. 2019 Издательство: Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова (Москва), c. 56 (год публикации - 2019)
17. Кусочек П.А., Боченкова А.В. МОДЕЛИРОВАНИЕ СТРУКТУРЫ И ЭЛЕКТРОННО-КОЛЕБАТЕЛЬНЫХ СПЕКТРОВ ПРОТОНИРОВАННОГО ОСНОВАНИЯ ШИФФА РЕТИНАЛЯ В ФОТОЦИКЛЕ БАКТЕРИАЛЬНОГО РОДОПСИНА KR2 СБОРНИК ТЕЗИСОВ ДОКЛАДОВ VII НАУЧНОЙ МОЛОДЕЖНОЙ ШКОЛЫ-КОНФЕРЕНЦИИ "ХИМИЯ, ФИЗИКА, БИОЛОГИЯ: ПУТИ ИНТЕГРАЦИИ" Москва, 2019, Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт химической физики им. Н.Н. Семенова Российской академии наук, Москва, c. 44 (год публикации - 2019)
18. Аференок А.С., Боченков В.Е., Шабатина Т.И. НАНОЧАСТИЦЫ ЗОЛОТА, ИМЕЮЩИХ ФОРМУ ДИСКА С ДВУМЯ СОПРИКАСАЮЩИМИСЯ ОТВЕРСТИЯМИ: МОДЕЛИРОВАНИЕ ОПТИЧЕСКИХ СВОЙСТВ XXXVI ВСЕРОССИЙСКИЙ СИМПОЗИУМ МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ ПО ХИМИЧЕСКОЙ КИНЕТИКЕ Сборник трудов. Под редакцией Мельникова М.Я., Верной О.И.. 2019 Издательство: Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова (Москва), c.106 (год публикации - 2019)
19. Кабылда А., Петрусевич Е.Ф. Моделирование механизма необратимой окислительно-восстановительной фотоконверсии двухцветного флуоресцентного белка Материалы XXVI Международной научной конференции студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов-2019», секция «Химия». – М.: Издательство «Перо», 2019., с.799 (год публикации - 2019)
20. Петрусевич Е.Ф. Молекулярный механизм окисления зеленого флуоресцентного белка Материалы XXVI Международной научной конференции студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов-2019», секция «Химия». –М.: Издательство «Перо», 2019, с.822 (год публикации - 2019)
21. Кусочек П.А. Моделирование электронно-колебательных спектров хромофорных групп фотоактивных белков в белковом окружении Материалы XXVI Международной научной конференции студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов-2019», секция «Химия». –М.: Издательство «Перо», 2019, с.807 (год публикации - 2019)
22.
А.С. Аференок, Т.И. Шабатина, В.Е. Боченков
Modeling the optical properties of gold nanodisks with two holes
Journal of Physics: Conference Series, 1348, 012088 (год публикации - 2019)
10.1088/1742-6596/1348/1/012088
23. В.Е. Боченков, А.М. Шахов, А.А. Астафьев,В.А. Тимошенко Immobilization and plasmon-enhanced fluorescence of EGFP on Al nanohole arrays Journal of Physics: Conference Series (год публикации - 2019)
24.
Свендсен, А; Кифер, ХВ; Педерсен, ХБ; Боченкова, АВ; Андерсен, ЛХ
Origin of the Intrinsic Fluorescence of the Green Fluorescent Protein
JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, Том: 139 Выпуск: 25 Стр.: 8766-8771 (год публикации - 2017)
10.1021/jacs.7b04987
25.
Боченков ВЕ
In-situ resist colloidal lithography for affordable plasmonics
AIP Conference Proceedings, Том 1874, Номер статьи 030004 (год публикации - 2017)
10.1063/1.4998033
26.
Иоффе ИН; Квик, М; Квик, МТ; Добряков, АЛ; Рихтер, С; Грановский, АА; Берндт, Ф; Марвальд, Р; Эрнстинг, НП; Коваленко, СА
Tuning Stilbene Photochemistry by Fluorination: State Reordering Leads to Sudden Polarization near the Franck−Condon Region
JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, Том: 139 Выпуск: 42 Стр.: 15265-15274 (год публикации - 2017)
10.1021/jacs.7b09611
Публикации
1. Боченков В.Е. Large Area Fabrication of 2D Chiral Plasmonic Nanoparticles Proceedings of META'18, The 9th International Conference on Metamaterials, Photonic Crystals and Plasmonics, Marseille, France, стр. 629-630 (год публикации - 2018)
2.
Боченков В.Е., Сазерленд Д.С.
Chiral plasmonic nanocrescents: large-area fabrication and optical properties
Optics Express, том 26, № 21, с. 27101-27108 (год публикации - 2018)
10.1364/OE.26.027101
3.
Кнудсен Й.Л., Клуге А., Боченкова А.В., Кифер Х.В., Андерсен Л.Х.
The UV-visible action-absorption spectrum of all-trans and 11-cis protonated Schiff base retinal in the gas phase
Physical Chemistry Chemical Physics, Том: 20 Выпуск: 10 Стр.: 7190-7194 (год публикации - 2018)
10.1039/c7cp07512j
4.
Боченков В.Е.
Chiral comma-shaped gold nanoparticles: fabrication and refractive index sensitivity
Journal of Physics: Conference Series, том 1092, с. 012011 (год публикации - 2018)
10.1088/1742-6596/1092/1/012011
5. Аференок А.С., Боченков В.Е. Моделирование оптических свойств наночастиц золота, имеющих форму диска с двумя отверстиями XXXV Всероссийский симпозиум молодых ученых по химической кинетике Сб. трудов, Москва, 2018.-162 с., стр. 76 (год публикации - 2018)
6.
Боченков В.Е., Шабатина Т.И.
Chiral Plasmonic Biosensors
Biosensors, том 8, № 4, 120 (год публикации - 2018)
10.3390/bios8040120
7. Авдонин И.С., Боченкова А.В. Долгоживущее электронно-возбуждённое состояние анионной формы мета-хромофора зелёного флуоресцентного белка Сборник тезисов докладов VI научной молодежной школы-конференции «Химия, физика, биология: пути интеграции», стр.11 (год публикации - 2018)
8. Авдонин И.С. Механизм безызлучательной электронной релаксации мета хромофора зелёного флуоресцентного белка Материалы IX научной конференции молодых ученых "Инновации в химии: достижения и перспективы - 2018", стр. 811 (год публикации - 2018)
9. Каморзин Б.Б. Моделирование электронно-колебательных спектров нежёстких биологических хромофоров Материалы IX научной конференции молодых ученых "Инновации в химии: достижения и перспективы - 2018", стр.847 (год публикации - 2018)
10. Петрусевич Е.Ф. Моделирование электронно-колебательных спектров ретиналь-содержащих фотоактивных белков Материалы IX научной конференции молодых ученых "Инновации в химии: достижения и перспективы - 2018" (год публикации - 2018)
11. Кусочек П.А. Механизм фотоиндуцированной изомеризации хромофорных групп ретиналь-содержащих фотоактивных белков Материалы IX научной конференции молодых ученых "Инновации в химии: достижения и перспективы - 2018", стр. 862 (год публикации - 2018)
12.
И.А. Колмычек,Е.А. Мамонов, В.Е. Боченков,Т.В. Мурзина
Second-harmonic generation in gold crescent and comma-like nanostructures
Optics Letters, vol. 44, no. 22,5473-5476 (год публикации - 2019)
10.1364/OL.44.005473
13. Боченкова А.В. МОЛЕКУЛЯРНЫЙ МЕХАНИЗМ ЗРЕНИЯ Сборник трудов конференции "Ломоносовские чтения 2.0", 15-16 апреля, Московский государственный университет, с.12 (год публикации - 2019)
14.
Е.М. Лобанова, Т.И. Шабатина, В.Е. Боченков
Computer Simulations of the Optical Properties of Triangular Gold Nanoparticle Dimers
Moscow University Chemistry Bulletin, Volume 74, Issue 5, 1 September 2019, Pages 229-231 (год публикации - 2019)
10.3103/S0027131419050080
15.
Кифер Й.В., Грубер Е., Лангеланд Й., Кусочек П.А., Боченкова А.В., Андерсен Л.Х.
Intrinsic photoisomerization dynamics of protonated Schiff-base retinal
Nature Communications, V. 10, article number 1210 (год публикации - 2019)
10.1038/s41467-019-09225-7
16. Кусочек П.А., Боченкова А.В. МЕХАНИЗМ И КИНЕТИКА ФОТОИЗОМЕРИЗАЦИИ ХРОМОФОРНЫХ ГРУПП РЕТИНАЛЬ-СОДЕРЖАЩИХ ФОТОРЕЦЕПТОРНЫХ БЕЛКОВ В ГАЗОВОЙ ФАЗЕ: ТЕОРИЯ И ЭКСПЕРИМЕНТ XXXVI ВСЕРОССИЙСКИЙ СИМПОЗИУМ МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ ПО ХИМИЧЕСКОЙ КИНЕТИКЕ Сборник трудов. Под редакцией Мельникова М.Я., Верной О.И.. 2019 Издательство: Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова (Москва), c. 56 (год публикации - 2019)
17. Кусочек П.А., Боченкова А.В. МОДЕЛИРОВАНИЕ СТРУКТУРЫ И ЭЛЕКТРОННО-КОЛЕБАТЕЛЬНЫХ СПЕКТРОВ ПРОТОНИРОВАННОГО ОСНОВАНИЯ ШИФФА РЕТИНАЛЯ В ФОТОЦИКЛЕ БАКТЕРИАЛЬНОГО РОДОПСИНА KR2 СБОРНИК ТЕЗИСОВ ДОКЛАДОВ VII НАУЧНОЙ МОЛОДЕЖНОЙ ШКОЛЫ-КОНФЕРЕНЦИИ "ХИМИЯ, ФИЗИКА, БИОЛОГИЯ: ПУТИ ИНТЕГРАЦИИ" Москва, 2019, Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт химической физики им. Н.Н. Семенова Российской академии наук, Москва, c. 44 (год публикации - 2019)
18. Аференок А.С., Боченков В.Е., Шабатина Т.И. НАНОЧАСТИЦЫ ЗОЛОТА, ИМЕЮЩИХ ФОРМУ ДИСКА С ДВУМЯ СОПРИКАСАЮЩИМИСЯ ОТВЕРСТИЯМИ: МОДЕЛИРОВАНИЕ ОПТИЧЕСКИХ СВОЙСТВ XXXVI ВСЕРОССИЙСКИЙ СИМПОЗИУМ МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ ПО ХИМИЧЕСКОЙ КИНЕТИКЕ Сборник трудов. Под редакцией Мельникова М.Я., Верной О.И.. 2019 Издательство: Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова (Москва), c.106 (год публикации - 2019)
19. Кабылда А., Петрусевич Е.Ф. Моделирование механизма необратимой окислительно-восстановительной фотоконверсии двухцветного флуоресцентного белка Материалы XXVI Международной научной конференции студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов-2019», секция «Химия». – М.: Издательство «Перо», 2019., с.799 (год публикации - 2019)
20. Петрусевич Е.Ф. Молекулярный механизм окисления зеленого флуоресцентного белка Материалы XXVI Международной научной конференции студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов-2019», секция «Химия». –М.: Издательство «Перо», 2019, с.822 (год публикации - 2019)
21. Кусочек П.А. Моделирование электронно-колебательных спектров хромофорных групп фотоактивных белков в белковом окружении Материалы XXVI Международной научной конференции студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов-2019», секция «Химия». –М.: Издательство «Перо», 2019, с.807 (год публикации - 2019)
22.
А.С. Аференок, Т.И. Шабатина, В.Е. Боченков
Modeling the optical properties of gold nanodisks with two holes
Journal of Physics: Conference Series, 1348, 012088 (год публикации - 2019)
10.1088/1742-6596/1348/1/012088
23. В.Е. Боченков, А.М. Шахов, А.А. Астафьев,В.А. Тимошенко Immobilization and plasmon-enhanced fluorescence of EGFP on Al nanohole arrays Journal of Physics: Conference Series (год публикации - 2019)
24.
Свендсен, А; Кифер, ХВ; Педерсен, ХБ; Боченкова, АВ; Андерсен, ЛХ
Origin of the Intrinsic Fluorescence of the Green Fluorescent Protein
JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, Том: 139 Выпуск: 25 Стр.: 8766-8771 (год публикации - 2017)
10.1021/jacs.7b04987
25.
Боченков ВЕ
In-situ resist colloidal lithography for affordable plasmonics
AIP Conference Proceedings, Том 1874, Номер статьи 030004 (год публикации - 2017)
10.1063/1.4998033
26.
Иоффе ИН; Квик, М; Квик, МТ; Добряков, АЛ; Рихтер, С; Грановский, АА; Берндт, Ф; Марвальд, Р; Эрнстинг, НП; Коваленко, СА
Tuning Stilbene Photochemistry by Fluorination: State Reordering Leads to Sudden Polarization near the Franck−Condon Region
JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY, Том: 139 Выпуск: 42 Стр.: 15265-15274 (год публикации - 2017)
10.1021/jacs.7b09611